Protein

UniProt accession
R9TM25_9CAUD [UniProt]
Protein name
Structural protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,4570

Protein sequence
MNINKVSQSIKSQTPDFVESEYSLFNKFLEYYYKSQEKTGLGQNILNNFLGYLDIDKLDIQILDGKTKLVEDISLTSDTIVVETIDSFLEQNGSILIGDEVIFYEKTVSSPNIALSPGVSYDQVKLKWVDLESILNLFDGSNTVFPLTSLGTPVAPISSKHLIVKLYNEILIPEIDFQISGTNITFTTAPRTKLPSDAAEQTSVTYLKGFSENSIIGIDNLSNAFGEDKTEFVMTVSGSRYEPITDEYIIAIYDNRLLIPRVDFFIDGDTFIFNTAPLNGRFLGLFSIEAPIPSFGSGAVGYSRVNNSGQITSVSTSETGANYRYEYPPKVTVSSAQGSGSSVSALVNGVKSVSLLEGGRGFSSTNPPIVTLEQPTKDGAVIPKLSAVVDTNGSVSEVTIDESGSGYTFTPRLSFKQPGGAKIGPVTIVSGQVSGTIPVTNGGLGYSTVPEIYVDEPTGINGIKASLQAVLTDGVVTSITVLNAGQGYETTPRVAVIDPVGAQILDVAVDGDGRVIRVDLLDGGSGYEDVPSVYIVDHRTSNRGTGATATAAIFNGRITDININNFGSGYSQTEPPEIIIQQPPTAKASVGVGQNELTGFSVKKSGSGYSKAKFEGCARAASAITAYTEDGNAVFSQNTTSSAATAGAEIKCLDALFVKRLLDKYTEQFLPDVPELDYSKIDVRTAIKTIKDFYTSKGTSFSIAYLFKLLYGEIVTVSYPKDQIIKPSAATWSVDTILRATVVSGDPTNIKDGLLTQDADIADTSVRAASALIENFLSIQTSDSVIYELILSEETINGNFIVPYKTRLGEPLNTTDSIITVDSTIGWPERNGEFIIGGTEIVRYKEKSLNQFIECTRSINNVVEDWDSATEVTSNFKVYVNKGTTQEVVMNIVGIVDAQQTTLTDTGSYYLPGDKLTISKLGGTSEDPELRTWLYNVKKLVEVTSITFGGINNQSATVTCNNPHGLLVGDQVTVYGANPIIYNGTFLVTSRDSETVFQYQLPQPAGVIPQGNILVSVDLNKGKSDDTGVLSAIGPYTTNIQNSFFNTQYVYVASTGIPNYKIGPFPGSALLPGNQRKLNRFPLTPSTISTKNLITPGPIGTWINGVSIWSYKSTTKKTFGAVTAINITNSGQGYDAASPPALTISGGNGTGAQATVIVNGSVSEITVEGGGTGYTSSPLVSIVGGGGSGASATAIITKGSVSRILINDGGTGYTSQPSITIVGGEGTGATATASVRGPIKSVSIDNGGQSYTSKPEIILSSGSGAVAQAIVNDGRIISIAIISAGQGYTTAPEIVIQGDGFGAVARTSIDVDGENAGRVTGIEIINRGIGYTQGTTVIGLNSIGSDAVFDANVFEWTYNLQETSIFDSSKGSVFEGFNNQYGGEYAHLSNPQRLRYILGDNLFENEQGVVLEQEDQLDHSPIIGWAFDGNPIYGPYGYQDPTDQGSEIARLRTSYRLKTNLVFNEITNPYPVRTDGPLLTEEAAGRFVEDYEFTFSLGDLDQYNGRFCKTPDFPEGRYCYFVTIDATEQGDSLFPYVLGPSFNSVVDIWNLNSNAIQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERAPNASTNSITAENGDILLFEVEDENRDGIISQDETDDPDEIFEESPLQLFDYFPTVKLDSRVDIEVETITKFEDASVTGFIVENPGVSYQVNDQLVFDNTDTDGSGVSARVSRIKGETPSSYSFENISGNNFGVLQTQNPHNLQVGDTIFVDYTPVMDNTNKTFSVRQFTGIEEIVVNQTGSGYNEDIPPQIIIDGNGKSGKLEATVTTVGSIDTVNIINAGFGYTSNPRVILSHPQVFKKADYYVSLVENNEYVKINDAFVNANKESFICGVTEDSTSNKVAFIAKLSATGVKEWEKTLELTTGQQYAEFQKVYVDGSDVWVVGINRPNSVILNNYNPDIILVKYTQSENGLDATLTFQKAYSGISGSSRSDNITSLQKMSDTRYVIGGFTNTNSSNPYDSFLATIDLSGNFALKRKVASASKSEKITDISVSGSNVFFTMETADDTTSDDVNVSFGKATVNVNSIDIEWIKEYSNSLYSFFDSSVTVDEFDEYYITSTLRLKSDDTTKDSVWIGKVDTDGDFIWNYRYVAPGGEVTAINKSHIDIFGDLNVGFSTTDSTTSLKTVDILKLNYKGELLNHTNNKFNLNRIEGITAHALNIDNSGDVYVFGQTSWNRNEFILEFATDATDKTGNYTPTLIGDDATDALVISGDGVAKLLAKDVGTPANWENSAIKFTAASLGTKLADNWTLEFMLYKDAANSQTHSQTEQTLFAIGDAADATGGLWMYYDIANGNLECVVTNNTTSVNSSGSSLQSTQTNMYADDSWQFIALTKSGNVFTGYVNGIQVFTGTVSNTSLGNKDLYFGNVPGRDGSTGTFRSNEQGQYYLDNLRLRNRILTPTVPSDVLSLPPTASYALAFDWTDDAWFTTNLNRYDYIDYVAWGLKADKNADAIRLGDKGLQTNTNVGFVRTAVTPVTGSALTMQSNGFALGTAGIQSLDFDDATTTMSENTETLTYNRDVWGSRTATVPSPGSQKLSVSAVVKPKYYFKVTPTVKIDNIQELTINQSFNFTIGSKVVLNNGGSFVNSGYLVKKDTENNKIYLAVNNNAWSNDLNVGELSTEQFSEQSSYGIVGPIPNDVNEIASFNFAQVVNTTPGTFDIDLNDYNLDATVSVGSGNLDSFAKFKPFTSADYSIRIDEVSGSSNFIVGSVIQPAGSDVSFNAAYSTIQITGLTGVLKITLIANLSKILRATAVANSDQVYVITSTSHYLSPGEMIHVDGNPSETVNTVVYDEYDGSFPVDTVVSPLEFTYKLPQAAITSPATSASSVSIFVRSPVLKMYYGHQYVFDLGHSSMVGGNLSFSKDNLYKLEYSFNSIERVGIPGVTGEGQPNPTVKLKVDRDIVTNISYYFDPSRPGLDSPIDPNSYLDVVGSPYQGTFEITSLAGATITRGADIVKFPLIDEPEGDAGISQTSYSTSSRRAVGSISDIRITNAGGFYTRLPIVTSITSTRQIERVQIVEPGTEYAVGTYNSVPISGDGEGGFVSISVADGSDDEGNNIPGQIQSVTVTSPGKGYTTATVDVESVQGILGPGLAGSGAELTVVIPPFGSGASIFTTGDSVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILDSITVTDPGSGYSQSPSVVITGGGGSGAIAESTIRNGRLDQIIVKDPGSGYSSTPIVSLRSSFNYVINLDLGLLQFAFPHGIPNGSQVSLIVTDTGDGADFPLSSGALGRLNSTTTYFAITGTANSLEPDQMKLAITAANAELGDAITFVNAGTGRQSVLTESFGGAATANVITSTFLEGELVYQGDALDTATATGYVSTNNGWQIGPRVLKIVDYTGEFIEGQQVTGVISKSSGTISDLNVAKGVLEIGSITNTTGQFIDDVGKPSEIIQRVQDSYYYQDFSYAVNSSVSINEWKELLLRNVHPASFKVFGELSLGEYGQIPNKQTFFELTKSVELAREATVPNIQSFALVEPIYSEFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISTLFDGERIAFPITVGGNNVVASADQLMVILNGVVQTPNTSFELQGDSIVFSEPPSPPASVKYVNITIEQIDTITVTVSNNSGIFPTAGNVLVGTTSNTRLTVTKVAGQTISGFITQGAFVANELVTVGATGFAATYDSQVSVDNLGLFIFGEQITNFDNDTAIVEQINLERGQETPLGKLRYSIGAATTSVEIITVGSTTNAPAAVPADTFVAGQNYQFGSEIFLVNTVTTGTNSTILTITRGQSQTAIVPQQENTPLYGTQIQVTNTLTLSKTAGTYQSTPGLFDIQLDDVIIGAQSGVVARVNSTATYQDPVTEEFIGQVNISEGSTFFGLLFNRIASTTYPNVILDDISKSQVSIVDFDDNSLAYDAKFPSTEPISNLVLPYDNLTNGPLLEDEYIRNYQIEYGNNTAEFLSGEDITVRKLTFDQKQGTGFFAAGQVIKTRDTKAEVIGYNQARSTIYLGKIGRVKNSGQDYHTAVFNADAQLDTAQKKFSSSSLLLDGTGDHVSFAGSTEFGFGTNAFTLECWIRPTSVTGTQYIIDLRSNSSDTTPKIYLEGAELRYGSATSDHITGGTLVVDTWYHVAVAKSGTTTRLFLDGAQIGTDYTDTNNYGSSQPINIGANEADGDNFNGHIDEVRVSNTARYTAVFTPRNGIFQGDANTKLLLHFDGADAQTYTEDWSGAESLTNGEEFHNDAILATSRVSGAPVGFTGNSHRVYNAAESIRLNKDFIAKETVYLLLQQYPSLTIPGGNVNCEDDIRDILDSIIEDLHNGSNNHMWDSSALYVDRTVNPVTLNHVETEIAETIWAYNKVDEMLQYIITNVTWTIQGDHGLTQTLNTDPTNIYESGSASLSNCADVYTTINNLIDLLTDTLSEANSPSATVDGDHLGTVTKVEPVYEFIGGTVDAYVERSFASTYHDGSTDVLYSNRVDASSRDRFYDAANLIEANSAVIIDKTSYDLLQRYPDLYQDMPRNENGVSDDGIERCKTDLTLILAELIKDIRYGGNLNTVQTAKFYLGSNQELLHIRLQVWQSAYAHTRLANYMKQAINGDLTYDNTDNIIVGDWGITNDAGGCADVQTAIDNLIDTFNDIIAPTDNDYNIAADRLYFNRDAITSEVNGVTNEYLTYILQNVQYSAYTINASNYASYMEKFLIAAISDLQTGGTNSILTEIDAYLNSSLAILTIEDELLPFLFSVEKLKEFGELAIENNIYTQGTSVTGDQYALRFSANASYRDSETPSNIQNVVTRYNTLIDLILSTLSPGSTAARSATKNIAFNANYYREEIRGEINAQFGSNAWVYEPFLNELTDSVVHDIITTDTSTTQSAYNVSLRNITGTFTVGEVVTSSGTGTATVLEYNNVNSILYVGAFTGTAWDAGDTLTGANGGTATITGGGTGSVAFDGSGDYLRTGFSNTDFAFGSNAITVEAWVYWNGNNS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Physico‐chemical
properties
protein length:6167 AA
molecular weight: 664500,72840 Da
isoelectric point:4,40573
aromaticity:0,09762
hydropathy:-0,15568

Domains

Domains [InterPro]
IPR023366
945–1012
IPR023366 IPR025924 IPR006558 IPR013320
R9TM25_9CAUD
1 6167
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-CAM8
[NCBI] 		754038 Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Neritesvirus scam8 >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGN33923.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ634178 [NCBI]
CDS location
range 54841 -> 73344
strand +
CDS
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