Protein
- UniProt accession
- G8EXP4_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Outer membrane protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9273
- Protein sequence
-
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGEIGIELDTTRLKIGDGVTAWNTLRYERPLESTTNTSNTLVQRDVDGNFSAGTITATLIGQSSTASRLASTRQVQITGDVTGTDNFDGSDNINLQSQLSIVDTLAHYDGTNTSLGTYTQVEVDAKGRIKRGFNPTSIADYGLDGSVEGSSAQPYDTDLQAIAQLNTTGLVARTSPGNAIARTINGTASQIVVNNGGGLTGNPVVDLAVTTVVAGDYNTESLTSVDALGSSNEPFGTETVNAAKFTVDDRGRLQSATNVPIATATEGSKYAAYAAGTTYVRYDIIEDSSKVYQAITGIAAGGGAPTHTDATDAGGWRYLGAATVEQKGLASFAQEDFDVDANGHVTIAAVGVDNTQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATSGYRGFNYLNYIKVNDVSGNLLVGANNTGDGGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGNLTFQLTQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTVQISASEADGKVHVEDARFQDNYIATANATLNLDPGDDRAATGTVRVWGNLQIDGTTTTVNSTTVTVDDPIITLGGDTAPATDDNLDRGIEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNTTEVFSGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVIAGGAGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDNIVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTTGNGSLAGILDVTGNLNVNTDKFNVIAASGNTSIAGTLGVTSIATFSNNIDANGDVAIAGNIHSESTNDITVLKNSGTGIWEIQSNDYGSLKVDGGAYVAGSALIDGTLHVNGAIEVKDSATETESRLNWLQVRYRGRFGDSYQATPSYASHNTTTIRAHGGAGIERSLHVGGTGTGEGLFVGKRYSGDTQKFSVLGASGNTTIEGTLTVNDNVNFNGTLDQDGDFAVRNGTTDKFFVAATSGDTNIEGTLTVDGHTELNSTLNVDNNVTLGAQLTVTGTTEFNNTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSVRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDAVQINDTLGVSDVVTFTRNTQQSITGNSISLDGAVRMSGGLGVSKNLAVGENLVVYGDFNIIGDTVVNGTTTYNAKIDITNTAEADSLGDSNVAFQVDGGGIIRKKLWAGGDFTVYDDANSRNAFFVDVSTGDATLHNDLTVGGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDSTAKVGFFGLDRSSLEYVFLNDATNSSEVLSGTDGQLRAGSLNLTGSGTSLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGAALVIPNTTKINNLNADLLDSMTTASTATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALKTARNITVAGVVSGDAEFNGSGDITITTSYVDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITITNADGVSGDITLNVASTSTNASNNLVLRDASGDFAANEITADLVGGVTGDVVGNVTGNVTGQTSDISNHDTGDLTEGSNLYYTDARADARIAAADTDALSEGSTNLYYTDARADARIAAADTGDLTEGSNLYYTNARADARIVAAGLDGGTLTGDVTGDVTGNVDGNVSGEVTLEGAAPASATATGTAGDIRYDADYIYICVATDTWKRAAISTWS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1720 AA molecular weight: 177258,80450 Da isoelectric point: 4,18934 aromaticity: 0,05930 hydropathy: -0,19942
Domains
Domains [InterPro]
IPR041352
5–43
5–43
1
1720
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Synechococcus phage S-CAM8 [NCBI] |
754038 | Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Neritesvirus scam8 > |
Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AET72584.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
JF974299
[NCBI]
CDS location
range 26073 -> 31235
strand -
strand -
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGACGTGGTGGTGCTCAGGAGTGGGCAAACGCGAATCCAACTCTTGCACAAGGTGAGATCGGCATCGAACTCGATACAACTCGCCTCAAGATTGGTGATGGTGTTACTGCATGGAACACTCTGAGGTATGAGCGTCCTCTTGAATCTACGACAAATACTTCAAACACTCTTGTACAAAGAGATGTTGATGGTAATTTTTCTGCAGGTACAATCACAGCAACGTTGATTGGACAATCTTCTACTGCTAGTCGCCTTGCTTCTACAAGACAGGTTCAGATAACTGGTGATGTAACTGGTACAGATAACTTTGACGGTTCGGATAACATCAATCTGCAATCTCAACTCTCGATTGTTGATACTCTTGCTCATTATGATGGTACAAATACGTCTCTAGGAACATACACTCAAGTTGAGGTAGACGCAAAAGGTAGAATTAAGAGAGGTTTTAATCCAACATCAATTGCTGATTATGGTCTTGATGGAAGCGTCGAAGGATCTTCCGCACAACCTTATGATACCGATCTTCAGGCGATTGCTCAATTAAATACCACTGGTCTTGTTGCCAGAACTTCTCCTGGTAATGCCATTGCCAGAACAATCAATGGTACAGCATCTCAAATTGTTGTTAACAATGGTGGCGGTCTTACTGGTAATCCAGTTGTTGACTTGGCAGTTACAACTGTAGTTGCAGGTGACTATAACACTGAATCATTAACATCAGTTGATGCTCTTGGATCTAGCAACGAACCATTCGGTACAGAAACTGTAAACGCTGCAAAATTTACAGTTGACGATAGAGGTCGTTTACAAAGTGCTACAAATGTACCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGGCATATGCAGCAGGTACAACGTATGTTAGATATGATATTATTGAAGATAGTAGTAAAGTATATCAAGCAATCACAGGAATCGCTGCAGGTGGTGGTGCTCCAACTCATACTGATGCTACAGATGCTGGTGGATGGAGATATCTCGGTGCTGCAACAGTTGAACAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTTGATGTTGATGCCAACGGTCATGTAACTATTGCTGCAGTTGGTGTTGATAATACACAACTACAGAATAATAGAGTTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTGCAACCTCTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGACGTTAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACGGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAATGTACGGTCGTACTTCTCTGACGCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCAACTTAACGTTCCAGTTAACACAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAACGCTGGGTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTGTACAGATTAGTGCATCAGAAGCAGATGGTAAGGTACATGTAGAAGATGCAAGATTTCAAGATAACTATATTGCTACAGCAAACGCGACATTAAACCTCGATCCTGGTGATGATCGTGCTGCTACAGGAACAGTTAGAGTCTGGGGCAACCTTCAGATTGATGGCACTACCACCACTGTAAACTCAACAACTGTTACAGTTGATGATCCTATTATCACTCTTGGTGGTGATACTGCACCTGCAACCGATGACAATTTAGATCGTGGTATTGAGTTTAGATATTATGATACTGAAGCACGTTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGTGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTACTGAAGTCTTTAGTGGCACTGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATCTAGTTATTGCTGGTGGTGCTGGTATCACACAAGATGTAAATATCGGTGGATTGCTAGATGTTGATGGTACTTTCCGTGCTAATAGTACTTCTCGCTTTGACGATAATATCGTTCTACAAGGTGCTTCTAAGACTTTACAACTGAATAATGGTAGTGGCACAACCAAGATTGAATTCCAATCTACAACTGGTAACGGATCTCTTGCTGGTATTCTGGATGTAACTGGAAACCTTAACGTTAATACTGATAAGTTTAATGTTATTGCTGCTTCAGGTAATACATCTATTGCTGGCACATTAGGTGTTACAAGTATCGCAACCTTCTCTAATAATATTGATGCTAACGGTGATGTTGCAATTGCAGGTAACATTCACTCCGAGAGCACCAATGATATCACAGTTCTTAAGAACTCAGGAACAGGTATTTGGGAGATTCAGTCTAATGACTATGGTTCGCTGAAAGTTGATGGTGGTGCATATGTTGCAGGATCTGCTCTGATTGATGGCACACTCCATGTTAACGGTGCTATTGAAGTTAAGGATAGTGCGACAGAGACTGAATCTAGACTTAACTGGTTGCAAGTAAGATACAGAGGTCGTTTCGGTGATTCTTATCAGGCAACTCCTTCTTATGCATCTCACAATACCACAACTATCAGAGCACATGGTGGTGCTGGTATTGAAAGATCTCTACATGTTGGTGGCACAGGAACTGGTGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAGAGATACTCTGGAGATACTCAGAAGTTTTCTGTTCTTGGTGCATCTGGCAATACAACAATTGAAGGCACACTAACTGTTAATGATAATGTAAACTTCAATGGCACTCTTGATCAAGACGGTGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACAACGGATAAATTCTTTGTTGCTGCTACCTCAGGCGATACAAATATTGAAGGCACACTGACTGTTGATGGTCACACTGAGTTAAATTCAACTCTTAATGTTGATAACAATGTCACACTTGGTGCTCAGTTAACAGTTACTGGTACAACTGAGTTTAATAATACTGTTGATGTTGATGCCAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAGCACTGATAAGATGACCGTTGCCTCTTCTTCAGGTAACATTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACTATCAATGATTCACTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTCTTCTCTGTCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGACAATGGCAACACAAACATCATTGGCACACTGACTGTTGGTGATGCGGTTCAGATCAATGATACCTTAGGCGTCTCCGATGTTGTAACCTTTACTAGAAACACACAACAATCTATCACTGGCAACTCCATCAGTCTGGATGGTGCCGTAAGAATGTCTGGTGGTCTTGGTGTTTCTAAGAACCTGGCAGTCGGTGAAAACTTAGTTGTTTATGGTGACTTTAATATCATTGGTGATACGGTAGTCAATGGTACTACCACTTATAATGCAAAAATTGATATTACAAATACTGCTGAAGCAGATTCTCTTGGTGATAGTAACGTTGCATTCCAAGTTGATGGTGGCGGTATTATCAGGAAGAAACTCTGGGCAGGAGGAGACTTCACTGTATATGATGATGCAAACTCCAGAAATGCATTCTTTGTCGATGTAAGCACTGGTGATGCAACTTTACACAATGACCTTACAGTTGGAGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCGACAACTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTATGACAGCACTGCGAAAGTGGGTTTCTTCGGACTCGACAGATCGTCGTTAGAATATGTCTTCCTTAATGATGCAACTAACTCATCAGAAGTTCTTTCTGGTACTGATGGACAACTTCGTGCTGGTAGTTTGAATCTTACTGGCAGTGGCACATCTCTTGATGTTGATGCAAATGCAAACATTGATGGCACCCTGACTGTAGATGGTCAGATTATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTGCTGCTCTAGTCATTCCTAACACGACTAAGATTAACAACCTGAATGCTGACCTTCTGGACAGTATGACAACTGCTTCTACAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTTAAAACGGCAAGAAATATTACAGTTGCTGGTGTTGTTTCTGGAGATGCTGAGTTTAATGGTTCTGGTGATATTACGATCACTACATCATATGTTGACGCAGACATTACTGCACTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGAACTGCTGCTAACACCTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTATTACCAACGCAGATGGGGTATCTGGCGATATCACCCTTAACGTCGCTTCTACGAGCACTAACGCATCCAATAACCTTGTCCTTCGTGATGCATCTGGTGACTTTGCTGCAAACGAGATCACTGCTGATCTGGTTGGTGGTGTAACGGGTGACGTTGTTGGTAACGTAACTGGTAATGTTACAGGACAAACTTCTGACATCAGCAACCATGATACTGGTGATCTTACAGAGGGATCCAATCTTTACTATACAGACGCTAGGGCAGATGCAAGAATTGCTGCTGCTGACACTGATGCATTGAGTGAGGGTTCTACCAACCTTTACTACACCGATGCTCGCGCTGATGCACGTATCGCTGCTGCTGATACTGGAGATCTTACAGAGGGATCTAACCTCTATTATACGAATGCTCGTGCTGATGCAAGAATTGTTGCTGCTGGACTTGACGGTGGCACTCTTACTGGTGATGTCACAGGTGATGTCACAGGTAATGTTGATGGTAATGTTTCTGGTGAAGTTACATTAGAGGGTGCTGCACCCGCCAGTGCTACTGCAACTGGAACTGCAGGTGATATTCGTTACGATGCTGATTATATCTACATCTGTGTTGCTACTGACACCTGGAAGAGAGCAGCAATTTCTACCTGGAGTTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.