Protein
- UniProt accession
- A0AAU8EHZ9_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Major tropism determinant N-terminal domain-containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9368
- Protein sequence
-
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGIELDTGRFKIGDGVSAWNTLRYERPVESTSNTANTLVQRDADGNFSAGTITATLIGNASTAARLASTRQIQLSQDITASGVFDGSANLNLNAELTLVSTLPHYDGTGTPTGTYTSVTVDAKGRIINASNPSTLAAYNLDGNVEGSSAQPYDLDLAAISGLTTTGIISRTSGGSMATRTITGTATRIAINDGAGISGNPTIDLIVTAVTPGDYNTESLTSVSGVGGNSEPFGTETVNATKFTVDAYGRLTSATNVPIATATEGSKYATYNAGTSYSRYDIIEEGGNVYQAIQDILAGSGAPAHTDGSDTGGWRFLAAAATEQKGLASFAQEDFDVDNNGHVTIAAQGVDNTQLQNNRISFADGNTKEDFELDQELTSTTGYRGFNYLNYVKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGELDINVRSYFSDPDITLDGVVAQTLDKTGDGDLTLQLTQNTASNRNFNILTTNAGAGTSNIIVTAEDTVQISASDAAGKVHVEDARFQDNYIATANATMNLDPGDDRAVTGLVRVWGDLQVDGVTTTVNSTTMTVDDVVLTLGGDTAPASDDNLDRGVEFRYYDTQARLGFYGWDTNYTDLSGHEGGYRFLHAATNTSETFAGTDSGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDTMVLRGASKSLQFQNGTGTVKSEIHTTSGNAEFGGILTITGATDLNSTLNVAGFTYLENTNEPQIALNGSTGLYEIQNSDYGAFRFDGGGYIEGDFMFNSDVYVNGQIVQKEDNTAVFNRQNYLLVRYKLYTGSSAAYTPSYATDSTTNLFVYGGAGITTSLHVGGTGAGEGLFVGKENSGDTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGQVTIQDSVIINAANEVFSIRNGSGVAKFDVDTDNGNTLIEGTLNVNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTTIQGTLNSVGAVDFDSALNVDGNTTLVGTLTVTNTSEFNNTVDVDADFAVRTGAGVDKFTVASVSGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIVGTLTVGDATQINDTLGVTGVTSITNSTGQTLTGTYGADGAVRITGGVGIGENLAVAGNMRVFGDFEITGSTTQSGNTGFSGRVSITNTQDVTSFADNNVAFTVDGGTRISKNAYIGGDFHVWDDVNSRDAFYVDVSTGDATLHNTLTVGGNLVVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGYDRSSDQYAFLVDATNNAEVHTGTDASVRAGSLRLTSAGTALDVDNNANIDGTLTVDGQITSNVATGSAPFVVASTTKVINLNADLLDGLTTATAATANTVVIRDASANFAANAITMATGTITGAATIGTTLGVTGATTLSSTLGVTGATTLSSTLGVTGVTTLTGLLNANGGIAVDTNNFTVDGVTGAVVTASTLSVGSTSSFTGAITATGGVIGNITGNLVAAISTGKNFNPETDSTYNLGASTLRWATAYVDSLNAGTSITTAGTLSVTGTSTFTGEISANGGIALQDTDKATFGNDDDMQIYWSGTQNRIDTEGPFQIRNSNASSGISFYDGDNTNFMFKALPLGAIELYHNGTKTFETTATGATLTGVLVATSLTGDVTGDVTGTVSDISNHTTDALAEGSTNLYYTDERVDDRIDALFVASTGITKVYDDAAGTYTLSVTQADINTDNVTEGSTNLFTTAARTRTHFTYGTGIEHDGSGTLSVTQADINTDNVTEGSTNIFYTEARFTTSLGTKTTTDLTEGTNLYYTDARADARIAAATTDDLSEGATNLYYTDARADARIAAATTDDLSEGATNLYYTDARAEASFDTKIAAATTDDLSEGATNQYYTEARVQTKLDNAFAQLQAMLNNLATTTTLTLNLSGDPTPGAVVTAGAVTEGGVGGFTAGTGVATTGGTGNGLTVDTTVVNGEITAVAVNAGGSDYLIDDTITITNPNAGGVASFNFGTLGGGTGYTTATNVPAVSVGGSGTNLTVDITASGGVITNVVVNNPGTGFTENELVFINQAGGSDGSIRVATVYGDATFALADITTMEVGATVTGATTGTTGVITALGTNQITVDTVSGFFKVGEVVSANDVTTLTIQSFG
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2177 AA molecular weight: 223714,00300 Da isoelectric point: 4,09539 aromaticity: 0,06936 hydropathy: -0,11576
Domains
Domains [InterPro]
IPR041352
5–43
5–43
1
2177
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Synechococcus phage QB2 [NCBI] |
3159453 | Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XCH00510.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PP861117
[NCBI]
CDS location
range 162307 -> 168840
strand +
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGAAGAGGTGGCGCTCAGGAATGGGCAAACGCTAACCCAACCTTGGCACAAGGTGAACTCGGAATCGAACTTGATACTGGTCGTTTCAAAATCGGTGACGGTGTTTCTGCTTGGAACACGCTGAGATATGAGCGTCCTGTTGAGTCTACCTCTAACACGGCAAATACTCTTGTGCAGAGAGATGCTGACGGCAACTTCTCTGCAGGTACAATTACCGCAACTCTGATTGGTAATGCTTCTACTGCTGCACGTCTGGCATCTACCAGACAAATTCAGTTATCTCAAGACATCACTGCTTCTGGTGTTTTTGATGGTTCTGCAAACTTGAACCTCAATGCAGAACTCACGCTTGTGTCAACTCTGCCTCATTACGACGGTACAGGAACACCTACAGGAACATACACCTCTGTTACTGTAGATGCGAAAGGTAGAATTATTAATGCTTCAAATCCATCTACCCTTGCTGCATACAATCTTGACGGTAACGTAGAGGGTTCTTCTGCACAACCTTATGACCTCGACCTTGCTGCAATTTCTGGTCTGACTACTACTGGTATTATTTCCAGAACTTCTGGTGGTAGCATGGCAACCAGAACTATTACTGGTACTGCAACTAGAATTGCTATTAACGATGGTGCTGGTATTTCTGGTAACCCAACAATTGACCTTATTGTTACAGCAGTAACACCTGGTGACTACAATACAGAATCCCTAACATCTGTAAGTGGTGTTGGTGGTAACAGCGAACCATTTGGTACAGAAACTGTAAACGCTACGAAATTTACAGTTGATGCTTATGGTCGCTTAACAAGTGCTACAAATGTGCCTATTGCTACTGCTACTGAGGGTAGTAAGTATGCTACATACAATGCTGGGACATCTTATTCCCGATATGACATCATCGAAGAAGGTGGTAACGTCTATCAAGCCATTCAAGATATTCTTGCGGGTTCTGGTGCCCCAGCTCATACTGATGGCAGCGATACTGGAGGATGGAGGTTCCTCGCGGCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGATTGGCTTCCTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAACAACGGGCACGTTACCATTGCCGCCCAAGGTGTAGATAATACTCAATTACAGAATAATAGAATTTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAACTTGATCAAGAACTTACTAGCACCACTGGATACCGAGGATTCAATTATCTTAACTACGTCAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATTTACTTGTTGGCGCTAATAATACAGGGGACGGCGGAGCTGGGGAACTTGATATCAATGTACGCTCGTACTTCAGCGATCCTGATATCACTCTTGATGGTGTTGTTGCTCAGACCCTGGACAAAACTGGAGATGGTGACCTCACTCTTCAATTAACACAGAATACTGCTTCCAACAGAAACTTCAATATCCTGACAACCAATGCTGGTGCAGGAACTAGCAATATTATTGTTACTGCTGAAGATACTGTTCAAATTAGTGCATCTGATGCAGCAGGTAAAGTTCATGTAGAAGATGCACGTTTCCAAGATAATTACATCGCCACAGCGAATGCGACGATGAATCTTGACCCTGGCGATGATCGTGCCGTAACTGGTCTGGTTCGTGTCTGGGGTGACCTCCAAGTTGATGGTGTAACAACAACTGTCAACTCAACAACCATGACAGTAGATGATGTTGTCCTTACTCTTGGTGGTGACACCGCTCCTGCATCTGATGACAACCTCGATCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTATGACACTCAAGCACGTCTTGGTTTCTACGGTTGGGATACTAACTACACTGATTTAAGTGGTCACGAAGGCGGTTATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTAGCGAAACTTTTGCTGGTACTGATTCTGGTATTATTGCTGGTAACCTTAAGTTAACAACTAACACCAACTCCACTTCAAATACGACTGGCGACTTGGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAATATCGGTGGTCTGCTAGATGTTGATGGCACCTTCCGTGCTAACAGCACTTCTCGCTTTGATGACACCATGGTTCTTCGTGGTGCATCTAAGTCACTTCAGTTCCAGAATGGTACTGGCACTGTTAAGTCTGAGATTCACACAACTTCTGGTAATGCTGAATTTGGTGGTATTCTTACTATAACTGGTGCTACCGACCTCAATAGCACACTGAATGTTGCTGGATTTACATATCTGGAAAATACCAACGAACCTCAGATTGCACTGAACGGGTCAACTGGTCTCTATGAGATTCAAAACAGCGACTACGGTGCATTCCGATTTGACGGTGGTGGATACATTGAAGGTGACTTCATGTTTAACTCCGATGTATACGTCAACGGTCAGATTGTTCAGAAAGAAGATAATACAGCAGTCTTCAACAGACAGAACTATTTGCTGGTTCGTTACAAACTGTATACTGGTTCTTCTGCTGCATACACACCATCTTATGCAACAGATAGCACCACCAACCTCTTTGTTTATGGTGGTGCTGGTATTACTACAAGTTTACATGTTGGTGGTACAGGTGCTGGCGAAGGTCTGTTTGTTGGTAAAGAGAACTCTGGCGATACTGTTAAGTTCTCTGTCTTGGGTGCATCTGGCAACACTGACATTGAAGGTACTCTGAACGTTGAAGGTCAAGTAACTATTCAAGATAGTGTAATCATCAACGCTGCAAATGAAGTCTTCTCTATTAGAAATGGTTCTGGCGTTGCAAAGTTTGATGTTGATACTGACAACGGCAATACTTTAATTGAAGGCACTCTGAATGTTAATGGTACAGTTGATGTTGATGCGGACTTCGCTGTTAGAAACGGCACAACTGATAAGTTCTTTGTTGACAACGTAACTGGTAATACGACAATTCAAGGCACTCTCAACTCTGTTGGTGCAGTAGACTTTGATAGTGCCCTCAATGTTGATGGCAATACAACTCTGGTTGGCACTCTGACAGTTACCAATACTTCCGAGTTTAATAACACTGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCAGTTAGGACTGGCGCTGGTGTTGATAAGTTTACTGTTGCTTCTGTATCTGGTAACGTTGCAACTGACGGCACACTGGTTGTTCAGGGTCAGACAACTATCAACGATTCTCTGATTGTTGATGCTGCTAACGAAGTCTTCTCCATCAGAAATGGTTCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCAGATAACGGCAATACAAATATTGTCGGTACACTAACTGTTGGTGATGCAACTCAGATTAACGACACTCTGGGTGTTACTGGTGTTACTTCCATCACCAATTCTACTGGTCAAACTTTAACTGGAACTTATGGTGCTGACGGCGCAGTTCGTATTACTGGTGGTGTTGGTATTGGAGAAAATCTCGCTGTTGCTGGCAACATGCGTGTCTTTGGTGACTTTGAAATCACTGGTTCTACCACTCAGTCTGGTAACACTGGATTCAGCGGTCGTGTTTCGATTACTAATACACAGGATGTAACATCTTTTGCCGATAACAATGTTGCATTTACTGTAGATGGTGGTACTAGAATTAGCAAAAACGCATACATTGGTGGCGACTTCCATGTTTGGGATGATGTAAACTCTAGAGATGCATTCTATGTTGATGTAAGCACTGGTGATGCAACTCTGCACAATACACTGACAGTTGGAGGAAACTTAGTTGTAAATGGAACGACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGCTTCTTCGGATATGACAGATCCTCCGACCAATACGCATTCTTAGTTGATGCAACTAATAATGCTGAAGTTCATACTGGTACAGATGCTTCAGTTCGTGCTGGTTCTCTGAGACTCACTAGTGCTGGCACGGCACTTGACGTTGATAACAATGCCAACATCGATGGTACTCTGACCGTTGATGGTCAAATCACTTCTAACGTTGCTACAGGAAGTGCTCCCTTTGTAGTTGCTTCTACTACCAAGGTTATCAATCTAAACGCTGACCTTTTAGATGGTCTGACGACTGCAACAGCAGCAACTGCAAATACAGTTGTAATTCGTGATGCATCTGCTAACTTTGCTGCTAATGCCATTACTATGGCAACAGGCACAATCACTGGTGCGGCGACGATTGGTACAACTCTCGGTGTCACTGGTGCAACAACATTAAGCTCCACACTTGGTGTTACGGGTGCAACGACACTCAGCAGCACCTTAGGAGTTACTGGTGTTACTACACTTACTGGTCTTCTCAATGCTAATGGTGGCATCGCAGTTGATACAAATAACTTCACTGTTGATGGAGTAACTGGTGCAGTTGTAACAGCAAGCACATTGAGTGTTGGTAGCACGTCTTCCTTTACAGGTGCTATTACAGCAACTGGTGGAGTTATTGGTAATATTACTGGTAATTTGGTTGCTGCTATTTCTACTGGTAAGAACTTTAACCCAGAGACTGATAGCACATACAACTTGGGTGCTAGCACACTGAGATGGGCAACTGCATATGTTGATTCTCTTAACGCTGGTACATCCATTACAACTGCTGGCACTCTGTCTGTAACAGGCACTTCCACCTTTACTGGTGAGATTAGTGCTAATGGTGGCATTGCTCTTCAAGATACCGATAAAGCGACATTCGGTAATGACGATGACATGCAGATTTACTGGAGTGGAACTCAGAATAGAATTGATACTGAAGGTCCTTTCCAGATTAGAAATAGTAATGCCTCTTCTGGTATTTCCTTCTATGATGGTGACAATACTAACTTTATGTTCAAGGCGTTACCTCTGGGTGCGATTGAACTCTATCATAATGGTACAAAGACCTTTGA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Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.