Protein

View in Explore
Genbank accession
YP_004301553.1 [GenBank]
Protein name
tail protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MLKVSDAFQNAFKADLREIKMRITINKKVYTQDDLNSFSYEGGSIAGESFMIGSVFSNSIKITLDKVVEGLKELDEINPEIGIKLPNGTIEYVSMGIFIINSRVDPDRNENKTTIEAADKFIMMGGVYVSKLKYPAKIKAVALEIANLSGIKVNTTTISRLSAAKITKMEGYTYRQAIGLIAQFESGYALFDRAGLLDIRNMFDAAANTEYVITPDTYFQKGLVKNEMLYRLGGISCKVPGNDDTEEKVLRAGSETGAQIELENKVMTQTLLNTIYQKIKNINYFPYTLKWRGNPALEAGDWIRMSDVKGNTFKVPNLDYKIEYTGGLSADSSAETTTQSDASYSYKGTLSQKIEELSGRVDAAGGNVINEGLDEPKNPKEGDLWFKPNGPDTEIWVYQRIGDTDKFEWVFRVTTAEDPVIKETIEQAQQDIIKAKEEAAKAQQKADEAQKKADESVKKANESTKKADEAQKKAQEGFDKGQEAIDDLANLKIGSNNLLPNSSFKFGFDNWEGSTASPYFIRDAESDYPSASILRILKNNDVSSAKSNAPIKIGLQKQYTISFDIRFIDNVPEQNKSIFIVRTFINATLPNTEGNAKQQRVITTSELGNKLSTGVWYRTSVTVNVEADFLRVVAHNSDTTATVTTDYRRIQVEEGNIATDWTESSSDIDKAVLLVDNKTGAIAGRVTDAEGNITTLTATAQGLQTSVKNKADSSTVTQLANLVNTKVSNADFESNKTQTAELISASVKNKADSSTVTQLANVVASKVSNADFESNKTQTAELISSKVEGLTIGESNYLYDSNFKSGAKNLINTSSVQARNIWRNSTTNGTIKSIVPMIENGFTAALKFKSAGTGQHMVAQDFIPCKKNQSVVLSGWFKAKAAGQGIQVQVGQGNAASDLDTYKGATFVASKANTWQKFEFVKVTDADTFTGVFLGGHNQIASEVWFANVKLEKGEKSTPWSESDFELASQSQVSQLADNINLKVDKDGIINQINVSPEGILIAGENVWISGKTKIDDAVIKNAMIDSLSANKLTAGTIDAGKINVINLNASNISTGIITGANLAINLNSGEVTFQKGIIQRADKLFSIDVTEGVIESYDRNGGFTISKGEITLNSSPGLTIGNSKKYGTITYKWRLLDASGLALIGEDGYSLGTSNAVKNIANSTVNQGSSISGNKEGYLNVFSRQVINLSSGDLYSYGSLNSKSLASIEIGNTSRNKSEVAISANIITLSATSGDHILLSSDSTGALVKSMVIYNRTYATAANVYITQYGNMGRSTSASKYKLAIEEDKTDNYKNILKLKHKTWYDKANTEAYARALDNKDTFDWDNPEDEVLPVERIHGLIAEDLVEAGLTEFVSYGELNDDGTKEVEGIQYDRLVVPLLQIVKDHQIEIEKLKERII
Physico‐chemical
properties
protein length:1400 AA
molecular weight: 152925,61840 Da
isoelectric point:5,28383
aromaticity:0,07643
hydropathy:-0,36100

Domains

Domains [InterPro]
DC_1421
STR
1–676
DC_1421 DC_0469
IPR021793
Unmapped
421–481
IPR021793 DC_2041 IPR012892 IPR030392
Coil
Unmapped
425–473
Coil
YP_004301553.1
1 1400
Architecture
STR
RBD
CHP
STR 1-834 | RBD 857-1381 | CHP 1382-1399 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Brochothrix phage BL3
[NCBI] 		764562 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Brochothrix thermosphacta
[NCBI] 		2756 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Bacillota > Bacilli > Bacillales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_004301553.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_015254 [NCBI]
CDS location
range 15659 -> 19861
strand +
CDS
ATGTTAAAGGTGAGCGATGCTTTTCAAAATGCTTTCAAAGCAGATTTAAGAGAAATAAAGATGCGAATCACTATCAATAAGAAGGTATACACACAAGATGATTTAAATTCGTTTAGTTATGAAGGCGGCAGTATAGCTGGTGAAAGTTTTATGATTGGTTCAGTATTTTCCAATTCAATAAAAATTACCTTAGATAAAGTTGTTGAAGGTTTAAAAGAACTTGATGAAATTAACCCGGAAATCGGTATTAAATTACCTAACGGTACAATCGAATATGTATCAATGGGAATTTTTATCATTAACAGTCGTGTTGATCCCGACAGAAACGAAAACAAAACGACGATAGAAGCTGCTGACAAGTTTATCATGATGGGTGGGGTTTATGTATCTAAACTAAAATATCCTGCTAAAATCAAAGCCGTAGCGCTTGAGATAGCTAATTTAAGTGGTATTAAAGTGAACACTACAACAATCTCCCGTTTAAGCGCTGCTAAAATAACTAAAATGGAAGGTTACACTTATAGACAAGCAATTGGTTTGATTGCTCAGTTTGAGAGTGGTTACGCGCTGTTTGACAGGGCAGGGTTACTTGATATACGCAATATGTTTGATGCAGCAGCTAATACTGAATATGTCATTACACCTGATACCTATTTTCAAAAAGGTTTAGTGAAAAACGAAATGTTATATCGCTTAGGTGGTATATCTTGTAAAGTTCCAGGTAATGACGATACGGAAGAAAAAGTATTGCGAGCAGGTTCAGAAACAGGTGCGCAAATCGAACTAGAAAACAAAGTCATGACACAAACCTTATTAAATACTATTTACCAAAAAATAAAGAACATCAACTACTTTCCTTACACTTTAAAATGGCGCGGGAATCCTGCACTTGAAGCGGGTGATTGGATAAGGATGTCTGATGTCAAAGGTAATACATTTAAAGTTCCGAACCTTGATTACAAAATTGAATATACAGGCGGGCTAAGTGCGGATAGTAGCGCTGAGACAACCACTCAATCAGATGCAAGTTACTCTTACAAAGGTACATTGTCTCAGAAAATAGAAGAATTATCAGGTCGTGTTGATGCGGCAGGGGGGAATGTTATTAACGAGGGTTTGGACGAACCGAAAAATCCCAAAGAAGGTGATTTATGGTTTAAGCCTAACGGACCAGATACGGAAATTTGGGTGTATCAACGTATTGGTGATACTGATAAATTCGAGTGGGTATTTCGAGTTACAACTGCTGAGGACCCGGTAATCAAAGAAACAATAGAACAAGCGCAACAAGATATTATTAAAGCAAAAGAGGAAGCAGCTAAAGCGCAACAAAAAGCCGATGAAGCTCAAAAAAAAGCAGATGAATCTGTAAAGAAAGCTAATGAATCTACAAAAAAAGCTGACGAAGCTCAAAAAAAAGCGCAGGAAGGATTCGACAAAGGACAAGAAGCAATTGATGATTTAGCTAACCTTAAAATAGGGTCAAACAACTTATTGCCGAACTCCAGTTTTAAATTTGGTTTTGATAACTGGGAAGGTTCTACAGCCTCGCCTTATTTTATCAGAGATGCAGAGAGCGATTATCCGTCAGCATCGATTTTAAGAATTTTAAAAAATAACGATGTATCTTCAGCAAAAAGTAACGCCCCGATCAAAATTGGATTACAAAAGCAATACACTATCAGTTTTGACATACGTTTTATTGATAATGTGCCAGAACAAAATAAAAGTATTTTCATTGTTAGGACGTTTATAAACGCAACATTACCTAATACCGAAGGAAACGCCAAACAACAGAGAGTTATCACAACGAGCGAGTTAGGTAATAAACTATCAACAGGAGTGTGGTATAGAACAAGTGTAACAGTAAACGTAGAAGCTGATTTTTTAAGAGTTGTTGCACACAATTCCGACACTACAGCAACCGTCACAACAGACTACCGCCGCATACAAGTCGAGGAGGGTAATATTGCCACAGATTGGACGGAATCATCGTCTGACATTGATAAAGCAGTCTTGCTTGTTGACAACAAAACAGGAGCTATCGCTGGTCGTGTCACAGATGCTGAGGGCAATATAACGACACTAACAGCGACAGCGCAAGGTTTACAAACAAGCGTTAAAAATAAAGCAGACTCATCAACAGTTACGCAGCTGGCTAACTTAGTTAACACAAAAGTCAGTAATGCGGATTTTGAGAGCAATAAAACGCAAACAGCAGAGCTTATTAGTGCAAGCGTTAAAAACAAAGCAGACTCATCGACAGTGACTCAGTTAGCTAATGTCGTTGCTAGCAAAGTAAGCAATGCGGATTTTGAGAGCAATAAAACGCAAACAGCAGAGCTTATTAGTAGTAAAGTGGAAGGTTTGACTATTGGAGAGTCTAACTATCTCTACGATAGCAATTTTAAAAGTGGCGCTAAAAACTTGATAAACACATCGTCAGTACAGGCGAGGAATATTTGGCGTAACAGCACGACTAACGGAACAATAAAATCTATCGTGCCAATGATTGAAAATGGATTTACTGCCGCCCTCAAATTTAAAAGCGCAGGCACAGGTCAGCACATGGTTGCACAAGATTTTATACCATGTAAAAAAAATCAATCTGTAGTTTTATCGGGTTGGTTTAAAGCTAAAGCTGCTGGACAGGGTATACAGGTGCAAGTCGGACAAGGTAATGCAGCAAGTGATTTAGACACGTATAAAGGTGCTACTTTTGTGGCATCTAAAGCTAACACGTGGCAAAAATTCGAATTTGTAAAAGTGACTGATGCTGACACGTTTACCGGCGTGTTTTTGGGCGGACATAATCAAATCGCAAGCGAAGTTTGGTTCGCTAACGTAAAATTAGAAAAAGGCGAAAAGTCGACGCCTTGGTCAGAGTCAGATTTTGAGTTAGCTAGTCAATCACAAGTATCTCAACTAGCCGATAACATCAATCTAAAAGTTGATAAAGATGGAATCATCAACCAAATAAACGTGTCTCCTGAAGGTATCTTGATTGCAGGTGAGAACGTTTGGATAAGCGGTAAAACTAAGATTGATGATGCTGTTATTAAGAACGCAATGATTGATAGTTTATCAGCTAACAAACTAACAGCTGGAACGATTGATGCAGGAAAGATAAACGTTATTAATCTCAATGCTTCAAATATAAGTACGGGTATTATAACAGGTGCTAATCTTGCGATTAACCTTAATTCAGGGGAAGTTACTTTTCAAAAAGGCATTATACAACGTGCTGATAAACTATTTTCTATTGATGTTACTGAAGGGGTTATCGAATCCTATGATAGAAATGGTGGATTTACAATTTCAAAAGGGGAAATAACTTTAAATAGTAGCCCCGGACTAACTATAGGTAATTCCAAGAAATATGGAACTATAACATACAAATGGCGGCTTCTCGATGCAAGTGGATTAGCTTTAATCGGAGAAGATGGTTATTCTTTAGGAACTTCTAATGCAGTTAAAAATATAGCTAATTCGACAGTGAATCAAGGTTCTTCTATATCAGGAAATAAAGAGGGTTATTTGAATGTTTTTTCTAGGCAAGTGATTAACTTGTCCTCAGGCGATTTATATAGTTATGGCAGCCTTAATTCTAAATCACTTGCTAGTATAGAGATTGGAAATACTTCAAGAAATAAATCGGAGGTAGCTATATCTGCAAATATAATAACATTATCTGCAACAAGCGGGGATCACATTTTATTATCAAGTGACAGTACAGGCGCTCTAGTTAAGTCGATGGTTATATATAATAGGACATATGCAACGGCAGCAAATGTTTATATAACTCAATATGGAAATATGGGACGTTCAACGTCAGCTTCTAAATACAAGTTGGCTATCGAGGAAGATAAAACAGACAACTATAAAAATATTTTGAAATTAAAACACAAAACTTGGTATGACAAAGCTAATACAGAGGCTTATGCAAGAGCGTTAGACAACAAGGATACGTTTGATTGGGATAATCCGGAAGATGAAGTATTACCAGTCGAACGAATTCATGGTTTAATTGCTGAAGATTTAGTTGAGGCGGGTTTAACGGAGTTTGTTTCATATGGGGAGTTAAACGATGATGGAACAAAAGAAGTGGAGGGTATTCAATATGACCGCTTGGTAGTTCCATTACTACAAATTGTTAAGGATCATCAAATAGAAATAGAAAAATTAAAGGAGCGAATTATATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
67b37e8f15c374176bd57e657614d8a18b0df1094874e53c003db688245aaf9d
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7363
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Genome analysis of three heterogeneous Brochothrix thermosphacta bacteriophages Kilcher,S., Loessner,M.J. and Klumpp,J. 2010-10-15 — GenBank