Protein

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Genbank accession
YP_009814239.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,88
Protein sequence
MADISIPEGDNPVRYQASLGGNQKYRNMGNVSGQAYLVRGQVTNVYYQKGTLDFNTYGSSVTSGVTDGSGSAPIPVDFWGKNTDGKVFGCYRPVQKGSQILVAYIGGDTSRPIVIGVYPDNEASYELISPVHYNTGDDSTDDVQNDALGERKIYPNQQMMYESGKGDILRSMGGKSFLYISENGSGYLDDINYAYDEISDFYDADANEIEPTMTKAQSWLLVHEDNESDEASDGHRTRFYVNRSGELMVTFANKEDPNNIVVLEASKDSGFKLTKRFDNSNIKEDSEDYVQFGIGNGNNVSIKSVDSGDATSFYLDNGNIKFSTPNKGSITFDGISVNDLLGKVSDAETAANDAGTKADIAASAGAIAQSAASNAASQALAASQAGEDAKSAAVNAQAAGEDAKTQAEDTRNRIIYYSSISNEKDVAIPGKYIIVNTDTYIKNGTIKTAHIGDGAITNAKIANLAVGTAQLEDAAITRAKIGNLAVGTAQIEDAAITDAKVGDLSADHLNAGTIDFSVISGIHINASEIDVGKIVADQIFVNGLGDISKNLGTVTSGKITGTNVNDDINTVQSGVNDLNNPNLMSVIEKQTAAKQFAGLTSQYNVILARAKDDSISTTDLTTAYTNLDNFITPLLKDTTKASKIDRYTYNSLTYAYNTALSNVQAALKDAYNTDISNMYTSVEVASQAASSAAIVASQAATTGDNASHAAEQARIAASQAQSAGNNATSVANNASQAASGAVIAGSQAASNADKAITAASQAKSAGDNATSVANNASQAASGAVIAGSQAAVIANKASTVANEAKSAGDNATSVANTATSVANSAKSTADSTYAYANSEIAVQSNLIQWSINIIW
Physico‐chemical
properties
protein length:855 AA
molecular weight: 89216,34180 Da
isoelectric point:4,53299
aromaticity:0,06550
hydropathy:-0,29754

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Lactobacillus phage Iacchus
[NCBI] 		2315483 Uroviricota > Caudoviricetes > Herelleviridae > Harbinvirus iacchus >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_009814239.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_048084.1 [NCBI]
CDS location
range 25097 -> 27664
strand +
CDS
ATGGCTGATATTAGTATTCCAGAAGGTGACAACCCTGTACGCTATCAAGCATCATTAGGTGGTAACCAAAAATACCGTAATATGGGGAATGTTTCTGGTCAAGCATACCTTGTCAGAGGACAAGTAACTAATGTTTATTATCAAAAAGGTACTCTAGACTTTAATACGTATGGGTCTAGTGTCACTAGTGGTGTTACTGATGGTTCTGGTAGTGCACCTATTCCAGTTGATTTCTGGGGTAAAAATACAGATGGAAAAGTATTTGGATGTTATCGACCGGTGCAGAAAGGTTCTCAAATACTGGTAGCCTATATTGGTGGTGACACTTCTCGGCCAATTGTAATCGGTGTTTACCCTGATAATGAAGCTTCATACGAGTTAATTTCACCAGTGCATTATAATACGGGTGACGATAGCACAGACGATGTTCAAAATGATGCTTTAGGCGAGAGGAAAATATACCCTAACCAGCAAATGATGTATGAGTCTGGTAAGGGAGACATCCTCAGAAGTATGGGTGGCAAGTCTTTCTTATATATATCTGAAAACGGTAGTGGCTACCTAGATGATATAAACTATGCTTATGATGAAATTAGCGATTTCTATGATGCTGATGCAAACGAAATCGAGCCAACAATGACTAAGGCTCAATCTTGGCTGTTAGTTCATGAAGACAATGAAAGTGATGAAGCATCAGACGGTCACAGAACAAGATTCTATGTTAATCGTTCTGGTGAACTAATGGTTACCTTTGCTAATAAAGAAGACCCCAATAACATTGTTGTTTTAGAAGCTAGCAAAGATTCTGGATTTAAGCTAACAAAGAGATTCGATAATAGCAATATTAAAGAAGACTCAGAAGACTATGTTCAGTTTGGAATAGGGAATGGCAATAATGTTAGTATTAAGAGTGTTGACAGTGGAGATGCTACTTCTTTTTATTTAGATAACGGTAATATTAAGTTTAGCACTCCAAATAAAGGTTCAATAACCTTTGATGGCATATCAGTAAATGACCTATTGGGTAAGGTATCAGATGCAGAAACTGCTGCTAATGATGCTGGTACTAAGGCAGATATTGCAGCTAGTGCAGGTGCAATAGCCCAGTCAGCTGCTAGCAATGCAGCAAGTCAAGCACTAGCAGCAAGCCAGGCAGGGGAAGATGCCAAGAGTGCTGCTGTTAACGCACAAGCCGCTGGAGAAGACGCTAAAACTCAGGCTGAAGATACCCGAAACAGAATAATATATTATTCTTCAATTTCAAACGAAAAAGACGTTGCTATCCCCGGTAAATATATTATAGTTAACACTGACACCTATATTAAAAACGGTACAATTAAAACTGCGCATATAGGTGATGGTGCAATTACTAATGCTAAAATAGCTAACCTAGCTGTTGGTACGGCTCAACTAGAAGACGCCGCTATCACTCGTGCTAAGATTGGTAATCTTGCCGTTGGTACTGCTCAAATTGAAGATGCCGCCATTACTGATGCCAAAGTAGGTGACCTTAGTGCTGACCATTTAAATGCAGGTACTATAGACTTTAGTGTCATTAGTGGTATTCATATTAATGCTAGTGAAATAGATGTTGGAAAAATTGTTGCTGACCAAATTTTCGTTAATGGACTAGGTGACATTTCTAAAAACCTGGGGACAGTTACTAGTGGTAAAATAACTGGTACAAACGTAAATGATGATATTAACACTGTACAATCTGGTGTTAATGATTTAAATAATCCAAACTTAATGAGTGTCATTGAAAAGCAGACAGCGGCCAAACAGTTTGCTGGGTTAACCAGCCAGTACAATGTGATTTTAGCCCGTGCTAAAGATGACAGTATCAGTACAACTGATTTAACCACGGCCTATACTAATCTGGACAACTTTATAACGCCTCTACTAAAAGATACTACTAAGGCTAGTAAAATTGACCGGTACACTTATAATAGTCTCACATACGCTTACAATACGGCTCTAAGCAATGTACAGGCCGCCTTAAAGGACGCCTATAACACAGATATTAGTAACATGTATACTAGTGTTGAAGTAGCTAGTCAAGCTGCTTCTAGTGCCGCTATAGTCGCTTCACAGGCAGCCACAACTGGGGATAATGCTAGTCATGCTGCAGAACAGGCCCGTATAGCAGCTAGCCAAGCTCAAAGTGCTGGTAATAATGCCACTAGTGTTGCTAATAATGCTAGCCAAGCGGCTTCTGGTGCTGTCATAGCTGGTAGTCAAGCAGCATCAAATGCAGACAAAGCAATTACAGCTGCTAGCCAAGCTAAAAGTGCTGGTGATAATGCCACTAGTGTTGCTAATAATGCTAGCCAAGCGGCTTCTGGTGCTGTCATAGCTGGTAGTCAAGCAGCAGTTATTGCCAACAAAGCAAGTACAGTTGCTAACGAAGCTAAAAGTGCTGGTGATAATGCCACAAGTGTTGCCAATACTGCCACTAGTGTCGCTAATAGTGCTAAGTCGACTGCTGATAGCACCTACGCTTATGCTAACTCTGAAATAGCCGTACAGTCTAATCTCATCCAGTGGTCAATTAATATTATCTGGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
d41004a553670aa85a27fb2b06afd42d1d9dba0c85762132efbcb699ca93725a
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5747
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Lactobacillus phages that infect wine-derived L. plantarum strains Kyrkou,I., Byth Carstens,A., Ellegaard-Jensen,L., Kot,W. and Hestbjerg Hansen,L. 2018-12-03 — GenBank