Protein

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Genbank accession
AOV61782.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,94
Protein sequence
MGFYRKTLGVLSAASTDKDIVDFALTGTVFFTDVNLRKYFIADDNVVISSPGSNYSVGDYVSVPLLGGTGSGAVADIGVNDWVGSITNAGSGYTEGTYTSLYPYVISGAGNGDALVAISVNENGNISSFTVEQYGTGYTQGTVLGLYGATTSATTLSTVDFNVTVSDTSSILVNSAVTGTGIAEGTTVASVLDGTTVELSAYPEIDGASTLTFTPSYGGGNGFQFTISAINAVGTVTITDGGNGYAAGDTLTVADASLSVPIEYVVSDLSVQRLTFVETIPVGTFSIGGTLEISTLDGTQYNIVEIETSGGNITSVVLRDSFFGATETLAYNGSATPIYTVDVATSEFRAGIDIGDGNGVQFTPNLTLYEDATYEFTYSGSNTFALSQTQDGPGEYAPSTVVRDTENNTLTVSVTDSYPSTLYYFSTDNPNYGGSSSITIDPNNPSPPGTGFQLLVNTVTILDSIALDIIDGSVTALDVITTNLTATTGTVSTLTSTSGDITTLKITSLSDKGSGIAVTTGGSTNITLTPGNSLNVGGALSIESATGNLTTSGVLKSTGSFNSNDKLLISENSISSLGTSDVVLAPIANTNAKVSGTMSLIIPSGDISQRPQGAKAESGSIRFNTETQQYEGYNGIAAAWSSLGGVRDVDGNTYILAEEFTGANDNTFWFYNGGTNSLTISQSEINLKSANKFKSTDVTSYTPWAGNTYYGLGELLYQDLNVYEVTVAGLSDTIAPTHETGAVTANGGTPTIAGAIAAFTVSTPSGNNAVGTYSYDDTYGSAQFEIIFQLGTVEVNLLSQGSGGYSTSGGGVDNVITILGSLIGGTDGVDDLTITITEIAVALELTWYGTTAGNIEFEDVNEVIFTDSTIHASNTISGRNLLITGGEIEGDGDLSIKIPDGSNLVVTATGSLAVPVGDNLQRGTPVAGSIRYNNEINQYEGYNSAASNWSSLGGVRDVDGNTYIIPESSAGANENILYFYNNDDNTLQVTQSQVLFGTIDSISSTSNALNINVENVTFNNLHSGIDVSDATTTLVYSSVNNLDFGLSTGLTIDTVLRLTDAGEIFLNKGYGTGVFEGVKFIDAFLKTFELDDVQIKTDDVVLTKGTTDTGTVVLYDPVEAKSSKVIVTAYNTTTEDVHTEEISVIVKGSDLYTVEYGTNKTTNLFAAVVDLNATGKVRLSLALDSGIATGEIVNITVVRTNVKK
Physico‐chemical
properties
protein length:1204 AA
molecular weight: 125015,54270 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,08223
hydropathy:0,04410

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-WAM2
[NCBI] 		1815522 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Cymopoleiavirus > Cymopoleiavirus swam2
Host Synechococcus sp.
[NCBI] 		1131 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOV61782.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KU686211 [NCBI]
CDS location
range 81781 -> 85395
strand +
CDS
TTGGGTTTTTACAGAAAAACTCTTGGTGTTTTATCTGCTGCATCGACAGACAAAGATATTGTAGATTTCGCACTTACAGGAACTGTATTCTTTACTGATGTAAACCTAAGAAAGTATTTTATTGCAGACGATAATGTAGTTATTTCATCACCTGGATCTAATTACAGTGTAGGTGATTATGTCAGTGTTCCTCTCTTGGGCGGAACTGGTTCTGGTGCTGTCGCTGATATCGGGGTAAACGATTGGGTTGGTTCTATAACCAATGCTGGATCTGGATACACAGAAGGAACATACACTAGTCTATATCCATATGTCATTTCGGGTGCTGGAAATGGAGATGCCCTTGTTGCTATTTCTGTTAATGAAAACGGTAACATAAGTTCTTTTACTGTCGAACAATATGGAACTGGTTATACTCAGGGAACAGTTTTAGGATTGTATGGAGCGACTACCTCTGCTACTACACTATCTACTGTCGATTTTAATGTCACAGTTAGTGACACATCATCTATTTTAGTAAACTCTGCAGTAACTGGAACGGGAATTGCAGAAGGAACTACAGTTGCAAGTGTTCTCGATGGAACTACGGTAGAATTATCCGCATATCCAGAGATAGATGGAGCATCAACTTTAACTTTCACTCCATCATATGGTGGTGGAAATGGTTTCCAATTTACAATTTCTGCTATCAATGCTGTAGGAACAGTAACTATCACCGATGGTGGTAATGGATATGCAGCTGGAGATACTCTAACAGTAGCAGATGCAAGTTTATCAGTACCAATCGAATATGTTGTTTCCGATCTTTCTGTTCAAAGACTTACATTTGTTGAAACTATTCCTGTTGGCACTTTTAGTATTGGTGGAACCCTAGAAATTTCAACACTGGATGGAACACAATATAATATTGTCGAGATTGAAACTTCTGGCGGAAATATCACATCTGTCGTATTACGAGATTCATTTTTTGGAGCTACAGAAACATTAGCATATAATGGTTCAGCAACTCCTATCTATACAGTAGATGTTGCTACATCGGAATTTAGAGCAGGAATTGATATTGGAGATGGTAATGGAGTGCAATTCACTCCAAACCTGACTTTATATGAAGATGCTACGTATGAGTTTACATATTCTGGTTCTAATACATTTGCTCTCAGTCAAACTCAGGATGGTCCAGGAGAATATGCTCCATCAACAGTAGTTAGAGACACAGAGAATAATACCTTAACTGTATCAGTAACTGATAGTTATCCATCAACTTTATACTATTTCAGCACAGATAATCCAAATTATGGAGGATCTTCTTCCATAACTATTGATCCAAACAATCCATCTCCCCCAGGAACTGGTTTTCAATTACTTGTTAATACAGTTACTATCCTTGATAGCATTGCTCTTGATATTATCGATGGTAGTGTAACTGCACTTGATGTAATTACTACAAATCTGACAGCAACTACTGGAACTGTATCTACATTAACTTCCACATCTGGCGATATTACAACTCTTAAAATTACATCTTTATCAGACAAAGGATCTGGAATTGCTGTTACTACTGGTGGATCTACTAATATTACACTAACACCTGGAAATAGTCTCAATGTTGGTGGAGCACTATCGATTGAATCTGCTACTGGTAATTTAACCACCAGTGGAGTATTGAAGTCTACTGGATCATTTAATTCAAACGATAAATTATTAATTTCCGAAAATTCAATATCATCTCTAGGAACTTCTGACGTTGTTCTTGCTCCTATAGCAAATACAAATGCTAAAGTTAGTGGCACGATGTCATTAATTATTCCGTCTGGAGATATTAGTCAAAGACCACAAGGAGCAAAAGCAGAAAGTGGTTCAATTAGATTTAACACTGAGACGCAGCAGTATGAAGGATATAATGGTATTGCCGCAGCATGGTCATCTCTGGGTGGTGTAAGAGACGTTGATGGTAATACATATATTCTTGCTGAAGAATTTACTGGTGCAAATGATAATACTTTCTGGTTCTATAATGGAGGAACCAATAGTCTAACCATCAGTCAATCAGAAATTAATCTAAAGTCTGCTAACAAGTTTAAGTCCACAGATGTGACATCTTACACACCATGGGCAGGAAACACATATTATGGTCTTGGAGAATTGTTATATCAAGATCTTAATGTGTATGAAGTAACTGTTGCTGGTCTGTCAGATACAATTGCTCCAACACACGAAACTGGTGCCGTAACCGCTAATGGAGGCACACCAACTATTGCTGGTGCTATTGCAGCATTTACCGTTTCAACTCCATCTGGAAATAATGCGGTAGGAACGTATAGTTATGATGATACTTATGGTTCTGCACAATTTGAAATTATATTCCAACTTGGAACAGTTGAAGTAAATCTTCTAAGTCAAGGATCTGGTGGTTATTCTACTAGTGGGGGAGGAGTAGATAATGTTATTACTATTCTTGGTTCTCTTATTGGAGGAACTGATGGAGTTGATGATCTAACGATCACAATTACCGAAATTGCTGTAGCTCTAGAATTAACTTGGTATGGAACTACAGCAGGAAACATCGAATTTGAAGATGTCAATGAAGTAATCTTCACAGACAGCACAATTCATGCATCAAATACCATCAGTGGAAGAAATTTATTAATAACTGGCGGAGAGATTGAGGGAGATGGAGATCTTTCTATTAAAATTCCAGATGGTTCTAATCTCGTCGTAACAGCGACAGGATCTCTTGCAGTTCCAGTTGGAGATAACCTACAGAGAGGAACTCCTGTTGCTGGTTCTATTAGATATAACAATGAGATCAATCAGTATGAAGGATACAATTCTGCTGCTTCAAATTGGTCTTCTCTTGGCGGAGTAAGAGACGTTGATGGCAATACTTACATTATTCCAGAATCTAGTGCTGGTGCTAATGAAAACATTCTATACTTCTACAACAACGACGACAACACTTTACAAGTAACACAGTCACAAGTTCTGTTTGGAACTATTGACAGTATTAGTTCGACAAGCAATGCACTCAATATTAATGTTGAGAATGTAACATTCAACAATCTACATTCTGGAATTGATGTATCAGACGCTACAACTACTCTTGTATATTCGTCGGTAAATAATTTAGATTTTGGTCTCAGCACTGGTCTAACTATTGACACAGTGTTAAGACTGACTGATGCTGGCGAAATTTTCTTGAATAAAGGATATGGAACTGGAGTTTTTGAGGGGGTCAAATTTATTGATGCCTTCCTAAAAACTTTTGAATTGGATGACGTTCAAATCAAGACAGATGATGTAGTTCTAACCAAAGGAACTACTGATACTGGAACTGTTGTTTTGTATGATCCAGTAGAAGCAAAGAGTTCAAAAGTTATTGTAACAGCATATAACACAACGACAGAAGACGTTCACACAGAAGAAATTAGTGTGATTGTAAAAGGAAGTGACCTATATACTGTTGAATATGGAACAAACAAAACTACAAATCTTTTTGCTGCTGTAGTAGATCTTAATGCCACTGGAAAAGTTCGTTTGTCTTTAGCATTAGATAGTGGTATTGCTACTGGTGAAATTGTTAACATCACCGTAGTCAGAACTAACGTAAAAAAATAG

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
43fac854f4045a44bb5b804453428412afc349c865d84fbe2611643c349c539a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2707
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50