Protein

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Genbank accession
UPW37964.1 [GenBank]
Protein name
hypothetical protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,63
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,78
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKKGFAVIHDQRIWVAQRDIDAPAGTFVPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTVVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFTETLITKPFSYNMIIFANRLWHFWEAGNEERGVRVEPNTAQFQAQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDMIKTVDIDGLGSKFHLIVETFDASSALGKQGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESIIVFGPNNTTPQTINITLPTGVAQGDTVKIALNYLRKAQTVNIKAAVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGNLSYTPVIELSYIEDNTTGGKYWVVAQNVPTVERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQNTGFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETDAGVDDTTIITPKKLQTRQGTEDLSGIVKYVSTVGTTPADTRENVGTNVYNKNTTTLVISPKALDQYKADQNNQGAVYLATQAETDAGATNPGFSNSVVTPETLGARRSTDTNHGLIEIATQVEVNAGTDYTRAVTPKTLNDRKATEALSGIAEIATQVEFDAGTDDTRISTPLKIKTRFNNTARTSVSAASGLIESGTLWNHYTLDISEASNTQRGTARLATQTEVNVGTDDKTIITPLKLQAKKATESSEGIVKIATRAETITGTSIITAVSPGSLKWIVQSEPTWAATTTTRGFAKMSEGAITFVGNATAGSTQALDLYEKNSYAISPYELNKTLGNFLPRLAKAVDSDKLDNLDSTQFIRRDVAQDINAAMTFKQPVRIESTLTVTGVVNLSGSITSNNTTLTGSTTINSNSTVGALNYIEFTSESQGSGTWNSQHDSNVKAPVFLNITTPAGSSRYVPLIKQRYKDGTFTFGTLINEPTSNDEGAFILHYIDAIKTQRKWTFRRNGDLEITTGNFVLGDGSAIINGGLSVTKASGITTTGLVANSESRFEGAVTINNFLTVSNKTTLNNGLAVQKYARVAGDKTSDIYSRKPTMDTAGFWSVDINDSTTYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLVRGEEVKSPGTLTQFGNTLNSLYQDWITYPNTADGSTTRWTRTWQQNKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNASMSNLTIRDWLRIGNVRIVPDPVTRSVKFEWIDTP
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 140783,06170 Da
isoelectric point:5,47311
aromaticity:0,08133
hydropathy:-0,38071

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1139–1237
IPR048391
UPW37964.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-1138 | ATT 1139-1237 | STR 1238-1270 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_EcoM_ESCO10
[NCBI] 		2918865 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
UPW37964.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OM386655 [NCBI]
CDS location
range 138536 -> 142411
strand +
CDS
ATGGCTGATATTTTAAAACCTGCATTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCGGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTACTAGATGATGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAAGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAAAGGGTTTGCAGTAATCCATGACCAACGTATTTGGGTTGCTCAACGTGATATTGATGCCCCTGCTGGAACTTTTGTACCTGGTTATTGGACTGCCACTCGTACCGACCCTAAATGGATTACTGTGGCATCTCCTACACGCCAGTTGGCTTCCGGTGAATATATTGCAGTAGATTCAGCTGCAAGCTTTACTACATTTACGTTACCTCCGAATCCTACAGACGGGGATACCGTTGTAATTAAGGATATCGGCGGGCGAGTAGGTTATAATGAAATAAAGGTCCAATCTAGTTCTGCTCCGGGCGGTGGTAATCAGAAAATTGTACGTTTCGGTAACCAGTTCACTGAAACTCTGATTACTAAACCTTTTTCTTATAACATGATTATCTTTGCCAACCGTTTATGGCATTTCTGGGAAGCCGGTAACGAAGAACGCGGTGTTCGTGTAGAACCTAACACGGCCCAGTTCCAGGCCCAAGCAGGTGATAATGTTTTACGTCGTTATACTTCAGGCGCAGTAATTAAATTTACTCTTCCTAAGTATGCTAACCAAGGTGATATGATTAAAACCGTTGATATCGATGGCCTTGGAAGTAAGTTCCATTTAATCGTTGAAACATTCGATGCTTCGTCTGCTTTAGGTAAACAAGGTCAGCATAGTATGGAATTCCGTACCTCTGGTGATGGATTCTTCGTTTATAACTCTACAGAAAAATTATGGTATGTTTGGGATGGTGACCGTCAAACTCGACTGCGTGTTATTCGTGATGACGTAGAACTATTGGCTAACGAAAGTATTATTGTTTTTGGTCCTAATAACACGACTCCTCAGACAATTAATATTACATTACCTACCGGTGTTGCCCAAGGTGATACGGTTAAAATTGCTCTGAACTATCTTCGTAAAGCGCAGACGGTAAATATTAAAGCTGCTGTAGGAGATAAGATTGCTTCTTCTGTTCAATTGCTTCAGTTCCCTAAACGTTCAGAATATCCGCCTGATACTGAATGGGTGTTAAATGATGTACTAACCTTCAATGGTAATTTGAGCTATACCCCGGTTATTGAACTGAGTTATATAGAAGACAACACTACAGGTGGAAAATATTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCTACTGTAGAGCGTGTAGATTCTAAGGACGATTTAACTCGTGCTCGTCTTGGTGTTATTGCTCTGGCAAGCCAGACTCAAGCTAACGTTGACCATGAAAATAACCCTGAAAAAGAATTGGCTATTACTCCGCAGACTTTGGCTAACCGTGTAGCGACTGAATCACGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACAACTGCTCAAGTAAATCAGAACACCGGATTTGCATTCCAGGATGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCTACTGAAACTCGTCGTGGTGTCGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATGCTGGTGTTGATGATACAACCATTATCACTCCTAAGAAGCTACAGACGCGCCAGGGAACTGAAGACCTCTCAGGTATAGTAAAATATGTATCTACTGTAGGAACCACTCCTGCCGATACTAGAGAAAACGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACACAACTACGTTGGTTATTTCTCCTAAAGCTTTAGACCAATATAAAGCTGACCAAAATAACCAAGGTGCCGTATATCTTGCTACGCAAGCGGAAACCGATGCAGGTGCTACTAATCCGGGATTTAGTAACTCAGTTGTTACTCCTGAAACATTAGGTGCTCGTCGTTCTACTGATACTAATCATGGTTTGATTGAAATTGCTACGCAAGTTGAAGTCAACGCCGGAACTGATTATACACGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAAAGCTACTGAAGCTTTAAGTGGTATAGCAGAGATTGCTACTCAGGTAGAATTTGATGCTGGTACTGATGATACTCGTATTTCAACTCCGTTGAAAATTAAAACAAGATTTAATAATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGTGGTTTGATTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATCAGTGAAGCAAGTAATACCCAACGTGGTACAGCTCGTCTGGCTACACAAACCGAAGTTAACGTTGGTACTGATGACAAAACCATCATTACTCCTCTTAAACTTCAAGCTAAAAAGGCTACTGAATCCTCTGAAGGTATCGTTAAAATCGCTACGCGAGCAGAGACTATTACCGGAACGAGTATTATTACTGCTGTATCTCCAGGTAGTTTAAAATGGATTGTACAGTCTGAGCCGACTTGGGCAGCAACCACGACGACCCGCGGCTTTGCTAAGATGTCTGAAGGCGCAATTACTTTTGTTGGTAATGCAACTGCAGGTTCTACTCAGGCTCTTGACTTGTACGAGAAAAATAGCTATGCTATCTCTCCGTATGAGTTAAACAAAACCCTTGGTAACTTCCTGCCACGTCTGGCTAAAGCGGTAGACTCTGATAAACTGGACAACCTGGATAGCACGCAGTTTATTCGTCGTGACGTAGCCCAGGATATTAACGCTGCTATGACATTTAAACAGCCTGTAAGAATTGAAAGTACTTTAACCGTTACAGGTGTGGTTAATTTGAGTGGTTCTATTACTTCAAATAATACTACATTAACCGGTTCTACTACAATCAATAGCAATTCTACAGTAGGTGCTCTGAATTACATTGAGTTTACTTCAGAATCTCAAGGTTCCGGTACTTGGAACTCCCAACATGATAGTAATGTTAAAGCTCCTGTATTTTTAAATATAACTACTCCGGCAGGCTCATCTAGATATGTTCCTTTAATTAAGCAACGTTATAAAGATGGGACATTTACCTTTGGTACATTGATAAATGAACCCACCTCAAATGATGAAGGTGCTTTTATTCTTCACTATATAGATGCGATAAAAACCCAGCGCAAATGGACCTTTAGACGGAATGGTGATTTAGAAATAACTACAGGTAATTTCGTTCTTGGTGATGGGTCTGCTATAATTAACGGCGGTCTTAGTGTTACTAAAGCTTCAGGTATCACAACCACTGGGCTAGTTGCTAATAGTGAATCCAGATTCGAAGGCGCTGTTACTATTAACAACTTCCTTACGGTAAGCAACAAAACCACACTTAACAACGGCTTAGCTGTTCAGAAATATGCAAGGGTTGCAGGAGATAAGACTTCTGATATCTATAGTAGAAAACCTACAATGGATACCGCAGGTTTTTGGTCTGTTGACATTAATGATTCAACCACATATAACCAATTCCCAGGTTATTTCAAAATGGTTGAAAAGACCAACGAAGTAACAGGTTTGCCTTATCTGGTTCGTGGTGAAGAAGTTAAGTCTCCAGGTACTTTGACTCAGTTTGGTAACACTCTGAACTCACTTTACCAGGATTGGATTACCTATCCAAACACTGCAGACGGAAGCACCACTCGTTGGACCCGTACCTGGCAGCAAAATAAAAATGCTTGGTCTGGATTTGTTCAGGTATTTGATGGCGGTAACCCACCTCAACCATCTGATATCGGTGCATTGCCTTCTGATAACGCATCGATGAGTAACTTGACTATTCGTGACTGGTTAAGAATCGGAAACGTTCGTATAGTTCCAGACCCAGTAACTCGTTCAGTTAAATTTGAATGGATCGATACACCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
16b129dba0ef2c202be5b2c98086f2d10caa44c2fdf6854eeb0a01da6b57b7bb
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5519
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Avian Pathogenic Escherichia coli bacteriophages Nicolas,M., Trotereau,A. and Schouler,C. 2015-06 — GenBank