Protein

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Genbank accession
QGT54250.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,83
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MALDSNISRIKFMRSKTAGAVPSPTLLDEGELAINLVDRTIFSKNGANTVELGFGKGGTVAGPINVTGGNAVTAAQFNGALNGNAATASRLLTGRKINDVVFDGTKDITIEDSTKLYKSDVLTSTGSSRVIRDAATIRAATVAKGAVVIHLPKRANSVNTMMKLCIQGFDYVAGRATQSNWSVDISGYNYTGAAWHSYQAISTGGPAPFDTVRWGQAGDHQVIILGEGGASPSSWSYYNISIEKIYLTNSTEAYDDPNDPIYMAIEADISNYVINATLPLEGVAMAKRLETGRTFTFTGDARGSLTFDGTANVSTALTINSATTGQAGLVKLNNTLTSTSLTEALTANMGKILGDAVNTKVDKINPTSSGTLTHTGAASTSGLLNATGGISTSSLAISTGSISKTDGTGYLSFLQGGAALGINIGDLLVSNSYSDRSKIPINGAYLKGGLDADNVIRGATGTAYSSLTAIGVGISIPFKLKDTNIGTSYGFVPGFGMNVQTSGGYRQVVSIGAYRPGSNWTDSGVYIATGATNDGYSSEAFLLKSGRTISNTAGPINLIGNADTASNIDASTGSLVGDSSAGWRKLGRATVPQNGRALMLQIFGGTGFNAGVPTQAMCTEIVLKGGNSGPSSINMVVHVPDSSNILANLGKGVANACFVPVTGDDYDIYINCVGYLRAGIVAIKGALTDWALNFDVAGVSTKPTGAVDAAIYTKAYTTSNVASATKLQNPRTINGVNFDGTANIKIQQESVAIPANANLTNYTNEGFYVCEANATAVTIKGTPFNPSGTSSSALAFSLLVEKSAGVKQTYTSYASGATRTWVRGIYQGSPSAWREVAFCNSPTFVDTTTFNGPIVASSTLNVTGTAGFNSVSVNNLSASTTISAGTSLGIANTVATTKYGLSLYGGASAGKPSYGVLFTGTSNSDTGKHGDVNGQWSVYFTCATSGSEKRGWVFQRSSGGAGGAQNVASISTDGNMVINGNFDTASDNTMIRVGNNNDLAMIKKAGSSAFIAVGSNTAFRVLKSPIATVDPTQSYVNLMTVTTSGDLDLAGNNILIGSGTNNNTYQTIQFGNYTKSSSGGGFSVLQTAPVGGSQGRVLQLANYTQAGTIDSALHVNNSGTYQTVGSTTLKLATISDNVASATKLQTARTFQITGGITTNAVSFDGQQNVVLTASNVDGSKVSGVVPEAVKAQTLAVTPQKNAKLVASWKGTILQSMTPTLTIVDANTLRVRLADDNPGNRLAVLRFNVKIGTVYHLAFSDTMLPINGTVTFVQTGLTWVEVDLNAPNHGLSGSGLGVNVMAITYSAYGCYFEGTISQIIGTTGPQDSQWAYVLKLNSPTTDATYNLSGSSQDAIWVADKNIWYLNPAQPVITAGAMISPDRLNFFAADTDSSARMRSNMVTAQIWDIV
Physico‐chemical
properties
protein length:1408 AA
molecular weight: 145897,28900 Da
isoelectric point:8,10692
aromaticity:0,07528
hydropathy:-0,01271

Domains

Domains [InterPro]
DC_0964
STR
18–632
DC_0964 cd19958 DC_0339
IPR054500
STR
334–364
IPR054500 DC_0113
QGT54250.1
1 1408
Architecture
STR
STR
STR 18-896 | STR 1051-1408
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QGT54250.1
1 1408
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 645 645 0,1594
Central domain 646 862 218 0,2564
C-terminal 863 1408 545 0,7313
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-645
Central
646-862
C-terminal
863-1408

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Acinetobacter phage Stupor
[NCBI] 		2666260 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Acinetobacter baumannii
[NCBI] 		470 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Moraxellales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QGT54250.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MN662249 [NCBI]
CDS location
range 154091 -> 158317
strand +
CDS
ATGGCATTAGACTCAAATATCAGTAGAATTAAATTTATGAGATCTAAGACAGCAGGTGCAGTGCCAAGCCCTACTCTCTTGGACGAAGGCGAATTGGCCATTAACTTGGTTGATCGTACAATATTTTCAAAAAATGGCGCAAACACAGTTGAACTCGGTTTTGGTAAAGGCGGAACAGTAGCTGGACCAATTAATGTTACAGGTGGTAATGCTGTAACTGCTGCGCAATTTAACGGTGCGCTAAATGGCAATGCTGCAACTGCATCAAGACTTCTTACAGGAAGAAAAATTAATGATGTAGTTTTTGATGGTACTAAAGATATTACTATCGAAGATTCTACTAAATTATACAAATCTGATGTGCTAACTTCAACTGGCAGTTCTCGTGTTATTCGTGATGCAGCAACAATTCGTGCAGCGACTGTTGCTAAGGGTGCAGTAGTCATCCATTTACCGAAAAGGGCAAATTCAGTTAACACAATGATGAAATTGTGCATTCAAGGATTTGATTATGTTGCTGGGCGAGCTACTCAAAGTAACTGGTCTGTAGATATTAGTGGATATAATTACACCGGTGCAGCTTGGCACTCTTACCAAGCAATTTCAACTGGTGGTCCTGCACCATTTGATACTGTTAGATGGGGGCAAGCTGGCGACCACCAAGTTATTATTTTAGGTGAAGGCGGTGCATCACCTTCTTCATGGTCATATTACAATATTAGTATTGAGAAAATTTATTTAACTAATAGTACAGAAGCATATGATGACCCTAATGATCCAATTTATATGGCAATTGAAGCCGATATATCTAATTATGTGATAAATGCCACTTTGCCACTTGAAGGCGTTGCAATGGCTAAACGTTTAGAAACAGGACGTACATTTACTTTCACTGGTGACGCTAGAGGTTCATTGACATTTGACGGTACTGCAAACGTTTCTACTGCATTAACAATTAATTCTGCAACTACAGGCCAAGCTGGTTTAGTTAAATTAAACAATACATTAACTTCTACATCTCTCACAGAAGCGTTAACTGCTAATATGGGTAAAATATTAGGTGATGCAGTTAATACAAAAGTTGATAAAATCAACCCAACTTCTTCTGGCACATTAACCCATACCGGCGCAGCTAGTACATCTGGTCTATTAAATGCGACAGGTGGTATTAGTACATCTAGCTTAGCAATTTCCACTGGTAGTATTTCAAAAACTGATGGTACTGGTTACTTATCATTTTTACAAGGTGGTGCGGCATTAGGTATCAATATTGGTGATTTACTTGTTTCTAATTCATATTCCGATAGATCAAAAATCCCGATAAATGGTGCATATCTTAAAGGTGGGTTGGACGCAGATAACGTTATCCGTGGCGCAACTGGTACTGCTTATAGCTCATTAACTGCAATTGGTGTAGGTATATCAATTCCATTTAAATTAAAAGACACCAATATTGGTACATCTTATGGATTTGTTCCTGGCTTTGGCATGAACGTCCAAACATCTGGAGGTTATCGTCAAGTAGTTTCAATTGGTGCATATCGCCCTGGTAGTAACTGGACAGATTCTGGAGTTTATATTGCTACGGGTGCAACCAATGATGGTTATTCATCTGAAGCATTTTTGTTAAAATCTGGCCGCACTATTTCTAATACAGCTGGGCCAATTAACTTAATTGGTAATGCTGATACTGCATCTAATATTGATGCATCAACCGGTTCACTAGTTGGTGATTCGTCTGCGGGTTGGCGTAAACTTGGTCGAGCAACTGTCCCGCAAAACGGTCGTGCATTGATGCTTCAAATTTTTGGCGGTACTGGTTTTAATGCTGGTGTGCCAACGCAAGCAATGTGCACTGAAATTGTATTAAAAGGCGGTAACAGTGGACCATCCAGCATTAATATGGTTGTACATGTACCAGACTCAAGCAATATATTGGCCAACTTGGGTAAAGGTGTTGCAAATGCTTGTTTTGTTCCAGTAACTGGTGATGATTATGATATCTATATCAATTGTGTTGGGTATTTACGAGCAGGTATTGTCGCAATAAAAGGCGCATTAACTGATTGGGCCCTTAACTTTGATGTAGCTGGTGTTTCAACTAAACCTACCGGCGCAGTTGACGCAGCAATTTATACCAAAGCATATACAACATCTAATGTAGCATCAGCAACCAAATTACAGAATCCAAGAACAATTAATGGTGTTAATTTTGACGGCACAGCTAATATCAAAATTCAACAAGAATCTGTCGCAATTCCAGCTAATGCGAACTTGACTAATTATACTAATGAAGGTTTTTATGTATGCGAGGCTAATGCAACAGCAGTTACAATAAAAGGTACACCGTTCAATCCATCTGGAACTTCATCTTCTGCATTGGCATTCAGTTTACTTGTTGAAAAATCTGCTGGTGTTAAACAAACTTACACGTCATATGCATCAGGCGCTACACGTACATGGGTTCGAGGAATTTATCAAGGATCACCATCTGCATGGCGTGAAGTAGCTTTTTGTAATTCTCCAACATTTGTAGATACTACTACGTTTAATGGTCCGATTGTTGCATCAAGCACGTTAAATGTAACTGGTACCGCAGGATTCAATAGCGTATCTGTGAATAATTTGTCAGCATCTACAACAATTAGTGCTGGAACTAGTCTTGGAATTGCTAACACAGTTGCAACTACCAAATATGGTTTAAGTCTTTATGGCGGGGCATCTGCAGGTAAACCAAGTTATGGGGTATTGTTTACTGGCACCTCAAACAGCGACACTGGTAAGCACGGTGATGTTAACGGCCAATGGAGTGTTTACTTTACTTGTGCAACATCAGGTTCAGAAAAACGAGGTTGGGTATTCCAGCGTTCATCTGGTGGAGCTGGTGGTGCTCAAAACGTAGCATCTATTTCAACTGACGGTAACATGGTTATCAATGGTAATTTTGATACTGCTTCTGATAACACAATGATTCGTGTTGGTAACAATAACGATCTTGCTATGATTAAAAAAGCGGGCTCGAGTGCATTTATTGCAGTTGGGTCTAATACTGCATTCAGAGTGTTAAAATCTCCAATTGCAACTGTTGACCCGACACAATCTTATGTTAATTTGATGACAGTAACAACATCAGGAGATTTAGATTTAGCTGGCAATAATATTCTTATTGGTTCAGGTACTAATAACAATACATATCAAACTATTCAGTTTGGTAATTATACTAAATCATCATCTGGCGGCGGATTCTCCGTTTTACAAACAGCTCCTGTGGGCGGTTCACAAGGCCGAGTTTTGCAATTAGCGAACTATACCCAAGCTGGTACTATTGATAGTGCATTACACGTAAATAATTCTGGAACTTATCAAACAGTAGGATCAACGACATTAAAATTAGCTACTATTAGTGATAATGTTGCTTCTGCAACCAAATTGCAAACTGCAAGAACATTCCAAATTACTGGCGGCATCACAACAAATGCAGTATCATTTGACGGACAACAAAACGTAGTGTTAACTGCAAGCAATGTAGATGGTTCTAAAGTATCTGGCGTGGTTCCTGAGGCGGTTAAAGCGCAAACTCTTGCAGTGACACCGCAAAAAAATGCGAAACTCGTTGCATCATGGAAGGGTACCATATTGCAATCTATGACGCCTACACTAACTATTGTTGATGCAAATACACTTCGTGTTAGATTAGCAGACGATAATCCGGGTAACAGATTGGCAGTATTGAGATTTAATGTGAAAATCGGCACAGTGTATCATCTCGCATTTAGTGATACTATGTTGCCGATCAATGGCACAGTAACTTTCGTCCAAACTGGGTTAACATGGGTTGAAGTTGATCTTAATGCACCTAACCATGGGCTATCTGGCAGTGGGCTCGGAGTTAATGTTATGGCGATAACATATTCTGCGTATGGTTGTTATTTTGAGGGCACAATTAGCCAAATCATTGGCACAACAGGGCCACAAGACAGTCAATGGGCATATGTATTGAAACTCAATTCTCCGACAACTGATGCTACATATAATCTTAGCGGATCTTCGCAAGATGCAATATGGGTTGCAGATAAAAATATTTGGTATCTTAATCCTGCGCAGCCGGTGATAACTGCAGGCGCTATGATTTCTCCTGATAGATTGAATTTCTTCGCTGCTGATACAGATTCTTCAGCAAGAATGCGTTCTAATATGGTAACTGCACAAATCTGGGACATTGTATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
97e1b5dc913be1c5a7fbf540f87a98c1cf9565caf621fb54c0c869873148b53f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,4429
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50