Protein

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Genbank accession
QXV83448.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,77
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTLFTKDDSGNIIDLSISAGGSISGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVAEGSFKIHYINESGDSKYWTFNRNGNFQVDTGDLFVSKGNISASGNINSATGIVSAPQINTKTIVFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGEENGINYLRKVRAKSGGTIYHEIASAQTGKNDEISWWTGNSLTTKLMGLRNDGAMVLRRSLAIGTITADENTNNYGSPTPMGERYIALGDAATGLKYIKQGVYDLVGNWNSVASITPDSFRSTRKGLFGRSEDQGGTWTMPGTNAALLSVQTQADVNNAGDGQTHIGYNSGGKFSHYFRGKGQTNINTQEGMEINPGILKLVTGSNNVQFYANGTVSSIQRIKFDNGLVLTGARPDGIQLDAPTSVDGTKTILWAGGTRAGQNKSYVSIKAWGNSFNASGDRTRESVFEVADGQGYYFYAQRIAPAPGSTTGVIQFRVAGALLTGGGITSSGSIVTESSLVANNGLSVNGQAKFGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEASLHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMVTVDNDSKVMVMTTNSRISPNFRMQIGQSSYIDAECTNAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPIVKQRYVQNNSCYSIGTLINGGNFRVHYHEGGDGGSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNVRIGTDGNITGGSLPNFANLNLTLDRKVNTRMVSYSGTGGWYKLATVTMPQSTSTVTFEIAGGNGYNVNTPHQCVTSKIVLRTSNNNPKGINAVVWSMDTDQGIKNVATVNTSGDVYDIYVNVGTYAQALAVSYYATPNATINQVFATDQPGATETAVELPETAIQGQVASVLNNLALTPNGVKRYEADSEIAINSQTGIRIRSNSDKTGSVATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVLMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDGTRGNRIEIADETNYIAYFQKLPGGQNQVSFNSATLSGLTQCNQFGVNTTNALGGNSITFGDTDTGIKQNGDGLLDIYANNVQVFRFQNGDLYSYKNINAPNVYIRSDIRLKSNFKPIENALDKVEKLNGVIYDKAEYIGGDAIETEAGIVAQTLQDVLPEAVRETEDSKGNKILTVSSQAQIALLVEAVKTLSARVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1302 AA
molecular weight: 139429,27720 Da
isoelectric point:7,57450
aromaticity:0,08449
hydropathy:-0,34608

Domains

Domains [InterPro]
DC_1954
STR
1–1301
DC_1954
IPR030392
CHP
1204–1301
IPR030392
IPR030392
CHP
1204–1261
IPR030392 Coil
QXV83448.1
1 1302
Architecture
STR
STR 1-1301 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
QXV83448.1
1 1302
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 423 423 0,0879
Central domain 424 629 207 0,4108
C-terminal 630 1302 672 0,6581
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-423
Central
424-629
C-terminal
630-1302

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage PaulHMueller
[NCBI] 		2852017 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli K-12
[NCBI] 		83333 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Escherichia

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QXV83448.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MZ501098 [NCBI]
CDS location
range 60207 -> 64115
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACACTTTTTACTAAAGATGATTCAGGAAATATCATCGACTTAAGCATTTCTGCTGGCGGTAGTATCAGTGGAAATATCACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAATGGAACATATAATCTTAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACTGCTGGTAATGGTGCTTGGGCAAATCAACACCTAAATAAAGCTCCTATTTTTACGGATTTAAGTTCAACTACTTCCGTTTCAGAATACCATCCGCTAATTAAGCAGCGTTATAAAGATGGGACTTTTTCAGCGGGTACATTGGTTGCTGAAGGAAGTTTTAAGATTCATTACATCAATGAATCTGGGGATTCGAAATATTGGACTTTTAATCGTAATGGTAATTTCCAAGTTGACACAGGCGATTTATTTGTCAGCAAAGGTAATATTTCCGCTTCAGGCAATATTAATTCAGCTACTGGAATAGTTTCTGCTCCACAGATTAATACAAAAACCATAGTTTTTGATACAAAGGCATTCGGACAATACGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAGAAAATGGTATAAACTATCTTCGTAAAGTTCGAGCTAAATCAGGCGGAACTATTTACCATGAAATCGCTTCAGCTCAAACCGGTAAGAATGATGAAATTTCTTGGTGGACTGGAAATTCGCTTACTACTAAATTAATGGGTCTTCGTAATGATGGCGCAATGGTATTACGTCGTTCACTTGCTATTGGCACAATTACCGCTGATGAAAATACTAACAACTATGGTTCTCCTACTCCAATGGGAGAAAGATATATTGCTTTGGGTGATGCTGCAACCGGTTTAAAATATATTAAGCAAGGTGTTTATGATTTAGTAGGTAATTGGAATTCTGTTGCTTCTATTACTCCTGACAGTTTCCGCAGTACTCGCAAAGGTTTATTTGGACGTTCAGAAGACCAAGGCGGAACCTGGACAATGCCTGGAACGAACGCTGCTCTCTTGTCTGTTCAAACCCAGGCAGATGTGAATAACGCAGGCGATGGTCAAACCCACATTGGATATAATTCTGGCGGTAAATTTTCCCATTATTTCCGCGGTAAAGGCCAAACCAACATTAATACGCAGGAAGGTATGGAAATTAACCCTGGTATTTTGAAATTGGTAACTGGCTCTAATAACGTACAGTTTTATGCTAATGGAACAGTATCTTCAATACAAAGAATTAAATTTGATAACGGATTAGTTCTTACTGGTGCTAGACCTGATGGTATTCAACTTGATGCGCCTACATCAGTAGATGGCACTAAAACTATACTGTGGGCTGGTGGTACTCGCGCAGGTCAGAATAAAAGTTATGTATCTATTAAAGCGTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGCACTCGTGAATCAGTTTTTGAAGTAGCTGATGGACAAGGTTATTATTTTTATGCGCAACGTATAGCTCCTGCACCAGGTTCAACAACTGGAGTAATTCAATTTAGAGTTGCTGGAGCATTATTAACCGGTGGTGGTATTACATCATCTGGTTCTATTGTTACTGAATCAAGTTTAGTTGCAAATAATGGATTATCTGTAAATGGTCAGGCTAAATTTGGTGGAACGGCAGATGCATTAAGAATTTGGAACGCTGAATATGGTGCTATTTTCCGTCGTTCAGAAGCATCATTACATATTATCCCGACTCCTAAAGATGCTGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCGCTTAGTATTAGCCTTAATAATGGTATGGTGCAAATGCGTCATTCTGTTACGTTAGGCGATGATGGTGCAGGCGGTAATATGGTGACGGTTGATAATGATTCTAAAGTTATGGTAATGACGACTAATAGCCGTATTAGTCCTAACTTCCGTATGCAAATTGGACAGTCGTCTTATATTGATGCTGAATGTACTAATGCTGTTAGACCGGCTGGCGCAGGTTCTTTTGCTTCGCAAAATAATGAAAATGTTCGTGCTCCGTTCTATATGAATATTGATAGAACTGATACTAGTACATATGTTCCAATTGTTAAACAGAGATATGTGCAAAATAATAGTTGCTATTCTATCGGTACTTTAATTAATGGTGGTAATTTTAGAGTTCATTATCATGAAGGTGGTGATGGCGGTTCTACTGGCGCGATTATAAAGGATTTAGGTTGGGAATTTAATAAAAACGGTGATTTTTACTCTCCTGGTAAATTAGGTGCTGGTAATGTTCGTATTGGTACTGATGGTAATATCACGGGGGGTTCATTACCTAACTTTGCTAACTTGAACTTGACATTAGATCGTAAAGTCAATACCCGAATGGTTTCTTATTCAGGTACTGGCGGTTGGTACAAATTAGCCACTGTAACAATGCCACAATCCACTTCAACCGTCACATTCGAAATTGCTGGTGGTAATGGCTATAATGTTAACACCCCACACCAATGCGTTACTTCGAAAATTGTTTTAAGAACTTCGAACAATAACCCGAAAGGTATTAATGCTGTTGTTTGGTCGATGGATACCGATCAGGGTATTAAGAATGTTGCAACGGTTAATACATCAGGCGATGTTTATGACATCTATGTAAACGTTGGTACTTATGCTCAGGCGTTAGCAGTTTCTTATTATGCTACTCCTAATGCTACCATTAACCAGGTATTTGCAACGGACCAACCGGGTGCAACAGAAACTGCGGTTGAACTTCCTGAGACGGCTATTCAAGGACAGGTTGCTAGTGTTCTGAATAACTTGGCTCTTACCCCGAACGGTGTAAAACGTTATGAAGCCGATTCTGAAATAGCTATTAATAGCCAAACTGGCATTCGTATTAGAAGCAACAGCGATAAAACTGGTTCTGTTGCTACAATGCTACGAAATGATGGTGGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACCGATGGCGCAGCAACTGTTAATGGTGATTGGAATAGTAAACGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACCGGCGAAGTGCTAATGAATAACGGCATAGCTGTTCGCAGCGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAACGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAGTCCGGAGCTAACCCAAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGGCACTCGTGGTAATCGCATTGAAATTGCCGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTCCAAAAATTACCTGGTGGTCAAAACCAAGTTTCATTCAATAGCGCTACACTTTCTGGATTAACACAGTGTAATCAATTTGGTGTTAACACAACAAACGCACTTGGTGGAAACAGTATAACATTTGGTGATACCGATACTGGTATTAAGCAAAATGGCGATGGATTATTAGACATATATGCGAACAACGTACAAGTGTTCCGTTTCCAAAACGGTGATTTGTACTCATACAAAAATATAAATGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTAAAATCCAACTTTAAGCCTATCGAAAATGCACTTGATAAAGTTGAAAAACTTAACGGTGTCATTTACGATAAGGCTGAATACATCGGTGGAGATGCAATTGAAACTGAAGCGGGTATTGTGGCTCAAACGTTACAAGACGTTTTACCAGAAGCTGTCCGTGAAACAGAAGACAGTAAGGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAAGCCCAGATTGCTCTTCTAGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTGCTCGTGTAAAAGAACTCGAATCTAAACTTATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
570e3234e3255260d19bc62118049847a43d843c85fada5f89977ab4fcc7151e
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5014
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Systematic exploration of Escherichia coli phage-host interactions with the BASEL phage collection Maffei,E., Shaidullina,A., Burkolter,M., Heyer,Y., Estermann,F., Druelle,V., Sauer,P., Willi,L., Michaelis,S., Hilbi,H., Thaler,D.S. and Harms,A. 2021 — GenBank