Protein

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Genbank accession
XYM57114.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein
RBP type
TF
Evidence Phold
Probability 1,00
Protein sequence
MPQNTNLNASPYFEDFDPQKNFYKVLFRPGYAVQARELTTLQSALQTQLESFGRNVFKQGDLVVPGEVGFNTKLNYVKLSSVSEVAVSDEAGNVTYQKYDISQLVGLKVRGVSSSVVASVIATEYSSDTESDTLYVNYLDSGASGDEERFRQGETLEVIGGVNSPLLVVGTDGVSLPTSISVTDPDTGIETFIDSPALGFASAIKVEEGIYFVNGYFVRNAEQLLVVEKYNDTPSAKIGFKISESLVTPEEDASLYDNARGFSNFSAPGAHRLKIDLELVKYGYYELTDKNFIQLLLVKSGVIQKQVKANDYSLVESVIARKTFDESGDYVVEPFPLQVREYYQTDDNLGFYAQGSDGLVNGLTTNEASAKLLGTIGSGKAYIKGYQVKNKETKYLTIDKARDTIKRENQTLKTSGLTSFFVSNVYGTTPLNAEGADLTSYPTMYLNASYNDGSIGLNDTEADTDVKQTLNRRGQGYGVTDGLKTIYCVLESGSQVSLAQCNDANFKGEGASTEPDLSKLYYVKSRTDTGDVSEYGYAEVVSFSKVQRPEIGTGTYLEITVKGNRAELDLFLTDVDLSISNKLRKLYKSQANVESATLAVFEIRDYNETITPVVGVSKPKNIALKEISAGFNKDLDKVVSKGKLAGGLEQYNSIFDLSYFAPEFFTRLLLEDQLQGDDFTPGKYIYGAVSKSIAVIEGGTDSVYSSVNKLFVTMIFGEFQSGETITSETGATMRIATDDTISHFIVPTRGDGYASSTKVILDGVTFEESQIDVVQSGAGAIDQVIVRDRSSVTQTYAQPPVVEFTGTTPSNQAKVVPVLYRNSVYTYSPKNIKSVFSEFGSGNANKFSADIELEKTGYVITSSVTDFTFSGTQGYKFIECNGFGGDASKVLVQGDVVQFSDTSGAVYKYIVQYATRPDGIKRSRIYLDRTLRENVSNASVVLQRPQIENPNASLIFPTGDKQISTLIDSSEDSKIKYHFRRDFITTSSSASGNITFAAQLPFGTQRFAPFSQENFLVTVLETGVAEHALDASGTLQLFGGPLKKGDIIYVDPSYVTISQSDSNLTAGSVTVNFPENHFGDIDALRTALEARAASPQAGDPEFTLPTSNFPKMKLTATLEVSKAKPRLKTSILNKQIIVQSSGTTVVPFRGQELDGETIQITSYSDVFKLRYVYEGSVSSPPTIGAGGNLISGTDVTNRYTFDNGQRDTHYDIARLILKPGITAPTGQLVIAFDYFEHSQGDFCTIDSYLHEAGVTEKDIPSFNSSVSGLVSLKDVIDFRPKVDNSNIVPGYQDKTLLAQDDYLSFSGVSGIPASTPADDANLDYTIKFNKEQYLDRIDGVFLNTDGQFVVKKGNSSLNPSRPESISDATPLYYLYIPAYTDSYRDVRIIPVENKRYTMKDIGKLSQRVERLEYYTSLSILEQQTLNMQVTDDIGLDRFKCGFYVDNFETHKGDIKAADHVCAIDTQQSVLRPQVSEDNFLVKEINTRNDQREVSGYVNNNGVLTLPFTNQRLLGNNFATKTINPNPFVVLQYVGDIAIDPNVDSWYDRSIAPLVTDNNTDLFVPFLAKDDLEVAFGSLYNSFIVTWTGTERSFYNINPLSKTNNEIANEEVVSASTASSSNVSPFNNELGKGISSRTSRGKSVAGSLQYFARSIPVKFSIRRLKPKTEVFVYLEGKKINRWVVPDIRFTGIPGNSLSTFNAPIITDENGNASGIVLIPAGNPPREGAAWTGEVETVSYDLGGEDVRIATGEKTLRFTSSATNRNKADVETFAETKFYASGLLPDNPGSIVSTKPAYFKANEGTQLVTNNTENEQKPNPLAQTFKIENFDEGVFSTGVDLYIANKSDSIPIRVYLTDVDSEKPGKNVIPGTEVVKEPYTYIKAYVSASVVVLKDEKINGVTTNASGPILKILDKNNNELPVSEDNEIQLNNEQVYTFVLSNNNGKSFIQDEELKINSIVVYNNANNTEITARIAKDSGSVSALKVTNTGSDYDSATITIESPSLPGGSNATGSVAVSGGLIYDSTITLAGRGYTEPPSVVIRGTGIGNTGAELETEITITEPAVRMGVAEDETGSLPSITPTNFMFDYPVFLQNNTEYALVVETDSKDYSIWVSKLGETEIATNTTVTTNPSLGSVYKSQNTESWVEDLFEDIKFTLYRAEFDTSTTATIDLTTISKGYDNMVVDPLETYAFANANATSSLFKNNNNIIKVSHKNHGFDDQRSYVFFKNLATTAGFTQGSLNGNLFKVDNAGLDTFTISGIGRAADTVFGGGETALIAANKKYERLLAQISYLQAPSTNINTSVKTTNIVPIDSNTENYTSYSPSAFERTFLNEEQFFINQKVIASDINALLNTLDNSLTYRLELSSTKSYLSPIIDLKTSSIKISSNRIENAQGKEGRYGKRYQKIKFLPVYSFVVGGNTDSSNQPIDIATGQTVEGKGWAASNIDASGARGEVVFYNTGTSTVFVKMRNENVFKAGEELFFSVQSQTGANLEDRNSDGNNSFDVRISGASPQLVNPSFSFNQLVTAINPSNTTENYDNLIAGNVITWDIPSQELTLENDKEPINSDYSSDNKSGSFIREADADDQSSDILRVGDLISWSDLSAGYEKFYEIKSMEFTDGVDYIPEDSAKNTSAVAKYVTKEINLKTPASAVDVIITANVTNSENIKLLYKTKTASVQKNFEDIEWVLFNGTGYADKPELATPQNTISAQKEEQSAYQEFRFSVDNLDDFVSFGVKVSMTSDDPAYVPKIQDIRVVASA
Physico‐chemical
properties
protein length:2759 AA
molecular weight: 302018,98370 Da
isoelectric point:4,72533
aromaticity:0,09750
hydropathy:-0,31323

Domains

Domains [InterPro]
DC_0414
STR
88–1560
DC_0414 DC_0082
IPR032096
STR
203–415
IPR032096 IPR032096 DC_0082
XYM57114.1
1 2759
Architecture
STR
RBD
RBD
STR 88-1560 | RBD 1561-1893 | RBD 2022-2759
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Sf-CH11
[NCBI] 		3413211 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYM57114.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV340848.1 [NCBI]
CDS location
range 79485 -> 87764
strand +
CDS
ATGCCTCAGAATACTAACCTTAATGCATCGCCTTACTTTGAAGATTTTGACCCGCAGAAGAATTTCTACAAGGTCTTGTTTCGACCTGGGTATGCAGTACAGGCTAGGGAGCTAACAACTCTCCAGTCTGCACTGCAAACTCAGTTAGAAAGTTTCGGAAGAAACGTCTTCAAGCAAGGCGATCTTGTTGTGCCTGGTGAAGTCGGGTTCAACACTAAACTAAACTACGTTAAGCTCTCGTCCGTTTCTGAGGTAGCTGTTAGCGACGAAGCAGGTAACGTTACATATCAAAAGTATGACATCAGTCAACTTGTAGGTTTGAAGGTTCGAGGCGTATCTTCAAGCGTAGTTGCTAGTGTCATTGCAACAGAGTATAGTTCTGACACTGAGTCAGATACACTTTATGTTAATTACTTAGATTCTGGTGCATCTGGTGATGAAGAGAGATTCCGTCAGGGTGAAACTCTAGAAGTAATCGGTGGTGTCAATTCTCCTCTATTGGTCGTAGGAACTGATGGAGTTTCTCTTCCCACTAGCATCAGTGTTACAGATCCAGATACAGGTATTGAAACTTTTATTGATAGTCCTGCTCTAGGATTTGCTTCTGCTATTAAGGTGGAAGAAGGAATTTATTTTGTCAATGGTTATTTCGTAAGAAATGCTGAGCAACTTCTAGTTGTAGAAAAGTATAATGATACTCCTTCTGCGAAAATTGGATTCAAGATTTCTGAGTCTCTAGTTACTCCAGAAGAGGATGCTTCTCTGTATGATAACGCAAGAGGATTCTCTAACTTCTCTGCACCTGGAGCACATAGACTCAAGATCGATCTTGAGTTGGTTAAGTATGGTTACTATGAACTAACGGATAAAAACTTTATTCAGTTGCTTCTTGTTAAGAGTGGAGTCATCCAAAAACAAGTTAAAGCAAATGATTACTCTCTTGTAGAGTCTGTAATTGCTAGGAAGACTTTTGACGAGTCTGGCGATTATGTAGTAGAACCTTTCCCTCTACAAGTGAGAGAGTATTATCAGACAGATGACAACTTAGGATTCTATGCACAAGGATCTGATGGTCTTGTCAATGGTCTAACTACCAATGAAGCATCTGCTAAACTACTCGGAACAATTGGTTCTGGTAAAGCATATATCAAAGGTTATCAAGTTAAAAACAAAGAGACTAAGTATCTCACCATTGATAAAGCAAGAGATACTATCAAAAGAGAGAATCAGACTCTAAAAACATCTGGTCTAACATCTTTCTTTGTTTCTAACGTATATGGCACCACTCCTCTAAATGCTGAGGGTGCAGATTTGACATCGTATCCTACGATGTACTTGAATGCTTCTTACAATGATGGTTCTATTGGTCTTAACGATACAGAAGCTGATACTGATGTAAAACAAACACTAAATCGTCGTGGTCAGGGATATGGTGTTACTGATGGTCTCAAGACCATTTATTGTGTCCTTGAATCTGGATCTCAAGTAAGTCTTGCTCAATGTAATGATGCAAACTTTAAAGGTGAAGGGGCGTCAACAGAACCCGATCTTAGCAAACTTTATTACGTCAAATCAAGAACTGATACGGGTGATGTATCTGAGTATGGTTATGCAGAAGTTGTTTCATTCTCTAAAGTACAACGTCCTGAAATTGGAACAGGTACGTACCTTGAGATTACAGTTAAAGGCAACAGAGCAGAGCTAGATTTGTTCTTGACAGATGTTGACCTTTCTATTAGTAATAAACTGAGAAAACTGTATAAGTCTCAGGCAAATGTAGAATCTGCAACTCTGGCAGTATTTGAAATTCGTGATTACAATGAAACTATCACACCTGTTGTTGGAGTTTCAAAACCAAAAAATATTGCACTAAAAGAAATTAGTGCAGGATTTAACAAAGATCTTGATAAGGTAGTATCTAAAGGAAAACTTGCTGGTGGTCTAGAGCAATACAATTCTATTTTCGATCTATCTTATTTTGCACCAGAATTCTTTACCAGACTACTTCTAGAAGATCAGCTTCAAGGAGACGACTTTACTCCTGGTAAGTATATCTATGGTGCGGTAAGCAAGTCTATTGCTGTAATTGAAGGCGGTACAGATTCTGTGTACTCGTCTGTAAACAAATTGTTCGTCACCATGATCTTTGGTGAATTCCAGTCAGGAGAAACTATCACTTCTGAAACTGGCGCAACCATGAGGATTGCAACAGACGACACAATCTCTCACTTTATTGTTCCTACGAGAGGTGATGGATATGCATCTTCAACAAAGGTTATTCTAGATGGTGTAACATTTGAAGAGAGTCAAATTGATGTTGTTCAATCTGGTGCTGGAGCAATTGATCAAGTTATCGTTAGAGACAGATCTTCTGTAACTCAGACATATGCACAACCACCTGTAGTTGAATTTACTGGAACAACACCAAGCAACCAAGCGAAAGTAGTACCTGTTCTTTATAGAAATAGCGTATACACATATTCTCCTAAGAACATTAAATCGGTATTCTCCGAATTTGGTTCTGGAAATGCCAATAAGTTCTCTGCAGATATTGAACTAGAAAAGACAGGATATGTCATTACATCTTCTGTAACAGACTTTACCTTCTCTGGCACTCAGGGATACAAATTCATTGAGTGTAATGGTTTTGGTGGAGATGCTTCTAAGGTGCTAGTACAGGGCGATGTAGTCCAGTTTTCTGACACATCTGGTGCTGTATACAAGTACATTGTACAATATGCAACTAGACCTGATGGCATCAAGAGATCTAGAATTTATCTAGACAGAACATTGCGTGAAAACGTATCTAATGCTTCTGTGGTTCTTCAAAGACCCCAGATTGAAAATCCAAATGCTTCTTTGATCTTCCCAACAGGAGATAAGCAGATTTCTACTCTTATTGATTCTTCGGAAGATTCTAAGATCAAGTATCATTTTAGAAGAGATTTTATTACAACATCTTCTTCTGCTTCTGGAAATATTACCTTTGCTGCTCAACTACCATTTGGTACACAAAGGTTTGCTCCATTCTCACAAGAGAACTTCTTGGTGACTGTTCTGGAAACTGGAGTTGCAGAACATGCTCTGGATGCAAGTGGCACCCTACAACTATTTGGTGGTCCTTTGAAGAAAGGGGATATCATTTATGTTGATCCATCATACGTAACCATTTCTCAGTCAGATAGTAATTTGACTGCTGGTAGTGTTACTGTAAACTTCCCCGAGAATCACTTTGGTGATATCGATGCACTTAGAACAGCACTAGAAGCAAGAGCAGCATCTCCACAAGCAGGAGATCCAGAGTTTACTCTACCAACGTCAAACTTCCCTAAAATGAAGTTGACTGCTACTCTAGAAGTTTCTAAAGCAAAACCAAGACTAAAAACTTCTATCCTAAACAAACAGATTATTGTCCAGTCTAGCGGAACCACTGTAGTTCCATTTAGAGGACAAGAACTTGATGGTGAGACTATTCAGATCACATCATATTCTGATGTTTTCAAACTTAGATATGTTTATGAGGGTTCTGTGTCTTCTCCTCCTACCATTGGTGCTGGAGGAAATCTCATCAGTGGTACTGACGTAACTAATAGATATACGTTTGATAATGGACAGAGAGATACCCATTATGACATTGCAAGACTAATTCTTAAACCAGGCATCACTGCTCCTACAGGACAACTGGTTATTGCTTTCGATTACTTTGAGCACTCTCAAGGTGACTTCTGCACAATTGACTCTTATCTGCATGAAGCAGGTGTTACCGAAAAAGATATTCCATCTTTCAACTCTTCTGTCAGTGGTCTAGTGTCCCTCAAGGATGTAATTGATTTCCGTCCAAAGGTTGACAATTCTAATATTGTTCCAGGATATCAAGATAAGACTTTGCTGGCACAAGACGATTATCTATCTTTCTCTGGTGTATCTGGTATTCCTGCTAGCACTCCTGCTGATGATGCCAATCTTGACTACACAATCAAATTCAATAAAGAACAATATCTAGATAGAATTGATGGTGTGTTCCTCAATACTGATGGTCAATTTGTTGTCAAGAAAGGTAACTCTTCACTGAACCCATCTAGACCAGAGTCTATTAGTGATGCTACTCCTCTATACTATTTGTATATCCCTGCATATACAGATTCGTACAGAGATGTTCGTATTATTCCTGTAGAGAATAAGCGTTACACGATGAAGGACATCGGTAAACTGAGTCAACGTGTTGAGCGTCTAGAATATTACACATCTCTCAGCATCCTTGAGCAGCAAACCTTGAATATGCAAGTAACCGATGATATCGGTCTTGATAGATTCAAGTGTGGATTCTATGTTGATAATTTTGAAACTCACAAGGGAGATATTAAGGCAGCAGATCATGTCTGTGCTATTGACACTCAGCAGTCTGTTTTGAGACCACAAGTCAGTGAAGATAATTTCCTTGTCAAAGAAATCAATACCAGAAATGACCAAAGAGAAGTTTCTGGTTATGTGAATAACAATGGCGTTTTGACGCTACCATTCACAAACCAAAGATTGCTTGGCAATAACTTTGCTACTAAGACGATTAATCCAAATCCATTCGTTGTTCTACAATATGTTGGTGATATTGCAATTGATCCTAATGTAGATTCTTGGTATGACAGATCTATTGCTCCTTTGGTAACTGATAACAATACAGATCTGTTTGTTCCTTTCCTTGCAAAAGATGATCTAGAGGTAGCATTCGGAAGTCTGTACAACTCGTTCATTGTTACTTGGACAGGAACGGAGAGATCTTTCTACAATATCAATCCACTATCTAAGACTAATAACGAGATTGCAAACGAAGAGGTAGTATCTGCATCTACTGCAAGTTCTTCTAATGTAAGTCCTTTCAACAATGAGTTGGGTAAAGGAATCTCTTCTAGAACCAGTCGTGGTAAATCTGTTGCTGGTTCTCTGCAATACTTTGCTCGTAGTATTCCTGTTAAGTTTAGCATTCGTAGACTGAAACCCAAGAC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Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
e234dd1a728be42ff18d8d63bb7428964a851dfec8903c98c2237a17f4d4a33a
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7571
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50