Protein

Genbank accession
WCF57393.1 [GenBank]
Protein name
polygalacturonase/tailspike protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,91
Protein sequence
MFFTQEDYRKIEKWFLANSRKDTDFAGAATPLKGNETVVLVQNGKNVKASVKDVVEQLFLLGVSDFVNITDKYGESYISLSQAIELIPYRSRKIGQVVTFLDDTGKWAMFQFQGTRKNQWGTLSLWVDLIDLMTGLTITDSEDIVTETNSANQVALKFADKTYNEADYSGLGRVYLRKNIVNVEDPVTGNIVTMNYLQQSMISKENTIYIIQYDYNLNGQTITIPSGCVLKFEGGSISNGSIKGTDTNIIAPQIRIFNTILLSGTWKVRDIFDDWFDFNATTNFDNINNFYNISILQSDDLENNVILKGNYYSSLKDGIVLSLSSNTNLVLNGSISLLPNNLSSYSIIKGVDKENIKISGGGRLIGDLQNHLGNTGEWGFGISFTGCKTISITNIDSSYMWGDGLYIGASDDTEEETLSQNIQVNNCKFEYNRRQGISITGAVDVFVNNCYFFNTGRINGTNPKAGLDIEPSGLYNSNVTISNCIADSNVSTGFLVYGDNRNIVIDNCASKNQLISITISQRSATTDNDDVFIRHGNIGGSLQITRGNIRVEDCEVDSVYFTADTSGIGANVTISNSVLGAKRWEGSTYFNSVFLIDSNSQINNLYIFDSKIDYDPSILTQGLFNIGGSSIRDNILFENCDISQKNTVNSLNTKVGSYRNCRFYNMTRIYLANEPNKTVEFTDNYCAMTKESPGTNIFSFLNSGNTQDVILFVVRNNTFSTKGSINVGSIGLIDVTGVNLGNKMIFENNHFLTQYPLTQEQIIKALSNRITVDTNYNFTSRFPYRATLESLPAYNAFDAGALIYGDDNLLYFWNGTNLTNSEGTDARKVVIV
Physico‐chemical
properties
protein length:832 AA
molecular weight: 92384,15610 Da
isoelectric point:4,76620
aromaticity:0,10577
hydropathy:-0,20769

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Bacteroides phage PhiCrAssBcn1
[NCBI] 		3023091 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
WCF57393.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OQ221536 [NCBI]
CDS location
range 49826 -> 52324
strand -
CDS
ATGTTTTTTACACAAGAAGATTATAGAAAGATAGAGAAGTGGTTCTTAGCAAATAGTAGGAAAGATACTGACTTTGCTGGGGCAGCCACCCCTCTTAAAGGAAATGAAACTGTAGTTCTTGTACAGAATGGTAAGAATGTAAAGGCATCAGTGAAAGATGTAGTTGAGCAACTATTTCTTCTTGGTGTATCTGACTTTGTGAACATTACTGATAAGTATGGTGAGAGTTATATTTCACTATCTCAAGCTATAGAATTAATTCCTTATAGAAGTAGAAAGATTGGTCAGGTAGTTACTTTCTTGGATGATACTGGAAAATGGGCTATGTTCCAATTCCAAGGTACAAGGAAGAATCAGTGGGGTACTTTATCTCTTTGGGTTGATTTGATAGACCTTATGACAGGTCTTACTATCACAGATAGTGAAGATATTGTTACTGAGACTAATAGTGCAAATCAAGTAGCTCTTAAGTTTGCAGATAAAACTTATAATGAAGCTGACTACTCAGGTTTAGGCAGAGTATATCTTAGAAAGAATATTGTAAATGTTGAAGACCCTGTAACTGGTAATATAGTTACTATGAACTACTTACAGCAGTCAATGATTTCTAAAGAGAATACTATCTATATCATTCAGTATGACTACAATTTGAATGGTCAAACTATCACTATTCCAAGTGGGTGTGTACTCAAGTTTGAAGGAGGGAGTATAAGTAATGGTTCTATAAAGGGCACAGATACTAATATAATAGCTCCTCAAATTAGAATATTTAATACTATCTTATTATCTGGTACTTGGAAAGTTAGAGATATATTTGATGATTGGTTTGACTTTAATGCTACTACCAATTTTGATAATATCAATAATTTCTATAATATATCCATATTACAATCAGATGATTTGGAGAATAATGTAATTCTTAAAGGGAACTATTATAGTTCTCTTAAAGATGGAATAGTTTTGTCCTTATCTTCTAATACCAATTTAGTACTTAATGGTAGTATTAGCTTGCTTCCTAATAACCTATCTTCATATTCTATAATAAAAGGAGTTGATAAGGAAAATATTAAAATAAGTGGAGGAGGAAGACTAATTGGAGATTTACAAAATCACTTAGGTAATACTGGAGAATGGGGATTTGGTATTAGTTTCACAGGTTGTAAAACTATATCAATAACTAATATTGATAGTTCTTATATGTGGGGAGATGGCTTATATATTGGGGCATCAGATGATACAGAAGAGGAGACACTATCTCAAAACATACAAGTAAATAATTGTAAATTTGAATATAATAGAAGACAAGGTATATCTATTACAGGAGCTGTTGATGTATTTGTTAACAATTGTTATTTCTTTAATACTGGTAGAATAAATGGAACAAATCCAAAAGCTGGATTAGATATAGAACCAAGTGGATTATATAATAGTAATGTTACAATAAGTAATTGTATAGCAGATTCAAATGTATCTACTGGATTTTTGGTTTATGGGGATAATAGAAATATTGTAATTGATAATTGTGCATCTAAAAACCAATTAATATCTATAACTATATCCCAAAGAAGTGCAACAACTGACAATGATGATGTATTTATAAGGCATGGAAATATAGGAGGTTCTCTACAAATCACAAGAGGTAATATAAGGGTAGAGGACTGTGAAGTAGATTCAGTTTATTTTACTGCTGATACATCAGGGATAGGAGCAAATGTAACTATTAGTAATTCAGTGTTAGGAGCAAAAAGATGGGAAGGAAGTACATATTTCAATTCAGTTTTTTTGATTGATTCTAATAGCCAAATTAATAACTTGTATATATTTGATTCCAAAATAGATTATGACCCATCAATTCTTACTCAAGGGTTGTTCAATATAGGTGGGAGTTCTATAAGAGATAATATCCTATTTGAAAATTGTGATATTTCACAAAAAAATACAGTAAATTCTCTAAATACAAAAGTAGGCTCTTATAGAAATTGTAGATTCTATAATATGACAAGAATATACTTGGCTAATGAACCAAATAAAACAGTTGAGTTTACAGATAATTATTGTGCTATGACAAAAGAAAGTCCAGGTACTAACATATTTAGTTTTCTAAATTCAGGTAACACTCAAGATGTTATACTCTTTGTTGTAAGAAATAACACCTTTAGTACTAAGGGGTCTATAAATGTTGGAAGTATAGGACTTATAGATGTTACTGGAGTTAATCTTGGTAATAAAATGATATTTGAGAATAATCATTTCTTAACTCAATATCCTCTTACACAAGAGCAGATAATAAAAGCCCTAAGCAATAGGATAACAGTTGATACCAATTATAATTTTACCTCCAGATTTCCTTATAGAGCTACTTTAGAATCTTTACCTGCTTATAATGCTTTTGATGCAGGGGCTTTAATATATGGGGATGATAATTTGTTATACTTTTGGAATGGTACAAATTTAACTAATTCAGAAGGTACAGATGCCAGAAAGGTAGTAATAGTCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.