Protein
- UniProt accession
- V5URV8_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Major tropism determinant N-terminal domain-containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9410
- Protein sequence
-
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGVELDTGRIKIGDGVSGWNNLRYERPIESTSNTAETLVQRDADGNFSAGTVTATLIGNASTASRFASTRQIQLANVGSTVSDVLGSDTFDGSQNVVIAAELRVLPTLPHYDGTDAPTRYYTKVEVDAKGRVIRGNTPEQLTLADYGLDGNNPAVGQVNADLAQPWDADLQALADNNDNGIVIRRQAGAISIREIVGNYEINIDDGDGVNGNPTLRLINTLVVPDPVTYDDGDYNTESLTSVTTTGPKGELVGTETVNATKFTVDKKGRLTSATNLPIATATEGSKYATYNHNLQYARYDIVDHLGNLYQALAQMGTGYAIPFGPVHTSGDAYSWRYLGPALTEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAVGVDNLQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYLKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGELDVNVRSYFSDPDITLDGALNQTLDKTGDGDLTFQLTQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQISASEAAGKVHVEDARFQDNYIATTNATMNLDPGDDRAATGTVRVWGNLQIDGTTTTVNSTTVTVDDPIITLGGDTAPTTDDNLDRGVEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNTTEVFSGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDTMVLRAASKSLQFQNGAGTVKSEIHTTSGNAEFGGILTVTGATDLNSTLNVASSVHFEATDEPTFALNSETGVWEIQSADYGSFRFDGGGYIAGDFMFDSDVVINGTILQKESAAEDFNEQNFLRVRRKFESGSVQVLTPSYASHTNSNARIFGGAGIGTTLHIGGTSSNEGLFIGKKVNSDTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGEVTIQDSVIINAANEVFSIRNGSGVAKFDVDTDNGNTLIEGTLNVNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGNTDKMTVKSSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDASNEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSNVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAAIGKNLAVSGDARVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDNVTITANNKTFAIQNGSAANKLTVDTDNGNTDIRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKVGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDGALRAGSLNLTGSGTTLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTNKINNLNADLLDSMTTASTATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALRTARTITVDGVVDGSVSFNGSADVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITVTNADGVSGNITINVASASSNSANNLVIRDASGDFAANEITADLIGGVTGDVVGNVTGNLQGSASQVDTVTASSANAAYHLTMVDQHNTVANNETINTDQSLTYNPSTNRLKTKLELQTDAAPASATATGTVGEIRYDANYIYICVATDTWKRSTLDTW
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1680 AA molecular weight: 175134,33840 Da isoelectric point: 4,24737 aromaticity: 0,06250 hydropathy: -0,22423
Domains
Domains [InterPro]
IPR041352
5–43
5–43
1
1680
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Synechococcus phage S-MbCM25 [NCBI] |
1340811 | Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHB80721.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF156339
[NCBI]
CDS location
range 87249 -> 92291
strand +
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGGAGAGGTGGAGCTCAAGAATGGGCAAACGCAAACCCAACTCTTGCTCAAGGAGAATTGGGAGTTGAGCTAGATACTGGTCGTATTAAAATCGGTGATGGTGTTTCGGGTTGGAATAACCTTAGGTATGAAAGACCTATTGAATCCACATCCAATACCGCAGAAACTCTCGTGCAGAGGGATGCTGATGGTAATTTTTCCGCAGGCACTGTTACTGCAACACTAATTGGTAATGCTTCTACTGCTTCTCGTTTTGCTTCTACCCGTCAGATTCAATTAGCAAACGTTGGTAGTACTGTATCTGATGTTTTAGGAAGTGATACCTTTGACGGATCCCAAAACGTTGTAATTGCAGCGGAGTTAAGAGTATTACCGACTCTGCCACATTATGATGGCACAGATGCACCCACTAGATATTACACTAAGGTAGAAGTTGACGCAAAAGGGCGTGTAATCAGAGGTAACACTCCAGAGCAGTTGACATTAGCAGACTATGGATTGGATGGTAATAATCCTGCTGTAGGTCAAGTGAATGCTGATCTAGCACAACCTTGGGATGCAGACTTACAAGCTCTTGCAGATAATAATGATAACGGCATTGTTATCAGAAGACAGGCAGGTGCAATTTCAATTAGAGAAATTGTTGGTAACTATGAAATTAATATTGATGATGGTGATGGTGTTAATGGAAATCCAACTTTAAGATTAATTAATACTTTAGTTGTCCCAGATCCTGTAACTTATGATGATGGTGATTACAATACAGAGTCATTAACATCTGTAACTACTACTGGTCCAAAGGGAGAGTTAGTTGGCACCGAAACTGTAAACGCTACAAAATTTACAGTTGATAAAAAGGGTCGCTTAACAAGTGCAACAAATCTGCCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGACATATAATCATAATTTGCAGTATGCTAGATATGATATTGTTGATCATCTTGGTAATCTATATCAAGCACTCGCGCAAATGGGTACGGGATATGCAATTCCCTTTGGTCCAGTTCATACTTCTGGAGATGCATATAGTTGGAGATATCTCGGTCCTGCACTGACAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTCGACGTTGACAGCAACGGGCATGTCACAATTGCTGCAGTAGGTGTTGATAACCTACAACTACAAAATAATAGAGTCTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAGCTTGATCAAGAGCTTACTGCAACCACTGGATATAGAGGATTCAATTATCTTAACTATCTTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACGGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAACGTACGGTCGTATTTCTCTGACCCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACACTGGATAAGACTGGGGATGGCGACCTAACATTCCAGTTAACACAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAGTGCATCAGAAGCAGCTGGTAAGGTACATGTAGAGGATGCAAGATTCCAAGATAATTACATCGCCACAACCAATGCGACGATGAATCTGGATCCTGGTGATGATCGTGCTGCTACAGGAACAGTTAGAGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACTACCACCACTGTAAACTCAACAACTGTCACAGTTGATGATCCTATCATCACTCTTGGTGGAGATACTGCACCTACAACTGACGATAATTTAGATCGTGGTGTTGAGTTTAGATATTACGACACTGAAGCACGCTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTACTGAAGTCTTTAGTGGCACCGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATTTGGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAACATCGGCGGTTTGTTGGATGTTGATGGCACATTCAGAGCAAATAGCACATCTCGTTTCGACGATACGATGGTGCTCCGTGCTGCTTCTAAGTCACTACAATTCCAGAATGGTGCAGGCACTGTTAAGTCCGAGATTCATACAACTTCAGGTAATGCTGAGTTTGGTGGTATCTTAACAGTTACTGGTGCTACTGACCTCAATAGCACATTGAATGTTGCTAGTTCTGTCCACTTTGAAGCAACTGATGAACCCACCTTTGCATTGAATAGTGAAACTGGTGTTTGGGAAATTCAATCTGCTGACTATGGATCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATATATTGCTGGCGACTTTATGTTTGACAGCGACGTTGTTATCAACGGCACTATTCTACAGAAAGAATCTGCTGCAGAAGACTTCAACGAGCAAAACTTCCTGAGAGTTCGTCGTAAGTTTGAATCTGGATCCGTCCAGGTTCTAACCCCTAGTTATGCTTCACATACTAACTCAAACGCTAGAATCTTTGGTGGTGCTGGTATCGGCACTACTCTTCATATCGGCGGCACATCTTCCAACGAAGGTCTGTTTATTGGTAAGAAAGTCAATTCCGATACGGTCAAATTCTCTGTCCTAGGTGCATCTGGTAACACTGATATTGAAGGCACTCTCAATGTTGAGGGTGAAGTTACTATTCAAGATAGTGTAATTATCAATGCTGCCAACGAAGTATTCTCTATTAGAAATGGTTCTGGTGTTGCTAAGTTTGATGTTGATACTGATAACGGCAATACCTTAATTGAAGGGACTTTAAATGTTAATGGCACTGTCGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACGACGGATAAATTCTTCGTTGATAATGTAACTGGCAATACTGATATCCAAGGCACACTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTCAGCAATGCTGTAACATTCGATCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGCACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAACACGGACAAGATGACCGTGAAGTCTTCATCAGGTAACATTGCAACGGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACCATCAACGATTCACTGATTGTCGATGCTTCCAATGAAGTCTTCTCCATCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCCGATAACGGTAATACAAATATCATTGGCACCTTGACTGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCCTTGGCGTCTCTAATGTTGTAACCTTCACAAGAAATACCCAACAAACTCTAACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGCTATTGGTAAGAATCTTGCAGTTAGTGGTGATGCTAGAGTTTATGGCGGCACTGAATTAACTGGTGCTCTGGATCTTAACAATAGTGCAGACATCTCTGGTGCTCTGGTAACTCACGACAATGTAACTATCACTGCAAATAACAAAACATTTGCTATCCAAAATGGATCTGCTGCTAACAAACTTACAGTAGATACTGATAATGGTAACACTGATATTCGTGGCACCCTAGACATTGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAATCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGATGGTAAGGATCGTGGTGTTGAATTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAGTTGGCTTCTTCGGATACGATAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAGTAGATGCAACTAACTCATCAGAAGTCCTTTCAGGCACTGATGGTGCTCTCCGTGCTGGCAGTCTGAATCTTACTGGTTCTGGCACCACTCTTGATGTTGATGCCAATGCTAATATTGATGGCACCCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTCCTGCACTGGTTATTCCTACAACCAATAAGATTAACAATCTGAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTACAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTGAGGACTGCAAGGACAATCACTGTTGATGGTGTAGTTGATGGTAGTGTATCCTTTAACGGATCTGCTGATGTTACTATTAGCACTACTTACAATGATGCAGACATCACTGCGCTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGGACTGCTGCTAATACTTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTGTTACTAATGCTGATGGTGTATCGGGCAATATCACCATTAACGTCGCTTCTGCAAGCAGCAACTCAGCAAACAACCTTGTCATTCGTGATGCTTCTGGTGATTTTGCTGCCAATGAAATTACTGCTGATTTGATTGGTGGTGTAACGGGTGACGTTGTTGGTAACGTAACTGGTAATCTCCAAGGTAGTGCATCTCAGGTTGATACCGTCACTGCATCCAGTGCCAATGCCGCTTATCATCTGACGATGGTTGACCAACATAATACTGTTGCGAATAACGAAACCATTAATACAGACCAAAGTCTGACTTATAATCCATCTACTAATCGCCTAAAGACTAAACTTGAATTACAGACAGATGCTGCACCCGCCAGTGCAACAGCAACTGGTACTGTTGGCGAAATTCGTTACGATGCAAACTATATTTACATCTGTGTTGCTACTGACACCTGGAAAAGATCCACCCTCGATACTTGGTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.