Protein

UniProt accession
V5UT29_9CAUD [UniProt]
Protein name
Virion structural protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9102

Protein sequence
MPAINVARTDTFEQQRLKINDISTQIFDVTSGGSNLATGELKIGDGTRVTPSLAFTSDSSLGIFKADTGTLGIVSAGKNLFDYAPLEVISYRDIKVRKKILVQSGLTVVNQGQNYDTGNYSSVILTGGSGEGATADIVVLEFKGTVTNTGANYAAGSYAAQPFVSSGSPTLGMFADFDVDGIIGDIVEGSAYVPGTYTDVPITGGSGTGAEATITITGNTQYPGTISNAGSGYPDGVYTFVQAFNTPTQTFAVSTVANGGTPPPAEIFQIDGQNQAVLNLVVGNTYRFDQSDASNTGHPLMFNDSVGSFLPAEYIMLSNGTPGSAGAFADIIVLPEATVGTVIQYNCSVHAGMGATINIVSGTAGSYGYGTSYDITITSGSATGIITASGGIGYQAGDVVNFPNSFLGGAGTGLEFTLSGPVYDGEVTAVVFTDNGQNYVTGNILSAADSDLGGGGGSGFSYTVTSNPGKIDAITISSYGTDHAVGDIQTLPVAVSSISSTLPGQVNGASATLTGSSAVVAMTTTAGINPGMNIYTDAGSTGDAGSGTLTVQTVDNATQITMSGPAITGGAATLTFVSPLGLSTIEVADASGIFGGYTVSKVSGAGVLADDTTVSSVDLTTTPNQIVLSASPTTPGAAVLDFAPPFGVGTTPFAFTIDALGVIDDTVFTLSDDGNGYNIGDSLSVDASSLTQPIIYTLTTQPTQLITFSSAVTSSAISVGDVVKVADGVPQSVSGAGSTILAEASAVYSGITVFTTSGNGQGGTIDISRDSAGDVSTVIFTGGLFYADTDTCTIGGNLVGGASPADDVTVTINGASLSTDAEVYVVNTAGGNIANIITYAAGFADAESIIVGATTASYGTTEYTINTAGTTRNKFFLDIGSGPQMHPDLTFYVGNKYQIDTSDASNNVHTFAFSALPGGSKAPSLVESVSTTLDSTSTQITVTSSAGIVAGMTVTETGTGAGELAINTTVESVDNATTITLSDAPLVSGLVTLTFAGNEYTDGVIRNQNDVEITVTANTPTTLYYYNSINDPENAESGGDIGSEATITSDPNNPKVFGSGFEVTVTQTQVSDTIRQDVDTGTITLVEVVSQQLSSSAANISGTLTAPRIDGGDIEVTNLTNITTNTITLNTSNVNVSADLAVGSAFTVAESTGNLTIGGTFVTTNTININSELVLENNEVRSVTSDLVLEPATGRVVKVEGTTAINIPAGDTSERPGAAAVGNGSIRFNTQTNQYEGYSATSQAWSSLGGVRDLDGNTYIIAEQTIGSNDNTLWFYNDAINTVKFGPTKLEFVTNKKIQSPAVNAPAYQTWTANTPVTIGQYVKWLNNLYEVTVAGTTGTSGNEPIHTTGNQLNGTAILTWSQLAVAPLTFEEIEEVRIGPDAACPVVINSELRLADNTISTDVSDLVIRPNAGKKLTIDAASSIVIPVGTDGERGVQAQGSIRFNTSATQFEGYDGSNWGSLGGVKDVDQNTYIIPETSPGANENVLYFYNDGNNTLRLTTTELQFDTVDTIVSSTSDEFEITASLMTFDGAATTLDNTAVDTTFLHGSKQYFDIGLSSGLFVEPVLRLDNQGDVYLNTGFGTGTINQVKVFDGDLREFELNDIKILTDKVSLTQGTVNNTNSILYPTATAMGAKTVIVAHNTTSNEKEFIEFGITDDNTNVFHTEYGNVRTGTQLIVPTFEVTGSNEVRLNIAIGSNVPTTETVNITVTSTITKK
Physico‐chemical
properties
protein length:1717 AA
molecular weight: 176724,17470 Da
isoelectric point:4,05003
aromaticity:0,07222
hydropathy:0,03500

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014h
[NCBI] 		1340810 Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Sedonavirus tusconh >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHB80495.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF156338 [NCBI]
CDS location
range 79644 -> 84797
strand +
CDS
ATGCCAGCAATTAATGTAGCACGTACTGATACCTTTGAACAGCAAAGGTTAAAAATTAATGACATCAGTACCCAAATTTTCGATGTCACATCTGGTGGTAGTAACCTCGCTACTGGAGAACTAAAAATTGGTGATGGAACTAGAGTTACGCCAAGTTTGGCGTTCACTAGCGATTCATCACTGGGTATCTTCAAGGCAGATACAGGAACTTTGGGTATTGTTTCTGCTGGTAAAAATCTATTCGACTATGCACCTTTAGAGGTAATTAGTTACAGAGATATCAAAGTAAGAAAGAAGATTCTTGTTCAGTCTGGTTTAACAGTTGTAAACCAGGGTCAAAACTACGATACTGGCAACTATAGTAGTGTAATTTTGACTGGTGGATCTGGTGAAGGTGCAACTGCAGATATTGTTGTACTAGAATTTAAAGGCACAGTTACTAACACAGGTGCTAACTATGCTGCTGGTAGTTATGCAGCACAACCATTTGTTTCTAGTGGGTCCCCTACACTAGGAATGTTTGCTGACTTTGATGTAGATGGTATTATAGGAGACATTGTAGAGGGTTCCGCGTATGTTCCTGGAACATATACCGATGTCCCTATTACAGGTGGTTCAGGAACTGGTGCGGAAGCAACGATTACTATTACTGGTAATACCCAATATCCTGGTACTATTTCCAACGCTGGTTCTGGATACCCAGATGGTGTGTATACATTTGTACAAGCATTTAATACACCAACACAAACATTTGCTGTTAGTACAGTAGCAAATGGAGGAACACCACCACCAGCAGAGATTTTCCAAATTGATGGTCAAAATCAAGCTGTACTAAATTTGGTCGTCGGTAATACTTACAGATTTGACCAGTCTGATGCATCAAATACTGGTCATCCGTTGATGTTCAATGATAGTGTAGGTAGTTTCTTACCTGCAGAATACATCATGCTTTCTAACGGTACTCCTGGTAGTGCTGGAGCATTCGCAGATATTATCGTTCTTCCTGAAGCAACCGTTGGTACTGTTATACAATACAATTGTTCTGTCCATGCTGGCATGGGTGCAACAATTAATATCGTATCTGGTACTGCTGGATCTTATGGTTACGGTACTTCTTATGACATCACTATTACTAGTGGATCTGCTACTGGTATTATCACTGCTTCTGGTGGCATTGGATATCAAGCAGGCGACGTTGTAAATTTCCCAAATAGTTTCTTGGGTGGTGCTGGTACTGGATTAGAATTTACGTTAAGTGGTCCTGTATATGACGGTGAAGTTACTGCCGTTGTATTTACAGACAATGGACAAAATTATGTAACTGGTAATATTCTAAGTGCTGCAGACTCTGACCTAGGTGGAGGCGGTGGATCTGGATTCTCGTACACAGTAACTAGTAACCCTGGTAAAATTGATGCAATTACGATTTCATCTTATGGAACTGATCATGCAGTAGGTGATATTCAAACTCTACCAGTAGCAGTCTCTAGTATATCTTCTACACTGCCTGGACAGGTAAACGGTGCATCTGCAACTCTCACTGGTTCTTCTGCTGTTGTCGCAATGACAACTACTGCAGGAATCAACCCAGGAATGAATATCTACACTGATGCTGGAAGCACTGGTGATGCTGGTTCTGGAACACTAACTGTTCAAACGGTTGATAATGCTACCCAGATTACTATGTCTGGTCCTGCAATCACTGGTGGTGCAGCAACCTTGACTTTTGTTTCTCCACTTGGACTATCTACGATTGAAGTTGCCGATGCTTCTGGTATTTTTGGTGGATATACTGTTAGTAAAGTAAGTGGTGCTGGTGTTCTCGCTGACGACACCACAGTTTCTTCTGTAGATCTAACAACTACACCAAATCAAATTGTTCTTTCTGCTTCACCAACAACTCCTGGTGCTGCAGTTCTAGACTTTGCACCTCCATTTGGAGTAGGAACAACTCCATTCGCATTTACAATTGACGCTCTAGGAGTTATTGATGATACAGTGTTCACACTGTCTGATGATGGTAATGGATACAACATTGGCGATAGTCTGAGTGTAGACGCATCTTCACTCACACAACCAATTATATACACACTTACAACACAACCAACTCAACTAATCACATTCTCTAGTGCAGTTACGTCTTCTGCAATTAGTGTTGGTGATGTTGTTAAAGTTGCCGATGGTGTGCCACAATCAGTAAGTGGTGCTGGTTCAACTATTCTAGCAGAAGCATCTGCCGTATATTCTGGAATTACAGTATTCACAACATCTGGAAATGGACAGGGTGGTACCATTGATATTTCTAGAGACAGTGCTGGTGACGTTAGCACAGTTATATTTACTGGTGGTTTGTTCTATGCAGACACAGACACTTGTACGATTGGCGGAAACCTAGTTGGTGGTGCAAGTCCAGCAGATGATGTTACCGTTACTATTAATGGTGCTTCTCTAAGCACAGATGCAGAAGTTTATGTAGTCAATACTGCTGGTGGAAACATCGCCAACATTATTACATATGCTGCTGGGTTCGCTGATGCGGAAAGCATTATTGTTGGTGCTACCACTGCTTCTTATGGAACAACTGAATATACCATCAATACAGCAGGAACAACTAGAAATAAGTTCTTCCTTGATATTGGTTCTGGACCACAAATGCATCCAGATCTAACTTTCTATGTTGGTAATAAGTATCAGATTGATACATCTGATGCATCAAACAATGTACATACATTTGCTTTCTCTGCACTGCCAGGTGGATCTAAAGCACCAAGTTTAGTAGAGAGTGTTAGTACGACCCTTGATTCTACTTCTACACAAATTACTGTAACCTCATCAGCTGGTATCGTTGCTGGAATGACAGTAACAGAGACTGGAACTGGTGCTGGAGAATTGGCAATCAATACAACTGTTGAATCTGTTGATAATGCAACAACAATTACTCTATCAGATGCCCCACTAGTTTCTGGTCTAGTAACTCTGACATTCGCTGGTAATGAGTATACTGATGGTGTAATTCGTAATCAAAATGATGTTGAGATTACAGTTACTGCAAATACTCCAACTACACTATATTACTACAACTCAATTAATGATCCAGAAAATGCTGAGTCTGGTGGTGACATCGGTAGCGAAGCAACTATAACATCAGATCCAAATAACCCCAAAGTATTTGGTAGTGGATTTGAAGTTACTGTAACTCAAACTCAAGTATCTGATACAATTAGACAAGATGTCGATACTGGAACTATTACCTTGGTGGAAGTAGTTTCTCAGCAATTGTCATCAAGTGCTGCTAATATATCGGGAACTCTAACTGCTCCAAGGATCGATGGAGGAGACATTGAGGTAACAAACTTAACTAATATCACCACCAATACGATTACATTAAACACAAGTAATGTTAACGTGTCTGCTGATCTTGCGGTTGGTAGTGCATTTACTGTTGCGGAATCTACTGGTAACCTAACGATCGGTGGTACTTTTGTAACTACTAATACAATTAATATTAATAGTGAACTTGTTTTAGAAAACAATGAGGTTCGCTCTGTAACTTCCGACCTAGTTTTAGAACCAGCTACTGGTAGAGTTGTCAAAGTAGAAGGAACTACAGCAATTAACATTCCTGCTGGCGATACATCAGAAAGACCTGGCGCAGCAGCAGTTGGTAATGGATCTATCAGATTCAATACACAAACAAACCAATATGAAGGATACAGTGCTACATCTCAAGCATGGTCTTCTCTTGGTGGTGTTAGAGACCTAGATGGCAATACTTATATCATTGCAGAACAAACAATTGGTTCTAATGATAATACCCTTTGGTTCTATAACGATGCTATCAATACTGTTAAGTTTGGTCCAACCAAGTTAGAGTTTGTAACTAATAAAAAGATTCAATCTCCAGCAGTCAATGCACCTGCATATCAAACTTGGACAGCAAATACTCCAGTAACAATTGGTCAATATGTCAAGTGGTTGAATAACTTATACGAAGTTACGGTTGCTGGTACAACTGGAACTAGTGGTAACGAACCTATCCACACCACAGGTAATCAACTAAATGGTACTGCAATTCTTACATGGTCTCAGTTAGCAGTTGCACCTTTAACATTTGAAGAGATTGAAGAAGTTAGAATCGGACCTGATGCTGCATGTCCAGTTGTTATTAATTCAGAACTGCGTTTGGCAGACAATACCATTAGCACTGACGTTAGTGATTTGGTCATCAGACCAAATGCTGGTAAAAAGTTAACTATTGATGCTGCGTCTTCAATTGTAATTCCAGTTGGCACCGATGGTGAAAGAGGAGTTCAAGCACAAGGCAGTATTCGATTCAATACTTCAGCAACACAGTTTGAAGGATACGATGGATCAAACTGGGGTTCTCTTGGTGGAGTAAAAGACGTTGACCAAAATACTTATATTATTCCAGAAACTTCACCTGGAGCAAATGAAAATGTCTTGTATTTCTATAACGATGGTAATAATACATTAAGACTGACTACTACAGAATTGCAGTTTGATACTGTAGATACAATTGTTTCATCTACTTCTGATGAATTTGAGATTACAGCATCTCTAATGACATTTGATGGTGCTGCAACAACATTAGACAACACCGCTGTAGATACAACATTCTTGCATGGTAGCAAGCAATACTTTGATATTGGACTTTCTAGTGGTCTTTTTGTCGAACCAGTCTTGAGACTCGATAACCAAGGTGATGTATACCTCAACACAGGTTTTGGAACTGGAACCATCAATCAAGTTAAAGTTTTTGATGGTGACCTGCGAGAATTTGAACTTAATGATATTAAGATTCTGACTGATAAAGTTTCATTAACACAAGGAACTGTAAATAATACAAACTCTATCCTTTATCCTACGGCAACTGCCATGGGAGCCAAGACAGTTATTGTTGCTCACAATACTACATCTAACGAAAAAGAGTTTATTGAATTTGGAATTACTGATGACAATACCAATGTATTCCATACAGA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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.