Protein
- UniProt accession
- V5USF6_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Structural protein
- RBP type
-
TSP
evidence: RBPdetect2
probability: 0,6393
- Protein sequence
-
MPVGFNSPARNLFLLGSSGAQVATNFFKSIDQSSSTDGTFVPSEIKFNYLDQKYILSGSASDSNSKYVGWIEKRDYDSTTDPENPTSTSEWDVRIQATQSSANTLLLAMELDSNNNLVVAGRTSSIPWVAKYSNAGVLDWQSTSNTGDLSYTGITSDSNGNYYACGSTDGGTPATLEAVAFVEKFDSNGNPGWGKQAFMLGRDVVLEKISANSRGEVVAVGFLEDDSAEKGYIVKIDTNTGEVLWDRTLERNISGYGGSSNDDIAAAEVRCTACYIDSKDQIYVVGTITGNSPVDNGTGEFLIKYSPEGNIIWQKENETIHYTALDGAPNVVPFDVKSDGETEQTVVLSVEDQGSFALNDSDIFITKYSKNGDLVFRRKISKGIDNLGAASLDADPSFYYILFRDQKFDVLAGEPDRYTFGKVSTSGNGLGAFQYDDLGPTATDIDYTVISNAENKIGRLSDGSVRNDTSDLVTYPFTANKLVFDDLATHVSNKRRQMDSADSFEYGGSPAIRINEFDQELNLLGNVYSGSGDWLDQSGKGRDTSASPGEPFYGSGGARFDGIDNYLEIANSTDFQFGTGDWTIEFWWKGFPSGSFTAVITTLISSNEAGTWRIGTRYNSTNRIYFARGTGSDFTDRQIDVNVNDNRWHHIAFVRSNGVIIPFVDGVDRTSDLVNGNLLDSNSMTTSNPVKIGYNQRDNAYIEGSVSQLRVVKGIAVYTSNFTPPTEALTAIPGTSLLTCQGLSITDASSSNHTITDPNAGSSAMVQSDLPIGRPTYNAAGYWDFDGFSEYLDASPPILKNYAGGTIEAWFKTGDSTTNGSTIYSEHTSGITGAGWAHLRIRGGKLRYTINPASGLTVKIQCAKFVDDNNWHHVVFTGSGSGSNGYKFYIDGMRYNESIIGDDNGYKWFNNNPATNEYSIGKTGQSTDGNNYFMGSLGDVRIYSRALTQAQAHQNYNATKSKYINEAPSTAPRITDKSIVIDSLRLYYDFGNRATYDTAQNLIPNSEDFTKWNQAVHFWENNYAIAPDGTKTAALLKESIPSQQQLSYHNIGLGGTSLVVGETYTFSVYAKANTRDTFEMHMYGDSSASFNLTTGSSTSTSSMTDVGDGWWLCKWVREKTNTAGFDYVYLGFSGSTYAGAGVDESIFIWHPQFERDVTRGRYIKTSGISITAPTTVKNLSSSSSGVGASLYTGTINGGATFNSDGYFEFDGTDDYIQSSSLVAPSEADFSVIMWYKITSTSGRGGLMERAADAPFTGWFLGHSGTTRWAAQVRDADNDEVDFEFTFPTVDQWTCDAFTWNTSTQSLAPYRNGAAAAGTATQSGNAVGSLDGNTRYPMAIGARLNDSGAQYKPMECGEVQIYIKALTAAEVLQNFNATRSKYGV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1383 AA molecular weight: 150365,81220 Da isoelectric point: 4,65815 aromaticity: 0,11569 hydropathy: -0,41265
Domains
Domains [InterPro]
IPR011047
217–414
217–414
1
1383
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Synechococcus phage ACG-2014h [NCBI] |
1340810 | Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Sedonavirus tusconh > |
Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHB80593.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF156338
[NCBI]
CDS location
range 165256 -> 169407
strand +
strand +
CDS
ATGCCAGTAGGTTTTAATAGTCCCGCCAGAAACCTTTTTCTTTTAGGTTCTTCTGGCGCACAAGTAGCAACGAACTTTTTTAAGTCTATCGATCAGTCTTCATCAACTGATGGTACTTTTGTTCCAAGTGAAATTAAATTTAATTACCTAGATCAAAAGTACATTCTGTCTGGTTCAGCATCAGATAGTAACTCAAAATATGTTGGGTGGATTGAAAAAAGAGATTACGATTCCACTACTGATCCAGAAAATCCAACATCAACGTCTGAATGGGATGTAAGAATTCAAGCGACACAATCATCTGCTAATACATTACTGCTTGCTATGGAGTTGGATAGTAACAACAATTTAGTTGTTGCTGGTAGAACAAGTAGTATTCCTTGGGTTGCGAAGTATTCTAATGCTGGTGTACTAGACTGGCAATCAACATCTAACACTGGTGACTTATCATATACTGGCATTACATCAGATAGCAATGGAAACTATTATGCTTGTGGTAGCACAGATGGTGGAACCCCAGCAACCCTGGAGGCAGTAGCATTTGTAGAAAAGTTTGATAGTAATGGCAACCCTGGATGGGGCAAACAAGCATTTATGTTAGGCAGAGATGTTGTTTTGGAAAAAATCTCTGCTAACTCTAGAGGTGAGGTAGTCGCTGTTGGATTCCTAGAAGATGACAGTGCTGAGAAAGGATACATCGTTAAGATTGATACCAACACAGGTGAAGTTCTATGGGACAGAACACTAGAGAGGAATATATCTGGATATGGTGGATCAAGTAATGATGATATTGCAGCTGCCGAGGTAAGATGTACTGCTTGTTATATTGACAGCAAGGATCAAATTTATGTTGTTGGTACTATTACTGGTAATAGTCCTGTTGACAATGGTACAGGAGAGTTCCTTATCAAGTATAGTCCCGAAGGAAATATTATATGGCAGAAAGAAAACGAGACTATACATTACACTGCGCTTGATGGTGCCCCTAATGTAGTTCCATTTGATGTTAAATCTGATGGTGAAACAGAGCAAACAGTTGTGCTATCGGTAGAAGACCAAGGATCTTTTGCTCTTAATGATTCTGATATTTTTATAACTAAGTATTCTAAAAATGGAGACTTAGTTTTTAGAAGAAAAATTAGTAAAGGTATTGATAATTTAGGTGCTGCTTCTCTAGATGCTGACCCGTCATTCTATTATATTTTGTTTAGAGATCAGAAATTTGATGTGCTGGCAGGAGAACCAGACAGATATACTTTTGGTAAGGTCAGTACGTCTGGTAATGGTTTGGGTGCTTTCCAATATGATGATTTAGGACCAACCGCAACAGATATTGACTATACTGTTATCTCTAATGCAGAAAATAAAATTGGCAGACTATCTGATGGTTCTGTAAGGAATGATACAAGTGATCTAGTTACATATCCTTTCACTGCTAACAAACTAGTCTTTGATGATCTTGCTACTCATGTCTCTAACAAGAGGAGACAGATGGATAGTGCTGATAGTTTTGAGTATGGTGGTAGTCCTGCTATTAGAATTAATGAGTTTGACCAAGAGTTAAACCTACTCGGCAATGTCTATTCTGGTAGTGGAGACTGGTTAGATCAATCAGGTAAAGGTAGGGATACTAGTGCTTCTCCTGGAGAACCTTTTTATGGTTCTGGTGGAGCAAGATTTGATGGTATTGATAATTATTTAGAAATTGCAAACAGCACAGACTTTCAATTTGGAACTGGTGATTGGACTATTGAATTTTGGTGGAAAGGGTTTCCTTCAGGATCTTTTACTGCTGTCATTACAACACTGATCTCCAGTAATGAAGCAGGAACTTGGAGAATTGGAACAAGATACAACAGCACCAACAGAATTTATTTTGCTCGTGGAACTGGTAGTGATTTTACAGATAGACAAATAGATGTCAATGTTAATGATAATCGATGGCATCATATTGCTTTTGTTAGAAGTAATGGAGTCATCATTCCTTTTGTTGATGGTGTTGATCGAACATCAGACTTAGTAAATGGGAATCTCCTTGATTCTAATAGTATGACTACAAGCAATCCTGTCAAGATTGGATATAACCAGAGAGATAATGCTTATATTGAGGGTAGTGTTTCTCAATTGAGAGTAGTTAAAGGAATAGCAGTATATACAAGCAACTTTACACCACCAACCGAGGCTTTAACTGCTATTCCAGGTACATCTTTACTAACATGTCAAGGACTTTCTATAACTGATGCTAGTAGTAGCAATCATACAATTACAGATCCTAATGCAGGAAGTTCGGCCATGGTGCAGAGCGATTTACCCATTGGTAGACCTACCTACAACGCCGCTGGATACTGGGACTTTGATGGATTTTCTGAGTACCTTGATGCATCACCTCCAATTCTTAAGAACTATGCTGGTGGAACAATTGAAGCATGGTTTAAGACAGGAGATAGTACAACCAATGGATCTACAATTTATTCGGAACATACAAGTGGAATTACTGGAGCTGGTTGGGCACATCTCAGAATTCGCGGCGGTAAACTAAGGTATACTATTAATCCTGCGAGCGGATTGACAGTAAAAATTCAATGTGCCAAGTTTGTGGATGATAACAATTGGCATCATGTTGTGTTCACTGGTAGTGGGTCTGGATCAAATGGTTATAAGTTTTATATTGATGGTATGAGATACAATGAATCTATAATAGGTGATGATAATGGATACAAATGGTTTAATAACAACCCTGCAACGAACGAATATTCTATTGGAAAAACTGGACAAAGTACAGATGGTAACAATTATTTTATGGGTTCACTCGGTGATGTTCGTATCTATTCAAGAGCTCTAACACAAGCACAAGCCCACCAGAACTATAACGCTACCAAGTCTAAGTATATCAACGAAGCACCTTCCACAGCACCTAGGATTACTGATAAGTCTATTGTAATTGATAGCCTGAGACTATACTATGACTTTGGAAACAGAGCAACGTATGATACAGCACAAAACCTTATTCCTAATAGTGAAGACTTTACTAAGTGGAATCAAGCAGTTCACTTCTGGGAAAATAACTATGCTATTGCTCCTGATGGAACTAAGACAGCAGCATTATTAAAAGAATCTATCCCATCACAGCAGCAGTTGTCTTACCACAATATTGGTCTCGGTGGAACATCTTTAGTTGTTGGAGAAACATATACTTTTAGTGTATATGCCAAAGCAAATACCAGAGATACCTTCGAGATGCATATGTATGGTGATAGCAGTGCTAGTTTCAATTTGACTACTGGATCTTCAACGTCCACTTCTTCCATGACAGATGTTGGAGATGGTTGGTGGTTATGTAAGTGGGTTAGAGAAAAGACTAATACTGCAGGTTTTGATTATGTTTATCTTGGATTTTCTGGTAGCACATACGCTGGTGCTGGAGTAGATGAATCGATATTCATTTGGCATCCTCAATTTGAAAGAGATGTTACCCGTGGCAGATACATCAAAACATCTGGAATTTCTATCACAGCACCAACCACAGTCAAGAACCTCTCAAGTTCTTCTTCTGGAGTTGGAGCGTCGCTTTATACTGGCACAATCAACGGAGGAGCTACATTTAATAGTGATGGATACTTTGAGTTTGATGGAACAGATGATTACATCCAATCAAGTAGTCTAGTGGCACCTTCAGAAGCAGACTTTAGTGTTATCATGTGGTATAAGATTACTAGCACTTCTGGTAGAGGTGGTCTCATGGAAAGAGCAGCTGATGCTCCTTTCACTGGATGGTTTTTAGGTCATAGTGGAACCACCAGATGGGCTGCTCAGGTTAGAGATGCCGATAATGATGAGGTTGATTTCGAGTTTACTTTCCCAACAGTTGATCAATGGACTTGTGATGCGTTCACTTGGAATACCTCAACACAATCACTAGCACCATATAGAAATGGTGCTGCTGCTGCTGGAACAGCAACGCAATCTGGAAATGCTGTTGGATCTTTAGATGGCAATACAAGGTATCCTATGGCAATTGGTGCTAGACTTAATGACAGTGGAGCACAATACAAACCTATGGAGTGTGGTGAGGTTCAGATATATATTAAAGCTCTAACAGCAGCAGAAGTTCTCCAAAACTTCAATGCCACCCGTAGTAAGTATGGTGTCTGA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.