Protein

UniProt accession
J9QL18_9CAUD [UniProt]
Protein name
Putative tail protein pb4
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,6126

Protein sequence
MIINNATEKLVIQSLAPSYTKLYVLHSIYRDYDVVGRSFWTYGSGVASERRDITDTSINFATLSGFNSSTEYSLRGAFFDAMVDAELLEAQIGINLSDATSFTTKQMPTITSVQSIAESVDVGVGPPRVSISTLGDADYCILEFKEVGASTWRRYYTGALAPTITFSGVPIGEYNVRIVGFITLPDGSTTEASTPFEFPQVLTVLYNFIPPSAPKNIQFKAARIQDGKERYDVRVEWDWEKDIGANVREFSLHYVEFDEFAVSGWEKAQVINVGAARAATITSFPFNRRYKFKVSSIAWGPDTQAITEAPSVEYILTEDTILDSSFTNETGIEVNYAHIKGSFKDGTIWRQSFLIDAATGAVSLGALDSEGRAPISFDPLSRTVNVDGSVITKSIYSANFILTNLTGEDNPAIFSQGKNWGDNNSGIWMGMDNTTLKPKFELGNSTQFIRYDGDTLRISGDTVIGTPSGDIDISTGLQGKQTVFIYRLAPPVITSPPASPDYPPEGWSTTPPARTSSLQSIYVSTGLLNPITNKLVDGEVWSNPSMWTGVRGADGTSAKNFSISSTAQSFSFTGEGAVKSASTITFTGNRSNAAGTITWTARNNSSAIVPLSITGDTATLSVANFGASLFVTVTATCDGISDVITIVRLIDGSNALTGYLTNESVSVPASSTGVVSSFSAATGQFKVFYGTWDVSSACTFSLVASSAATGAIGSASGTYNISAMSANLGSITLRASHPTYGTVEKIFSISKSIAGVEGIAGTAAKGFSITSTAQSFVYTGIGTLKSAPSIVFTALRQSTTANVTWSAVSNTGATVALTSVSNTGATLTSANQGGFAWVTVTATCDGMSDKITIVLLTDGSNVMSGYLTNEAVVLDSNSDGYVQVYTSATGYFKVYFGTADITSQCTFSVSNPSNLTTSINSAGLYSTTAMAPGVGVTQGYSDLTATHPTYGSITKRLSISKSLAGRGYNVIYTTNFENSSRGSWNGSPIQDDSALVPLGFTKYMPCYERDTLEANNIVSVVAGEKYKVRALINTEASQQTVYLGARLLNAEKEHVTWAIADGAGRAPTPGWGVIQGTLTIPNGVAYIIPWIQRSGPHGTANGYSRVTDISFEDLSMKGIDGTDGNDGTSVLVQWSVNGVNNWHDTYVAGDKYMRQQVSGAWGPAAKVVGEDGTNGTAGTYVSFIFRASTTRPPQPLGQNPPGWTDSPPSSGVVWMSSATKTGDTGFLLSAWSVPVKLTGETGAKGDSITGPAGTRGVGTYTQAVAGLANFDTTIAWNFFISNFGSGPVAGDVLTQYRTGAPNIAFTRYWNGAAWTAAALVVHGDMIVNGTIPSAKIIDASITSAKIQDAAITNAKIANGTITNAKIQDAAITRAKISTTLESDNFVNNSTGTSINFATGQIQMNSTGAGGRMTITNERIDIYDENNRLRVRIGKL
Physico‐chemical
properties
protein length:1435 AA
molecular weight: 151916,49910 Da
isoelectric point:5,14031
aromaticity:0,09547
hydropathy:-0,05150

Domains

Domains [InterPro]
J9QL18_9CAUD
1 1435
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pectobacterium phage My1
[NCBI]
1204539 Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Myunavirus > Myunavirus My1
Host Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum
[NCBI]
555 Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Pectobacterium

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFQ22289.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JX195166 [NCBI]
CDS location
range 85495 -> 89802
strand -
CDS
ATGATAATAAATAACGCTACGGAAAAGCTAGTGATTCAGTCACTAGCCCCTTCTTACACAAAACTTTATGTTCTACATAGTATATACAGAGACTATGACGTAGTTGGTAGGTCTTTCTGGACGTACGGATCTGGAGTAGCTTCTGAGCGTAGAGACATAACAGATACATCAATAAACTTTGCAACACTATCAGGATTTAATTCTAGCACTGAATATTCCTTAAGAGGAGCATTCTTTGACGCCATGGTTGATGCCGAACTTTTAGAGGCCCAAATTGGTATTAACCTGTCAGATGCCACCTCTTTTACAACAAAACAAATGCCTACCATTACCTCAGTTCAATCTATAGCAGAGTCTGTAGACGTAGGGGTAGGCCCACCAAGAGTCAGTATTAGTACTCTTGGTGACGCTGATTACTGCATTCTAGAGTTTAAAGAAGTAGGGGCATCAACATGGAGACGTTATTACACAGGTGCTCTAGCTCCTACCATAACCTTTAGTGGTGTTCCTATTGGTGAGTATAATGTTCGTATAGTGGGGTTTATAACTCTTCCTGATGGATCTACTACAGAAGCATCCACTCCATTTGAATTCCCACAGGTACTGACAGTTTTATATAACTTCATACCTCCTAGTGCTCCAAAGAATATACAATTTAAAGCTGCGCGTATTCAAGACGGTAAAGAACGTTATGATGTTAGGGTAGAGTGGGATTGGGAAAAAGATATAGGTGCCAATGTAAGAGAGTTCTCTCTCCACTATGTAGAGTTCGATGAGTTTGCAGTAAGTGGGTGGGAAAAAGCTCAGGTAATTAACGTGGGTGCAGCTAGAGCAGCAACTATAACTTCGTTCCCATTCAACAGACGATACAAATTCAAAGTCTCTTCTATAGCATGGGGGCCAGATACTCAAGCTATAACTGAGGCACCTTCTGTAGAGTACATCCTTACTGAGGATACTATACTTGATTCAAGCTTTACTAATGAAACTGGTATAGAAGTTAACTATGCACATATAAAGGGTAGTTTTAAGGATGGAACTATATGGAGACAGTCTTTCCTTATAGATGCTGCTACTGGTGCTGTAAGCTTAGGGGCACTGGATTCCGAAGGTAGAGCACCAATATCTTTTGACCCTCTAAGTAGAACTGTTAACGTGGATGGTTCCGTTATAACCAAGAGTATATACTCCGCTAACTTTATTCTTACTAATCTTACTGGAGAAGATAACCCAGCAATATTTAGTCAGGGAAAGAATTGGGGTGATAATAACTCAGGAATCTGGATGGGTATGGATAATACTACCCTAAAGCCTAAGTTCGAATTAGGTAACTCCACTCAGTTTATACGCTATGATGGGGATACTCTTAGGATTTCAGGGGATACAGTAATAGGAACCCCTAGTGGGGATATAGATATTAGCACTGGTTTACAAGGTAAACAGACAGTATTTATATATAGGTTAGCTCCCCCTGTTATTACATCTCCACCAGCTAGTCCTGATTACCCTCCAGAAGGTTGGTCAACTACCCCTCCTGCGAGAACTTCTAGCCTTCAGTCTATATACGTTTCTACAGGTCTTTTAAACCCTATAACAAACAAACTAGTAGACGGAGAGGTCTGGAGTAATCCTTCTATGTGGACAGGAGTAAGGGGTGCTGACGGTACTTCTGCTAAAAATTTCAGTATTAGTAGTACAGCTCAGTCTTTCTCTTTCACAGGGGAAGGTGCAGTTAAGAGTGCTAGTACTATTACCTTCACAGGTAATAGATCAAATGCCGCGGGTACTATAACGTGGACTGCACGTAATAACTCTAGTGCTATAGTACCTTTAAGTATAACAGGAGATACTGCTACTCTATCTGTAGCTAACTTTGGTGCTTCCTTGTTTGTTACAGTTACTGCAACTTGCGATGGAATATCCGATGTTATAACTATAGTAAGACTGATTGACGGATCTAACGCACTGACTGGGTACCTAACTAACGAGTCCGTGTCTGTACCTGCAAGTTCTACTGGAGTGGTTTCTAGTTTTTCTGCTGCTACAGGACAGTTTAAGGTATTTTATGGGACTTGGGATGTGTCTTCCGCATGTACGTTCTCACTAGTAGCTTCTAGCGCTGCTACTGGTGCAATAGGTAGTGCTTCCGGAACATATAATATATCTGCAATGTCAGCCAATTTAGGTAGTATTACTCTTAGAGCATCTCATCCTACTTATGGTACTGTAGAGAAAATCTTTAGCATCTCTAAATCTATAGCAGGTGTGGAAGGTATTGCAGGTACTGCTGCTAAAGGGTTCAGTATTACTTCTACCGCTCAAAGTTTTGTATATACGGGTATCGGTACTCTTAAATCTGCCCCTAGTATAGTGTTCACAGCCCTTAGACAGAGTACTACTGCAAACGTTACCTGGTCAGCGGTGTCCAATACGGGAGCTACTGTAGCTTTAACATCTGTTAGTAATACAGGTGCTACTCTTACTTCAGCTAACCAAGGGGGTTTTGCTTGGGTTACTGTAACTGCAACATGTGATGGGATGTCTGATAAGATAACTATAGTACTGCTTACTGATGGTTCTAACGTTATGAGTGGGTACTTAACTAACGAAGCTGTAGTTTTAGATTCTAACTCAGACGGCTACGTACAAGTGTATACTTCGGCTACAGGGTATTTTAAGGTATATTTTGGCACAGCAGATATAACGTCTCAGTGTACCTTTTCAGTGTCTAACCCATCTAACTTAACAACTAGCATTAACTCTGCAGGGCTGTATAGCACTACTGCAATGGCTCCCGGGGTAGGAGTAACTCAAGGGTATTCTGATTTGACTGCTACCCATCCTACTTATGGTTCCATAACCAAAAGACTAAGTATTTCTAAGTCTTTAGCTGGTAGAGGGTACAATGTAATATACACTACTAACTTTGAAAACAGTTCACGAGGTTCTTGGAATGGTTCTCCTATACAAGATGATTCTGCACTTGTACCTTTAGGCTTTACAAAGTACATGCCTTGCTATGAAAGGGACACCCTAGAGGCTAATAATATTGTATCAGTAGTAGCTGGAGAAAAGTATAAGGTTAGAGCACTGATCAACACAGAAGCATCACAGCAGACGGTATACCTAGGTGCTAGGCTATTAAATGCTGAGAAAGAACACGTCACATGGGCTATCGCAGATGGAGCTGGTAGGGCACCTACTCCTGGGTGGGGTGTTATACAAGGTACGCTTACAATACCTAATGGTGTCGCGTATATAATACCATGGATACAGAGAAGTGGGCCGCATGGTACTGCTAATGGGTACTCTAGGGTTACTGATATATCCTTTGAAGATTTATCTATGAAGGGTATAGATGGGACCGACGGTAATGATGGTACCAGTGTTCTTGTTCAATGGTCTGTAAATGGAGTTAATAACTGGCACGATACTTATGTTGCTGGGGATAAGTACATGAGACAACAAGTTTCTGGAGCTTGGGGTCCAGCTGCAAAAGTAGTAGGGGAAGACGGTACAAACGGTACTGCAGGAACTTATGTATCATTTATCTTCAGAGCCTCTACTACCCGACCTCCTCAGCCTCTAGGACAGAATCCCCCTGGATGGACTGACTCACCTCCTTCTAGTGGTGTTGTATGGATGAGTAGTGCCACGAAAACAGGGGATACCGGTTTTCTATTATCTGCTTGGTCTGTACCAGTTAAACTTACTGGGGAGACTGGTGCTAAAGGGGACTCTATAACAGGGCCTGCGGGTACTAGAGGGGTTGGTACATATACTCAAGCAGTAGCTGGCTTAGCAAACTTTGACACTACTATTGCTTGGAATTTCTTTATAAGTAATTTCGGGTCTGGGCCTGTAGCTGGTGATGTATTAACTCAATATAGAACAGGTGCTCCTAACATAGCATTTACAAGGTACTGGAATGGAGCAGCTTGGACAGCCGCAGCATTGGTGGTTCATGGGGATATGATAGTAAATGGTACTATACCAAGTGCTAAGATTATCGATGCGTCTATTACTAGTGCCAAGATTCAGGATGCGGCTATTACTAATGCTAAGATAGCTAATGGTACTATCACTAATGCTAAGATTCAGGATGCTGCTATTACTAGGGCTAAGATATCTACTACTCTAGAGTCTGATAACTTTGTTAACAACTCTACCGGTACGTCTATAAATTTTGCTACAGGGCAAATCCAGATGAATAGTACAGGGGCAGGGGGTAGAATGACCATAACCAATGAGAGGATAGATATTTATGACGAGAATAACAGACTCAGAGTTAGAATAGGAAAACTATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.