Protein
- UniProt accession
- J9QL18_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Putative tail protein pb4
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,6126
- Protein sequence
-
MIINNATEKLVIQSLAPSYTKLYVLHSIYRDYDVVGRSFWTYGSGVASERRDITDTSINFATLSGFNSSTEYSLRGAFFDAMVDAELLEAQIGINLSDATSFTTKQMPTITSVQSIAESVDVGVGPPRVSISTLGDADYCILEFKEVGASTWRRYYTGALAPTITFSGVPIGEYNVRIVGFITLPDGSTTEASTPFEFPQVLTVLYNFIPPSAPKNIQFKAARIQDGKERYDVRVEWDWEKDIGANVREFSLHYVEFDEFAVSGWEKAQVINVGAARAATITSFPFNRRYKFKVSSIAWGPDTQAITEAPSVEYILTEDTILDSSFTNETGIEVNYAHIKGSFKDGTIWRQSFLIDAATGAVSLGALDSEGRAPISFDPLSRTVNVDGSVITKSIYSANFILTNLTGEDNPAIFSQGKNWGDNNSGIWMGMDNTTLKPKFELGNSTQFIRYDGDTLRISGDTVIGTPSGDIDISTGLQGKQTVFIYRLAPPVITSPPASPDYPPEGWSTTPPARTSSLQSIYVSTGLLNPITNKLVDGEVWSNPSMWTGVRGADGTSAKNFSISSTAQSFSFTGEGAVKSASTITFTGNRSNAAGTITWTARNNSSAIVPLSITGDTATLSVANFGASLFVTVTATCDGISDVITIVRLIDGSNALTGYLTNESVSVPASSTGVVSSFSAATGQFKVFYGTWDVSSACTFSLVASSAATGAIGSASGTYNISAMSANLGSITLRASHPTYGTVEKIFSISKSIAGVEGIAGTAAKGFSITSTAQSFVYTGIGTLKSAPSIVFTALRQSTTANVTWSAVSNTGATVALTSVSNTGATLTSANQGGFAWVTVTATCDGMSDKITIVLLTDGSNVMSGYLTNEAVVLDSNSDGYVQVYTSATGYFKVYFGTADITSQCTFSVSNPSNLTTSINSAGLYSTTAMAPGVGVTQGYSDLTATHPTYGSITKRLSISKSLAGRGYNVIYTTNFENSSRGSWNGSPIQDDSALVPLGFTKYMPCYERDTLEANNIVSVVAGEKYKVRALINTEASQQTVYLGARLLNAEKEHVTWAIADGAGRAPTPGWGVIQGTLTIPNGVAYIIPWIQRSGPHGTANGYSRVTDISFEDLSMKGIDGTDGNDGTSVLVQWSVNGVNNWHDTYVAGDKYMRQQVSGAWGPAAKVVGEDGTNGTAGTYVSFIFRASTTRPPQPLGQNPPGWTDSPPSSGVVWMSSATKTGDTGFLLSAWSVPVKLTGETGAKGDSITGPAGTRGVGTYTQAVAGLANFDTTIAWNFFISNFGSGPVAGDVLTQYRTGAPNIAFTRYWNGAAWTAAALVVHGDMIVNGTIPSAKIIDASITSAKIQDAAITNAKIANGTITNAKIQDAAITRAKISTTLESDNFVNNSTGTSINFATGQIQMNSTGAGGRMTITNERIDIYDENNRLRVRIGKL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1435 AA molecular weight: 151916,49910 Da isoelectric point: 5,14031 aromaticity: 0,09547 hydropathy: -0,05150
Domains
Domains [InterPro]
IPR015406
1361–1416
1361–1416
1
1435
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Pectobacterium phage My1 [NCBI] |
1204539 | Uroviricota > Caudoviricetes > Demerecviridae > Myunavirus > Myunavirus My1 |
Host |
Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum [NCBI] |
555 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Enterobacteriales > Enterobacteriaceae > Pectobacterium |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFQ22289.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
JX195166
[NCBI]
CDS location
range 85495 -> 89802
strand -
strand -
CDS
ATGATAATAAATAACGCTACGGAAAAGCTAGTGATTCAGTCACTAGCCCCTTCTTACACAAAACTTTATGTTCTACATAGTATATACAGAGACTATGACGTAGTTGGTAGGTCTTTCTGGACGTACGGATCTGGAGTAGCTTCTGAGCGTAGAGACATAACAGATACATCAATAAACTTTGCAACACTATCAGGATTTAATTCTAGCACTGAATATTCCTTAAGAGGAGCATTCTTTGACGCCATGGTTGATGCCGAACTTTTAGAGGCCCAAATTGGTATTAACCTGTCAGATGCCACCTCTTTTACAACAAAACAAATGCCTACCATTACCTCAGTTCAATCTATAGCAGAGTCTGTAGACGTAGGGGTAGGCCCACCAAGAGTCAGTATTAGTACTCTTGGTGACGCTGATTACTGCATTCTAGAGTTTAAAGAAGTAGGGGCATCAACATGGAGACGTTATTACACAGGTGCTCTAGCTCCTACCATAACCTTTAGTGGTGTTCCTATTGGTGAGTATAATGTTCGTATAGTGGGGTTTATAACTCTTCCTGATGGATCTACTACAGAAGCATCCACTCCATTTGAATTCCCACAGGTACTGACAGTTTTATATAACTTCATACCTCCTAGTGCTCCAAAGAATATACAATTTAAAGCTGCGCGTATTCAAGACGGTAAAGAACGTTATGATGTTAGGGTAGAGTGGGATTGGGAAAAAGATATAGGTGCCAATGTAAGAGAGTTCTCTCTCCACTATGTAGAGTTCGATGAGTTTGCAGTAAGTGGGTGGGAAAAAGCTCAGGTAATTAACGTGGGTGCAGCTAGAGCAGCAACTATAACTTCGTTCCCATTCAACAGACGATACAAATTCAAAGTCTCTTCTATAGCATGGGGGCCAGATACTCAAGCTATAACTGAGGCACCTTCTGTAGAGTACATCCTTACTGAGGATACTATACTTGATTCAAGCTTTACTAATGAAACTGGTATAGAAGTTAACTATGCACATATAAAGGGTAGTTTTAAGGATGGAACTATATGGAGACAGTCTTTCCTTATAGATGCTGCTACTGGTGCTGTAAGCTTAGGGGCACTGGATTCCGAAGGTAGAGCACCAATATCTTTTGACCCTCTAAGTAGAACTGTTAACGTGGATGGTTCCGTTATAACCAAGAGTATATACTCCGCTAACTTTATTCTTACTAATCTTACTGGAGAAGATAACCCAGCAATATTTAGTCAGGGAAAGAATTGGGGTGATAATAACTCAGGAATCTGGATGGGTATGGATAATACTACCCTAAAGCCTAAGTTCGAATTAGGTAACTCCACTCAGTTTATACGCTATGATGGGGATACTCTTAGGATTTCAGGGGATACAGTAATAGGAACCCCTAGTGGGGATATAGATATTAGCACTGGTTTACAAGGTAAACAGACAGTATTTATATATAGGTTAGCTCCCCCTGTTATTACATCTCCACCAGCTAGTCCTGATTACCCTCCAGAAGGTTGGTCAACTACCCCTCCTGCGAGAACTTCTAGCCTTCAGTCTATATACGTTTCTACAGGTCTTTTAAACCCTATAACAAACAAACTAGTAGACGGAGAGGTCTGGAGTAATCCTTCTATGTGGACAGGAGTAAGGGGTGCTGACGGTACTTCTGCTAAAAATTTCAGTATTAGTAGTACAGCTCAGTCTTTCTCTTTCACAGGGGAAGGTGCAGTTAAGAGTGCTAGTACTATTACCTTCACAGGTAATAGATCAAATGCCGCGGGTACTATAACGTGGACTGCACGTAATAACTCTAGTGCTATAGTACCTTTAAGTATAACAGGAGATACTGCTACTCTATCTGTAGCTAACTTTGGTGCTTCCTTGTTTGTTACAGTTACTGCAACTTGCGATGGAATATCCGATGTTATAACTATAGTAAGACTGATTGACGGATCTAACGCACTGACTGGGTACCTAACTAACGAGTCCGTGTCTGTACCTGCAAGTTCTACTGGAGTGGTTTCTAGTTTTTCTGCTGCTACAGGACAGTTTAAGGTATTTTATGGGACTTGGGATGTGTCTTCCGCATGTACGTTCTCACTAGTAGCTTCTAGCGCTGCTACTGGTGCAATAGGTAGTGCTTCCGGAACATATAATATATCTGCAATGTCAGCCAATTTAGGTAGTATTACTCTTAGAGCATCTCATCCTACTTATGGTACTGTAGAGAAAATCTTTAGCATCTCTAAATCTATAGCAGGTGTGGAAGGTATTGCAGGTACTGCTGCTAAAGGGTTCAGTATTACTTCTACCGCTCAAAGTTTTGTATATACGGGTATCGGTACTCTTAAATCTGCCCCTAGTATAGTGTTCACAGCCCTTAGACAGAGTACTACTGCAAACGTTACCTGGTCAGCGGTGTCCAATACGGGAGCTACTGTAGCTTTAACATCTGTTAGTAATACAGGTGCTACTCTTACTTCAGCTAACCAAGGGGGTTTTGCTTGGGTTACTGTAACTGCAACATGTGATGGGATGTCTGATAAGATAACTATAGTACTGCTTACTGATGGTTCTAACGTTATGAGTGGGTACTTAACTAACGAAGCTGTAGTTTTAGATTCTAACTCAGACGGCTACGTACAAGTGTATACTTCGGCTACAGGGTATTTTAAGGTATATTTTGGCACAGCAGATATAACGTCTCAGTGTACCTTTTCAGTGTCTAACCCATCTAACTTAACAACTAGCATTAACTCTGCAGGGCTGTATAGCACTACTGCAATGGCTCCCGGGGTAGGAGTAACTCAAGGGTATTCTGATTTGACTGCTACCCATCCTACTTATGGTTCCATAACCAAAAGACTAAGTATTTCTAAGTCTTTAGCTGGTAGAGGGTACAATGTAATATACACTACTAACTTTGAAAACAGTTCACGAGGTTCTTGGAATGGTTCTCCTATACAAGATGATTCTGCACTTGTACCTTTAGGCTTTACAAAGTACATGCCTTGCTATGAAAGGGACACCCTAGAGGCTAATAATATTGTATCAGTAGTAGCTGGAGAAAAGTATAAGGTTAGAGCACTGATCAACACAGAAGCATCACAGCAGACGGTATACCTAGGTGCTAGGCTATTAAATGCTGAGAAAGAACACGTCACATGGGCTATCGCAGATGGAGCTGGTAGGGCACCTACTCCTGGGTGGGGTGTTATACAAGGTACGCTTACAATACCTAATGGTGTCGCGTATATAATACCATGGATACAGAGAAGTGGGCCGCATGGTACTGCTAATGGGTACTCTAGGGTTACTGATATATCCTTTGAAGATTTATCTATGAAGGGTATAGATGGGACCGACGGTAATGATGGTACCAGTGTTCTTGTTCAATGGTCTGTAAATGGAGTTAATAACTGGCACGATACTTATGTTGCTGGGGATAAGTACATGAGACAACAAGTTTCTGGAGCTTGGGGTCCAGCTGCAAAAGTAGTAGGGGAAGACGGTACAAACGGTACTGCAGGAACTTATGTATCATTTATCTTCAGAGCCTCTACTACCCGACCTCCTCAGCCTCTAGGACAGAATCCCCCTGGATGGACTGACTCACCTCCTTCTAGTGGTGTTGTATGGATGAGTAGTGCCACGAAAACAGGGGATACCGGTTTTCTATTATCTGCTTGGTCTGTACCAGTTAAACTTACTGGGGAGACTGGTGCTAAAGGGGACTCTATAACAGGGCCTGCGGGTACTAGAGGGGTTGGTACATATACTCAAGCAGTAGCTGGCTTAGCAAACTTTGACACTACTATTGCTTGGAATTTCTTTATAAGTAATTTCGGGTCTGGGCCTGTAGCTGGTGATGTATTAACTCAATATAGAACAGGTGCTCCTAACATAGCATTTACAAGGTACTGGAATGGAGCAGCTTGGACAGCCGCAGCATTGGTGGTTCATGGGGATATGATAGTAAATGGTACTATACCAAGTGCTAAGATTATCGATGCGTCTATTACTAGTGCCAAGATTCAGGATGCGGCTATTACTAATGCTAAGATAGCTAATGGTACTATCACTAATGCTAAGATTCAGGATGCTGCTATTACTAGGGCTAAGATATCTACTACTCTAGAGTCTGATAACTTTGTTAACAACTCTACCGGTACGTCTATAAATTTTGCTACAGGGCAAATCCAGATGAATAGTACAGGGGCAGGGGGTAGAATGACCATAACCAATGAGAGGATAGATATTTATGACGAGAATAACAGACTCAGAGTTAGAATAGGAAAACTATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.