Protein
- UniProt accession
- H8ZN75_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Gp14 neck protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,6208
- Protein sequence
-
MDTSLAIDEFKELYVTGGLRLKSDDTTRDSFWVGKIDTDGTFIWNYRYLAPTGGSITVTPSSAIDIFGDLNIAFTSFNNTNTLPTVDTVKIGYDGKIKNHTTNQFTQNNTEGITAYSVDVDNSGDINIVGQTQWNRNEFIFPFTGGSQVDTTSHYTLTSTSTSNSITYANDVAKIHGYADGQTTWTQGNLQITSAQLGARLNSDFTVEMMVYKDTNTSSLTGGSITQHTLLAIGDAEEATGALWLYYDVSSGYLELVVTNGSTKLNSASGAGQSSLNNMFADNTWQFIGLKREGNIFTVYVNGIQAIQSTVPSTALGSKHLYVGQIPGRSGSAGNFRINEQGQFHVDNFRLRNRAITPSVPSDVSAFPSAGGFGFQYTWTDTAWFTTNLNRYDLIDYDGFSLKIDKNADAARIGTVSTQTNTQLGFTRTAVTPVTGSTLTMQNTGYALSEAGFQSLDFDDATINMTPATETLTYTQDVWSSRTATVPSPGSQKLNVSAVVKDRYFFKVTPTTKIDNIQELTINQAFRFTVGSKLRLNNDSGSFVNSGYIVRVDDANNKVYLAVNNNTWTDDTATGNLVTEQFSEQSTYGIVGPIPNDINVIEGYTFPLVNNTTPGTFDIDLDKYNLDGTYNAAGSQNLDSFAKFKPFATIDYSVRIDEVSGSSPFIVGSVVQLTSSDISFNAAYSTTTITNLTGVTKITLVANLDKILQVSSVANSDEVYVITSTSHYLSVGDVIYVDGNPSQTVGSVVYDEYDGAFPVDRVISPLEFTYKLNQAAITSPATSAGSVNIFMKSPTLKMYYGHQYIFDLSHSSLVGGNLSFAKDSLYKLEYSFNSIERDGTPGVTGAGAPTPSVKLKVDPTIVTNISYYFDPSRTGSDSPVVPGSYLDVVDSPYKGNFEISSIAGQTITRGADIIKFPLLNEPEGAADINQASYATSSLRAVGSINAVRIVNPGGFYTRLPIVSSIQSTRQIERVQINDPGTEYAVGQYTSVPITGDGEGGFVTINVADGQDANGVTIPGQIQLVTVTSPGKGYTTASIDIESVSGILGSGLTGSGAEVVVVIPPFGSGASIFTQGSSVGKIKKLKNNNFGYDYPHDYTLRPEITFPINAQLTSTSILDSITVSDPGTGYSQAPAVVITGGGGSGAIAEATTKNGRLDTIIVKDPGAGYSSTPTVSLRSSFNYVVNLDLGLLQFAFPHGITNGSAVTLNVVDTGDGVAYPLSAGAVGRLNGTTTYYAIAGSANSLENDQLKLAITSANAALGDALAYVNAGTGRQQVLTESFGGAATANVVTSTFLEGELVYQGESLSTSTATGYVSTNAGWQVGPRVLKIVDYTGEFSTGQRITGVISKSSGIMTDIKVAKGVLEIGSVTKTTGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSAVSIGEWKEILIKNVHPASFKVFGELDLNDYGFIPNKETFFQLTKSVELARDAIVPNIQNFALVEPVYSEMNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISSQFDGQKISFPLTVDGNNVVANANQLMIVLNGVVQTPGTAFEIQGDSVVFAEPPQPPASVKYVNVSINQIATVALTFNNISGIFPTAGMTVVGTSSQARLTVTTVVGNTINGFITQGTYTIGELVTVGATGFAANVATVTSISNIGLFVFGENITNLTGDTAKVEQINLASGAETPLAQLRYTIGAATTTIEMVAYKTDNTGTDYQVTAGVFVAATNYQLGSEIFRVDSVTQNTDSTTLVITRGQNGTTPVSHQEDAPSYSTDISITNALTLSKIAGTYQSTPGLFDIQLNDVIIGAQSGVVARVTQTSTYQDPTTQEFIGQVNISEGSSFFGLLFNRITSQTYPNVVLDDISKSQIGIVDFTDNSTAFDSSFPANEQINNYVIPYDNLTGTFQENEYIRNYKIEYGNNQGEFLPTESAKIRKLTFTDRIGSGFFQAGQIIRSRDTKAEVIGANSARSTIFLGKVGRSQRGGLDYNIPTSEREAQIDTSTKKFGTASHLLGRANHTHTFVSGVANGIQASNGATSTHTAVAGTTYDPEAGTLVINIGTHSLTTSNKVTIADGGLTFTCTADSNTTNHPYPRSTDPASGQALTISAVTSNTITVDVGVAQVSLDYLSVDSSSDFAWGTAGYTIELYIKAAASSISGIHSILDFRTASTDAAGHLYLNAGQVRYNVSNSDVVTSGATTIAQDTWTHIVVQRTSTTVKIFINGAEAGTGTDSTNYAAKPFVLGASYGLGNAFYGHIDELRLSATTRYSTIPFTPVNGIFQGDTNTKILWHFDGADKQVFLEDWSGTQDFTINEYINNDAIRATARLIGGVHKFVSASSNAVSVTGSSSFTPTAVDYDAITGSMEINIGSHSYTTSDTITIAANSLTFTCSKDNHATQHTYPRLTDPS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2400 AA molecular weight: 256053,33810 Da isoelectric point: 4,73295 aromaticity: 0,09333 hydropathy: -0,11713
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Synechococcus phage metaG-MbCM1 [NCBI] |
1079999 | Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Galenevirus mbcm1 > |
Host |
Synechococcus [NCBI] |
1129 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFD02936.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
JN371769
[NCBI]
CDS location
range 60364 -> 67566
strand +
strand +
CDS
ATGGATACTAGTCTTGCTATTGATGAATTCAAAGAACTTTATGTTACTGGTGGTCTAAGACTTAAGTCAGACGATACTACTAGAGATAGTTTCTGGGTTGGTAAGATTGATACAGATGGCACATTTATCTGGAACTATCGCTATCTTGCTCCAACTGGAGGATCTATTACTGTTACTCCTAGTTCTGCAATTGATATCTTTGGTGATTTAAACATTGCGTTTACTAGCTTCAATAATACCAATACTTTACCTACAGTTGATACTGTTAAGATTGGTTATGACGGAAAAATTAAAAATCATACGACTAACCAATTTACACAAAACAATACTGAGGGTATTACTGCTTACTCTGTTGATGTTGATAACTCTGGTGATATTAATATTGTTGGACAAACTCAATGGAATAGAAACGAGTTTATCTTCCCCTTCACTGGAGGATCTCAAGTTGATACAACCAGTCACTACACATTAACTTCTACATCAACAAGCAACTCTATCACTTATGCCAATGATGTTGCTAAGATCCATGGTTATGCAGATGGTCAAACTACTTGGACTCAAGGTAATCTTCAAATTACTTCTGCTCAATTAGGAGCAAGACTTAATAGTGACTTCACTGTTGAGATGATGGTTTATAAAGATACTAATACATCAAGTTTAACTGGTGGTAGTATCACTCAACATACTCTTCTTGCTATCGGTGATGCTGAAGAGGCAACTGGTGCTCTTTGGTTATATTATGACGTAAGTAGCGGATACTTAGAACTTGTTGTAACTAACGGATCTACTAAACTCAATAGTGCATCTGGTGCAGGACAGTCCTCCCTCAACAATATGTTTGCCGACAACACTTGGCAATTCATTGGATTGAAGAGAGAAGGTAATATCTTTACTGTTTATGTGAATGGAATTCAAGCGATTCAATCTACAGTTCCTTCTACTGCTCTTGGTAGTAAGCATCTTTATGTTGGTCAGATCCCTGGTAGATCTGGTAGTGCAGGTAACTTTAGAATCAATGAGCAAGGTCAGTTCCATGTTGATAACTTTAGATTAAGAAACAGAGCGATTACTCCTTCTGTTCCTTCTGATGTTAGTGCATTCCCATCTGCAGGTGGATTTGGTTTCCAATACACTTGGACTGATACTGCATGGTTCACTACTAACCTTAACAGATATGATCTGATTGATTATGATGGATTCTCACTTAAAATTGATAAGAATGCTGATGCTGCAAGAATCGGTACAGTTTCTACTCAAACTAATACTCAACTAGGATTTACTAGAACTGCTGTTACTCCTGTAACTGGTAGTACTCTTACAATGCAGAATACTGGTTATGCTTTATCTGAGGCAGGATTCCAATCTCTTGACTTTGATGATGCTACAATCAATATGACTCCTGCAACTGAGACTCTTACTTATACTCAGGATGTTTGGAGTTCTAGAACTGCAACTGTTCCTTCTCCTGGATCTCAGAAACTTAATGTATCTGCTGTTGTTAAAGACAGATATTTCTTCAAGGTTACTCCTACAACTAAGATTGATAACATTCAAGAGTTAACGATAAATCAGGCATTTAGGTTTACTGTTGGTAGTAAGTTACGTCTAAACAACGATTCTGGGTCATTTGTCAACAGCGGTTATATCGTAAGAGTTGATGATGCAAATAATAAAGTATATCTTGCTGTAAACAATAATACATGGACAGATGATACTGCTACTGGAAACTTAGTAACTGAACAGTTTAGTGAGCAATCAACTTATGGTATTGTTGGACCTATTCCAAATGATATCAACGTTATTGAGGGTTATACATTCCCATTAGTTAATAATACAACTCCAGGAACTTTTGATATTGATCTTGACAAGTATAACTTAGATGGTACTTACAACGCAGCAGGTAGTCAAAATCTTGACTCATTTGCTAAATTCAAACCATTTGCAACTATTGATTACTCTGTAAGAATCGATGAAGTATCTGGTTCTTCCCCATTCATTGTTGGTTCTGTTGTACAACTGACTTCTAGTGATATCTCATTCAATGCAGCATATAGCACAACAACGATAACAAACTTAACTGGCGTAACCAAAATTACATTAGTTGCTAATCTTGATAAGATCTTGCAAGTTTCTTCTGTTGCAAACAGTGATGAAGTTTACGTTATTACAAGTACTAGTCATTACCTTTCTGTAGGAGACGTAATTTATGTTGATGGTAACCCATCTCAGACTGTAGGTAGTGTTGTATACGATGAATATGATGGTGCGTTCCCTGTTGATCGTGTTATCAGTCCTCTTGAATTCACTTATAAGTTAAATCAAGCAGCAATTACTTCACCTGCCACATCTGCAGGTAGTGTAAACATCTTTATGAAGTCTCCGACTTTGAAGATGTACTATGGTCACCAATATATCTTTGACTTAAGTCATTCTTCACTTGTTGGTGGTAACCTTTCCTTTGCTAAGGATAGTCTATACAAACTTGAATATTCATTCAACTCTATTGAAAGGGATGGAACCCCTGGTGTCACTGGAGCAGGAGCACCTACTCCATCTGTGAAACTAAAAGTTGACCCAACAATTGTTACTAATATTTCTTACTACTTTGACCCTTCTAGAACTGGTTCTGATTCTCCTGTTGTGCCTGGTAGTTACCTCGATGTTGTAGACTCTCCATATAAGGGAAACTTTGAGATTTCCTCTATTGCAGGTCAGACTATTACTCGTGGTGCTGATATTATCAAGTTCCCTCTTCTTAACGAACCAGAGGGTGCTGCTGATATCAACCAAGCAAGTTATGCAACTTCTTCCTTAAGAGCAGTTGGATCAATTAACGCTGTTCGTATTGTAAACCCAGGTGGTTTCTATACTAGATTACCTATCGTTTCTAGCATTCAATCAACTAGACAGATTGAAAGAGTTCAAATTAATGATCCTGGAACTGAATATGCTGTTGGACAATACACCAGTGTACCTATTACAGGTGACGGTGAAGGTGGATTTGTTACTATTAATGTTGCTGATGGACAAGATGCCAATGGCGTAACTATCCCTGGTCAGATTCAACTAGTAACTGTTACATCTCCTGGTAAAGGATACACTACAGCAAGTATTGATATTGAGTCAGTGTCTGGTATCTTAGGATCTGGTTTGACTGGATCTGGTGCTGAAGTTGTAGTTGTTATCCCACCATTCGGTTCTGGTGCATCTATCTTCACTCAAGGATCTAGTGTTGGTAAGATTAAGAAACTTAAAAATAATAACTTTGGTTATGACTATCCTCATGACTACACATTACGTCCTGAGATTACATTCCCAATCAATGCTCAGTTAACATCTACAAGTATTCTCGATAGTATTACAGTTAGCGATCCTGGTACTGGATATTCTCAAGCACCTGCTGTTGTCATCACTGGAGGTGGTGGTAGTGGTGCTATTGCAGAAGCAACAACTAAGAACGGTCGTCTTGATACTATTATTGTTAAAGATCCTGGTGCAGGATATTCTTCAACTCCTACTGTATCACTAAGATCTTCATTCAACTATGTTGTTAACCTTGACTTGGGACTCTTACAGTTCGCTTTCCCACATGGTATTACAAACGGATCTGCTGTCACACTGAATGTTGTTGACACTGGAGACGGTGTTGCATATCCTCTATCTGCAGGTGCTGTTGGTAGATTGAATGGAACTACTACTTACTATGCTATTGCAGGTTCTGCTAACTCTCTTGAAAATGATCAATTAAAACTCGCGATTACTTCTGCTAACGCTGCACTTGGTGATGCATTGGCATATGTAAACGCAGGTACAGGTCGTCAACAGGTTCTTACCGAATCATTTGGTGGTGCTGCTACAGCAAACGTTGTTACATCTACTTTCTTAGAAGGAGAACTTGTATATCAAGGTGAATCTTTATCTACTTCAACTGCAACTGGATATGTTTCTACTAACGCAGGTTGGCAAGTTGGACCTAGAGTTCTTAAGATTGTTGACTATACTGGAGAGTTCTCTACTGGTCAAAGAATCACTGGTGTGATTTCTAAGTCTTCTGGTATCATGACTGATATCAAAGTTGCTAAAGGTGTTCTTGAGATTGGTTCTGTCACTAAAACTACAGGTCAGTTTATCGATGACGTTGGTAAACCATCTGAGATTATTCAGAAGATTCAAGATAGTTACTATTATCAAGACTTCTCATATGCTGTTAAGTCTGCTGTTTCTATTGGTGAATGGAAAGAGATTCTTATCAAGAACGTTCACCCCGCATCATTCAAAGTATTTGGTGAGTTAGATCTCAATGATTATGGATTTATTCCTAATAAAGAGACATTCTTCCAGTTAACTAAGTCTGTTGAACTTGCAAGAGATGCAATTGTTCCTAATATTCAAAACTTTGCTCTTGTTGAACCTGTTTACTCTGAGATGAATAATACTGAAGTACTATTCAGACAAAAACGACTAACTTCTTCTGAGAACATTCTAACTTCTGTTGTACAGAGACTTGATGATATTTCTAGTCAGTTTGATGGTCAAAAGATTTCCTTCCCTCTAACTGTTGATGGTAACAACGTTGTTGCGAATGCTAACCAGTTGATGATTGTTCTTAATGGTGTTGTTCAAACTCCAGGAACTGCATTTGAGATTCAAGGTGATTCAGTTGTCTTTGCAGAACCACCTCAACCTCCTGCAAGTGTTAAGTATGTAAACGTTTCTATCAATCAGATTGCAACTGTTGCTCTAACATTCAATAATATCAGTGGTATTTTCCCAACTGCAGGTATGACCGTAGTTGGCACATCGTCTCAGGCAAGATTGACTGTTACCACTGTTGTTGGTAATACTATCAATGGTTTCATCACTCAAGGAACATACACTATCGGTGAACTAGTAACTGTTGGTGCAACTGGTTTTGCTGCTAACGTTGCTACTGTAACTAGCATTTCTAATATCGGTCTGTTTGTCTTCGGTGAAAACATTACGAACCTTACAGGCGATAC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Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.