Protein

UniProt accession
H8ZMJ2_9CAUD [UniProt]
Protein name
Major tropism determinant N-terminal domain-containing protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9417

Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANANPTLAQGELGVELDTGRIKIGDGVSGWNNLRYERPIESTSNTAETLVQRDADGNFSAGTVTATLIGNASTASRFASTRQIQLANVGSTVSDVLGSDTFDGSQNVVIAAELRVLPTLPHYDGTDAPTRYYTKVEVDAKGRVIRGNTPEQLTLADYGLDGNNPAVGQVNADLAQPWDADLQALADNNDNGIVIRRQAGAISIREIVGNYEINIDDGDGVNGNPTLRLINTLVVPDPVTYDDGDYNTESLTSVTTTGPKGELVGTETVNATKFTVDKKGRLTSATNLPIATATEGSKYATYNHNLQYARYDIVDHLGNLYQALAQMGTGYAVPFGPVHTSGDAYSWRYLGPALTEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAVGVDNLQLQNNRVSFADGNTKEDFELDQELTATTGYRGFNYLNYIKVNDTSGNLLVGANNTGDGGAGELDVNVRSYFSDADITLDGALNQTLDKTGDGNFTFQLSQNTATNRNFNILTTNAGSGSSNIIITAEDTIQISASEATGKVHVEDARFQDNYIATTNATMNLDPGDDRAATGTVRVWGNLQIDGTTTTVNSTTVTVDDPIITLGGDTAPTTDDNLDRGVEFRYYDTEARLGFYGWDTNYTDLGGHGGGYRFLHAATNTTEVFSGTDSGIIAGNVKLTTGTNSTTNTTGDLVVAGGVGITQDVNIGGLLDVDGTFRANSTSRFDDTMVLRAASKSLQFQNGAGTVKSEIHTTSGNAEFGGILTVTGATDLNSTLNVASSVHFEATDEPTFALNSETGVWEIQSADYGSFRFDGGGYIAGDFMFDSDVVINGTILQKESAAEDFNEQNFLRVRRKFESGSVQVLTPSYASHTTSNARIFGGAGIGTTLHIGGTSSNEGLFIGKKVNSDTVKFSVLGASGNTDIEGTLNVEGEVTIQDSVIINAANEVFSIRNGSGVAKFDVDTDNGNTLIEGTLNVNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLLVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGNTDKMTVKSSSGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVDASNEVFSIRNGSAVEKFGVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTLGVSNVVTFTRNTQQTLTGSYAADGAFRLTGGAAIGKNLAVSGDARVYGGTELTGALDLNNSADISGALVTHDNVTITANNKTFAIQNGSAANKLTVDTDNGNTDIRGTLDIGGDVTAESNLTVTGNLTINGTTTTVNSTVTTLDDPIITVGGDTAPASNDGKDRGVEFRYYDSSAKVGFFGYDRSANQFAFVVDATNSSEVLSGTDGALRAGSLNLTGSGTTLDVDANANIDGTLTVDGQIISQVSSGPALVIPTTNKINNLNADLLDSMTTASTATATTVVARDSSGDFAANIITVASGVGAAAGIQGNATTADALRTARTITVDGVVDGSVSFNGSADVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVARTAANTYAQRSVTATASSGITVTNADGVSGNITINVASASSNSANNLVIRDASGDFAANEITADLIGGVTGDVVGNVTGNLQGSASQVDTVTASSANAAYHLTMVDQHNTVANNETINTDQSLTYNPSTNRLKTKLELQTDAAPASATATGTVGEIRYDANYIYICVATDTWKRSTLDTW
Physico‐chemical
properties
protein length:1680 AA
molecular weight: 175130,30660 Da
isoelectric point:4,25294
aromaticity:0,06310
hydropathy:-0,22244

Domains

Domains [InterPro]
IPR041352
5–43
IPR041352
H8ZMJ2_9CAUD
1 1680
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014c
[NCBI] 		1079998 Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Namakavirus smbcm6 >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI] 		32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AFD02703.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
JN371768 [NCBI]
CDS location
range 87252 -> 92294
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAATTAAGGAGAGGTGGAGCTCAAGAATGGGCAAACGCAAACCCAACTCTTGCTCAAGGAGAATTGGGAGTTGAGCTAGATACTGGTCGTATTAAAATCGGTGATGGTGTTTCGGGTTGGAATAACCTTAGGTATGAAAGACCTATTGAATCCACATCCAATACCGCAGAAACTCTCGTGCAGAGGGATGCTGATGGTAATTTTTCCGCAGGCACTGTTACTGCAACACTAATTGGTAATGCTTCTACTGCTTCTCGTTTTGCTTCTACCCGTCAGATTCAATTAGCAAACGTTGGTAGTACTGTATCTGATGTTTTAGGAAGTGATACCTTTGACGGATCCCAAAACGTTGTAATTGCAGCGGAGTTAAGAGTATTACCGACTCTGCCACATTATGATGGCACAGATGCACCCACTAGATATTACACTAAGGTAGAAGTTGACGCAAAAGGGCGTGTAATCAGAGGTAACACTCCAGAGCAGTTGACATTAGCAGACTATGGATTGGATGGTAATAATCCTGCTGTAGGTCAAGTGAATGCTGATCTAGCACAACCTTGGGATGCAGACTTACAAGCTCTTGCAGATAATAATGATAACGGCATTGTTATCAGAAGACAGGCAGGTGCAATTTCAATTAGAGAAATTGTTGGTAACTATGAAATTAATATTGATGATGGTGATGGTGTTAATGGAAATCCAACTTTAAGATTAATTAATACTTTAGTTGTCCCAGATCCTGTAACTTATGATGATGGTGATTACAATACAGAGTCATTAACATCTGTAACTACTACTGGTCCAAAGGGAGAGTTAGTTGGCACCGAAACTGTAAACGCTACAAAATTTACAGTTGATAAAAAGGGTCGCTTAACAAGTGCAACAAATCTGCCTATTGCTACTGCTACCGAGGGTAGTAAGTATGCGACATATAATCATAATTTACAGTATGCTAGATATGATATTGTTGATCATCTTGGTAATCTATATCAAGCACTCGCGCAAATGGGTACGGGATATGCCGTTCCCTTTGGTCCAGTTCATACTTCTGGAGATGCATATAGTTGGAGATATCTCGGTCCTGCACTGACAGAGCAGAAAGGACTTGCTTCTTTCGCACAAGAAGATTTCGACGTTGACAGCAACGGGCATGTCACAATTGCTGCAGTAGGTGTTGATAACCTACAACTACAAAATAATAGAGTCTCTTTTGCTGATGGAAATACAAAAGAAGATTTTGAGCTTGATCAAGAGCTTACTGCAACCACTGGATACAGAGGATTCAATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGATACGAGCGGTAATCTACTCGTTGGCGCTAATAATACGGGGGACGGCGGAGCTGGCGAACTTGATGTTAACGTACGGTCGTATTTCTCTGACGCTGATATTACTCTTGACGGCGCTCTTAATCAGACATTGGATAAGACTGGGGATGGTAACTTTACCTTCCAGTTAAGTCAGAATACTGCTACAAATAGAAACTTTAACATTCTGACAACTAATGCTGGTTCTGGATCCAGCAACATTATTATTACTGCTGAAGATACTATACAGATTAGTGCATCAGAAGCAACTGGTAAGGTACATGTAGAGGATGCAAGATTCCAAGATAATTACATCGCCACAACCAATGCGACGATGAATCTGGATCCTGGTGATGATCGTGCTGCTACAGGAACAGTTAGAGTCTGGGGTAACCTTCAGATTGATGGCACTACCACCACTGTAAACTCAACAACTGTCACAGTTGATGATCCTATCATCACTCTTGGTGGAGATACTGCACCTACAACTGACGATAATTTAGATCGTGGTGTTGAGTTTAGATATTACGACACTGAAGCACGCTTAGGTTTCTATGGTTGGGATACTAACTACACCGATTTGGGTGGTCATGGTGGCGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACAAATACTACTGAAGTCTTTAGTGGCACCGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACGTAAAACTTACAACTGGCACCAACTCAACTACTAATACAACTGGTGATTTGGTAGTTGCTGGTGGTGTTGGTATTACTCAGGATGTAAACATCGGCGGTTTGTTGGATGTTGATGGCACATTCAGAGCAAATAGCACATCTCGTTTCGACGATACGATGGTGCTCCGTGCTGCTTCTAAGTCACTACAATTCCAGAATGGTGCAGGCACTGTTAAGTCCGAGATTCATACAACTTCAGGTAATGCTGAGTTTGGTGGTATCTTAACAGTTACTGGTGCTACTGACCTCAATAGCACATTGAATGTTGCTAGTTCTGTCCACTTTGAAGCAACTGATGAACCCACCTTTGCATTGAATAGTGAAACTGGTGTTTGGGAAATTCAATCTGCTGACTATGGATCATTCCGATTTGATGGTGGTGGATATATTGCTGGCGACTTTATGTTTGACAGCGACGTTGTTATCAACGGCACTATTCTACAGAAAGAATCTGCTGCAGAAGACTTCAACGAGCAAAACTTCCTGAGAGTTCGTCGTAAGTTTGAATCTGGATCCGTCCAGGTTCTAACCCCTAGTTATGCTTCACATACTACCTCAAACGCTAGAATCTTTGGTGGTGCTGGTATCGGCACTACTCTTCATATCGGCGGCACATCTTCCAACGAAGGTCTGTTTATTGGTAAGAAAGTCAATTCCGATACGGTCAAATTCTCTGTCCTAGGTGCATCTGGTAACACTGATATTGAAGGCACTCTCAATGTTGAGGGTGAAGTTACTATTCAAGATAGTGTAATTATCAATGCTGCCAACGAAGTATTCTCTATTAGAAATGGTTCTGGTGTTGCTAAGTTTGATGTTGATACTGATAACGGCAATACCTTAATTGAAGGGACGTTAAATGTTAATGGCACTGTCGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTCAGAAACGGCACGACGGATAAATTCTTCGTTGATAATGTAACTGGCAATACTGATATCCAAGGCACACTGGATGTCAATGGTGCAACTGAGATTACAAATACTCTGGATGTCAGCAACGCTGTAACATTCGATCAGACACTGTTAGTCCAAGGCAACTCTGAGTTTAACGGCACTGTTGATGTTGATGCTAACTTCGCTGTTAGAAGTGGTAACACGGACAAGATGACCGTGAAGTCTTCATCAGGTAACATTGCAACGGACGGCACACTGGTTGTCCAAGGTCAAACAACCATCAACGATTCACTGATTGTCGATGCTTCCAATGAAGTCTTCTCTATCAGAAACGGATCTGCTGTTGAGAAGTTTGGTGTTGATGCCGATAACGGCAATACAAATATCATTGGCACCCTGACTGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGACACCCTTGGCGTCTCTAATGTTGTAACCTTCACAAGAAATACCCAACAAACTCTAACTGGTTCTTATGCTGCTGATGGTGCATTCCGTCTGACTGGTGGTGCTGCTATTGGTAAGAATCTTGCAGTTAGTGGTGATGCTAGAGTTTATGGCGGCACTGAATTAACTGGTGCTCTGGATCTTAACAATAGTGCAGACATCTCTGGTGCTCTGGTAACTCACGACAATGTAACTATCACTGCAAATAACAAAACATTTGCTATCCAAAATGGATCTGCTGCTAACAAACTTACAGTAGATACTGATAATGGTAACACTGATATTCGTGGCACCCTAGACATTGGTGGTGATGTAACTGCTGAGTCCAATCTTACTGTTACTGGAAACCTTACTATCAATGGAACGACCACTACTGTCAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTGTGGGTGGTGACACAGCACCAGCGTCTAACGATGGTAAGGATCGTGGTGTTGAATTCCGTTATTACGACAGCTCTGCGAAAGTTGGCTTCTTCGGATACGATAGATCCGCCAACCAATTCGCATTCGTAGTAGATGCAACTAACTCATCAGAAGTCCTTTCAGGCACTGATGGTGCTCTCCGTGCTGGCAGTCTGAATCTTACTGGTTCTGGCACCACTCTTGATGTTGATGCCAATGCTAACATTGATGGCACTCTGACTGTAGATGGTCAAATCATCTCTCAAGTTTCTTCTGGTCCTGCACTGGTTATTCCTACAACCAATAAGATTAACAATCTGAATGCTGACCTTCTGGACAGCATGACAACTGCTTCTACAGCAACTGCAACTACTGTTGTTGCTCGTGACTCTAGTGGAGACTTTGCTGCAAATATCATTACGGTTGCTTCTGGTGTAGGTGCTGCTGCTGGTATTCAAGGTAATGCAACAACTGCAGATGCACTGAGGACTGCAAGGACAATCACTGTTGATGGTGTAGTTGATGGTAGTGTATCCTTTAACGGATCTGCTGATGTTACTATTAGCACTACTTACAATGATGCAGACATCACTGCGCTCGCCGCTATGGCAGGCACTGGTCTAGTAGCAAGGACTGCTGCTAATACTTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCGTCCTCTGGTATCACTGTTACTAATGCTGATGGTGTATCGGGCAATATCACCATTAACGTCGCTTCTGCAAGCAGCAACTCAGCAAACAACCTTGTCATTCGTGATGCTTCTGGTGATTTTGCTGCCAATGAAATTACTGCTGATTTGATTGGTGGTGTAACGGGTGACGTTGTTGGTAACGTAACTGGTAATCTCCAAGGTAGTGCATCTCAGGTTGATACCGTCACTGCATCCAGTGCCAATGCCGCTTATCATCTGACGATGGTTGACCAACATAATACTGTTGCGAATAACGAAACCATTAATACAGACCAAAGTCTGACTTATAATCCATCTACTAATCGCCTAAAGACTAAACTTGAATTACAGACAGATGCTGCACCCGCCAGTGCAACAGCAACTGGTACTGTTGGCGAAATTCGTTACGATGCAAACTATATTTACATCTGTGTTGCTACTGACACCTGGAAAAGATCCACCCTCGATACTTGGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.