Protein

UniProt accession
A0A0E3HSR4_9CAUD [UniProt]
Protein name
Structural protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,6952

Protein sequence
MTINKVSQVSREQLPQFIDDGFPLFGKFIEYYYKSQEKTGLGQNILNNFLNYMDIDKLNVDILDGATTIVEDITTSSSTIVVENIDSFLENNGSVLVGDEVIFYERAVASPSIALSPGISFEEVQLKEITLAQIADLFDGSRQIFPLTTQNNPVSAPSPQHLQVTLYGELLVPLDDYNVDGTNITFVNPPRARTASDDISTIQIKYFNGFVESEIVRLDNISGGFNDETVSFPVTKDSIDYKPEIDEYILATYDGSRLIAKNDFTFDGNLITFNFTPLPGRKLTLYSIEAPIPSFGSGAIGFSRVNNNGELVSVAVGENGSNYRFEYPPKVSIKDNNGQGSGGSAVALINGVKSVSLLDGGFGYSDTNPPTVFVEAPTTVDSKLPKIKASVTNGSISSLEIEESGSGYTFTPRLSFVQPGGAKLATPTIISGSISGDIAITDGGSGYTTSPTVYVDFPTGEDSIRASLRANLVDGKVSSITVLNPGQGYETAPRVAIVDPVGAQVLETRVDADGRVISIELLDGGSGYEDVPSVYIVDDRQDPVTGNYSGGTGATAVCAIFNGQITDINITNFGTGYSADAPPSIVIQAPPKAEASVVVGLSEITGFEVINSGSNYSKCKLEGCARAVSGMVNYNQVGNAEFSNDTTAVAHQSGEVVKCLDALFIKRLLDKYIEQYLPDVPELDYKNIDVRSAIKNIKTFYSTKGTSFSIAYLFKLLYGENVSISYPKDQLIKPSASTWATNTILRAKLVSGNPQNIKDATLIQEADIADPNVQDASALVENFISIKTSEFDIYELILSQETIEGNFTVPYKSRLAEELVEGDLIITVDSTIGWPERNGELIINDTEIVRYKEKSLNQFIECTRDTNSSGETTWDAATEIRSIFRVYLNKGTLTEVVMDIVGIVDAQQTTLSDTGSYYLPGDKLTVSKLGGSSVDPQLTTWLYNVKKLIEVETITYGGINNSFATVTCSAPHGLLVGDQVTVYGANPIIYNGTFLVTSRDSTTIFQYNLPQPAVVEPQGNILISVDLNKGKSENDAIRKTIAPYTTNIQNTFFNAEHVYVASTGIPNYNIGPFLGSALLPGNQRKLNRFPLNVQTISTKSEITPGSIGTWVNGVSVWSYKSPQTKTFGAVTGVSILNSGSNYDAANPPTITIAGGGGSGASSTVVVDGSITAIEVDQGGSGYTSSPLVSIVGGNGSGASATAIITRGVVSRILVNNGGSGYTSQPEITIVGGDGSGAAATAQVRGPVESVNIIDGGASYTSMVVMDLVLLLQHK
Physico‐chemical
properties
protein length:1274 AA
molecular weight: 136017,45740 Da
isoelectric point:4,50292
aromaticity:0,08242
hydropathy:-0,06099

Domains

Domains [InterPro]
A0A0E3HSR4_9CAUD
1 1274
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014c
[NCBI]
1079998 Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Namakavirus smbcm6 >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI]
32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX38078.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019128 [NCBI]
CDS location
range 50778 -> 54602
strand +
CDS
ATGACAATCAATAAGGTTTCCCAAGTATCTAGAGAGCAACTACCTCAGTTTATCGATGATGGATTTCCACTATTTGGAAAATTCATTGAGTATTACTACAAATCGCAGGAGAAGACAGGTTTAGGACAAAATATCCTAAACAATTTTCTAAACTACATGGATATCGACAAATTAAATGTCGATATTCTTGACGGTGCAACAACAATTGTAGAAGACATCACTACATCATCTTCTACGATTGTTGTTGAAAACATAGACTCTTTCTTAGAAAATAACGGAAGTGTTTTAGTTGGTGATGAAGTCATTTTTTATGAAAGAGCAGTTGCTTCACCAAGTATTGCTTTAAGTCCTGGTATTTCTTTTGAGGAAGTACAATTAAAGGAAATCACCCTTGCTCAAATTGCAGATCTTTTTGATGGATCAAGGCAAATCTTTCCTCTTACAACTCAAAATAATCCTGTCTCTGCCCCTTCGCCTCAACATTTACAAGTCACCTTATATGGTGAATTATTAGTACCTTTAGATGATTACAATGTAGACGGTACAAATATTACCTTTGTAAATCCACCTAGAGCAAGAACTGCATCTGACGATATTTCTACGATTCAAATTAAATATTTCAACGGATTTGTTGAAAGTGAAATTGTAAGGCTGGATAATATTTCTGGCGGTTTTAATGATGAGACCGTATCATTTCCTGTTACTAAAGATTCTATTGATTACAAACCAGAAATTGACGAGTATATTCTTGCGACTTATGATGGAAGTCGCTTAATTGCTAAAAATGACTTTACATTTGATGGAAATTTAATTACATTTAATTTTACTCCACTTCCAGGAAGAAAGTTAACTTTATATTCTATTGAAGCTCCTATTCCAAGTTTTGGTAGTGGTGCCATTGGATTTTCTAGGGTTAATAATAACGGTGAATTAGTATCAGTTGCAGTTGGTGAAAACGGGTCAAATTATAGATTTGAATATCCTCCTAAAGTTTCTATCAAAGATAATAACGGACAAGGGTCTGGCGGATCTGCTGTAGCACTAATTAATGGTGTTAAATCAGTTTCTCTTCTTGATGGGGGATTTGGTTACAGTGATACCAATCCACCTACAGTTTTTGTTGAAGCACCAACAACAGTTGATTCAAAATTACCAAAAATTAAAGCATCAGTTACAAATGGATCTATTTCTTCTTTAGAGATTGAAGAATCTGGAAGTGGATATACTTTCACACCAAGACTGTCGTTTGTCCAACCTGGAGGAGCAAAACTTGCTACTCCGACGATTATATCTGGATCTATTAGTGGTGATATTGCTATAACTGATGGTGGATCAGGATATACAACTTCTCCGACTGTTTATGTTGATTTTCCTACTGGCGAAGATTCAATTAGAGCAAGTTTGAGAGCAAACTTAGTGGATGGAAAAGTTTCCTCCATTACAGTTTTGAATCCAGGACAAGGATATGAAACTGCACCAAGAGTTGCAATTGTTGATCCTGTAGGAGCACAAGTTTTAGAAACTAGAGTTGATGCAGATGGAAGAGTAATCTCCATTGAATTGCTGGATGGTGGATCTGGTTATGAGGATGTGCCATCGGTATATATTGTTGATGATAGGCAAGATCCAGTTACAGGTAACTACTCTGGTGGCACAGGTGCAACTGCAGTATGTGCTATTTTCAATGGTCAAATCACCGATATCAATATTACCAATTTTGGCACTGGATACAGCGCCGATGCACCTCCATCTATTGTAATTCAAGCACCACCCAAAGCAGAAGCTTCTGTTGTTGTTGGTTTAAGTGAAATTACGGGTTTTGAGGTAATCAATTCTGGTAGCAATTATAGTAAGTGTAAATTAGAAGGATGTGCCAGAGCCGTAAGTGGCATGGTAAATTACAATCAAGTTGGTAATGCTGAATTTTCCAATGATACTACTGCAGTAGCACACCAATCAGGTGAAGTAGTTAAGTGTTTGGATGCTTTGTTTATTAAGAGACTTCTAGACAAGTATATTGAGCAGTATCTTCCTGATGTCCCAGAATTAGACTACAAAAATATTGATGTAAGATCTGCAATTAAAAATATCAAGACCTTTTATTCTACAAAAGGCACTTCATTTAGTATTGCATACTTATTCAAACTTCTTTATGGTGAAAATGTAAGTATTAGTTATCCAAAAGATCAATTAATCAAACCATCTGCATCTACTTGGGCAACAAATACAATCCTTAGAGCAAAACTTGTATCTGGCAACCCTCAAAACATTAAAGATGCAACATTAATCCAAGAAGCAGATATTGCAGATCCAAATGTGCAAGATGCTTCTGCTCTTGTGGAAAACTTCATTTCTATCAAAACTTCCGAGTTTGATATTTACGAATTGATTCTTTCCCAAGAAACAATTGAAGGAAATTTCACAGTTCCTTACAAATCCAGACTTGCAGAAGAATTGGTAGAAGGAGATCTAATCATCACCGTTGACTCCACTATTGGATGGCCAGAAAGAAACGGCGAACTCATTATTAATGATACTGAAATTGTAAGATATAAGGAAAAATCTTTAAACCAGTTTATTGAATGCACTAGAGACACAAATAGCAGTGGTGAGACTACCTGGGACGCTGCTACAGAGATCAGATCTATCTTTAGAGTATATCTAAACAAAGGGACCTTAACAGAGGTCGTAATGGATATTGTGGGCATTGTTGATGCTCAACAAACTACACTGTCTGACACAGGATCTTACTATCTTCCTGGAGACAAACTTACTGTATCTAAGTTAGGAGGATCTTCAGTAGATCCTCAACTAACAACTTGGTTATATAACGTTAAAAAACTAATTGAAGTTGAAACTATCACTTATGGTGGTATTAATAACAGTTTTGCAACAGTTACCTGCTCTGCACCTCATGGTCTTCTGGTTGGTGATCAAGTAACTGTTTATGGTGCAAATCCAATCATCTATAACGGCACATTTTTAGTTACATCTAGAGATTCCACAACGATATTCCAATATAACTTGCCTCAACCTGCTGTGGTTGAGCCTCAAGGCAATATCTTGATTTCGGTCGATCTAAACAAAGGTAAATCTGAAAATGATGCAATTAGAAAGACAATTGCGCCATATACAACCAATATTCAGAATACCTTCTTCAATGCAGAGCATGTTTATGTAGCATCTACAGGTATTCCAAACTATAATATTGGTCCTTTCCTGGGATCTGCACTTTTACCTGGCAACCAAAGAAAATTAAATCGTTTCCCATTAAATGTCCAAACAATTTCAACTAAGAGTGAAATTACACCTGGATCTATTGGCACATGGGTTAACGGCGTTTCTGTATGGTCTTATAAATCACCACAAACAAAAACCTTTGGTGCTGTAACGGGTGTTAGCATTTTAAATTCAGGATCTAATTATGATGCAGCAAATCCACCAACAATTACGATTGCTGGCGGTGGTGGTAGTGGAGCATCTTCAACTGTAGTTGTTGATGGATCAATTACAGCAATTGAGGTAGATCAAGGTGGATCTGGGTATACATCCTCTCCACTTGTTTCTATTGTTGGTGGTAATGGATCTGGTGCATCTGCTACTGCAATTATCACTAGAGGTGTTGTATCTAGAATTCTTGTCAATAATGGAGGGTCTGGATATACTTCTCAACCCGAAATTACTATTGTTGGTGGTGATGGATCTGGTGCTGCTGCTACAGCACAAGTAAGAGGTCCAGTCGAGTCTGTTAATATTATCGATGGTGGAGCATCTTATACTTCTATGGTGGTGATGGATCTGGTGCTGCTGCTACAGCACAAGTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.