Protein
- UniProt accession
- A0A0E3FY41_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Structural protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,4467
- Protein sequence
-
MFEGLNNQYGGEYSHVANPQRLRYILGDNLILDSNSNLTEQNASLDHSPIIGWAFDGNPIYGPYGFDDPTDQTSNIVRMGTSYRLKIRLVYDDITNPYPSRDDGPSLIDEPAGTFIEDYEYDFGSGDLDQYNGRFCKTPEFPNGRYCYFVTIDNSEAGNSVFPYVLGPSFNSIVDIWNLNDYSIQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERIPNSSSNALTTEAGDTLLFEIEDENKDGVISQDETDDPDQIFEESPLQLYDYFPKVRFDSRVDIEVDTITRFENASVTGFIVENAGQSYQVNDIIVFDNATSGGSGASARISKISGESITSYSYENVANINYGILTTVVPHNLVVGDKITVNYTPVMDTTNKRFVVRQYKGIEEVVINQTGSGYSVDIPPTIIIDGDGVSAEVEAIVETNGSINSFNIINSGSQFTENPRFILSHPQIFKKANYATTLLNSNEDVKINDIYIAENKKYYVCGRSVDSVGNYIGFVAKISESGLLEWRKTTEVTAPSGELTYLEFTNILVEGSDIYAVGINKPNVSVLDAYNPDIVFVKFQEDSTGLNASVSQQRAYAGISGSTRSDTVTGIKKLTDNRYVICGHTNTNSSNPLDAFVIVIDNTGTFVTKRKIASDLKSEKIVDFIIKNEQIYFLMETAATNVATDISLTLGKCRLDGNVILVDWMKEFTNPTYSFLNSTIELDEFEDFYLTSTLCLKATPTVKNAFWVAKINDTPSVIWSYSYAVAGGNIDTVNRGSVDIFGDINIAYTKTHTNDEISLEAVQVNYKGEIVGHTSNRLTPNGDVYNNIEGIKSYATANDVSGDLTVYGQSQWNRNEFTFTFDQTDSATDTCGKYTPTLIGNDSTDALTLVGDGVAKLFGYDVATPANWENAAIKFAAANLDEKLGDSWTLEFTLYKDSTNSQTHSQTQQTLVAIGDATDTTGGLWLYYDVSSGQLELVISNSVTALNAAGSGLNSVSSNLYADDTWQWVALQKNGDAFSAYINGTQVFTGTVLNTAFENKDLYIGNIPGKNGTTGQFASAYQGQYYIGDLRLKNRALTPTVPSDITTAPTDDQFELAYNWSDDAWFTAFHEKYDYIDYKGISLRLDKTQSPDYLGSLTTTTNTELKWNRSLVAAATGVNLPVALVNYAIGSEGLQALDFNSTTLVALYDNEAFTHNQDILFFRTATIPSPGSQKVIASAVIKDRYYFKVTDTLKIDNIKRLTINQPFNLSENAKLVLDNGSGGFVNSGYITAVDVENRYVYVAINNNTWGNDTNTGFLTTSRFDEQDTYGIVGPNVNDTNTITNYEFVDVVNTTPGTFDIDMQDYDMLPTVGGTDNLDEYARFFSTFSLNDYSVKIIETSGATTFVPGSVVGIEESDVSYNSERNTIQITGLTGVTKITLVADLEKILQVTAVTNSDEVYIVTESSHYLSPGENIFVDGNPEAQYNGSFTVDRVISVKEYTYKLNAIATEEPALTSGDVDVFSKSPTLKMYNQHQYIFDMSHVSLIGGNLSFAKDSLYKLEYSFNIIERIGTPGIVAGAQVPSIKLKVDDSIVTNISYYFDPSRTGDNSPIDSDSYLDIGPSPYIGNFTITETTGGTITTGDNTMKFVLVSEPEDVATIEKAKYATSSTKAVGSISDIRIVNGGGFYTKVPIISNIESSRKIERVEIVEPGTEYAVGLYNSVPISGDGEGGLVSITVENTTDSEGVSIPGQITKVTVTSPGKNYTTATIDVDSISGILGVGLTGSGAELNVIIPPAGTGASIFATGRNIGKIKQLKNNNFGYDYPHDYTLRPEISFPLNAQLINTSILESIRVSDPGSGYSQAPAVVITGGGGSGAIAESTIQNGRLSQIIVKDPGSGYSSPPTVELKSSFNYVVNLDLGLLQFAFPHGIINGAQVTLEAVDIGDGVEFPLAAGAIGRLNSQTTYYAISGAEQSLEADQLKLAITESNAELGDAIGYVNAGIGRQQVLTSSFGGAAVANVVTSTFLEGEQVYQGDSIQNATATGFVSENNGWQIGPRILKIVNYNNNFSVGEKVTGVISKSAGVISDLNIASGVLEIGPITKTTGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSSVSINDWKNILIKNVHPASFKVFGELNITENAVIPNKEIDFQLTKSVELARNAIVPNIQNFALAEPIYQDFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISNLFDGIRTQFPLTIDQNNIVADAKQLMIVLNGVVQTPETAFKVLSDSIVFSEPPSPPASIKYASVTIEQISIVQFEFSNQSGTPPDDNQIGAVIVGTQSGARAQLTKVLGTNNVGNLELEGFIAEGVFIANELCTINATGYAANLQSTSVPTQGSLFFYGEEIRNLDGDEAVIERVNLQTGQETPIAELRYAIGLSTTVFEVIPSTGIAAPVLDVFELNENYQIGSEIVTVTGITQNVDSTTLEVSREQNGTALSAQQAGVPIYGTQIEITNQLVISKTTGTYQSTPGLFDIQLNDVIIASQSGVVARVIGTSAYQDPSTQQFISQINISDGSSFFGLLFNRITSPEFPNIVIDDISQSQVNVVEYGDNISLFSSSFPANEFINNYSIIYDNAVGTFQDNEFIRNWKFDYGNSSDDFAANEEVNVRKLTFKDAVGDGFFTAGQILRSPNSKAEVIGYNQARSIIYLSKMARTQSTGEDYHNMTFVAGAEINTYNEKFGNACLALSKGTSAHTFVSATENGITAGGGATGTFTAATGTTYDAITGDMIIEIGTHTLTTSNTVTIVASGVTFTCASDNNTAEYSYPRATDPQFGQAIAISAVTSTTITVNVGAVPVDEYLTIPTSTEFGFGTGDFTLELWMKTNSIASGGKTLLDFRSATAEVAPYLYLDGANLKYYVNAAEVITGTTNFAVNNWYHIAISRSSGTTKLFLNGVQEGSDYADTNDYGSTKPIRIGAAWNATNVLPGYIDELRVSTNARYTADFGNPTGIFQGDANTVLLIHFDGAQGQTYTDDWSGEANWTRSDFFNNDAILATKRSTNGSNSQHSNNTQRYYDAASLIENNRDFIGAETQALIQVSLPYTLDTSAVTNTITASDYLSMGSNTYFGKSVGITQDKIVVGSYEADIQGVGNNRGAVYTYNLDGTGEVKIATPTGGGGDDFGWDVDAFYSTVDSTSKLVVGAPFYEPSSSYSNSGIAYIYNADGTNQVILNADVITSNNRFGYSCAAGGGKVAVGAYGDDTYRGSVFIFDEDGTNRIKVTASDSATYDYFGFSIAIANNKLIVGAYGHEDTGSGRGCVYVYDLDGTNEVKIQASDAENGDAFGFSVAGDGDKILVGAYSEDTGASGAGSAYLYNYDGTGEIKFQSNDVQSGDQFGHGTLLVDGEFIIVGNVSYDGISSNGGALEKFIYDSDAGTVTYDSTLPLPSHTSSFHGEFRGGNIAYDTTARKMVYGNRYQTVTGLTRSGQVFVFDYNQSSTASGFDTPIKETLTALVDDLRGGSNSHIWDNAATYVNRSSLPITSLLKFIGQEASLISGYTSLKTIIQNVINNYPLTVTGSHGIIQFTDVSITDSSYPTLTKLTPTNVDYNATTGDMVITVVGHTLTTADVISIAEESLKFTCSSDGNVRVLSHPRVSDTRAFNAALRITATTTDTFTINVGASPADQQYTHQFSSADADAITVLDYTTGDCADVTTTNDNLIDIVIDTLNEGSGTTTNTADGDHLATVTKLSPAYEFLGGTVDGFYEIPLTVSNSLPNDQVFYTNRIGKESRNRYIDAANLIRLNSSVIVDKASFDLLARYPDLANDMPRNDPNNTDDPNAGTRRCQTDLALLLASLADDIENGGSKNTVTVSNFYLGVNDALNHIRLQVWQSLFAHDRLGFYMKQAINGNLVSDVGTDDIIVGDWGITDDAIVNFTPTAATYDAATGVMVITIGSHSLALGRRITIADNSLTFTCTSDGNVSNETYPRTTDPASGVSLEVTASTATTITVNVGASPAGQQYAHTFVSAAANAVSTAGECANVETAIDTLIDTLNDAIAPVSANNNYRIAADRLYFNRLFIQEEVLGSIIDEFTYSVGGTTYNSYDFSGDNNQEQLKDDINLFILSAISDLQTGGSNSSIDAISTFLDSRLEVTRIEDILTVFISILKEVKTLGIKALRNQLYSLNEGTQTSPNYQGQFTSQSTYRDSESISATDLNDFSFRFRDLIEIVIKTIAPSDIIGMGDAAKQILFNEHYYESEISSIVNTQFGSNTWQYTDFLNGILKDVLHDAIITNTTSSNSQTARRISLLREGVVSEIVFTAGTGYRSAPTITLDPPGTGITATAEVVLDTSGSLSSLSITTPGSGYTFSPDLVFTGSTFDVGDSHGGSSTLTNGAVTAVTYDGIVYDFNNSVTSALTLGSAVSMTAGTSGMLTGRQLLLFGTGSGSRFASIQTPFDTTYAETIRVYVIAGGSSNGGNAPEINEDLKLYYSTTGSNWVLIDTLVEGGSTGTSKEYTNFNTLNYVDITLPTLARAQTIYFRFQQDQYTDGSFDQYGVTRIGLIDGAQQFSIDTTIAVNNASLESGTPSTAEVELVTGIGIAAINITNPGSGYDPANPPTATLTGGGTTNPGTITDLSVSLDNSRFIVNAEITNGSGTTGNVLEDSGNNLYIGSITGSGFADGDTLTQGLVTAEIPSNGVGPEINYYNDIANVETINTARNISSLVEGEIISANLLTNPEFATTSTWRRSRSNLINAAALAPDATQTAIAWRSNTTSSTSHYVYRDYYLTAYETLDNGSIRFDTSNTTFDEGAPSDGSKRQFTYSFFAKSVDYDELYVRIQAYNSSTSQRINFSRVNIETGVVSGISSQGQAFDIEEYGSVPYGNGWFRFYFTFSVSYGYSLVRFFQYLRAPGGGGTGFSADLNDEAYMWGMKLNEGGLDTYSSESSQIFYSNTEYNVKKFAIETLEDLTVSALNGVLASPSGNSGFTSFYDSDYASSYQTDTIARFIRQNLNIILNQLLNGNYYATVTTNNGITIPTYTYGTRDLLVPLSGAIED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- Physico‐chemical
properties -
protein length: 5642 AA molecular weight: 609374,73540 Da isoelectric point: 4,33024 aromaticity: 0,09926 hydropathy: -0,16276
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
Synechococcus phage ACG-2014c [NCBI] |
1079998 | Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Namakavirus smbcm6 > |
Host |
Synechococcus sp. WH 7803 [NCBI] |
32051 | Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus > |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX38079.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019128
[NCBI]
CDS location
range 55013 -> 71941
strand +
strand +
CDS
GTGTTTGAGGGGTTGAATAATCAATATGGTGGTGAATATTCTCACGTTGCTAATCCACAACGTCTTAGATATATTCTTGGCGATAATTTAATCTTAGATAGCAATAGTAATCTCACTGAGCAAAATGCGTCTTTGGATCATTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGCAATCCAATTTATGGTCCATATGGATTTGATGATCCTACAGATCAAACTTCTAACATCGTTAGAATGGGCACTTCATATAGATTGAAGATAAGACTAGTATATGATGATATTACTAATCCATATCCTTCAAGAGATGACGGTCCATCATTGATCGACGAGCCAGCTGGCACATTCATTGAAGATTATGAATATGATTTTGGCAGTGGCGACCTTGATCAGTATAATGGTAGATTCTGTAAAACTCCCGAGTTTCCAAACGGTAGATACTGCTATTTTGTTACTATTGATAATAGTGAAGCTGGAAATTCAGTATTCCCCTATGTTTTGGGTCCTTCCTTTAACTCTATTGTAGATATTTGGAATCTAAACGACTATTCAATTCAGCAAAATATTCCAACTGGTGTTGTAAGGTATAGAGATCCTTATGAAAACGTTGATATTGATGTTGAGCGTATTCCTAATTCATCTTCCAATGCTTTAACCACAGAAGCGGGTGATACCCTTCTATTTGAAATTGAAGACGAAAATAAAGATGGTGTAATCAGTCAAGATGAGACTGATGATCCCGACCAAATTTTTGAAGAGTCTCCTTTACAACTTTATGATTACTTCCCTAAAGTTAGATTTGATTCCCGAGTTGACATTGAAGTTGACACTATTACTAGATTTGAAAATGCTTCCGTTACTGGATTTATTGTTGAAAATGCAGGTCAAAGTTATCAAGTAAATGATATCATTGTTTTTGACAATGCTACTAGTGGTGGTAGTGGTGCTTCTGCTAGAATCTCTAAAATTTCTGGAGAATCTATTACTTCTTATTCATATGAAAATGTTGCAAACATAAACTACGGCATTCTCACTACAGTAGTTCCACATAATCTGGTTGTTGGAGATAAAATTACTGTTAATTATACTCCTGTAATGGATACGACAAATAAGAGATTTGTTGTGCGCCAATATAAGGGTATTGAAGAAGTTGTTATCAATCAAACAGGTAGTGGGTATAGTGTAGACATTCCTCCAACCATCATTATTGATGGCGACGGTGTTTCTGCTGAAGTTGAGGCAATCGTAGAGACCAATGGATCTATCAATTCATTTAATATTATAAATTCGGGATCTCAATTCACAGAAAATCCTAGATTTATACTTTCACATCCACAAATCTTCAAAAAAGCAAATTATGCTACAACATTACTTAATAGTAATGAAGATGTAAAAATTAATGATATTTACATTGCCGAAAATAAAAAATATTATGTCTGTGGAAGATCCGTAGATAGTGTAGGCAATTATATTGGATTTGTTGCCAAGATTTCTGAATCTGGACTATTAGAGTGGAGAAAAACAACAGAGGTTACGGCACCATCTGGTGAGTTAACTTATTTGGAATTTACAAATATTTTAGTTGAAGGATCGGACATATATGCCGTAGGTATTAACAAACCAAATGTTTCAGTCTTGGATGCATACAATCCCGATATTGTATTTGTAAAATTCCAAGAAGATTCTACTGGACTAAACGCATCTGTATCTCAACAAAGAGCTTATGCAGGTATTTCTGGATCCACAAGATCGGATACTGTAACAGGCATTAAAAAGTTAACAGATAATAGATATGTTATTTGTGGACATACAAATACTAACTCCAGTAATCCTTTGGATGCATTTGTCATTGTTATTGACAATACTGGCACTTTTGTAACTAAGAGAAAAATTGCTAGTGATTTAAAATCTGAGAAAATTGTTGATTTTATTATCAAAAATGAGCAAATTTATTTCCTCATGGAAACTGCAGCAACAAATGTTGCTACCGATATCAGTTTAACTTTAGGTAAGTGCCGTTTAGATGGAAATGTTATCTTAGTTGATTGGATGAAGGAATTTACCAATCCAACTTACTCTTTCCTGAATTCTACAATTGAGTTAGATGAATTTGAAGACTTCTATCTAACATCGACACTATGTTTAAAAGCAACTCCCACTGTAAAGAATGCTTTCTGGGTCGCTAAAATAAATGATACCCCAAGTGTTATTTGGAGTTATAGTTATGCAGTTGCTGGTGGTAATATTGATACAGTCAACAGAGGAAGTGTTGATATATTTGGTGATATCAATATTGCATACACAAAAACTCATACAAATGATGAAATTTCTTTAGAAGCAGTACAAGTAAACTATAAAGGAGAAATTGTTGGTCATACTTCTAATAGACTAACTCCAAATGGAGATGTTTATAACAATATTGAAGGTATCAAATCATATGCTACCGCTAACGATGTTTCTGGCGATTTGACTGTATATGGTCAATCTCAGTGGAATAGAAATGAATTTACATTCACCTTTGATCAGACAGACAGTGCTACAGATACTTGTGGCAAATATACCCCAACTTTAATTGGTAATGATTCTACTGACGCTTTAACTCTTGTCGGTGATGGTGTAGCAAAACTATTTGGATATGATGTTGCAACTCCAGCAAACTGGGAGAATGCGGCAATTAAATTTGCAGCAGCAAATCTAGATGAAAAATTAGGAGATAGTTGGACACTAGAGTTTACTTTATATAAAGATTCGACTAACTCTCAGACTCATTCTCAAACTCAGCAAACTTTAGTTGCTATTGGTGATGCTACAGATACTACTGGTGGTCTTTGGTTATATTATGATGTTTCAAGTGGTCAGTTAGAATTAGTGATAAGCAATAGCGTCACTGCTCTCAATGCTGCAGGATCTGGTTTGAATTCTGTTTCTAGTAACCTTTATGCAGATGATACTTGGCAATGGGTTGCACTTCAAAAGAATGGTGATGCATTTAGTGCATATATTAATGGCACTCAAGTTTTTACGGGCACAGTTTTAAATACTGCCTTTGAAAACAAAGATCTTTATATTGGCAATATTCCTGGTAAAAATGGCACAACTGGTCAGTTTGCTTCTGCATATCAGGGTCAATATTACATTGGTGATCTTCGTCTTAAGAATAGAGCACTTACACCAACTGTTCCTTCAGATATTACTACAGCACCAACTGATGATCAGTTTGAATTAGCATATAATTGGAGTGATGATGCTTGGTTTACTGCATTCCATGAAAAGTATGATTATATTGATTATAAGGGTATTAGTTTAAGACTTGATAAGACTCAAAGTCCAGATTATCTTGGTAGTCTTACTACTACAACTAATACAGAATTGAAATGGAATAGATCTTTAGTTGCTGCGGCAACTGGAGTTAATTTGCCTGTTGCTTTAGTAAATTATGCAATTGGATCGGAAGGTCTTCAGGCACTTGATTTCAATAGCACAACTTTAGTTGCTCTATACGATAATGAAGCCTTTACTCATAATCAAGATATTTTATTCTTCCGTACAGCAACAATTCCATCTCCAGGATCGCAGAAAGTTATCGCTAGTGCTGTAATTAAAGACAGATATTATTTTAAAGTAACTGACACCTTAAAAATTGATAATATTAAGAGATTAACAATTAATCAACCATTTAACCTCAGTGAAAATGCTAAGTTGGTATTGGATAATGGATCTGGAGGATTTGTAAACAGTGGTTATATTACTGCTGTTGATGTAGAGAATCGCTATGTCTATGTTGCAATCAATAATAATACTTGGGGTAATGATACCAATACTGGTTTCTTAACTACTTCTAGATTTGATGAGCAAGATACTTATGGCATTGTTGGTCCAAATGTCAATGATACCAATACGATTACTAACTATGAGTTTGTTGATGTTGTAAACACAACACCAGGCACATTTGATATTGATATGCAAGATTATGATATGCTTCCTACTGTTGGTGGGACAGATAATCTTGACGAATATGCAAGATTCTTTAGCACTTTCAGTCTGAATGATTATTCAGTCAAGATTATTGAAACTTCTGGCGCTACAACTTTCGTACCTGGATCTGTTGTTGGTATTGAAGAATCTGATGTTTCTTACAATTCAGAGAGAAATACTATTCAAATTACTGGATTGACTGGTGTAACTAAAATTACTCTAGTTGCAGATCTTGAAAAGATTTTACAAGTAACTGCAGTTACAAATAGTGATGAAGTTTATATTGTTACCGAAAGTAGTCATTACTTAAGTCCAGGTGAAAATATTTTCGTAGATGGCAACCCCGAGGCACAATATAATGGATCTTTCACTGTAGATCGAGTTATTAGTGTTAAAGAATATACTTACAAGTTAAATGCAATTGCGACGGAAGAACCAGCATTAACTTCTGGTGATGTTGATGTATTCTCCAAGTCTCCAACTCTTAAGATGTATAATCAACATCAATACATCTTTGACATGAGTCATGTATCTCTTATTGGTGGAAATCTTTCTTTTGCAAAGGATAGTCTTTATAAGTTGGAATATTCTTTTAATATCATTGAAAGAATTGGTACTCCAGGAATTGTTGCTGGTGCTCAAGTGCCATCAATTAAGTTAAAAGTAGACGATTCTATCGTTACAAATATTTCCTATTACTTTGATCCTTCTCGTACGGGAGACAACAGTCCAATTGATAGTGATAGTTACCTTGATATTGGTCCATCTCCTTATATTGGAAACTTTACTATTACAGAAACAACAGGTGGCACTATCACTACTGGTGATAATACTATGAAATTTGTTTTGGTTTCTGAGCCAGAAGATGTTGCTACAATAGAAAAAGCAAAATACGCAACATCTTCTACAAAAGCAGTCGGATCTATTTCTGATATTAGAATTGTTAATGGTGGTGGTTTCTATACTAAAGTGCCGATTATTTCTAATATCGAATCAAGTAGAAAAATTGAAAGAGTTGAAATTGTAGA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