Protein

UniProt accession
A0A0E3FY41_9CAUD [UniProt]
Protein name
Structural protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,4467

Protein sequence
MFEGLNNQYGGEYSHVANPQRLRYILGDNLILDSNSNLTEQNASLDHSPIIGWAFDGNPIYGPYGFDDPTDQTSNIVRMGTSYRLKIRLVYDDITNPYPSRDDGPSLIDEPAGTFIEDYEYDFGSGDLDQYNGRFCKTPEFPNGRYCYFVTIDNSEAGNSVFPYVLGPSFNSIVDIWNLNDYSIQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERIPNSSSNALTTEAGDTLLFEIEDENKDGVISQDETDDPDQIFEESPLQLYDYFPKVRFDSRVDIEVDTITRFENASVTGFIVENAGQSYQVNDIIVFDNATSGGSGASARISKISGESITSYSYENVANINYGILTTVVPHNLVVGDKITVNYTPVMDTTNKRFVVRQYKGIEEVVINQTGSGYSVDIPPTIIIDGDGVSAEVEAIVETNGSINSFNIINSGSQFTENPRFILSHPQIFKKANYATTLLNSNEDVKINDIYIAENKKYYVCGRSVDSVGNYIGFVAKISESGLLEWRKTTEVTAPSGELTYLEFTNILVEGSDIYAVGINKPNVSVLDAYNPDIVFVKFQEDSTGLNASVSQQRAYAGISGSTRSDTVTGIKKLTDNRYVICGHTNTNSSNPLDAFVIVIDNTGTFVTKRKIASDLKSEKIVDFIIKNEQIYFLMETAATNVATDISLTLGKCRLDGNVILVDWMKEFTNPTYSFLNSTIELDEFEDFYLTSTLCLKATPTVKNAFWVAKINDTPSVIWSYSYAVAGGNIDTVNRGSVDIFGDINIAYTKTHTNDEISLEAVQVNYKGEIVGHTSNRLTPNGDVYNNIEGIKSYATANDVSGDLTVYGQSQWNRNEFTFTFDQTDSATDTCGKYTPTLIGNDSTDALTLVGDGVAKLFGYDVATPANWENAAIKFAAANLDEKLGDSWTLEFTLYKDSTNSQTHSQTQQTLVAIGDATDTTGGLWLYYDVSSGQLELVISNSVTALNAAGSGLNSVSSNLYADDTWQWVALQKNGDAFSAYINGTQVFTGTVLNTAFENKDLYIGNIPGKNGTTGQFASAYQGQYYIGDLRLKNRALTPTVPSDITTAPTDDQFELAYNWSDDAWFTAFHEKYDYIDYKGISLRLDKTQSPDYLGSLTTTTNTELKWNRSLVAAATGVNLPVALVNYAIGSEGLQALDFNSTTLVALYDNEAFTHNQDILFFRTATIPSPGSQKVIASAVIKDRYYFKVTDTLKIDNIKRLTINQPFNLSENAKLVLDNGSGGFVNSGYITAVDVENRYVYVAINNNTWGNDTNTGFLTTSRFDEQDTYGIVGPNVNDTNTITNYEFVDVVNTTPGTFDIDMQDYDMLPTVGGTDNLDEYARFFSTFSLNDYSVKIIETSGATTFVPGSVVGIEESDVSYNSERNTIQITGLTGVTKITLVADLEKILQVTAVTNSDEVYIVTESSHYLSPGENIFVDGNPEAQYNGSFTVDRVISVKEYTYKLNAIATEEPALTSGDVDVFSKSPTLKMYNQHQYIFDMSHVSLIGGNLSFAKDSLYKLEYSFNIIERIGTPGIVAGAQVPSIKLKVDDSIVTNISYYFDPSRTGDNSPIDSDSYLDIGPSPYIGNFTITETTGGTITTGDNTMKFVLVSEPEDVATIEKAKYATSSTKAVGSISDIRIVNGGGFYTKVPIISNIESSRKIERVEIVEPGTEYAVGLYNSVPISGDGEGGLVSITVENTTDSEGVSIPGQITKVTVTSPGKNYTTATIDVDSISGILGVGLTGSGAELNVIIPPAGTGASIFATGRNIGKIKQLKNNNFGYDYPHDYTLRPEISFPLNAQLINTSILESIRVSDPGSGYSQAPAVVITGGGGSGAIAESTIQNGRLSQIIVKDPGSGYSSPPTVELKSSFNYVVNLDLGLLQFAFPHGIINGAQVTLEAVDIGDGVEFPLAAGAIGRLNSQTTYYAISGAEQSLEADQLKLAITESNAELGDAIGYVNAGIGRQQVLTSSFGGAAVANVVTSTFLEGEQVYQGDSIQNATATGFVSENNGWQIGPRILKIVNYNNNFSVGEKVTGVISKSAGVISDLNIASGVLEIGPITKTTGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSSVSINDWKNILIKNVHPASFKVFGELNITENAVIPNKEIDFQLTKSVELARNAIVPNIQNFALAEPIYQDFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISNLFDGIRTQFPLTIDQNNIVADAKQLMIVLNGVVQTPETAFKVLSDSIVFSEPPSPPASIKYASVTIEQISIVQFEFSNQSGTPPDDNQIGAVIVGTQSGARAQLTKVLGTNNVGNLELEGFIAEGVFIANELCTINATGYAANLQSTSVPTQGSLFFYGEEIRNLDGDEAVIERVNLQTGQETPIAELRYAIGLSTTVFEVIPSTGIAAPVLDVFELNENYQIGSEIVTVTGITQNVDSTTLEVSREQNGTALSAQQAGVPIYGTQIEITNQLVISKTTGTYQSTPGLFDIQLNDVIIASQSGVVARVIGTSAYQDPSTQQFISQINISDGSSFFGLLFNRITSPEFPNIVIDDISQSQVNVVEYGDNISLFSSSFPANEFINNYSIIYDNAVGTFQDNEFIRNWKFDYGNSSDDFAANEEVNVRKLTFKDAVGDGFFTAGQILRSPNSKAEVIGYNQARSIIYLSKMARTQSTGEDYHNMTFVAGAEINTYNEKFGNACLALSKGTSAHTFVSATENGITAGGGATGTFTAATGTTYDAITGDMIIEIGTHTLTTSNTVTIVASGVTFTCASDNNTAEYSYPRATDPQFGQAIAISAVTSTTITVNVGAVPVDEYLTIPTSTEFGFGTGDFTLELWMKTNSIASGGKTLLDFRSATAEVAPYLYLDGANLKYYVNAAEVITGTTNFAVNNWYHIAISRSSGTTKLFLNGVQEGSDYADTNDYGSTKPIRIGAAWNATNVLPGYIDELRVSTNARYTADFGNPTGIFQGDANTVLLIHFDGAQGQTYTDDWSGEANWTRSDFFNNDAILATKRSTNGSNSQHSNNTQRYYDAASLIENNRDFIGAETQALIQVSLPYTLDTSAVTNTITASDYLSMGSNTYFGKSVGITQDKIVVGSYEADIQGVGNNRGAVYTYNLDGTGEVKIATPTGGGGDDFGWDVDAFYSTVDSTSKLVVGAPFYEPSSSYSNSGIAYIYNADGTNQVILNADVITSNNRFGYSCAAGGGKVAVGAYGDDTYRGSVFIFDEDGTNRIKVTASDSATYDYFGFSIAIANNKLIVGAYGHEDTGSGRGCVYVYDLDGTNEVKIQASDAENGDAFGFSVAGDGDKILVGAYSEDTGASGAGSAYLYNYDGTGEIKFQSNDVQSGDQFGHGTLLVDGEFIIVGNVSYDGISSNGGALEKFIYDSDAGTVTYDSTLPLPSHTSSFHGEFRGGNIAYDTTARKMVYGNRYQTVTGLTRSGQVFVFDYNQSSTASGFDTPIKETLTALVDDLRGGSNSHIWDNAATYVNRSSLPITSLLKFIGQEASLISGYTSLKTIIQNVINNYPLTVTGSHGIIQFTDVSITDSSYPTLTKLTPTNVDYNATTGDMVITVVGHTLTTADVISIAEESLKFTCSSDGNVRVLSHPRVSDTRAFNAALRITATTTDTFTINVGASPADQQYTHQFSSADADAITVLDYTTGDCADVTTTNDNLIDIVIDTLNEGSGTTTNTADGDHLATVTKLSPAYEFLGGTVDGFYEIPLTVSNSLPNDQVFYTNRIGKESRNRYIDAANLIRLNSSVIVDKASFDLLARYPDLANDMPRNDPNNTDDPNAGTRRCQTDLALLLASLADDIENGGSKNTVTVSNFYLGVNDALNHIRLQVWQSLFAHDRLGFYMKQAINGNLVSDVGTDDIIVGDWGITDDAIVNFTPTAATYDAATGVMVITIGSHSLALGRRITIADNSLTFTCTSDGNVSNETYPRTTDPASGVSLEVTASTATTITVNVGASPAGQQYAHTFVSAAANAVSTAGECANVETAIDTLIDTLNDAIAPVSANNNYRIAADRLYFNRLFIQEEVLGSIIDEFTYSVGGTTYNSYDFSGDNNQEQLKDDINLFILSAISDLQTGGSNSSIDAISTFLDSRLEVTRIEDILTVFISILKEVKTLGIKALRNQLYSLNEGTQTSPNYQGQFTSQSTYRDSESISATDLNDFSFRFRDLIEIVIKTIAPSDIIGMGDAAKQILFNEHYYESEISSIVNTQFGSNTWQYTDFLNGILKDVLHDAIITNTTSSNSQTARRISLLREGVVSEIVFTAGTGYRSAPTITLDPPGTGITATAEVVLDTSGSLSSLSITTPGSGYTFSPDLVFTGSTFDVGDSHGGSSTLTNGAVTAVTYDGIVYDFNNSVTSALTLGSAVSMTAGTSGMLTGRQLLLFGTGSGSRFASIQTPFDTTYAETIRVYVIAGGSSNGGNAPEINEDLKLYYSTTGSNWVLIDTLVEGGSTGTSKEYTNFNTLNYVDITLPTLARAQTIYFRFQQDQYTDGSFDQYGVTRIGLIDGAQQFSIDTTIAVNNASLESGTPSTAEVELVTGIGIAAINITNPGSGYDPANPPTATLTGGGTTNPGTITDLSVSLDNSRFIVNAEITNGSGTTGNVLEDSGNNLYIGSITGSGFADGDTLTQGLVTAEIPSNGVGPEINYYNDIANVETINTARNISSLVEGEIISANLLTNPEFATTSTWRRSRSNLINAAALAPDATQTAIAWRSNTTSSTSHYVYRDYYLTAYETLDNGSIRFDTSNTTFDEGAPSDGSKRQFTYSFFAKSVDYDELYVRIQAYNSSTSQRINFSRVNIETGVVSGISSQGQAFDIEEYGSVPYGNGWFRFYFTFSVSYGYSLVRFFQYLRAPGGGGTGFSADLNDEAYMWGMKLNEGGLDTYSSESSQIFYSNTEYNVKKFAIETLEDLTVSALNGVLASPSGNSGFTSFYDSDYASSYQTDTIARFIRQNLNIILNQLLNGNYYATVTTNNGITIPTYTYGTRDLLVPLSGAIED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Physico‐chemical
properties
protein length:5642 AA
molecular weight: 609374,73540 Da
isoelectric point:4,33024
aromaticity:0,09926
hydropathy:-0,16276

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014c
[NCBI]
1079998 Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Namakavirus smbcm6 >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI]
32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX38079.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019128 [NCBI]
CDS location
range 55013 -> 71941
strand +
CDS
GTGTTTGAGGGGTTGAATAATCAATATGGTGGTGAATATTCTCACGTTGCTAATCCACAACGTCTTAGATATATTCTTGGCGATAATTTAATCTTAGATAGCAATAGTAATCTCACTGAGCAAAATGCGTCTTTGGATCATTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGCAATCCAATTTATGGTCCATATGGATTTGATGATCCTACAGATCAAACTTCTAACATCGTTAGAATGGGCACTTCATATAGATTGAAGATAAGACTAGTATATGATGATATTACTAATCCATATCCTTCAAGAGATGACGGTCCATCATTGATCGACGAGCCAGCTGGCACATTCATTGAAGATTATGAATATGATTTTGGCAGTGGCGACCTTGATCAGTATAATGGTAGATTCTGTAAAACTCCCGAGTTTCCAAACGGTAGATACTGCTATTTTGTTACTATTGATAATAGTGAAGCTGGAAATTCAGTATTCCCCTATGTTTTGGGTCCTTCCTTTAACTCTATTGTAGATATTTGGAATCTAAACGACTATTCAATTCAGCAAAATATTCCAACTGGTGTTGTAAGGTATAGAGATCCTTATGAAAACGTTGATATTGATGTTGAGCGTATTCCTAATTCATCTTCCAATGCTTTAACCACAGAAGCGGGTGATACCCTTCTATTTGAAATTGAAGACGAAAATAAAGATGGTGTAATCAGTCAAGATGAGACTGATGATCCCGACCAAATTTTTGAAGAGTCTCCTTTACAACTTTATGATTACTTCCCTAAAGTTAGATTTGATTCCCGAGTTGACATTGAAGTTGACACTATTACTAGATTTGAAAATGCTTCCGTTACTGGATTTATTGTTGAAAATGCAGGTCAAAGTTATCAAGTAAATGATATCATTGTTTTTGACAATGCTACTAGTGGTGGTAGTGGTGCTTCTGCTAGAATCTCTAAAATTTCTGGAGAATCTATTACTTCTTATTCATATGAAAATGTTGCAAACATAAACTACGGCATTCTCACTACAGTAGTTCCACATAATCTGGTTGTTGGAGATAAAATTACTGTTAATTATACTCCTGTAATGGATACGACAAATAAGAGATTTGTTGTGCGCCAATATAAGGGTATTGAAGAAGTTGTTATCAATCAAACAGGTAGTGGGTATAGTGTAGACATTCCTCCAACCATCATTATTGATGGCGACGGTGTTTCTGCTGAAGTTGAGGCAATCGTAGAGACCAATGGATCTATCAATTCATTTAATATTATAAATTCGGGATCTCAATTCACAGAAAATCCTAGATTTATACTTTCACATCCACAAATCTTCAAAAAAGCAAATTATGCTACAACATTACTTAATAGTAATGAAGATGTAAAAATTAATGATATTTACATTGCCGAAAATAAAAAATATTATGTCTGTGGAAGATCCGTAGATAGTGTAGGCAATTATATTGGATTTGTTGCCAAGATTTCTGAATCTGGACTATTAGAGTGGAGAAAAACAACAGAGGTTACGGCACCATCTGGTGAGTTAACTTATTTGGAATTTACAAATATTTTAGTTGAAGGATCGGACATATATGCCGTAGGTATTAACAAACCAAATGTTTCAGTCTTGGATGCATACAATCCCGATATTGTATTTGTAAAATTCCAAGAAGATTCTACTGGACTAAACGCATCTGTATCTCAACAAAGAGCTTATGCAGGTATTTCTGGATCCACAAGATCGGATACTGTAACAGGCATTAAAAAGTTAACAGATAATAGATATGTTATTTGTGGACATACAAATACTAACTCCAGTAATCCTTTGGATGCATTTGTCATTGTTATTGACAATACTGGCACTTTTGTAACTAAGAGAAAAATTGCTAGTGATTTAAAATCTGAGAAAATTGTTGATTTTATTATCAAAAATGAGCAAATTTATTTCCTCATGGAAACTGCAGCAACAAATGTTGCTACCGATATCAGTTTAACTTTAGGTAAGTGCCGTTTAGATGGAAATGTTATCTTAGTTGATTGGATGAAGGAATTTACCAATCCAACTTACTCTTTCCTGAATTCTACAATTGAGTTAGATGAATTTGAAGACTTCTATCTAACATCGACACTATGTTTAAAAGCAACTCCCACTGTAAAGAATGCTTTCTGGGTCGCTAAAATAAATGATACCCCAAGTGTTATTTGGAGTTATAGTTATGCAGTTGCTGGTGGTAATATTGATACAGTCAACAGAGGAAGTGTTGATATATTTGGTGATATCAATATTGCATACACAAAAACTCATACAAATGATGAAATTTCTTTAGAAGCAGTACAAGTAAACTATAAAGGAGAAATTGTTGGTCATACTTCTAATAGACTAACTCCAAATGGAGATGTTTATAACAATATTGAAGGTATCAAATCATATGCTACCGCTAACGATGTTTCTGGCGATTTGACTGTATATGGTCAATCTCAGTGGAATAGAAATGAATTTACATTCACCTTTGATCAGACAGACAGTGCTACAGATACTTGTGGCAAATATACCCCAACTTTAATTGGTAATGATTCTACTGACGCTTTAACTCTTGTCGGTGATGGTGTAGCAAAACTATTTGGATATGATGTTGCAACTCCAGCAAACTGGGAGAATGCGGCAATTAAATTTGCAGCAGCAAATCTAGATGAAAAATTAGGAGATAGTTGGACACTAGAGTTTACTTTATATAAAGATTCGACTAACTCTCAGACTCATTCTCAAACTCAGCAAACTTTAGTTGCTATTGGTGATGCTACAGATACTACTGGTGGTCTTTGGTTATATTATGATGTTTCAAGTGGTCAGTTAGAATTAGTGATAAGCAATAGCGTCACTGCTCTCAATGCTGCAGGATCTGGTTTGAATTCTGTTTCTAGTAACCTTTATGCAGATGATACTTGGCAATGGGTTGCACTTCAAAAGAATGGTGATGCATTTAGTGCATATATTAATGGCACTCAAGTTTTTACGGGCACAGTTTTAAATACTGCCTTTGAAAACAAAGATCTTTATATTGGCAATATTCCTGGTAAAAATGGCACAACTGGTCAGTTTGCTTCTGCATATCAGGGTCAATATTACATTGGTGATCTTCGTCTTAAGAATAGAGCACTTACACCAACTGTTCCTTCAGATATTACTACAGCACCAACTGATGATCAGTTTGAATTAGCATATAATTGGAGTGATGATGCTTGGTTTACTGCATTCCATGAAAAGTATGATTATATTGATTATAAGGGTATTAGTTTAAGACTTGATAAGACTCAAAGTCCAGATTATCTTGGTAGTCTTACTACTACAACTAATACAGAATTGAAATGGAATAGATCTTTAGTTGCTGCGGCAACTGGAGTTAATTTGCCTGTTGCTTTAGTAAATTATGCAATTGGATCGGAAGGTCTTCAGGCACTTGATTTCAATAGCACAACTTTAGTTGCTCTATACGATAATGAAGCCTTTACTCATAATCAAGATATTTTATTCTTCCGTACAGCAACAATTCCATCTCCAGGATCGCAGAAAGTTATCGCTAGTGCTGTAATTAAAGACAGATATTATTTTAAAGTAACTGACACCTTAAAAATTGATAATATTAAGAGATTAACAATTAATCAACCATTTAACCTCAGTGAAAATGCTAAGTTGGTATTGGATAATGGATCTGGAGGATTTGTAAACAGTGGTTATATTACTGCTGTTGATGTAGAGAATCGCTATGTCTATGTTGCAATCAATAATAATACTTGGGGTAATGATACCAATACTGGTTTCTTAACTACTTCTAGATTTGATGAGCAAGATACTTATGGCATTGTTGGTCCAAATGTCAATGATACCAATACGATTACTAACTATGAGTTTGTTGATGTTGTAAACACAACACCAGGCACATTTGATATTGATATGCAAGATTATGATATGCTTCCTACTGTTGGTGGGACAGATAATCTTGACGAATATGCAAGATTCTTTAGCACTTTCAGTCTGAATGATTATTCAGTCAAGATTATTGAAACTTCTGGCGCTACAACTTTCGTACCTGGATCTGTTGTTGGTATTGAAGAATCTGATGTTTCTTACAATTCAGAGAGAAATACTATTCAAATTACTGGATTGACTGGTGTAACTAAAATTACTCTAGTTGCAGATCTTGAAAAGATTTTACAAGTAACTGCAGTTACAAATAGTGATGAAGTTTATATTGTTACCGAAAGTAGTCATTACTTAAGTCCAGGTGAAAATATTTTCGTAGATGGCAACCCCGAGGCACAATATAATGGATCTTTCACTGTAGATCGAGTTATTAGTGTTAAAGAATATACTTACAAGTTAAATGCAATTGCGACGGAAGAACCAGCATTAACTTCTGGTGATGTTGATGTATTCTCCAAGTCTCCAACTCTTAAGATGTATAATCAACATCAATACATCTTTGACATGAGTCATGTATCTCTTATTGGTGGAAATCTTTCTTTTGCAAAGGATAGTCTTTATAAGTTGGAATATTCTTTTAATATCATTGAAAGAATTGGTACTCCAGGAATTGTTGCTGGTGCTCAAGTGCCATCAATTAAGTTAAAAGTAGACGATTCTATCGTTACAAATATTTCCTATTACTTTGATCCTTCTCGTACGGGAGACAACAGTCCAATTGATAGTGATAGTTACCTTGATATTGGTCCATCTCCTTATATTGGAAACTTTACTATTACAGAAACAACAGGTGGCACTATCACTACTGGTGATAATACTATGAAATTTGTTTTGGTTTCTGAGCCAGAAGATGTTGCTACAATAGAAAAAGCAAAATACGCAACATCTTCTACAAAAGCAGTCGGATCTATTTCTGATATTAGAATTGTTAATGGTGGTGGTTTCTATACTAAAGTGCCGATTATTTCTAATATCGAATCAAGTAGAAAAATTGAAAGAGTTGAAATTGTAGA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