Protein

UniProt accession
A0A0E3F8P2_9CAUD [UniProt]
Protein name
Structural protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,4909

Protein sequence
MTINKVSQVSREQLPQFIDDGFPLFGKFIEYYYKSQEKTGLGQNILNNFLNYMDIDKLNVDILDGATTIVEDITTSSSTIVVENIDSFLENNGSVLVGDEVIFYERAVASPSIALSPGISFEEVQLKEITLAQIAELFDGSRQIFPLTTQNNPVSAPSPQHLQVTLYGELLVPLDDYNVDGTNITFVNPPRARTASDDISTIQIKYFNGFVESEIVRLDNISGGFNDETVSFPVTKDSIDYKPEIDEYILATYDGSRLIAKNDFTFDGNLITFNFTPLPGRKLTLYSIEAPIPSFGSGAIGFSRVNNNGELVSVAVGENGSNYRFEYPPKVSIKDNNGQGSGGSAVALINGVKSVSLLDGGFGYSDTNPPTVFVEAPTTVDSKLPKIKASVTNGSISSLEIEESGSGYTFTPRLSFVQPGGAKLATPTIISGSISGDIAITDGGSGYTTSPTVYVDFPTGEDSIRASLRANLVDGKVSSITVLNPGQGYETAPRVAIVDPVGAQVLETRVDADGRVISIELLDGGSGYEDVPSVYIVDDRQDPVTGNYSGGTGATAVCAIFNGQITDINITNFGTGYSADAPPSIVIQAPPKAEASVVVGLSEITGFEVINSGSNYSKCKLEGCARAVSGMVNYNQVGNAEFSNDTTAVAHQSGEVVKCLDALFIKRLLDKYIEQYLPDVPELDYKNIDVRSAIKNIKTFYSTKGTSFSIAYLFKLLYGENVSISYPKDQLIKPSASTWATNTILRAKLVSGNPQNIKDATLIQEADIADPNVQDASALVENFISIKTSEFDIYELILSQETIEGNFTVPYKSRLAEELVEGDLIITVDSTIGWPERNGELIINDTEIVRYKEKSLNQFIECTRDTNSSGETTWDAATEIRSIFRVYLNKGTLTEVVMDIVGIVDAQQTTLSDTGSYYLPGDKLTVSKLGGSSVDPQLTTWLYNVKKLIEVETITYGGINNSFATVTCSAPHGLLVGDQVTVYGANPIIYNGTFLVTSRDSTTIFQYNLPQPAVVEPQGNILISVDLNKGKSENDAIRKTIAPYTTNIQNTFFNAEHVYVASTGIPNYNIGPFLGSALLPGNQRKLNRFPLNVQTISTKSEITPGSIGTWVNGVSVWSYKSPQTKTFGAVTGVSILNSGSNYDAANPPTITIAGGGGSGASSTVVVDGSITAIEVDQGGSGYTSSPLVSIVGGNGSGASATAIITRGVVSRILVNNGGSGYTSQPEITIVGGDGSGAAATAQVRGPVESVNIIDGGASYTSNPTVTLSSGFGAVAQPIVNNGRILSIAIISGGQGYTTAPEVEIFGSGFGAVAKAIIDTDGDNAGKVTGVEILNRGIGYVDGTTTISLSSIGSGGEFSANVFQWTYNLQETTTFDSAKGSVFEGLNNQYGGEYSHVANPQRLRYILGDNLILDSNSNLTEQNASLDHSPIIGWAFDGNPIYGPYGFDDPTDQTSNIVRMGTSYRLKIRLVYDDITNPYPSRDDGPSLIDEPAGTFIEDYEYDFGSGDLDQYNGRFCKTPEFPNGRYCYFVTIDNSEAGNSVFPYVLGPSFNSIVDIWNLNDYSIQQNIPTGVVRYRDPYENVDIDVERIPNSSSNALTTEAGDTLLFEIEDENKDGVISQDETDDPDQIFEESPLQLYDYFPKVRFDSRVDIEVDTITRFENASVTGFIVENAGQSYQVNDIIVFDNATSGGSGASARISKISGESITSYSYENVANINYGILTTVVPHNLVVGDKITVNYTPVMDTTNKRFVVRQYKGIEEVVINQTGSGYSVDIPPTIIIDGDGVSAEVEAIVETNGSINSFNIINSGSQFTENPRFILSHPQIFKKANYATTLLNSNEDVKINDIYIAENKKYYVCGRSVDSVGNYIGFVAKISESGLLEWRKTTEVTAPSGELTYLEFTNILVEGSDIYAVGINKPNVSVLDAYNPDIVFVKFQEDSTGLNASVSQQRAYAGISGSTRSDTVTGIKKLTDNRYVICGHTNTNSSNPLDAFVIVIDNTGTFVTKRKIASDLKSEKIVDFIIKNEQIYFLMETAATNVATDISLTLGKCRLDGNVILVDWMKEFTNPTYSFLNSTIELDEFEDFYLTSTLCLKATPTVKNAFWVAKINDTPSVIWSYSYAVAGGNIDTVNRGSVDIFGDINIAYTKTHTNDEISLEAVQVNYKGEIVGHTSNRLTPNGDVYNNIEGIKSYATANDVSGDLTVYGQSQWNRNEFTFTFDQTDSATDTCGKYTPTLIGNDSTDALTLVGDGVAKLFGYDVATPANWENAAIQFAAANLDEKLGDSWTLEFTLYKDSTNSQTHSQTQQTLVAIGDATDTTGGLWLYYDVSSGQLELVISNSVTALNAAGSGLNSVSSNLYADDTWQWVALQKNGDAFSAYINGTQVFTGTVLNTAFENKDLYIGNIPGKNGTTGQFASAYQGQYYIGDLRLKNRALTPTVPSDITTAPTDDQFELAYNWSDDAWFTAFHEKYDYIDYKGISLRLDKTQSPDYLGSLTTTTNTELKWNRSLVAAATGVNLPVALVNYAIGSEGLQALDFNSTTLVALYDNEAFTHNQDILFFRTATIPSPGSQKVIASAVIKDRYYFKVTDTLKIDNIKRLTINQPFNLSENAKLVLDNGSGGFVNSGYITAVDVENRYVYVAINNNTWGNDTNTGFLTTSRFDEQDTYGIVGPNVNDTNTITNYEFVDVVNTTPGTFDIDMQDYDMLPTVGGTDNLDEYARFFSTFSLNDYSVKIIETSGATTFVPGSVVGIEESDVSYNSERNTIQITGLTGVTKITLVADLEKILQVTAVTNSDEVYIVTESSHYLSPGENIFVDGNPEAQYNGSFTVDRVISVKEYTYKLNAIATEEPALTSGDVDVFSKSPTLKMYNQHQYIFDMSHVSLIGGNLSFAKDSLYKLEYSFNIIERIGTPGIVAGAQVPSIKLKVDDSIVTNISYYFDPSRTGDNSPIDSDSYLDIGPSPYIGNFTITETTGGTITTGDNTMKFVLVSEPEDVATIEKAKYATSSTKAVGSISDIRIVNGGGFYTKVPIISNIESSRKIERVEIVEPGTEYAVGLYNSVPISGDGEGGLVSITVENTTDSEGVSIPGQITKVTVTSPGKNYTTATIDVDSISGILGVGLTGSGAELNVIIPPAGTGASIFATGRNIGKIKQLKNNNFGYDYPHDYTLRPEISFPLNAQLINTSILESIRVSDPGSGYSQAPAVVITGGGGSGAIAESTIQNGRLSQIIVKDPGSGYSSPPTVELKSSFNYVVNLDLGLLQFAFPHGIINGAQVTLEAVDIGDGVEFPLAAGAIGRLNSQTTYYAISGAEQSLEADQLKLAITESNAELGDAIGYVNAGIGRQQVLTSSFGGAAVANVVTSTFLEGEQVYQGDSIQNATATGFVSENNGWQIGPRILKIVNYNNNFSVGEKVTGVISKSAGVISDLNIASGVLEIGPITKTTGQFIDDVGKPSEIIQKIQDSYYYQDFSYAVKSSVSINDWKNILIKNVHPASFKVFGELNITENAVIPNKEIDFQLTKSVELARNAIVPNIQNFALAEPIYQDFNNTEVLFRQKRLTSSENILTSVVQRLDDISNLFDGIRTQFPLTIDQNNIVADAKQLMIVLNGVVQTPETAFKVLSDSIVFSEPPSPPASIKYASVTIEQISIVQFEFSNQSGTPPDDNQIGAVIVGTQSGARAQLTKVLGTNNVGNLELEGFIAEGVFIANELCTINATGYAANLQSTSVPTQGSLFFYGEEIRNLDGDEAVIERVNLQTGQETPIAELRYAIGLSTTVFEVIPSTGIAAPVLDVFELNENYQIGSEIVTVTGITQNVDSTTLEVSREQNGTALSAQQAGVPIYGTQIEITNQLVISKTTGTYQSTPGLFDIQLNDVIIASQSGVVARVIGTSAYQDPSTQQFISQINISDGSSFFGLLFNRITSPEFPNIVIDDISQSQVNVVEYGDNISLFSSSFPANEFINNYSIIYDNAVGTFQDNEFIRNWKFDYGNSSDDFAANEEVNVRKLTFKDAVGDGFFTAGQILRSPNSKAEVIGYNQARSIIYLSKMARTQSTGEDYHNMTFVAGAEINTYNEKFGNACLALSKGTSAHTFVSATENGITAGGGATGTFTAATGTTYDAITGDMIIEIGTHTLTTSNTVTIVASGVTFTCASDNNTAEYSYPRATDPQFGQAIAISAVTSTTITVNVGAVPVDEYLTIPTSTEFGFGTGDFTLELWMKTNSIASGGKTLLDFRSATAEVAPYLYLDGANLKYYVNAAEVITGTTNFAVNNWYHIAISRSSGTTKLFLNGVQEGSDYADTNDYGSTKPIRIGAAWNATNVLPGYIDELRVSTNARYTADFGNPTGIFQGDANTVLLIHFDGAQGQTYTDDWSGEANWTRSDFFNNDAILATKRSTNGSNSQHSNNTQRYYDAASLIENNRDFIGAETQALIQVSLPYTLDTSAVTNTITASDYLSMGSNTYFGKSVGITQDKIVVGSYEADIQGVGNNRGAVYTYNLDGTGEVKIATPTGGGGDDFGWDVDAFYSTVDSTSKLVVGAPFYEPSSSYSNSGIAYIYNADGTNQVILNADVITSNNRFGYSCAAGGGKVAVGAYGDDTYRGSVFIFDEDGTNRIKVTASDSATYDYFGFSIAIANNKLIVGAYGHEDTGSGRGCVYVYDLDGTNEVKIQASDAENGDAFGFSVAGDGDKILVGAYSEDTGASGAGSAYLYNYDGTGEIKFQSNDVQSGDQFGHGTLLVDGEFIIVGNVSYDGISSNGGALEKFIYDSDAGTVTYDSTLPLPSHTSSFHGEFRGGNIAYDTTARKMVYGNRYQTVTGLTRSGQVFVFDYNQSSTASGFDTPIKETLTALVDDLRGGSNSHIWDNAATYVNRSSLPITSLLKFIGQEASLISGYTSLKTIIQNVINNYPLTVTGSHGIIQFTDVSITDSSYPTLTKLTPTNVDYNATTGDMVITVVGHTLTTADVISIAEESLKFTCSSDGNVRVLSHPRVSDTRAFNAALRITATTT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Physico‐chemical
properties
protein length:7022 AA
molecular weight: 755884,29080 Da
isoelectric point:4,35338
aromaticity:0,09613
hydropathy:-0,14174

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage ACG-2014c
[NCBI]
1079998 Uroviricota > Caudoviricetes > Kyanoviridae > Namakavirus smbcm6 >
Host Synechococcus sp. WH 7803
[NCBI]
32051 Bacteria > Cyanobacteria > Oscillatoriophycideae > Chroococcales > Synechococcus >

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AIX22846.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KJ019064 [NCBI]
CDS location
range 50873 -> 71941
strand +
CDS
ATGACAATCAATAAGGTTTCCCAAGTATCTAGAGAGCAACTACCTCAGTTTATCGATGATGGATTTCCACTATTTGGAAAATTCATTGAGTATTACTACAAATCGCAGGAGAAGACAGGTTTAGGACAAAATATCCTAAACAATTTTCTAAACTACATGGATATCGACAAATTAAATGTCGATATTCTTGACGGTGCAACAACAATCGTAGAAGACATCACTACATCATCTTCTACGATTGTTGTTGAAAACATAGACTCTTTCTTAGAAAATAACGGAAGTGTTTTAGTTGGTGATGAAGTCATTTTTTATGAAAGAGCAGTTGCTTCACCAAGTATTGCTTTAAGTCCTGGTATTTCTTTTGAGGAAGTACAATTAAAGGAAATCACCCTTGCTCAAATTGCAGAGCTTTTTGATGGATCAAGGCAAATCTTTCCTCTTACAACTCAAAACAATCCTGTCTCTGCCCCTTCGCCTCAACATTTACAAGTCACCTTATATGGTGAATTATTAGTACCTTTAGATGATTACAATGTAGACGGTACAAATATTACCTTTGTAAATCCACCTAGAGCAAGAACTGCATCTGACGATATTTCTACGATTCAAATTAAATATTTCAACGGATTTGTTGAAAGTGAAATTGTAAGGCTGGATAATATTTCTGGCGGTTTTAATGATGAGACCGTATCATTTCCTGTTACTAAAGATTCTATTGATTACAAACCAGAAATTGACGAGTATATTCTTGCGACTTATGATGGAAGTCGCTTAATTGCTAAAAATGACTTTACATTTGATGGAAATTTAATTACATTTAATTTTACTCCACTTCCAGGAAGAAAGTTAACTTTATATTCTATTGAAGCTCCTATTCCAAGTTTTGGTAGTGGTGCTATTGGATTTTCTAGGGTTAATAATAACGGTGAATTAGTATCAGTTGCAGTTGGTGAAAACGGGTCAAATTATAGATTTGAATATCCTCCTAAAGTTTCTATCAAAGATAATAACGGACAAGGGTCTGGCGGATCTGCTGTAGCACTAATTAATGGTGTTAAATCAGTTTCTCTTCTTGATGGGGGATTTGGTTACAGTGATACCAATCCACCTACAGTTTTTGTTGAAGCACCAACAACAGTTGATTCAAAATTACCAAAAATTAAAGCATCAGTTACAAATGGATCTATTTCTTCTTTAGAGATTGAAGAATCTGGAAGTGGATATACTTTCACACCAAGACTGTCGTTTGTCCAACCTGGAGGAGCAAAACTTGCTACTCCGACGATTATATCTGGATCTATTAGTGGTGATATTGCTATAACTGATGGTGGATCAGGATATACAACTTCTCCGACTGTTTATGTTGATTTTCCTACTGGCGAAGATTCAATTAGAGCAAGTTTGAGAGCAAACTTAGTGGATGGAAAAGTTTCCTCCATTACAGTTTTGAATCCAGGACAAGGATATGAAACTGCACCAAGAGTTGCAATTGTTGATCCTGTAGGAGCACAAGTTTTAGAAACTAGAGTTGATGCAGATGGAAGAGTAATCTCCATTGAATTGCTGGATGGTGGATCTGGTTATGAGGATGTGCCATCGGTATATATTGTTGATGATAGGCAAGATCCAGTTACAGGTAACTACTCTGGTGGCACAGGTGCAACTGCAGTATGTGCTATTTTCAATGGTCAAATCACCGATATCAATATTACCAATTTTGGCACTGGATACAGCGCCGATGCACCTCCATCTATTGTAATTCAAGCACCACCCAAAGCAGAAGCTTCTGTTGTTGTTGGTTTAAGTGAAATTACGGGTTTTGAGGTAATCAATTCTGGTAGCAATTATAGTAAGTGTAAATTAGAAGGATGTGCCAGAGCCGTAAGTGGCATGGTAAATTACAATCAAGTTGGTAATGCTGAATTTTCCAATGATACTACTGCAGTAGCACACCAATCAGGTGAAGTAGTTAAGTGTTTGGATGCTTTGTTTATTAAGAGACTTCTAGACAAGTATATTGAGCAGTATCTTCCTGATGTCCCAGAATTAGACTACAAAAATATTGATGTAAGATCTGCAATTAAAAATATCAAGACCTTTTATTCTACAAAAGGCACTTCATTTAGTATTGCATACTTATTCAAACTTCTTTATGGTGAAAATGTAAGTATTAGTTATCCAAAAGATCAATTAATCAAACCATCTGCATCTACTTGGGCAACAAATACAATCCTTAGAGCAAAACTTGTATCTGGCAACCCTCAAAACATTAAAGATGCAACATTAATCCAAGAAGCAGATATTGCAGATCCAAATGTGCAAGATGCTTCTGCTCTTGTGGAAAACTTCATTTCTATCAAAACTTCCGAGTTTGATATTTACGAATTGATTCTTTCCCAAGAAACAATTGAAGGAAATTTCACAGTTCCTTACAAATCCAGACTTGCAGAAGAATTGGTAGAAGGAGATCTAATCATCACCGTTGACTCCACTATTGGATGGCCAGAAAGAAACGGCGAACTCATTATTAATGATACTGAAATTGTAAGATATAAGGAAAAATCTTTAAACCAGTTTATTGAATGCACTAGAGACACAAATAGCAGTGGTGAGACTACCTGGGACGCTGCTACAGAGATCAGATCTATCTTTAGAGTATATCTAAACAAAGGGACCTTAACAGAGGTCGTAATGGATATTGTGGGCATTGTTGATGCTCAACAAACTACACTGTCTGACACAGGATCTTACTATCTTCCTGGAGACAAACTTACTGTATCTAAGTTAGGAGGATCTTCAGTAGATCCTCAACTAACAACTTGGTTATATAACGTTAAAAAACTAATTGAAGTTGAAACTATCACTTATGGTGGTATTAATAACAGTTTTGCAACAGTTACCTGCTCTGCACCTCATGGTCTTCTGGTTGGTGATCAAGTAACTGTTTATGGTGCAAATCCAATCATCTATAACGGCACATTTTTAGTTACATCTAGAGATTCCACAACGATATTCCAATATAACTTGCCTCAACCTGCTGTGGTTGAGCCTCAAGGCAATATCTTGATTTCGGTCGATCTAAACAAAGGTAAATCTGAAAATGATGCAATTAGAAAGACAATTGCGCCATATACAACCAATATTCAGAATACCTTCTTCAATGCAGAGCATGTTTATGTAGCATCTACAGGTATTCCAAACTATAATATTGGTCCTTTCCTGGGATCTGCACTTTTACCTGGCAACCAAAGAAAATTAAATCGTTTCCCATTAAATGTCCAAACAATTTCAACTAAGAGTGAAATTACACCTGGATCTATTGGCACATGGGTTAACGGCGTTTCTGTATGGTCTTATAAATCACCACAAACAAAAACCTTTGGTGCTGTAACGGGTGTTAGCATTTTAAATTCAGGATCTAATTATGATGCAGCAAATCCACCAACAATTACGATTGCTGGCGGTGGTGGTAGTGGAGCATCTTCAACTGTAGTTGTTGATGGATCAATTACAGCAATTGAGGTAGATCAAGGTGGATCTGGGTATACATCCTCTCCACTTGTTTCTATTGTTGGTGGTAATGGATCTGGTGCATCTGCTACTGCAATTATCACTAGAGGTGTTGTATCTAGAATTCTTGTCAATAATGGAGGGTCTGGATATACTTCTCAACCCGAAATTACTATTGTTGGTGGTGATGGATCTGGTGCTGCTGCTACAGCACAAGTAAGAGGTCCAGTCGAGTCTGTTAATATTATCGATGGTGGAGCATCTTATACTTCTAATCCTACAGTAACACTAAGTTCTGGATTTGGTGCTGTAGCACAACCAATTGTTAATAATGGTAGAATTCTTTCTATTGCAATTATTTCAGGTGGTCAAGGTTATACAACAGCACCTGAAGTAGAAATTTTTGGTAGTGGTTTCGGTGCTGTAGCGAAAGCCATTATTGATACTGATGGCGATAACGCAGGAAAGGTCACTGGTGTTGAGATTTTAAATAGAGGTATTGGTTATGTAGACGGAACGACAACAATTTCACTAAGTTCTATTGGATCTGGTGGTGAATTTTCTGCAAATGTATTCCAATGGACATACAATTTACAAGAAACAACCACATTCGATTCTGCCAAAGGATCTGTGTTTGAGGGGTTGAATAATCAATATGGTGGTGAATATTCTCACGTTGCTAATCCACAACGTCTTAGATATATTCTTGGCGATAATTTAATCTTAGATAGCAATAGTAATCTCACTGAGCAAAATGCGTCTTTGGATCATTCTCCTATTATTGGATGGGCATTTGATGGCAATCCAATTTATGGTCCATATGGATTTGATGATCCTACAGATCAAACTTCTAACATCGTTAGAATGGGCACTTCATATAGATTGAAGATAAGACTAGTATATGATGATATTACTAATCCATATCCTTCAAGAGATGACGGTCCATCATTGATCGACGAGCCAGCTGGCACATTCATTGAAGATTATGAATATGATTTTGGCAGTGGCGACCTTGATCAGTATAATGGTAGATTCTGTAAAACTCCCGAGTTTCCAAACGGTAGATACTGCTATTTTGTTACTATTGATAATAGTGAAGCTGGAAATTCAGTATTCCCCTATGTTTTGGGTCCTTCCTTTAACTCTATTGTAGATATTTGGAATCTAAACGACTATTCAATTCAGCAAAATATTCCAACTGGTGTTGTAAGGTATAGAGATCCTTATGAAAACGTTGATATTGATGTTGAGCGTATTCCTAATTCATCTTCCAATGCTTTAACCACAGAAGCGGGTGATACCCTTCTATTTGAAATTGAAGACGAAAATAAAGATGGTGTAATCAGTCAAGATGAGACTGATGATCCCGACCAAATTTTTGAAGAGTCTCCTTTACAACTTTATGATTACTTCCCTAAAGTTAGATTTGATTCCCGAGTTGACATTGAAGTTGACACTATTACTAGATTTGAAAATGCTTCCGTTACTGG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