Protein
- UniProt accession
- D6PGQ6_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Phage related protein tail component-like protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,8409
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9594
- Protein sequence
-
MTDIKRIIRGSKGGDPSPPKPTREPDTLHSRQYATFLDLISEGEIEGFATASKEGRTKGTTAYNNAALKDVFLNDTPVITASADSTDIQDTDRNFQNVTFTPRFGVDSQTAIPNIDSSVSTTSVGVEVTKAIPVTRQITNTNVDKVRVSITFPQLQRATDDGDLLGTEVQFKISVQYNSGGFTDVITPDNGGKVSGRSGDAYQRDYGIQLTGAFPVDIRVSRVTDDATDTNVQDTFQWTSFGEIIEESRTYNNSAYTALRLDSMQFSSIPDRKFRIRGIKVRVPGAGASSSGTPTVVTNQAEATALGLGTLSSFGFIHYPDGYIFNGVMGAATWCSDPAMILLDLLTTSRYGFGDHIADTSLDLFSFVNASKFASTLVDDGAGALEPRFSCNVNIQSPKEAFELINELAGVMRCMPIWSAGSITITQDKPTDPSYLFNLSNVGEGGFSYAGSSLKTRHSVVSVSYFNMDSQEVDFEVHEDADLIAKIGTVVKKVKAFGCTSRNQAKRLAKSIVFAENNESEVVTFTTSIDSGVIVRPGAVIEIQDPVRAGVRRGGRLKSVTSTTVVTVDDTAATDLAINASGSPVGDAKISIIMPDGTLEVGTISAVSGGTITVNSVVKNNADGTQTTQSTFSSAPNVNANFLISNVTIKSQLFRVITVEEQDGINYAITALSYVEGKYAFIEDGEALPARTVSKLNELTPPPDGVNAVERIFPINNQAISKIVISWQPIVGVTEYQVNYKFGNDNFISEKVSRPDFEIMNSRKGTYTIQVLSYNVQNRLSATSTNITFEAVGKTALPQNVSNLLVEPVSDQFIRLRFDKATDIDVTHGGNVVVRHSNISDGTATFTNSTDAIPALPGSVSETLVPAVNGEYILKFRDDGGRLSPGETSVIVNTPDPFPKLTVFTDREDTDATPFAGTKVDCFFSDDVNGLVLGSLETLDSVTDFNAIADFDFLGAVDITGGHYDFASKLDLGGKQPLRLTRHLVSQGFYPNDLVDKRTANIDTWRDFDGATAFDVNAKLLVATTDSDPATSDSATYTQSGTTITVTKTSHGFAVGTFVDIDFTSGGATDGYFEVQSVPTDSTFTVTASSSATISSSNCTLGAGFTRFSTFVNGTFIGRGFRFRCEMDSDDPAQSIEIDQLGYNAQLESRTETSLGNAGATGGLIASGTSTKSVTFTNSFFIGQANTDVAADSVKPSVGITIENAQAGDFFTIPSITSTGFTINVKNRDTSGNETFVNRNFKYAATGFGRGS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1252 AA molecular weight: 134008,00690 Da isoelectric point: 4,70976 aromaticity: 0,08546 hydropathy: -0,17324
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured phage MedDCM-OCT-S01-C104 [NCBI] |
743532 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADD94907.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU943050
[NCBI]
CDS location
range 7145 -> 10903
strand +
strand +
CDS
ATGACTGATATTAAACGTATTATCAGAGGTTCAAAAGGTGGAGATCCATCACCTCCGAAACCTACAAGAGAACCTGATACTCTTCATAGTAGACAATACGCTACTTTTTTAGACTTAATATCAGAGGGGGAAATTGAAGGTTTTGCTACTGCGTCTAAAGAGGGAAGGACAAAAGGTACGACTGCCTATAATAATGCTGCACTTAAAGATGTATTTTTAAATGATACTCCTGTTATAACAGCTTCAGCAGATTCTACTGATATTCAAGATACGGATAGGAACTTTCAGAATGTTACTTTTACTCCTCGTTTTGGAGTTGATAGTCAAACTGCTATACCAAATATAGATAGTAGTGTATCAACAACAAGTGTCGGTGTTGAAGTCACGAAAGCTATTCCTGTAACTAGACAGATTACTAATACAAATGTTGATAAAGTACGAGTATCAATCACCTTTCCCCAGTTACAAAGAGCAACTGATGATGGCGATTTATTAGGAACAGAAGTTCAGTTTAAAATATCTGTTCAATATAATTCTGGTGGCTTTACAGATGTAATTACACCTGATAATGGTGGAAAAGTATCAGGAAGAAGTGGAGATGCTTACCAAAGAGATTACGGAATACAACTTACAGGTGCATTTCCTGTAGATATAAGAGTTAGCAGAGTTACAGATGATGCTACAGATACTAATGTTCAAGATACTTTCCAGTGGACAAGTTTTGGAGAAATAATTGAAGAATCTCGTACTTATAACAACAGTGCTTATACTGCTTTACGTCTGGATTCAATGCAATTCAGTTCGATTCCAGATAGAAAATTTAGAATTAGAGGAATAAAAGTAAGAGTTCCTGGAGCAGGTGCATCTAGCTCTGGTACTCCAACTGTTGTTACAAATCAGGCTGAAGCAACTGCGTTAGGACTTGGTACTCTTAGTAGTTTTGGTTTTATCCATTATCCAGATGGCTATATATTTAATGGAGTAATGGGAGCAGCGACTTGGTGTTCTGATCCTGCAATGATATTGCTTGATCTTTTGACTACAAGTAGATATGGATTTGGAGATCATATAGCAGACACTTCTCTTGATCTTTTTAGTTTTGTAAACGCAAGTAAATTTGCAAGCACATTAGTTGATGATGGTGCTGGAGCACTTGAGCCTAGATTTAGCTGCAATGTAAATATTCAAAGTCCAAAAGAAGCATTTGAGTTAATTAACGAGTTAGCAGGTGTAATGAGATGTATGCCAATATGGTCTGCTGGTTCGATAACCATAACTCAGGACAAACCAACCGATCCAAGCTATTTATTTAACTTATCAAATGTAGGAGAAGGAGGTTTTAGCTACGCAGGAAGTAGTCTTAAAACGAGACACAGTGTTGTATCTGTTTCTTACTTCAATATGGATAGTCAAGAAGTTGATTTTGAAGTCCATGAAGATGCTGATTTAATAGCAAAAATAGGTACAGTAGTTAAAAAAGTAAAAGCATTTGGTTGCACAAGTCGTAATCAAGCAAAAAGATTAGCAAAATCTATAGTATTTGCGGAAAATAATGAGTCAGAAGTAGTTACGTTTACAACCTCTATAGATTCTGGAGTGATTGTACGACCTGGTGCTGTTATTGAAATTCAAGATCCAGTAAGAGCAGGAGTAAGAAGAGGTGGCAGACTGAAAAGTGTTACTTCTACAACTGTTGTTACTGTTGATGATACTGCTGCGACTGATCTTGCTATAAATGCAAGTGGTAGTCCTGTTGGAGATGCCAAAATATCTATAATTATGCCAGATGGAACACTAGAAGTAGGTACTATTTCTGCTGTGTCAGGAGGTACTATTACTGTAAATAGTGTTGTAAAAAACAATGCTGACGGAACTCAAACTACTCAATCAACATTTAGCTCTGCTCCAAATGTAAATGCTAATTTCCTTATATCAAACGTAACTATAAAGTCTCAATTATTCAGAGTAATAACAGTAGAAGAGCAAGATGGTATTAATTATGCAATTACAGCTTTATCTTATGTTGAAGGTAAATATGCGTTTATTGAAGATGGTGAAGCATTACCAGCTAGAACTGTATCAAAATTAAATGAACTTACTCCACCTCCTGATGGTGTAAATGCTGTTGAAAGAATATTTCCTATTAATAATCAAGCTATATCTAAAATTGTTATTAGTTGGCAGCCTATAGTTGGTGTTACTGAATATCAAGTTAATTATAAATTTGGTAATGACAATTTCATAAGTGAAAAGGTATCAAGACCTGATTTTGAAATAATGAACAGTAGAAAAGGAACTTATACCATCCAAGTCTTGTCATATAATGTTCAAAATAGATTATCAGCAACTTCAACAAATATTACGTTTGAAGCGGTAGGAAAAACTGCACTACCACAGAATGTCTCTAATTTACTTGTAGAACCAGTATCAGATCAATTTATAAGACTACGTTTTGATAAAGCTACAGATATTGATGTTACGCATGGTGGAAACGTAGTTGTTAGACACAGTAATATTAGCGATGGAACGGCTACATTTACAAACTCTACTGACGCTATCCCTGCATTGCCAGGATCGGTCAGCGAAACGCTTGTGCCAGCAGTTAACGGAGAGTATATTCTTAAGTTCAGAGATGATGGTGGCAGATTAAGTCCTGGAGAAACTTCAGTTATAGTTAATACTCCAGATCCATTTCCTAAGTTAACTGTATTCACAGATAGAGAAGATACTGACGCAACACCTTTTGCAGGTACAAAAGTTGATTGCTTTTTTAGTGATGATGTAAATGGGCTTGTTCTTGGGTCGTTAGAAACTTTAGATTCTGTTACAGATTTTAATGCTATTGCTGACTTTGATTTCTTAGGTGCTGTTGATATTACTGGTGGTCATTATGATTTTGCTTCTAAATTAGATTTAGGTGGTAAACAACCATTGAGATTAACGAGACATCTTGTAAGCCAAGGTTTTTATCCAAATGACTTAGTAGATAAACGAACTGCAAATATAGATACTTGGAGAGATTTTGATGGTGCTACTGCTTTTGATGTAAACGCAAAACTATTAGTGGCAACAACTGACAGCGATCCAGCTACATCTGATTCAGCCACTTACACACAATCTGGAACAACAATAACAGTAACAAAGACTAGCCACGGATTTGCTGTTGGTACTTTTGTTGATATTGATTTTACAAGTGGTGGTGCAACTGACGGGTATTTTGAAGTTCAATCAGTACCGACTGATAGTACATTTACTGTTACAGCATCATCTAGTGCAACAATATCGAGCAGTAATTGTACTCTTGGAGCAGGATTTACTAGATTCAGTACTTTTGTTAATGGAACATTTATTGGTAGAGGATTTAGGTTCAGATGTGAAATGGATTCAGACGATCCAGCACAATCCATTGAAATAGATCAACTGGGTTATAATGCACAACTTGAAAGTAGAACTGAAACAAGTCTTGGTAATGCAGGAGCTACGGGTGGTTTGATTGCATCTGGAACGTCTACAAAGTCTGTTACTTTTACCAATAGTTTCTTTATAGGTCAAGCTAATACAGATGTTGCAGCAGATAGTGTAAAACCCTCTGTTGGTATTACTATTGAAAATGCCCAAGCTGGTGATTTTTTTACAATTCCAAGTATTACATCAACAGGTTTTACTATTAATGTAAAAAATAGAGATACATCTGGAAATGAGACTTTTGTTAATAGAAATTTCAAATATGCTGCTACTGGATTTGGGCGTGGTAGTTAG
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.