Protein

Genbank accession
AGG54131.1 [GenBank]
Protein name
structural protein [Synechococcus phage S-SSM4]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGGAQEWANENPTLAQGEIGIELDTNRFKIGDGVRGWNTLPYERPIESVANTANTLVTRDADGNFSAGAITATLIGNSATSSRLANPRQIQLSQDLSGSGTFDGSSNLSLNAQLQVLSSLPHYDGTTTSTGTYTKVIVDAKGRITNASQPSSYVDLGLNDVQPLDSDLSAIANLTSTGIITRNAGGSALTRSVQGSSGRISVVNGNAVAGNPTIDLIDTTVALEAEFIAGSGQYNIPSLTSVGGDNLPEAANRTVNSTRYTVDQYGRFTSALTIPIATAREGSKYPNYDAATTYSRYAIIQNASKVYQALTTINAGAGAPTHSSGDTGSWRYLAAEATEQKGLASFAQEDFDVDSNGHVTIAAAGVDNTQLQNNLLRFADGNATEDFELDNELTSTTGYRGFNKLNYVKVNDTSGNLLVGLNNTGDGGAGELDVNVRSYFSDPDVTFDGAVQQAINKTGDGDFQILHQQNTASARTFAIAAQNSGSGNSQVAISAENVVSIDATDSAGKVHIEDLRIQDNYLASTGQLNLDPGDDRTNAGLVRIFGDLQIDGTTTTVNSTTMTVDDVTILLGGDTAPASDDNLDRGIEFRYYDTQARLGFYGWDTSYTDLSGHEGGYRFLHAATNTGEVFAGTDSGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVVLGGAGIGDDVNIGGSVDIDTNLRIHGTSRFDDNVVLQGASKTLQLNNGSGTTKIEFQSTSGNGSLAGILDVTGNFNVNSNKFNVVAASGNTSIAGTLAVTQGTTMSAGLDLNSTLNVSNTVYFEDTNEPTWAKNSGTGLWEIQSNDYGAFRFDGGGYVAGDFMFDSDVVINGTILQRDDATETFNEQNYLRVRRKLFVGNIQALTPSYASHSNTNLRVYGGAGIQTDLHIGDDLYIGKLNSNDSVKFQVLGESGNTTIQGTLLVENNTNFNGTLDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLDVNGATEITNTLDVSNAVTFDQTLTVQGNSEFNGTVDVDANFAVRSGSTDKMTVASSTGNIATDGTLVVQGQTTINDSLIVQASNEFFKVQNGSSADRFTIDTDNGNTSVIGTLTVSQATDLNNTLNVAGITTFENNTDQNITNVSYSADGAVRIDGGVGIDKKLAVGGASRFYGTAEFSSDLDINAAADISGNLTISNGNQVTSFADTTVALKVTGGARINKNLMTGGDFTVYDNSGGLNSFLVEVATGDATLRNDLVVGGNLTVNGTTTTVNSTTVTLDDPIMTLGGDTAPVSDDNKDRGIEFRYYDTQARLGFIGFDNNLEKFRFLVNATNSSEVFSGTDGSLQAGTLNLTGSGTALDVDNNANIDGTLTVDGVITSTKTSGAPFVVNSTSKVTNLNADLLDGMTTAATNTVSTVVARDSSGNFAAGTITAALVGNSSTATALETARNIAVAGVVSGTVSFDGTSDVSITTSFVDADVAALAAMSGTGMVTRTAGNTYAQRTLSKSGAGITITNGDGVSGNPTINIQSASTNSASNLVLRDASGNFSAGTVTANLTGNVTGNVTGTVSDISNHDTDDLSEGSTNVYYTNARADARVNLQTGANLSLANKTTTDLAEGTNQYYTEARVQAKLDNAYEQLRAMLTNLATSTTLTLNLSGDPTPGAVVAIGAIQNNGIGGFSNSTGLATGGGSGTSLTVDLTTSAGAITGIAINTPGTNYTTSDTITITNPNAGGVNAFNFGSLSAGTNYVSTNNVLTTGGSGTGLRVNFTAGSGNVTNVTVASAGSGYVNGETVTIPNDGAASASITAAGTGYSVDSLVSTTGGTGSGLTISIDTVNPGTGAITGLSIVSGGHGYTASDVITVSGGNGDATFTIGSVHAGNATIDISQVFTNATFALSDVTEMEVGATVTGATSGTTARISSLGATAITVDNVDGFFKKGEVVSANDVTTLTISSFS
Physico‐chemical
properties
protein length:1931 AA
molecular weight: 198695,43280 Da
isoelectric point:4,24487
aromaticity:0,06163
hydropathy:-0,16396

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-SSM4
[NCBI] 		536466 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AGG54131.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HQ316583.1 [NCBI]
CDS location
range 71649 -> 77444
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAACTTAGACGTGGTGGTGCTCAGGAGTGGGCTAATGAAAACCCAACCCTAGCCCAAGGCGAAATTGGCATTGAACTTGATACCAACCGATTCAAAATCGGTGATGGTGTCAGGGGATGGAATACCTTACCGTATGAACGGCCGATTGAATCCGTGGCAAACACGGCTAATACTCTTGTAACTAGAGATGCTGATGGTAACTTCTCTGCTGGTGCTATTACTGCTACCTTAATTGGTAACTCTGCAACATCTTCTCGTCTTGCCAACCCTCGTCAGATCCAACTATCTCAAGACCTTTCAGGTTCTGGTACTTTTGACGGTTCGTCTAACTTATCTCTTAACGCTCAGTTACAGGTTCTTTCTTCATTACCACATTACGATGGTACAACAACCTCTACTGGCACTTATACTAAAGTAATTGTTGATGCTAAAGGTAGAATTACAAACGCATCTCAACCATCATCTTATGTTGATCTTGGATTAAATGATGTTCAACCTTTAGACTCAGACCTTTCTGCAATTGCAAACTTAACCAGTACAGGTATTATCACTCGTAACGCTGGTGGTTCTGCACTTACCAGATCTGTACAAGGTTCATCAGGTAGAATTTCTGTTGTAAATGGTAACGCTGTTGCTGGTAATCCAACGATTGACCTTATTGATACTACCGTTGCTCTTGAGGCAGAATTTATTGCTGGTAGCGGTCAATACAATATCCCAAGTTTAACGTCAGTAGGTGGTGATAATCTACCAGAAGCAGCAAACAGGACGGTAAATAGTACAAGATACACTGTAGATCAGTACGGACGTTTCACGTCTGCATTGACTATTCCTATTGCTACCGCTCGTGAAGGTAGCAAGTATCCTAACTATGATGCAGCAACAACCTATTCTAGATATGCAATTATCCAGAATGCGTCCAAAGTTTACCAAGCACTTACAACAATTAACGCTGGCGCTGGTGCTCCTACTCATTCCAGTGGCGATACTGGATCATGGCGCTACCTCGCGGCTGAAGCCACGGAACAGAAGGGACTGGCTAGCTTTGCACAGGAAGATTTTGACGTTGACAGCAACGGGCACGTTACCATCGCCGCCGCAGGCGTAGACAATACACAACTACAAAATAATCTTCTAAGATTTGCTGACGGAAACGCTACAGAAGATTTTGAATTAGATAACGAATTAACTTCAACAACTGGTTATAGAGGATTTAATAAACTTAATTATGTTAAAGTCAACGATACTAGTGGTAATCTGCTGGTTGGCCTTAATAACACTGGCGATGGTGGAGCGGGGGAACTTGATGTCAATGTAAGATCATACTTCTCTGATCCTGACGTAACCTTTGATGGTGCTGTACAGCAAGCAATCAATAAAACTGGTGATGGAGATTTCCAAATTCTACATCAACAGAACACTGCGTCTGCTAGAACTTTTGCAATTGCTGCTCAAAACAGTGGTTCTGGAAATAGTCAGGTTGCAATCAGTGCTGAGAACGTTGTTTCAATTGATGCAACTGATTCTGCTGGTAAGGTTCATATTGAAGACCTTAGAATTCAGGACAACTATCTAGCAAGCACAGGACAACTTAATCTTGATCCTGGCGATGATCGTACGAATGCTGGTTTAGTTCGTATCTTTGGTGATTTACAAATTGACGGTACTACTACCACAGTAAACTCCACTACTATGACAGTGGATGATGTTACTATTCTTCTCGGTGGTGATACTGCTCCTGCATCTGACGATAACCTTGATAGAGGTATTGAGTTTAGATACTATGATACTCAAGCACGTCTTGGTTTCTATGGATGGGATACAAGTTATACAGATTTAAGTGGTCATGAGGGTGGATATCGTTTCCTTCATGCTGCTACTAATACTGGTGAAGTTTTCGCTGGTACTGATTCTGGTATCATTGCAGGTAACTTAAAACTCACAACAAATACAAACTCAACATCTAATACTACTGGAGACTTGGTAGTTCTCGGTGGTGCAGGTATTGGTGATGATGTCAATATCGGTGGTTCAGTTGATATTGATACTAACCTCCGTATTCATGGTACATCTCGTTTTGATGATAACGTAGTCTTACAGGGTGCTTCTAAGACTCTGCAACTTAATAATGGATCTGGAACTACTAAGATTGAGTTTCAATCTACAAGTGGTAATGGTTCTCTTGCAGGTATCTTAGATGTAACTGGTAACTTTAACGTTAACTCTAACAAGTTTAACGTTGTTGCTGCCTCAGGTAATACTTCTATCGCTGGTACTCTTGCAGTAACACAAGGTACTACGATGAGTGCTGGTCTTGATCTGAACAGCACACTGAATGTATCAAACACTGTATACTTTGAAGATACTAACGAACCTACATGGGCAAAGAATAGTGGCACTGGTCTTTGGGAAATTCAATCCAATGACTACGGTGCATTCCGATTTGATGGTGGTGGTTACGTTGCTGGTGACTTCATGTTTGATAGTGACGTTGTTATCAACGGTACTATCCTTCAGAGAGATGATGCTACTGAGACATTTAACGAACAGAACTACCTAAGAGTTCGTCGTAAACTATTTGTTGGTAATATTCAAGCACTGACACCTAGTTACGCTTCTCATAGTAATACAAACTTGAGAGTTTACGGTGGTGCTGGTATTCAAACTGATCTCCATATTGGTGACGATCTTTACATTGGTAAATTAAACAGTAATGATAGTGTTAAGTTCCAAGTTCTAGGTGAGAGTGGTAATACAACTATTCAGGGTACATTACTTGTTGAAAATAATACAAACTTCAATGGTACTCTTGATGTTGACGCAGACTTTGCTGTTAGAAACGGAACTACTGACAAGTTCTTTGTTGACAATGTAACTGGTAACACAGATATTCAAGGCACTCTGGATGTTAACGGTGCAACTGAAATCACTAACACCTTAGATGTTAGCAATGCTGTTACCTTTGACCAGACACTTACAGTACAAGGTAATTCTGAATTCAACGGAACTGTAGATGTTGATGCAAACTTTGCAGTCAGATCAGGTTCAACTGATAAGATGACTGTTGCATCTTCTACAGGTAACATTGCAACTGATGGAACTTTAGTTGTTCAAGGTCAGACAACTATCAATGATTCTCTGATTGTACAAGCATCTAATGAATTCTTTAAGGTTCAGAATGGTAGTTCTGCAGATAGATTTACTATTGATACTGATAATGGTAACACCTCTGTTATTGGTACTCTTACAGTTTCCCAAGCAACTGACCTTAATAATACTCTTAACGTTGCTGGTATTACAACGTTTGAAAATAATACTGATCAAAATATTACCAACGTATCTTATAGTGCCGATGGTGCTGTAAGAATTGACGGTGGTGTAGGTATTGATAAGAAACTTGCTGTAGGCGGTGCTTCAAGATTCTATGGAACTGCTGAGTTTAGTTCCGATCTTGACATTAATGCTGCTGCAGATATTTCTGGCAACCTTACTATTAGTAATGGAAACCAAGTTACTAGTTTTGCTGACACTACAGTTGCTCTTAAAGTTACTGGTGGTGCGAGAATTAACAAAAACTTGATGACTGGTGGAGACTTCACCGTTTATGATAATTCTGGTGGTCTTAATAGTTTCCTTGTAGAAGTTGCTACTGGTGATGCTACCTTGAGAAATGACTTGGTAGTCGGTGGTAACTTAACTGTTAATGGTACGACTACAACCGTTAATAGCACTACGGTCACACTAGATGATCCTATCATGACACTGGGTGGAGATACCGCTCCAGTATCTGATGATAACAAAGACCGTGGTATTGAATTTAGATATTACGATACTCAAGCAAGACTTGGATTCATTGGTTTTGATAACAACCTAGAGAAGTTTAGATTCCTTGTTAATGCCACAAACTCCAGTGAAGTATTCTCTGGTACTGATGGTTCTTTACAGGCAGGTACATTAAACCTTACTGGTTCTGGTACTGCACTTGACGTTGATAATAATGCAAACATTGACGGAACTCTAACCGTTGATGGTGTAATTACATCTACTAAGACATCTGGTGCTCCTTTCGTAGTTAACTCTACTTCTAAGGTCACTAATCTTAACGCAGATCTCTTAGATGGAATGACAACTGCTGCTACTAATACAGTATCTACAGTTGTTGCTCGTGATTCTTCTGGTAACTTTGCTGCTGGAACTATCACTGCTGCTCTGGTTGGTAACTCTTCTACCGCAACTGCTCTTGAAACTGCAAGAAACATTGCAGTTGCTGGCGTTGTTTCTGGTACTGTGTCGTTTGATGGTACTTCAGACGTATCTATCACAACTTCATTTGTTGACGCTGATGTGGCTGCTTTAGCAGCTATGTCTGGTACTGGTATGGTTACCAGAACTGCAGGAAATACTTACGCGCAGCGTACACTTTCCAAGTCTGGTGCTGGTATTACAATCACTAATGGTGATGGTGTTTCTGGCAATCCTACTATCAATATTCAGTCTGCATCTACTAATAGTGCATCTAATCTCGTTCTTCGTGATGCGTCTGGTAACTTCTCAGCAGGCACTGTTACTGCAAACTTGACTGGTAACGTTACTGGTAATGTGACTGGTACAGTTTCTGATATTAGTAACCACGATACTGATGATCTTAGCGAAGGATCTACTAATGTCTACTATACAAATGCTCGTGCTGACGCTAGAGTTAATTTGCAGACTGGTGCAAACCTCAGTCTTGCTAATAAGACTACGACTGATCTTGCTGAGGGAACTAATCAATATTATACAGAAGCAAGAGTACAAGCAAAACTTGATAATGCATACGAGCAACTTAGAGCAATGCTTACCAACCTTGCGACTTCTACCACATTAACGTTGAATCTCTCTGGAGACCCAACACCTGGTGCTGTTGTTGCAATCGGTGCTATTCAAAACAACGGTATTGGTGGATTTAGTAACTCTACTGGTCTTGCTACTGGTGGGGGTAGCGG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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.