Protein

Genbank accession
AEF56891.1 [GenBank]
Protein name
tail tape measure [Clostridium phage phiCD38-2]
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,88
Protein sequence
MADGSIIIDTLLNTEDAEKQLNNLADTMKKKAKSALAVAGIGASLGAIGKQAIDFGDEYQKAMNSFESATGNAEAKAKGFGEALQQVYANNFGEDMGDISEVMSLISQKLDGIDASNIQEVTESAIMMRDTFDMDIGESLNGVNSMMRQFGVSAKESYNLIAQGAQQGLNQNDDLGDQLAEYSTYYAQMGFSAEEMFNMMKNGAESGVYQIDYLNDALKEFNIRTKDGSNGTKEAFEALGFNADELTKKFANGGSSAKEAFIQVTTALNNLDDNVLKNQIGVQLFGTKFEDLEADAVTALTNIEGSISSSKDKLEEINKIKYNSFGEAVTGIGRQMQVNLLLPIAEGLLPVLNDLANKFAKAFQNENTKNAIRSTAESIGGLIGTVVKLISLALTPLINVITFLVQHGSLVAPLIAGIGVAFTSLKVAGIVRGIQKSFTDAQLAVRIFTSGVTESETKLTLYQMVVGLVTKKISLAQVATNLWKGALTALGGPVGLTIVAVTALTAVVVSLWKNNEAFRDAVIKIWNNIKDAGAKIFGQIAKFFTETIPQALSKAISFIKDNWQGLLLMLVNPFVGAFKLIYDNCESFRNKVNSIFNKIIGIFKNVLNFIKNNWKNIGSMLLSPFVNAFKAIYNSCVNFKNKVFSFFSNVVKGFATFGKNIIVGIINGLSSGIGLVVDTVKNIGLIVVNTFKKVLRIHSPSKVTTELGEFAGIGFANGIKNTSKDVVEATKELISAMEKNLDTNKSKFEKICEAITTALKNQYESQKDIQIKALDERLKVEEKASNDRLKVYEKEYNEKLKYLDTETNEKTNAIQEQIDAIDKQIEEEQKAEEEKAYNEKISDLDRKLATAKNQKEREKIQKEISEAQSDRQKKLLDEQRQQEKNRLKEQIENIKTEASNKKEQYKEEYDNQKEAESKKLELIKESNASQKEEIEKYFSELLEETNIQNEARRLLLQKNSEEIIKLLSEYNPHWQDAGQSLADSLLNGVNSKKQSIQEAVKEAINLKEIIPAQEKELDRLKKKLEEYEKLKEKANTSSASGGDVDSSAKSSSLDSGSAKLDAGELEEYADGIDDVKTSVEGLELVSDELVTGTVPKVGDSASKLSESIKKGFNGIGGFFGGIEKWLRDTDKNINEWLASAKNSIGDFFSKVKDKFKEGIENIGGFFGGLGNKISEGFAGAGDFFTEFGDKAQQGFSSIKDKAVEIFGGLSNWFKETGSKIGDAIGSGLKSGLDFFTSTVPKWFAGIGDKIKEECGKIGEKISSFFNETMPAIINNIVEWFKQIPYNIGFVIGSIAGFFVDLGANLYAWATETLPEIINSIVEWFVSLPEKISEFFSIILQNIQTWGENFKVSVSEFFGAIWENITQFFTELPERISEWFNTVVETISGWGENLKQLATDIFNQFVDNVLIPISELPGKLWEKFTDIMGKVSEWGSNLIQKALETGSKFLENIMKFFSELPGKIWEKLTNIMQKVMEWEVNLSKKALETAKNFFNNIYNTVSQLPGKFREWLDNIISNVISWGTNLVKQAGEAGKNMANAVKDALKDLPSKIMSIGKDVVRGLWEGITGMGGWLKDQVLDFASNVIDGFRDGFGVHSPSIIMRDLIGRNLVKGVGVGIDVETPGLKEKIEKNISELTGKLKATVNFETSKIQANIVASTDFKAGKETAIMSNNKADEANENQAGIKLNIENFVNNRQQDIENLFDEILFLAKRKGAL
Physico‐chemical
properties
protein length:1716 AA
molecular weight: 189404,03680 Da
isoelectric point:5,14782
aromaticity:0,08566
hydropathy:-0,25798

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Clostridium phage phiCD38-2
[NCBI] 		1032362 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AEF56891.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
HM568888.1 [NCBI]
CDS location
range 10920 -> 16070
strand +
CDS
ATGGCAGATGGTTCTATTATTATAGATACTCTTTTAAATACCGAAGACGCAGAGAAACAACTTAATAACTTAGCTGATACCATGAAAAAGAAGGCGAAAAGCGCTTTAGCGGTAGCTGGAATTGGCGCAAGTCTAGGAGCTATAGGAAAACAGGCTATTGACTTCGGAGATGAATATCAAAAAGCAATGAATAGTTTCGAGTCAGCGACAGGAAACGCAGAAGCTAAAGCAAAAGGCTTTGGAGAAGCGCTACAGCAGGTTTATGCAAATAATTTTGGCGAGGATATGGGCGATATAAGTGAGGTCATGAGTTTAATATCTCAAAAGCTTGATGGGATAGATGCTAGCAATATTCAAGAGGTTACTGAAAGTGCTATTATGATGAGGGATACCTTCGATATGGATATTGGGGAAAGTTTAAATGGTGTTAACTCTATGATGCGCCAGTTTGGGGTTAGCGCAAAAGAGTCTTATAACTTGATTGCACAGGGTGCGCAACAAGGGTTAAATCAGAATGACGACCTCGGCGACCAATTAGCAGAATATTCGACATATTACGCACAGATGGGTTTTTCAGCAGAGGAAATGTTTAATATGATGAAAAACGGGGCGGAGAGTGGAGTCTATCAAATAGACTATTTAAATGATGCCTTGAAAGAATTTAATATTAGAACAAAGGATGGTTCTAATGGTACTAAGGAAGCTTTTGAGGCGCTCGGTTTTAATGCTGATGAACTAACTAAGAAATTTGCGAATGGTGGAAGTAGTGCAAAAGAAGCTTTTATTCAAGTTACAACAGCTTTGAATAACTTGGATGATAATGTATTGAAAAATCAGATAGGTGTACAACTCTTTGGTACTAAATTTGAAGATTTGGAAGCGGACGCAGTAACAGCGCTAACAAATATTGAAGGAAGTATAAGCAGTTCAAAAGATAAATTAGAAGAAATTAATAAGATAAAATATAATAGCTTCGGAGAAGCAGTAACGGGAATTGGAAGGCAAATGCAGGTTAATTTACTTCTTCCAATCGCAGAAGGATTGCTTCCTGTTTTAAATGATTTAGCAAATAAATTTGCTAAGGCTTTTCAGAATGAGAATACTAAAAATGCTATAAGAAGTACAGCAGAAAGTATTGGCGGGCTAATTGGAACAGTTGTAAAATTAATATCTTTAGCATTAACCCCTTTAATCAATGTTATAACCTTTTTGGTTCAGCATGGTAGCCTTGTAGCACCCTTAATAGCAGGAATTGGAGTTGCTTTTACAAGTCTTAAAGTAGCTGGGATTGTGAGGGGTATACAAAAAAGTTTTACAGATGCCCAGTTGGCGGTAAGAATTTTCACATCTGGCGTGACTGAGTCAGAAACTAAATTGACTTTGTATCAAATGGTAGTTGGATTGGTTACCAAAAAAATAAGTTTGGCGCAAGTTGCTACCAATCTGTGGAAAGGAGCATTAACTGCGCTTGGTGGTCCAGTTGGCTTAACTATAGTTGCGGTAACTGCATTAACGGCGGTCGTTGTTTCTTTATGGAAAAATAACGAAGCTTTCAGAGACGCGGTTATAAAAATTTGGAACAATATTAAAGACGCTGGAGCTAAAATATTTGGTCAGATTGCTAAATTCTTTACAGAAACAATACCACAAGCACTAAGTAAGGCTATATCCTTTATTAAAGATAATTGGCAAGGATTATTGCTAATGCTGGTTAATCCTTTTGTTGGAGCTTTTAAGCTGATTTATGATAATTGCGAAAGCTTTAGAAATAAAGTAAATTCTATATTTAACAAAATCATTGGTATCTTTAAAAATGTTTTAAACTTTATTAAAAACAACTGGAAAAATATAGGAAGCATGTTATTAAGTCCTTTTGTAAATGCATTTAAAGCTATTTATAATAGTTGTGTAAATTTTAAAAATAAGGTTTTTAGCTTTTTCTCTAATGTTGTAAAAGGCTTCGCTACTTTTGGAAAAAATATAATAGTTGGAATAATAAACGGACTTTCGAGCGGTATCGGCTTGGTTGTAGATACTGTAAAAAATATCGGTTTAATTGTAGTCAATACATTTAAAAAAGTGCTACGAATACATTCACCGTCCAAAGTTACAACAGAGCTTGGAGAGTTTGCAGGTATTGGTTTTGCTAATGGTATAAAAAATACAAGCAAAGATGTAGTAGAAGCAACAAAAGAATTAATAAGCGCTATGGAAAAAAATCTCGATACCAATAAAAGCAAATTTGAAAAAATTTGCGAGGCTATAACAACAGCATTAAAAAATCAATACGAAAGTCAAAAAGATATACAAATAAAAGCGCTTGATGAAAGACTAAAAGTTGAGGAAAAGGCATCAAATGATAGATTAAAGGTCTATGAAAAAGAATACAATGAGAAATTAAAGTATTTAGATACAGAAACAAATGAGAAAACTAATGCTATACAAGAACAAATTGACGCCATAGACAAGCAAATTGAAGAAGAACAAAAAGCAGAAGAAGAGAAAGCGTACAATGAAAAAATAAGCGACCTTGACAGGAAACTAGCAACAGCTAAAAATCAAAAAGAACGAGAAAAAATACAAAAAGAAATATCAGAAGCACAATCAGATAGACAGAAGAAATTATTAGATGAACAAAGGCAACAAGAAAAAAACAGATTAAAAGAACAGATTGAAAATATAAAAACAGAAGCTAGTAACAAAAAAGAGCAGTACAAAGAAGAGTACGACAATCAAAAAGAAGCAGAAAGTAAAAAACTTGAATTGATAAAAGAGTCTAATGCTAGTCAAAAAGAAGAAATTGAAAAATATTTTAGTGAACTTTTAGAAGAGACAAATATTCAAAATGAAGCGAGAAGGCTACTTTTACAAAAAAATTCAGAAGAAATTATAAAACTTTTAAGTGAATATAACCCGCATTGGCAGGATGCAGGGCAGAGTTTAGCAGATAGTTTGTTAAATGGAGTTAACTCTAAAAAGCAATCTATCCAGGAAGCTGTAAAGGAAGCTATTAACTTAAAAGAGATTATACCAGCACAAGAAAAAGAGCTTGATAGATTGAAGAAAAAGTTAGAAGAATATGAGAAACTAAAAGAAAAAGCTAATACTTCTAGCGCAAGTGGAGGGGATGTAGACTCATCTGCTAAAAGTTCCTCTTTGGATTCTGGTTCTGCCAAACTGGACGCTGGAGAACTAGAAGAATATGCTGATGGCATAGATGATGTTAAAACTTCTGTTGAAGGCTTAGAACTTGTCAGTGATGAACTCGTAACAGGAACAGTCCCTAAAGTTGGGGATTCAGCTAGTAAATTATCTGAAAGTATAAAAAAAGGGTTCAATGGCATTGGTGGTTTTTTTGGTGGAATAGAAAAATGGCTAAGAGATACAGACAAAAATATAAATGAGTGGCTAGCTAGTGCAAAAAATTCTATTGGTGATTTCTTCTCTAAAGTAAAAGATAAATTCAAAGAAGGAATTGAAAATATAGGTGGATTTTTTGGTGGTCTTGGAAATAAAATAAGTGAAGGATTTGCAGGAGCTGGAGACTTTTTTACAGAGTTTGGAGATAAGGCACAGCAAGGTTTTTCAAGTATAAAAGATAAAGCTGTAGAGATTTTCGGCGGTCTTAGCAATTGGTTCAAAGAGACTGGGTCAAAAATTGGAGATGCAATTGGAAGCGGATTAAAAAGTGGTTTAGACTTTTTTACTAGCACAGTACCAAAATGGTTTGCGGGTATTGGCGACAAGATAAAAGAAGAATGTGGGAAAATAGGAGAAAAAATATCAAGTTTCTTTAATGAGACAATGCCAGCTATAATAAATAATATTGTCGAATGGTTTAAACAAATTCCATATAATATTGGTTTTGTAATCGGGTCTATTGCTGGTTTTTTCGTTGATTTAGGAGCTAATCTGTACGCCTGGGCAACAGAAACATTACCAGAAATAATAAATAGCATTGTCGAATGGTTTGTAAGCCTTCCGGAAAAAATTTCGGAATTTTTTAGTATCATATTGCAAAATATTCAAACTTGGGGCGAAAATTTCAAGGTTTCTGTTTCAGAGTTTTTTGGTGCAATTTGGGAAAATATAACACAGTTTTTTACAGAGCTACCCGAAAGAATTTCGGAATGGTTTAATACAGTAGTAGAAACAATAAGTGGCTGGGGCGAAAATTTAAAGCAATTGGCAACAGATATTTTTAATCAATTTGTTGACAATGTATTAATTCCAATTTCGGAGCTTCCGGGAAAATTATGGGAAAAGTTTACAGATATCATGGGAAAAGTTTCGGAATGGGGTTCTAATCTAATTCAAAAAGCATTAGAAACAGGAAGCAAATTCTTAGAAAATATAATGAAATTCTTTTCAGAACTTCCGGGCAAAATATGGGAAAAATTAACTAATATAATGCAAAAAGTCATGGAGTGGGAAGTTAATTTATCTAAAAAAGCTTTAGAAACAGCGAAAAACTTTTTTAACAATATATACAATACTGTTAGCCAGCTTCCAGGAAAATTTAGAGAATGGCTAGACAATATCATTTCAAATGTCATAAGCTGGGGGACTAACTTAGTCAAACAAGCTGGAGAAGCTGGAAAAAATATGGCAAATGCTGTTAAGGATGCTTTGAAAGATTTGCCTAGTAAAATTATGAGTATCGGGAAAGATGTTGTAAGAGGCTTATGGGAAGGTATAACGGGCATGGGTGGCTGGTTAAAAGACCAAGTCCTTGATTTTGCTAGTAATGTTATAGATGGATTTAGAGACGGCTTTGGAGTGCATTCACCTTCCATAATCATGCGAGATTTAATTGGTAGAAATCTTGTAAAAGGGGTCGGCGTTGGAATAGATGTAGAAACGCCAGGCTTGAAAGAAAAAATAGAGAAAAATATATCTGAACTTACAGGTAAATTAAAAGCTACAGTTAATTTTGAAACGTCTAAAATACAAGCTAATATAGTTGCAAGTACAGATTTTAAAGCTGGAAAAGAAACAGC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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.