Protein

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Genbank accession
AOO11124.1 [GenBank]
Protein name
structural protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MANRIQLRRGSATQWSNANPTLAQGELGIELDTGRIKIGDGVTAWNSLRYERPIESVSATANTLVQRDADGNFSAGTITASLIGNASTASRLSSTRQIQLSQDVTGSGVFDGSANLNINAVLGLVPSLPHYDGTDTSSGTYTKVVVDAKGRITNASNPTTIQDYGLDGTVVGQSAQPYDLDLISLTNLPDGAAGFGIVTRTSTGNITVRDIVTASTQRIIVDNGDGIGGNPAIDLANTTVVPDPTTYSDGNYNTESLTSVTSVGAKGEPVGTQTVNTVKFTVDKYGRLQSATNVPIATATEGSKYPTYSAGASYSRYDIIEEGGNVYQAIQDILAGSGAPAHTDSSDTGGWRFLASAATEQKGLASFAQEDFDVDNNGHVTIAAAGVDNTQLQNNRIIFTDQNTVQEFELDNELTTATAHTGFDYLNYIKVNDTSGNLLFGANNTGDGGAGEIDINVRSYFSDPDITLDGIVAQTLDKTGDGDLTLQLTQNTASNRNFNILTTNAGSGTSNIIVTAEDTVQISASQAAGKVWVEDARFQDNYIATTNATLNLDPGDDRAVTGTVRVWGDLQVDGTTTTVNSTTLQVDDPIVTLGGDTAPVANDNLDRGVEFRYYDSAAKLGFYGYDASYSDLAGHTGGYRFLYDATNTSEVFSGTDAGIIAGNLKLTTNTNSTSNTTGDLVLAGGAGIGQDVNIGGLLDVDSTLRVHSTSRFDDSMVIQGASKTLQLNNGTGTTRIELQSTTGNADFYGIVNITNDLNINTNKFNVASATGNTLIAGTLGVTGQTTLTGALDLNNTLNVSGFTYLESTDEPQIALNSGTGLYEIQNSDYGAFRFNGGGYIEGDFMFNSDVYVNGTVVQKEDETAVFNRQNYLNVRYILYAGSSSARTPSYATDTTTNLRVFGGAGIATDLHIGDDLYIGKLNSSDTIEFQVVGESGNTTIGRSGAGTNSVGTLTVHGDVTFNRDLFANGNITLGNATSDTLTVQANSEFNGTVDVDADFAVRNGTTDKFFVDNVTGNTDIQGTLYVLGNTNIDGTLDVDSNFAVRSGTTDKFTVASASGNVATDGTLVVQGQTTINDSLIVDAANEVFSIRNGSAIEKFSVDADNGNTNIIGTLTVGDATQINDTFGVSGIVTSTNNTQQSINGNSIALDGAARFSGGVGVAKNLAVGEDLMVYGDFNIVGNQVINGTTTYNARIDITNTAEADSLSDNNVAFQVDGGGIIRKKLWAGGDFTVYDTANARNAFFVDVSTGDATLHNTLTVGGDLIVNGTTTTVNSTVTTLDDPIITLGGDTAPTTNDGKDRGVEFRYYDGSAKVGFFGFDRSSSQFTFLTDSTNVSEVHTGTDAALRAGSLNLTGTGTILDVDANANIDGTLTVDGQIISQVTSGPALVIPNTTKINNLNADLLDGYTTATANTASTVVVRDASGDFAAGTITASLAGNATTASRLQTARTITIDGVVDGSVSFNGSSNVTISTTYNDADITALAAMAGTGLVTRTAANTYAQRSVTATAASGITITNADGVSGDITINVASASTNASNNLVLRDASGNFAAGTITASLVGNVTGNVTGNVTGDLTGQADGADRVVTQEVTTNFDYPIVFASARFTTPTNTQIYTEASGGAAATYNPSTKTLEVETIKCDTISPRDPGAIQFNINANSVTATIGFTGDLTGDVTGDVTGNADTATVADTATQVATQTVQTNFNQEHFLPFVVSNSASVINQSVLTDGGATYNPFQNRITAQTFAGDLTGDVTGNVDGNVAGEVTLEGTVPATATDPGTAGDVRYDADYVYVCVATNTWKRSALATW
Physico‐chemical
properties
protein length:1806 AA
molecular weight: 187465,41410 Da
isoelectric point:4,13853
aromaticity:0,06866
hydropathy:-0,16318

Domains

Domains [InterPro]
G3DSA:2.10.10.30
ATT
1–44
G3DSA:2.10.10.30 DC_1607 DC_1607 DC_0574
DC_1619
ATT
1–463
DC_1619
SSF69349
STR
4–244
SSF69349
IPR041352
ATT
5–43
IPR041352
AOO11124.1
1 1806
Architecture
ATT
STR
STR
RBD
ATT 1-463 | STR 464-960 | STR 1125-1559 | RBD 1577-1806
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage S-RIM8
[NCBI] 		756278 Uroviricota > Caudoviricetes > Pantevenvirales > Neptunevirus > Neptunevirus srim18
Host Synechococcus
[NCBI] 		1129 cellular organisms > Bacteria > Bacillati > Cyanobacteriota/Melainabacteria group > Cyanobacteriota > Cyanophyceae

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AOO11124.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KX349289 [NCBI]
CDS location
range 83162 -> 88582
strand +
CDS
ATGGCAAATAGAATTCAGTTAAGACGTGGCTCGGCTACGCAGTGGAGTAATGCAAACCCCACTCTAGCTCAAGGCGAGTTGGGAATCGAACTTGATACGGGTCGTATCAAAATCGGTGATGGTGTTACCGCATGGAACTCATTGAGGTATGAGAGACCGATTGAATCTGTGTCAGCAACTGCCAATACTTTGGTGCAACGTGATGCCGATGGAAATTTCTCGGCAGGAACAATCACAGCATCCTTAATTGGTAATGCTTCTACTGCATCTAGACTGTCATCTACACGCCAGATTCAGTTGTCTCAAGACGTTACTGGTTCTGGTGTTTTTGATGGTTCTGCTAACTTAAATATTAATGCTGTTCTTGGATTAGTGCCATCGTTACCACATTACGATGGTACAGATACTTCTAGTGGCACTTACACAAAAGTTGTAGTTGATGCCAAGGGTAGAATAACCAATGCTTCCAATCCAACCACTATTCAAGACTACGGACTAGATGGCACTGTTGTTGGTCAATCTGCTCAACCATATGACCTCGATTTAATATCGCTCACAAATCTTCCTGATGGTGCCGCAGGTTTTGGTATTGTTACCCGAACATCTACAGGTAACATTACCGTTAGAGATATTGTAACTGCTTCGACACAACGCATCATTGTTGATAATGGTGATGGTATTGGCGGCAATCCCGCAATCGATTTAGCAAACACTACTGTTGTTCCAGACCCAACAACATATAGTGATGGTAACTATAATACAGAATCGTTAACTTCAGTAACTAGTGTTGGTGCCAAAGGAGAACCAGTAGGAACTCAAACAGTAAATACTGTCAAATTTACTGTTGATAAGTACGGTCGTCTTCAATCTGCTACAAATGTACCAATTGCTACTGCTACCGAAGGTAGCAAGTATCCTACATATAGTGCTGGGGCATCTTATTCCCGATATGACATCATCGAAGAAGGTGGCAACGTTTATCAAGCCATTCAAGATATTCTTGCGGGTTCTGGTGCCCCAGCTCATACTGATAGCAGCGATACTGGAGGATGGAGGTTCCTCGCGTCTGCGGCAACAGAGCAGAAGGGACTGGCTAGCTTTGCACAGGAAGATTTCGACGTTGACAACAACGGGCATGTCACCATTGCCGCCGCTGGTGTAGATAACACCCAATTACAGAATAATAGAATTATCTTTACTGACCAGAACACTGTTCAAGAGTTTGAGTTAGATAACGAACTCACTACTGCTACAGCACATACTGGTTTTGATTATCTTAACTATATTAAAGTTAATGACACGAGTGGTAATTTACTGTTCGGCGCTAATAATACAGGTGACGGTGGTGCTGGTGAGATTGATATCAATGTACGCTCGTACTTCAGCGATCCTGATATCACTCTTGATGGTATTGTTGCTCAAACCCTGGACAAGACTGGAGATGGTGACCTCACTCTTCAATTAACACAGAATACTGCTTCTAACAGAAACTTCAACATCCTGACAACAAATGCTGGTTCTGGAACTAGCAACATTATTGTCACTGCTGAAGATACTGTTCAAATTAGTGCATCTCAAGCAGCAGGTAAAGTTTGGGTAGAAGATGCACGTTTCCAAGATAATTATATTGCTACAACAAATGCAACTCTCAACCTTGATCCTGGTGATGATAGGGCGGTTACTGGAACCGTCAGAGTTTGGGGTGATTTACAGGTTGACGGCACCACGACGACGGTCAATTCGACGACCCTTCAGGTTGATGACCCCATTGTTACTCTTGGTGGTGATACTGCTCCTGTTGCTAACGATAATCTCGATAGAGGCGTTGAGTTCAGATATTATGATAGTGCAGCAAAGCTTGGATTCTACGGTTACGATGCTTCGTATTCTGATCTCGCAGGTCATACAGGAGGATACCGATTCCTCTACGATGCTACAAACACTTCTGAAGTCTTCTCTGGAACAGATGCAGGCATCATCGCTGGTAACCTTAAACTAACTACCAACACTAACTCCACCTCCAATACAACTGGCGACCTTGTACTTGCTGGTGGTGCTGGTATCGGTCAGGATGTTAATATTGGTGGTCTTCTGGATGTTGACAGCACTCTGCGCGTCCACAGCACCTCTCGCTTTGATGACAGCATGGTCATCCAAGGTGCTTCTAAGACACTGCAACTGAATAATGGTACTGGTACAACTCGTATTGAGTTGCAATCTACAACTGGTAATGCTGATTTCTATGGTATCGTCAATATTACCAATGACCTTAACATCAACACTAATAAATTTAATGTTGCTTCTGCAACTGGTAACACTCTCATTGCTGGTACACTTGGAGTAACTGGTCAGACTACTTTAACTGGTGCTCTTGACCTTAACAACACTCTGAATGTTTCTGGATTTACATATCTGGAAAGTACAGACGAACCTCAGATTGCTCTGAATTCTGGCACTGGTCTGTATGAGATTCAGAACAGTGACTATGGTGCATTCCGATTTAATGGTGGTGGATACATTGAAGGCGACTTCATGTTTAACTCCGATGTTTATGTCAACGGTACTGTAGTTCAGAAAGAAGACGAAACCGCAGTATTCAACAGACAAAACTACCTGAACGTTCGTTATATTCTATATGCAGGTTCTTCTTCTGCACGCACACCTTCTTATGCAACAGACACTACAACTAACTTAAGAGTTTTTGGTGGTGCTGGTATTGCAACTGACCTTCACATCGGTGATGACCTGTATATCGGTAAACTCAACAGTAGCGATACTATTGAATTCCAAGTCGTCGGTGAAAGCGGCAACACTACAATCGGTCGCTCTGGTGCAGGCACTAACTCTGTAGGTACACTGACTGTCCATGGTGATGTAACATTCAACAGAGACCTGTTTGCTAATGGCAACATCACTCTTGGTAACGCAACTAGCGATACTCTGACTGTCCAAGCAAACTCCGAGTTTAATGGCACGGTTGATGTTGATGCAGACTTTGCTGTTAGAAACGGCACAACCGACAAGTTCTTTGTTGACAACGTAACAGGTAACACTGATATTCAAGGAACTTTATACGTATTGGGTAATACCAATATCGATGGTACTTTAGATGTTGACTCCAACTTTGCTGTTAGAAGTGGCACTACAGACAAATTTACTGTTGCTTCTGCTTCTGGTAACGTTGCAACTGATGGTACTCTGGTCGTCCAAGGTCAAACAACTATTAACGATTCTTTGATTGTTGATGCTGCTAATGAAGTTTTCTCTATCAGAAATGGTTCTGCTATTGAAAAGTTTAGTGTTGATGCAGATAACGGTAATACCAACATCATTGGTACTCTGACCGTTGGTGATGCAACTCAGATTAATGATACCTTCGGCGTATCTGGTATTGTAACCTCAACCAATAATACTCAACAATCTATTAATGGCAATTCTATTGCTCTTGACGGTGCTGCAAGATTCTCGGGTGGTGTTGGTGTTGCTAAGAACTTAGCAGTTGGTGAAGACCTTATGGTCTACGGGGACTTCAACATTGTTGGTAATCAGGTCATCAATGGTACTACCACTTATAATGCACGAATTGATATTACAAATACTGCTGAAGCAGACTCTCTTAGTGATAATAACGTTGCATTCCAAGTTGATGGTGGCGGTATTATTAGAAAGAAACTTTGGGCGGGTGGAGACTTCACTGTATATGATACTGCAAACGCTAGAAATGCATTCTTTGTTGATGTAAGCACTGGCGATGCCACCCTACACAATACACTTACTGTTGGTGGAGACTTAATTGTAAATGGCACAACCACTACTGTTAATTCTACGGTCACAACTCTCGATGACCCTATTATTACTTTGGGTGGTGACACAGCACCAACAACTAACGACGGTAAGGACCGTGGTGTTGAGTTCCGTTATTACGACGGCTCTGCGAAAGTGGGTTTCTTCGGATTCGACAGGTCGTCCTCCCAATTCACATTCCTAACAGATTCTACCAATGTATCTGAAGTTCACACTGGCACAGATGCTGCTCTTCGTGCTGGTAGCCTGAATCTGACTGGCACTGGCACCATTCTTGACGTTGATGCTAATGCCAACATCGATGGCACTCTGACTGTTGATGGTCAGATTATCTCTCAGGTTACATCTGGTCCTGCTCTGGTTATTCCTAACACTACTAAGATTAATAACCTGAATGCTGACTTGCTGGATGGTTATACAACTGCAACTGCTAATACTGCAAGTACGGTTGTTGTCAGAGATGCTTCGGGAGATTTTGCTGCAGGAACTATCACTGCTTCCCTGGCGGGCAATGCTACTACTGCATCTAGATTGCAGACAGCACGCACAATCACAATCGACGGAGTTGTTGATGGCAGCGTTTCCTTTAATGGTTCTTCCAACGTAACAATCAGCACCACCTACAACGACGCAGACATCACTGCACTCGCCGCTATGGCAGGTACAGGTCTGGTTACCAGAACTGCTGCTAATACCTACGCACAACGCTCTGTGACCGCCACAGCAGCGTCTGGAATCACGATTACTAATGCAGACGGTGTATCAGGCGACATCACCATTAACGTCGCTTCTGCGAGCACCAACGCATCAAATAACCTCGTTCTTCGTGATGCCTCTGGTAACTTTGCTGCTGGCACAATTACGGCAAGTTTGGTTGGTAACGTAACTGGTAATGTCACTGGTAACGTAACTGGAGACTTGACTGGTCAGGCAGATGGTGCAGATAGAGTAGTTACTCAAGAGGTTACAACTAATTTTGATTACCCAATTGTTTTTGCATCGGCAAGATTTACAACTCCAACTAATACTCAGATTTATACAGAGGCTTCGGGTGGTGCAGCTGCAACATATAATCCATCTACTAAAACTTTAGAAGTAGAAACAATTAAGTGTGATACAATTTCACCTAGGGATCCTGGAGCCATCCAATTCAATATTAATGCAAATAGTGTTACTGCTACTATTGGATTTACTGGAGACCTTACTGGCGATGTCACGGGTGATGTAACAGGCAATGCTGATACCGCAACTGTTGCTGATACTGCAACTCAAGTTGCTACGCAAACAGTTCAAACAAACTTCAACCAGGAACACTTCCTTCCATTCGTTGTTTCTAACAGTGCTTCGGTAATTAATCAAAGCGTTCTCACTGACGGGGGTGCAACCTATAATCCATTCCAGAATAGAATCACCGCACAAACTTTTGCGGGTGATTTAACTGGTGATGTAACTGGTAACGTTGATGGTAATGTTGCAGGTGAAGTTACTCTTGAAGGTACTGTACCTGCTACTGCTACCGATCCTGGCACTGCAGGTGATGTTCGTTATGATGCAGATTATGTCTATGTTTGTGTTGCCACAAATACTTGGAAAAGATCCGCCCTCGCTACTTGGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8a8c8bfbcb4629c3f5b8624487a875b15cf5dfb2a094c75556c5e741e42bdd3f
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,5337
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50