Protein

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Genbank accession
QVW28396.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,64
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,93
Protein sequence
MADILKPAFRATSGLDAAGEKVINVAKADYNVLDDGVNVEFFIDENTIQAYDETRGYKNGFAVIHDQRIWVAQRDINAPAGTFTPGYWTATRTDPKWITVASPTRQLASGEYIAVDSAASFTTFTLPPNPTDGDTVVIKDIGGRVGYNEIKVQSSSAPGGGNQKIVRFGNQFSETLITKPFSYNMLIFANRLWHFWEAGNEERGIRVEPNMAQFQSQAGDNVLRRYTSGAVIKFTLPKYANQGDMIKTVDIDGLGSKFNLIVETFDASSALGKPGQHSMEFRTSGDGFFVYNSTEKLWYVWDGDRQTRLRVIRDDVELLANESVIVFGPNNTTPQTINITLPTSVAQGDVVKIALNYLRKAQTVNIKASVGDKIASSVQLLQFPKRSEYPPDTEWVLNDVLTFNGNLSYTPVIELSYIEDPTTGAKYWVVAQNVPTVERVDSKDDLTRARLGVIALASQTQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATESRRGIARIATTAQVNQNTEFAFQDDLIISPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETDAGVDDTTIITPKKLQTRQGTEILSGIVKYVSTTGTTPATSRATVGTNVYNKNTTTLVISPKALDQYKANYENQGAVYLATQAEVNAGATNPGFSNSVVTPETLGARRATDTNHGLIEIATQAETDTGTDYTRAVTPKTLNDRNATQTLTGIARIGTQVEFDAGVLDNVISTPLKVKTRFNDTARTSVSAASGLVESGTLWNHYTLDIREASNTQRGTARLATQTEVNTGTDDKTIITPLKLQAKKATENAEGIIQLATQAEVIDGTVSNKAFSPKHYKYIVQQEKSWEATSARRGYVKLTTGTATWEGDDTNGSVANLAKFEDSGFAISPLQMNTALTHYLPIKGKAFDSDKLDNLDSSQFVRRDIDQIVEGTLTLRKNIRVDGQLATGGTGEFGGSLAANSTFTLRNTGTATRIVFEKGPQTGTNPAQSMSIRVWGNQFGGGSDQTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNNLGNITMSINGTVQPINVNASGTLNASGVATFGRSVTAQGEFISYSSNAFRAISGNYGFFIRNDNSNVYFMLTNSGDQTGGFNGLRPLAINNTSGQVTIGEGLVIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGAKPADLYSRKPDADNTGFWSVDVNDSATYTQFPGYFKMVEKINEVTGLPYLVRGEEVKSPGTLTQFGNTLNSLYQDWITYPNTADGSTTRWTRTWQQNKNAWSGFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNASMSNLTIRDWLRIGNVRIIPDPVTRSVKFEWIDTP
Physico‐chemical
properties
protein length:1299 AA
molecular weight: 141548,61120 Da
isoelectric point:5,61907
aromaticity:0,08391
hydropathy:-0,40908

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
11–126
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
988–1100
IPR048390
DC_1209
STR
1076–1279
DC_1209
QVW28396.1
1 1299
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 11-126 | STR 349-987 | ATT 988-1100 | STR 1101-1146 | ATT 1147-1245 | STR 1246-1279 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage C6
[NCBI] 		2831681 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Escherichia coli
[NCBI] 		562 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
QVW28396.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
MW679410 [NCBI]
CDS location
range 150830 -> 154729
strand +
CDS
ATGGCTGATATTTTAAAACCTGCATTCCGTGCTACATCCGGACTCGATGCTGCGGGCGAGAAAGTTATCAATGTTGCCAAAGCCGATTACAATGTATTAGATGATGGCGTCAACGTTGAATTCTTTATAGATGAGAACACCATCCAGGCGTACGACGAGACGCGCGGATATAAGAATGGGTTTGCAGTAATCCATGACCAACGTATCTGGGTTGCTCAACGTGATATCAATGCTCCTGCAGGAACTTTTACTCCCGGCTATTGGACTGCTACCCGTACTGACCCTAAATGGATTACCGTAGCGTCTCCTACACGCCAGCTGGCTTCCGGTGAATATATTGCGGTGGATTCCGCTGCTAGCTTTACTACATTTACCCTGCCTCCTAACCCTACAGATGGTGATACCGTTGTAATTAAAGATATCGGCGGACGAGTGGGTTATAACGAAATCAAGGTCCAATCTAGTTCTGCTCCTGGCGGTGGTAACCAGAAAATTGTTCGTTTTGGTAATCAGTTCTCTGAAACCCTGATAACTAAGCCTTTTTCTTATAACATGCTTATCTTTGCTAACCGTCTTTGGCATTTCTGGGAAGCAGGTAATGAAGAACGTGGTATTCGTGTAGAACCGAACATGGCCCAGTTCCAATCACAAGCAGGTGATAACGTTCTCCGTCGTTATACTTCAGGTGCAGTAATTAAGTTTACTCTTCCTAAGTATGCGAACCAAGGTGATATGATTAAAACCGTTGATATCGATGGTTTAGGAAGTAAGTTCAACTTAATCGTTGAAACGTTTGATGCTTCATCTGCATTAGGTAAGCCTGGACAGCATAGCATGGAATTCCGTACCTCCGGTGATGGATTCTTTGTTTATAACTCTACCGAAAAATTATGGTATGTTTGGGACGGTGACCGTCAAACTCGTTTACGTGTAATTCGTGATGATGTTGAGCTCTTGGCTAATGAAAGTGTTATTGTTTTTGGCCCTAATAATACAACGCCGCAGACGATTAATATCACATTACCCACAAGCGTAGCCCAGGGTGATGTCGTTAAGATTGCTCTGAACTATCTCCGTAAAGCTCAGACGGTAAATATTAAGGCTTCTGTAGGAGATAAAATAGCTTCTTCGGTTCAATTGCTCCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCGCCAGATACTGAATGGGTATTGAATGATGTATTGACCTTCAATGGTAACTTAAGTTATACTCCGGTTATTGAACTGAGTTATATCGAAGACCCCACTACAGGTGCTAAATATTGGGTTGTTGCTCAGAACGTTCCTACTGTAGAACGCGTGGATTCTAAGGATGATTTAACCCGTGCTCGTCTAGGTGTTATTGCTCTGGCGTCACAGACCCAAGCAAACGTCGACCACGAAAATAATCCTGAAAAAGAACTGGCTATCACACCGCAGACTTTAGCTAATCGTGTAGCTACTGAATCACGTCGTGGTATTGCTCGTATTGCTACAACCGCTCAGGTAAACCAGAATACCGAATTTGCATTCCAGGACGATTTGATTATTTCTCCTAAGAAATTAAACGAACGTACTGCTACCGAAACTCGTCGTGGTGTCGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTGATGCTGGTGTTGATGATACAACCATTATCACTCCTAAGAAGCTACAGACGCGCCAGGGAACTGAAATCCTGTCCGGTATAGTAAAATACGTATCCACCACAGGAACCACTCCTGCGACTTCTAGAGCAACTGTAGGTACTAACGTTTATAATAAGAACACAACTACTTTAGTTATTTCTCCTAAAGCTTTGGACCAATATAAAGCTAACTATGAGAACCAAGGCGCTGTATATCTTGCTACGCAAGCCGAAGTTAATGCGGGTGCTACTAACCCTGGTTTTAGTAACTCAGTTGTTACACCTGAAACATTAGGTGCTCGTCGTGCTACTGATACCAATCATGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAGACTGATACTGGAACTGATTATACTCGTGCGGTAACGCCTAAGACGTTAAATGACAGGAATGCTACTCAAACACTTACCGGTATTGCTCGTATTGGTACTCAAGTAGAATTTGATGCAGGTGTATTAGATAATGTTATTTCAACTCCGTTGAAAGTTAAAACAAGATTTAATGATACTGCTAGAACTTCTGTCTCAGCAGCCAGCGGTTTGGTTGAATCAGGAACCTTATGGAACCATTATACACTAGATATCCGTGAAGCAAGTAATACTCAACGTGGTACGGCTCGTTTGGCTACCCAAACTGAAGTTAATACTGGTACCGATGACAAAACAATCATCACTCCACTTAAGCTTCAAGCTAAAAAGGCTACCGAAAACGCTGAAGGTATTATCCAACTCGCTACTCAGGCCGAAGTTATTGATGGTACGGTAAGTAATAAAGCGTTTAGTCCAAAGCATTACAAATATATCGTTCAACAGGAAAAATCCTGGGAAGCTACTTCTGCTCGTAGAGGATATGTTAAATTAACCACAGGTACAGCCACTTGGGAAGGTGATGATACTAATGGTTCTGTTGCTAACCTGGCTAAATTTGAAGATTCCGGCTTTGCTATTTCCCCTCTTCAAATGAATACAGCATTAACTCACTATCTTCCGATTAAAGGTAAGGCTTTTGACTCTGATAAATTGGACAACCTGGATAGCTCTCAGTTCGTCAGGAGAGATATTGACCAAATAGTTGAAGGAACATTAACCCTTCGTAAAAACATCAGAGTAGATGGCCAGTTGGCTACAGGCGGTACCGGTGAATTTGGTGGTTCTTTAGCTGCTAATAGCACATTTACCCTCCGTAATACAGGAACGGCTACGCGTATAGTATTTGAAAAGGGTCCTCAAACGGGAACTAACCCTGCCCAATCTATGAGTATTCGCGTATGGGGTAACCAATTTGGCGGTGGGTCCGACCAAACCCGTTCTACGGTATTTGAAGTTGGCGATGAAACATCTAACCACTTCTATAGCCAGCGTAACAATTTAGGTAACATTACCATGAGTATTAATGGTACTGTCCAACCTATTAATGTTAACGCTTCGGGTACATTGAACGCTTCCGGTGTTGCTACCTTTGGACGTTCTGTAACAGCCCAAGGTGAATTTATATCTTATAGTTCAAACGCATTTAGAGCAATAAGTGGTAATTACGGGTTCTTTATTCGTAATGATAACTCTAATGTTTATTTCATGTTGACTAATTCAGGCGACCAGACTGGCGGCTTTAACGGATTAAGACCATTAGCTATTAATAATACATCCGGCCAGGTTACAATTGGCGAAGGGCTTGTTATTGCTAAAGGAGCCACTATTAACTCAGGCGGTTTAACGGTTAATTCAAGAATTCGTTCACAAGGTGCTAAACCGGCAGACCTTTATTCTAGAAAACCTGATGCGGATAACACTGGCTTTTGGTCTGTTGACGTTAATGATTCAGCCACATATACCCAGTTCCCGGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAATTAACGAAGTAACCGGACTGCCGTATTTGGTTCGTGGTGAAGAAGTTAAATCGCCTGGTACGTTAACTCAGTTCGGTAATACTCTGAATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACCTATCCAAATACTGCAGACGGAAGCACTACTCGTTGGACTCGTACTTGGCAGCAAAATAAAAATGCTTGGTCTGGATTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGTAACCCACCACAACCATCTGATATCGGTGCATTGCCTTCAGACAACGCTTCAATGAGTAACTTGACCATTCGTGATTGGTTACGTATTGGTAACGTTCGTATAATTCCGGACCCGGTAACTCGTTCTGTTAAATTCGAATGGATTGATACACCATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
f03384a47041ea581bde81911bf59ddf01e63a8d8227da0f29561a3f475e7b1d
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5701
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50

Literature

Title Authors Date PMID Source
Biological properties of an Escherichia lytic phage infecting 4 pathogenic Escherichia coli strains Lin,Y. and Zhu,W. 2019-04-18 — GenBank