Protein

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Genbank accession
XYL04171.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,53
Protein sequence
MSDLIKQHFRATNGLDAGGNKVINVAKADRTVMSDGVNVEYLIQENTIQPWANDRGYPEGFAVTMEKRIWVARADIPAPIPPAVNTFRQGDWISMRVDPKWEQYSSGTSELLPGTYANIDTRVNPVTLVLPKNKVEQGDTIVIRDIGGKPGINQALIKVQDSAPAMIFQGSILRELQLTRPYSMLLMTFTSAGWYVTLSDLSSLARTIDSTTLDAATDVGAQVQSSEYIVLYYTSNKKLTVRLPRYANHGDMITFAEPKGETPLYHFTIKTYDANSSIGTEGATSWTSKIKGGGILIYDGPRKVWRINSIDMQQRVKIVTDDVVMQPNEAIAIFGANNSTVKTITVTLPTLVAPGDTVRIGMNYMRKGQTVNIVTPPAPAGGTKDRIASTVGLLQFPKRSEYPPEAAWTQVDSLSFNGTSDYPPVLELAYVEATPNNYWIVSENIPTVERVDSTNDTTKARVGVIALATTAQAQATSGHNDDRAITPLTLSQRTATESRTGIAEIATQAEANSTTDDTRIITAKKLNDRLATETMRGVAEIATQAETNGSTVDDRIVTPKKLNGRKATATLDGIIQLVNTGGTPGTSRSDPGTSNGTGVYDHTDFSKAVTPKTLREYKATELASGCVWLATEAEVRNGTPASNNIPTVVTPATLHAKTSTAKDIGLIRIATQDEANAMSNALGNAAITPATLNGRTASYTQTGITRYAIQEEFDGGSLENVAVNPRKIKDYFSRPARMTTRSEAGLAQSGNLWDGWVLNIQVPTETQRGTPKIATQALVNAGTDDVDYLTSKKLQAKKGTESAYGIVKYATQADTNTGTANDVAVSPVHLKYVIQTSADWRAQDNVRGTVRVANGAVAWTGNSTTGSDNTPKESSGYAVSPNGLKQALANYLPLNAKADNSGLLNGLTSDQFVRRDIDQTVNGKLTLTKDTDFNSDITVKGHGNFTGGEVKVFATSSTANSHVRFLNSDGNERGIIYARPVAAGNSQQLTLRVKGSAPDAGKEFSFGNNGEFVAPNKLTSNGTIHSASDVNSNSVYRVKNASVVQLQDSDSVASFGNLAKKGRILTNDASQTQVTDDSGNYVILTTKNKDSILDTRYVRSAGDTMTGNLTMNGSALVINGSEGWYDHSTTANTEKYARAGSWTVEIKNAAKLATLPGYVVPIREENPLVPGSMIVTGYEEKTAAGGLLAQISVSSDYTYQTWTPYPPSAEQAAKARTHTMWTRVYNPYLKKFDSWMRVYTSATPPTAADIGAPSSVSTSVKTLEVQEWIKIGPVKIYPDRTSQTVKFEWVGD
Physico‐chemical
properties
protein length:1292 AA
molecular weight: 139268,06610 Da
isoelectric point:7,20891
aromaticity:0,06889
hydropathy:-0,37755

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
7–130
DC_1986 DC_1209
IPR048391
ATT
1138–1239
IPR048391
XYL04171.1
1 1292
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT 7-130 | STR 356-1137 | ATT 1138-1239 | STR 1240-1285 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Klebsiella phage THQ_07
[NCBI] 		3453359 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host Klebsiella pneumoniae
[NCBI] 		573 cellular organisms > Bacteria > Pseudomonadati > Pseudomonadota > Gammaproteobacteria > Enterobacterales

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XYL04171.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV963844 [NCBI]
CDS location
range 85226 -> 89104
strand -
CDS
ATGAGCGACTTAATCAAACAGCATTTTAGAGCAACCAACGGGCTTGATGCTGGTGGAAACAAAGTAATCAACGTCGCTAAAGCCGATCGTACTGTGATGAGCGATGGGGTCAACGTTGAGTATCTTATCCAAGAAAATACCATCCAGCCTTGGGCCAATGATCGTGGGTATCCTGAAGGTTTTGCGGTTACCATGGAAAAACGTATCTGGGTGGCACGTGCAGATATCCCAGCCCCGATCCCACCGGCAGTAAATACCTTTAGACAGGGTGATTGGATCTCCATGCGTGTAGACCCGAAGTGGGAACAGTATAGTTCAGGAACCTCAGAACTTTTACCAGGGACTTATGCAAACATCGATACCCGAGTTAATCCGGTTACACTAGTTCTTCCTAAAAATAAAGTAGAACAAGGTGATACGATTGTTATTCGTGACATCGGCGGTAAACCAGGTATCAACCAGGCATTAATTAAAGTACAAGACTCTGCGCCAGCAATGATCTTCCAAGGAAGTATCCTTCGTGAACTGCAGCTGACTCGTCCTTATAGTATGCTTCTGATGACGTTTACATCGGCTGGGTGGTACGTAACTCTTTCAGATCTGAGTTCTTTGGCTCGTACTATTGATTCTACCACACTGGATGCTGCTACCGATGTAGGTGCTCAGGTACAAAGTTCAGAGTACATTGTACTTTATTACACTTCTAATAAAAAATTAACGGTTCGTCTTCCGCGGTACGCTAACCATGGAGATATGATTACCTTTGCTGAACCGAAAGGCGAAACACCATTATACCATTTTACTATTAAGACTTATGATGCAAATAGTTCTATTGGAACAGAAGGGGCCACGTCTTGGACCTCTAAGATTAAAGGTGGTGGTATTCTGATTTATGATGGCCCTCGTAAGGTGTGGCGCATCAACTCTATAGACATGCAGCAACGTGTAAAAATCGTTACTGATGATGTAGTGATGCAACCTAACGAAGCTATTGCTATATTTGGTGCTAATAACTCGACTGTTAAAACTATTACTGTTACTTTGCCTACTTTAGTTGCTCCTGGCGATACCGTTAGAATTGGCATGAACTATATGCGCAAAGGACAGACAGTCAACATTGTTACTCCTCCTGCTCCGGCTGGTGGTACTAAAGATAGGATTGCATCCACAGTTGGCTTACTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAGTATCCGCCTGAGGCCGCGTGGACCCAAGTTGATAGTTTATCATTCAATGGAACTTCGGACTATCCTCCGGTCCTAGAGTTGGCCTATGTTGAAGCTACTCCTAATAACTACTGGATCGTTTCTGAAAATATCCCTACCGTAGAGAGGGTTGATTCTACCAACGATACAACTAAAGCTCGCGTAGGTGTTATTGCGTTAGCAACCACCGCGCAGGCTCAAGCAACCAGTGGGCATAATGATGACAGAGCTATTACTCCGTTAACTTTGTCCCAGCGTACTGCTACTGAGTCTCGTACCGGTATTGCTGAAATTGCTACTCAAGCTGAAGCTAATTCAACAACAGATGATACCCGCATTATTACGGCTAAAAAATTGAACGATCGTTTAGCTACAGAAACTATGCGTGGCGTTGCTGAAATTGCTACCCAAGCTGAAACAAACGGTTCTACGGTAGATGACAGGATCGTTACTCCTAAAAAATTAAACGGGCGTAAAGCTACTGCTACGCTAGACGGAATTATCCAGCTGGTTAATACAGGCGGCACACCTGGAACAAGCCGATCAGATCCTGGTACTTCTAATGGTACTGGCGTATACGACCATACTGATTTCTCTAAGGCGGTAACTCCTAAAACTTTACGTGAATATAAAGCTACGGAACTTGCCTCCGGATGCGTATGGCTTGCAACCGAAGCAGAAGTTCGTAATGGTACTCCGGCGTCTAATAATATTCCGACCGTTGTTACGCCAGCAACATTGCATGCTAAAACTTCTACTGCAAAAGATATTGGTTTAATCCGTATCGCTACTCAAGATGAAGCTAATGCAATGTCTAATGCTTTGGGTAATGCAGCTATTACTCCGGCAACATTAAACGGACGGACGGCAAGTTATACTCAAACAGGTATAACCCGTTATGCTATTCAGGAAGAATTTGATGGTGGGTCTTTAGAAAACGTTGCAGTGAACCCTAGAAAAATTAAAGACTATTTTTCTAGACCAGCTCGTATGACAACAAGATCCGAAGCTGGGTTGGCCCAGTCCGGAAACTTGTGGGACGGGTGGGTTCTTAATATCCAGGTTCCAACAGAAACTCAGCGTGGTACTCCTAAGATTGCAACGCAGGCACTTGTTAATGCCGGTACAGACGATGTTGATTATCTGACGTCTAAAAAGCTTCAAGCTAAAAAAGGTACTGAATCCGCATACGGTATTGTTAAATATGCAACCCAAGCCGATACTAACACCGGTACTGCTAACGATGTAGCCGTTTCTCCGGTCCACTTGAAGTATGTTATTCAGACTTCAGCCGATTGGCGTGCACAAGATAACGTTCGCGGTACAGTCCGTGTGGCTAATGGCGCTGTTGCTTGGACCGGTAACAGTACTACAGGTTCTGATAATACGCCAAAAGAATCTAGTGGCTATGCAGTATCACCTAATGGGCTGAAACAGGCGTTAGCTAACTATCTTCCTTTGAATGCTAAAGCTGATAACTCTGGTTTATTAAATGGGCTTACTTCTGATCAATTTGTTAGACGTGACATAGATCAAACCGTTAACGGTAAATTGACTCTTACCAAAGATACAGACTTTAACTCGGATATCACCGTTAAAGGACATGGTAATTTTACTGGTGGTGAGGTTAAGGTATTTGCTACTTCGTCTACAGCCAATTCTCACGTCAGATTTTTAAACTCAGACGGAAATGAACGTGGAATAATTTACGCTAGACCGGTAGCTGCAGGGAATTCTCAGCAGCTTACACTACGTGTTAAAGGTTCAGCCCCTGATGCAGGTAAAGAATTTTCTTTTGGTAATAATGGGGAGTTTGTTGCTCCTAATAAATTAACCTCTAACGGGACAATTCATTCTGCTTCAGATGTTAACTCAAACAGTGTGTACCGCGTTAAAAATGCTTCAGTGGTTCAACTCCAGGATTCTGACAGTGTGGCATCTTTTGGCAATCTTGCTAAGAAAGGAAGGATCTTAACAAACGATGCGAGCCAGACACAAGTTACTGATGACTCAGGAAATTATGTTATTTTAACAACTAAAAACAAGGATAGCATTTTAGATACTAGGTACGTTAGGTCAGCTGGCGATACAATGACTGGCAACTTAACTATGAATGGTTCTGCTCTCGTTATCAACGGTTCTGAAGGTTGGTACGATCACTCTACTACGGCAAATACCGAGAAATATGCAAGAGCTGGTTCTTGGACGGTAGAAATCAAAAATGCCGCTAAGTTAGCCACACTGCCTGGTTATGTTGTTCCAATCAGAGAAGAGAACCCGCTAGTTCCAGGTTCTATGATCGTAACTGGGTATGAAGAAAAAACTGCCGCCGGCGGTCTTTTAGCTCAGATAAGCGTTTCTTCTGATTATACCTATCAGACATGGACCCCGTATCCACCTAGTGCAGAGCAGGCCGCTAAAGCAAGAACCCACACCATGTGGACCAGGGTATATAACCCGTATCTTAAGAAGTTTGATAGTTGGATGCGTGTATACACTAGCGCCACTCCTCCTACGGCTGCAGATATCGGTGCGCCGAGCTCAGTAAGTACTTCTGTTAAAACCTTGGAAGTTCAAGAATGGATTAAGATTGGCCCGGTCAAGATTTATCCTGATCGTACTTCTCAGACCGTTAAGTTTGAATGGGTAGGTGATTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
0c5565b817069732313a8263df05984ea3b72e48c682f1d2846b730b22a6343e
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7485
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50