Protein

Genbank accession
ADO99465.1 [GenBank]
Protein name
VrlC protein
RBP type
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,75
Protein sequence
MAQNTNLNVTPYYDDFDKDKNFYRVLFRPGFPIQARELTTMQSILQNQIENIGSGTYKDGSMVIPGQVGYDLTVDAIMLQESFLGADVEQYRAQLTGKIIEGLTSGVKAKVLFSISDTESDKGYITLYVKYIESGGDSQEQTTFSNNEQLVTDVEITFGTTLIEVGSPFAQLLPTGSLQQGSVAYIQPGVYYIRGFFVDVDYQYLLLDQYGSNPSYRVGLDIQESIITPEDDLSLNDNAAGTSNYAAPGSHRFRITTKLNKKLLTDDADKDFIELLRLNNSKVEQLVDRSALSELEKSLALRTYEESGDYVVKDFNISVRENLDDGNNNGVYAAGDTTAQDNTASSDKYAVEFGPGTAYVRGYRVSTLSQTFVDLDKPRDTTNRENTNIAFKLGNLINVNNVYGFPNTTGSTITNAYQTLELRDTFSASAGTAAGEKIGLARVISFEHRSNPDGTYGNADDNYKANLMDIQMFTVLDMNSNQTLGAGVQVVGRTSGARGYTTEAFSNAGHIDLIQVEGSFIKNEMLTADGINLDTIDNIHTYQFSDVRQLLSRDETTSVIEFTGDIILEDIQPIQGSTFTYDATGGSEDITGLQSNFALDLRPGDRIYFSATKYVDVDKVDPDALSTTGFASIFDYSAQTVNVTPGAGGAAPSAGTYTSLLRYRAKLFDVENANLLSKMPKNYVKSISDESMIVRRTFDTQTVSGGGSVSLTLPENEQFEAINDANFTMIALASTNGSYPVGSEIQLKPPSAGHASNVLGYADFTSSDNTTLQIDNLTNITSVKITATIAKNVTTRKTKSENKMFVLKVINTVEDLDKPKYNLTHTNTYGTRIEDKDISLGAVDAYRLHAVYESNDDNDPVIPSVTLVEPVFFATGSIVTGKTSNARAKVVDFSSGNLKLTVVYESGQFQAGETLSGFDSNNTAINAIINDSEGSVVAGSKVITGNFFLEVNQTPFIYDISKITRKKGVAKPIRKLKVVFDYYTHSATGDYFGGQSYLNTTYDDIPFFGVNFLADYLDFRPSVKNLYSGTGSVSSPAYVGVNSLDFNSRVFNTSGSPAATIFDVPKLQTNFKCDFDWYLPRTDKLFLNPDGEFQVVKGKSAEAPDEPDDIKDSLLLAVLSHKPYGFDPEQDVVITRSDHKRYTMKDIGGLERRLDQVEYYTSLNLLETDTYNTKILDGDGKDRLKNGFTVDDFSDHSKSDTGNEDFNAALDFAQGWCRASHYTSNVGLVINTSLSTNYQQTGPLLTLPYTEKKIIDQPYASRVENINPFNVFTYIGRIDLTPQSDDWIDTERLPQQVTQIEGDFQAVSSEMNVDQNGFAPIQWGAWRDQWSSSRVVGSNVTRNSFWLEMDRGRSPAPGVWGGRGMRRVNRTDTILTTTRQTRTGIRSRVIPRIDRQSLGDSVVSSTTIPFVRSRNIAFKAARMKPRTAFFTFFSGVNMGLYVMPKLIELIKDPAVDSRTNSTPFVIGETVTGLRSGVRLRVVAPNDVYKFNPYDDTELPSSYASTTAFLNIDLDSLAAQATGSFFGNMEVGEILVGASGAKAVVKDRRLLSDRSGKMHGSLYIPPARRLFPRDVVTILPFPGVGESGVPRFRTGSNTLRFTTDAKDSRLPGAVASSAEAEYEAKGTLNRVRENVLAVRNAEVVRDTVNQSRNFNTIRTETRQIGWYDPLAQSFIVDEQGGVFITSVDVYFNTKDTNIPVSMQIRTMENGYPTTKILPFSDVTLEPNDIQLSATAAVATKFTFRAPVYIPQSQEHCFVLLSDSNSYQVWVSRMGEVDITGDRTISEQPYAGVLFKSQNASTWTADQYEDLKFSINRAEFVTNQNSSVILNNVALDKGNKGVIQLRNDAVETFIPELQLVLDSTTVPFTIGARIKQKITLAEATITNVQNLTAGVTLTINDITGTFASSNDLVSSKTTGTLTVASTANFGVGDNITGGTSNATATITAVTNATTLALNFVSDDFANSENITGDGAGAGVNTAATTAASSSAFTPAGDQVESGVINPAEPSSTPTYTTGQRKVRIHHSNHGMHDVSNNVTIEGIESEISDTALTASISASDLTLSVVDATAFHKTINGLAISSTNPGYARIFNRTLGLGDQSEVVSYSAISSDGKTITLVERGLDGTTARSHPDETPVECYNLDGIPLTEINKAHTGISNPTLDSYDISTTSIARLGIRGGGSRGSATQNVQYEILVPQVERMLLPGTDITARVKTISGTSINNGATVLESSFSDDGIFKDITLSEDNYFSAPNLICSTVNESAELSGAKSFRMDLTLISDKTNLSPVIDTERLSITCVSNRINSPSDENTARLASGDEHEAAYITRPANLVNPSKSLKVYFSGYRPTGSTIKVLYRVRPVGGSDSLESLGYSFFDIGDANIPETTENQVFNEYEYEVSGLNFDQYQIKVVFVSPNQAYSPIIKDFRAIALAV
Physico‐chemical
properties
protein length:2430 AA
molecular weight: 265263,62850 Da
isoelectric point:4,81809
aromaticity:0,08889
hydropathy:-0,29230

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Synechococcus phage Syn19
[NCBI]
445684 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
ADO99465.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
GU071106 [NCBI]
CDS location
range 81146 -> 88438
strand +
CDS
ATGGCACAAAATACCAATTTAAACGTCACCCCTTACTACGACGACTTCGATAAGGACAAGAATTTTTATCGAGTGCTGTTCCGTCCTGGATTCCCCATTCAGGCGAGAGAACTCACTACGATGCAGAGTATTCTGCAGAATCAAATTGAGAACATCGGTTCTGGCACATATAAAGATGGATCGATGGTCATCCCTGGTCAGGTGGGTTATGACCTGACAGTTGATGCGATTATGCTTCAGGAATCTTTCCTGGGTGCTGACGTTGAACAGTATCGTGCTCAACTTACAGGAAAAATTATTGAAGGTTTGACATCTGGTGTCAAAGCAAAAGTCCTCTTCAGTATTTCGGATACAGAGTCTGATAAAGGTTATATCACACTCTATGTCAAGTACATTGAATCTGGTGGCGACTCCCAGGAACAAACAACATTCTCAAACAACGAACAGTTGGTTACCGATGTTGAGATTACATTCGGAACAACTTTGATTGAGGTTGGTTCTCCCTTCGCTCAACTTCTGCCCACAGGATCTTTACAGCAAGGTTCTGTTGCATATATTCAACCTGGTGTTTATTACATCAGAGGTTTCTTTGTTGATGTTGATTATCAATATCTTCTTCTCGATCAGTATGGATCAAACCCCTCCTATCGTGTTGGTCTCGATATCCAAGAATCCATTATCACTCCCGAGGATGACCTCAGCCTCAACGATAATGCTGCTGGAACAAGTAACTATGCTGCTCCTGGTTCTCATAGATTTAGAATCACCACAAAATTAAATAAAAAACTATTAACGGATGATGCCGATAAGGACTTCATCGAACTGCTCCGTCTCAACAACTCTAAAGTAGAGCAGTTGGTTGATCGTTCAGCTCTTAGTGAACTTGAAAAGTCTTTAGCACTTAGAACTTATGAAGAGTCTGGTGACTATGTTGTAAAAGACTTCAATATTTCTGTTAGAGAAAATCTGGATGACGGCAACAATAATGGTGTGTATGCTGCTGGTGATACCACTGCTCAAGATAATACTGCATCTTCTGATAAGTATGCAGTTGAGTTTGGTCCTGGAACTGCATATGTCAGAGGATATCGTGTAAGTACATTGTCTCAGACTTTTGTTGATCTAGATAAACCGAGAGATACTACTAATAGAGAAAATACTAATATTGCATTTAAGTTAGGTAATCTAATCAACGTAAATAACGTTTATGGATTCCCCAATACAACTGGATCTACAATTACCAATGCATATCAGACACTTGAATTAAGAGACACATTTAGTGCTTCTGCAGGAACTGCTGCTGGTGAGAAGATCGGTCTTGCTCGTGTTATTTCTTTTGAACACAGAAGTAATCCCGATGGAACTTATGGTAATGCTGATGATAACTATAAGGCAAACCTTATGGATATCCAGATGTTTACTGTTCTGGATATGAACAGCAACCAAACTCTTGGTGCGGGTGTTCAAGTTGTTGGTAGAACTTCTGGTGCTAGAGGATATACTACAGAGGCATTTAGTAATGCTGGTCACATCGACCTCATTCAAGTAGAGGGATCATTCATTAAGAATGAAATGTTGACAGCAGATGGTATTAATCTGGACACTATTGATAATATTCATACATATCAGTTCTCTGACGTTCGTCAACTCCTTTCTAGAGATGAGACTACTAGTGTTATTGAATTTACTGGTGACATAATTTTAGAAGATATTCAACCTATTCAAGGTAGTACATTCACTTACGATGCTACTGGTGGTAGTGAAGATATTACTGGTTTACAGTCCAACTTTGCTCTAGATCTTCGCCCTGGAGATCGTATTTACTTCAGTGCAACAAAATATGTTGACGTTGATAAAGTAGATCCTGATGCATTAAGCACGACTGGATTTGCAAGTATCTTTGATTACTCTGCTCAGACAGTTAATGTAACACCTGGTGCAGGTGGTGCTGCTCCTAGTGCAGGAACATATACTAGTCTTCTTCGTTATCGTGCTAAGTTATTTGATGTTGAGAATGCAAATCTTCTCAGCAAGATGCCCAAGAACTATGTTAAGAGCATCAGCGATGAGTCTATGATCGTCAGAAGAACGTTTGACACCCAAACGGTTTCTGGTGGTGGTTCTGTATCCTTAACTCTTCCTGAAAACGAACAGTTTGAAGCTATTAATGATGCAAACTTCACAATGATTGCCTTGGCTTCTACTAATGGATCTTATCCAGTAGGGTCAGAAATTCAATTAAAACCCCCTAGTGCTGGTCATGCATCTAATGTTCTTGGTTATGCAGACTTTACCTCTAGTGATAACACTACACTTCAGATTGACAACTTAACAAATATCACTTCTGTTAAGATTACAGCAACTATTGCTAAGAACGTAACAACCAGAAAGACAAAATCTGAAAACAAGATGTTTGTTCTTAAGGTTATTAATACGGTAGAAGATTTAGATAAACCTAAGTACAACCTGACTCATACCAATACATACGGCACTCGTATTGAAGATAAAGATATTTCTCTTGGTGCAGTTGATGCTTATCGACTTCATGCAGTTTATGAATCTAACGACGATAACGATCCTGTAATTCCTTCAGTAACTCTTGTAGAACCTGTCTTCTTTGCAACAGGATCTATTGTTACAGGTAAAACATCAAATGCTAGAGCAAAAGTTGTAGATTTCTCCTCAGGTAATTTAAAACTTACTGTTGTTTATGAATCTGGTCAATTCCAAGCAGGTGAAACTCTGTCTGGTTTTGATAGCAATAATACTGCAATTAACGCTATCATTAATGATAGTGAAGGATCTGTCGTTGCAGGTTCAAAGGTTATTACTGGAAACTTCTTCTTAGAAGTGAATCAAACACCATTCATCTATGATATTTCTAAGATTACTAGAAAGAAGGGTGTCGCAAAACCGATCAGAAAACTAAAAGTTGTTTTTGATTACTATACACACTCTGCTACAGGTGATTATTTTGGCGGACAATCGTATCTGAATACAACTTATGATGATATTCCATTCTTTGGAGTTAATTTCTTAGCAGATTACCTTGACTTCCGTCCTTCTGTTAAGAACTTGTACTCTGGAACAGGTTCTGTTTCTTCACCTGCGTATGTTGGTGTTAATAGTCTTGATTTTAATTCAAGAGTATTCAATACTTCAGGATCGCCAGCAGCAACTATTTTTGACGTTCCGAAATTACAGACTAACTTTAAGTGTGATTTTGACTGGTATCTACCTAGAACGGATAAACTCTTCCTCAATCCTGATGGTGAATTCCAGGTTGTTAAGGGTAAATCTGCAGAGGCTCCTGATGAACCTGATGATATTAAAGATAGTTTACTTTTAGCAGTTCTCAGTCATAAACCATATGGTTTTGATCCTGAACAGGATGTGGTAATCACTAGATCTGACCACAAGCGTTACACCATGAAAGATATTGGTGGTCTTGAGCGTCGTCTTGATCAAGTTGAATACTACACATCACTAAACCTTCTTGAAACTGATACTTATAATACTAAGATTCTTGATGGTGATGGTAAAGATCGTTTGAAAAACGGTTTTACTGTTGATGACTTCTCCGACCATAGTAAGTCGGATACTGGTAACGAAGATTTTAATGCTGCATTAGATTTCGCACAAGGATGGTGTCGTGCATCTCACTACACCTCTAATGTTGGACTGGTAATTAATACTTCTCTGTCTACTAACTATCAGCAAACTGGTCCTCTTCTGACACTCCCATACACCGAGAAGAAGATTATTGATCAACCATATGCTTCGAGAGTTGAGAACATCAACCCATTCAACGTATTTACCTATATTGGTCGTATTGATCTTACTCCTCAATCCGATGATTGGATTGATACTGAAAGATTACCTCAGCAGGTAACTCAAATTGAAGGTGATTTCCAAGCAGTATCATCTGAAATGAATGTTGACCAAAATGGTTTTGCTCCTATTCAATGGGGTGCATGGCGTGATCAGTGGTCTTCCAGTAGAGTTGTTGGATCTAACGTTACCAGAAACTCTTTCTGGTTAGAAATGGACCGTGGTAGATCACCTGCTCCTGGTGTCTGGGGTGGTCGTGGTATGCGTCGTGTTAACAGAACGGATACAATTCTTACCACTACACGTCAAACCAGAACTGGTATTCGCTCCAGAGTTATTCCTAGAATCGATCGACAGTCTCTGGGTGATAGTGTCGTATCTTCTACTACAATCCCATTCGTCCGTTCTAGAAACATTGCTTTCAAAGCGGCTCGTATGAAACCGAGAACTGCATTCTTCACTTTCTTCAGTGGAGTTAATATGGGTCTGTACGTGATGCCAAAACTGATCGAACTTATTAAAGATCCTGCAGTTGATAGTAGAACTAATTCTACTCCATTTGTTATTGGAGAAACTGTCACTGGACTAAGATCTGGTGTAAGATTGAGAGTTGTTGCACCAAATGATGTTTATAAGTTCAATCCATATGATGATACAGAACTTCCATCTTCTTATGCTTCAACGACTGCGTTCTTGAATATTGATTTGGATTCTCTTGCAGCGCAAGCTACAGGTTCATTCTTTGGAAATATGGAGGTTGGTGAAATCTTGGTTGGCGCATCTGGTGCTAAGGCAGTAGTCAAAGACCGCAGACTTCTCAGTGATAGATCTGGTAAGATGCACGGTTCTTTGTATATTCCTCCTGCTCGTAGATTATTCCCTAGAGATGTCGTGACTATTCTTCCCTTCCCTGGGGTTGGTGAGTCAGGTGTTCCTAGGTTTAGAACTGGATCAAACACTCTTAGATTTACAACAGATGCAAAAGACTCCCGTCTTCCTGGTGCTGTAGCATCCTCTGCTGAAGCAGAGTACGAAGCAAAGGGCACTTTGAACAGAGTTCGCGAAAATGTTCTTGCTGTTAGAAACGCTGAAGTTGTTCGTGATACTGTAAACCAGTCAAGAAACTTCAATACAATTAGAACAGAAACCCGTCAGATTGGTTGGTATGA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Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.