Protein

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Genbank accession
XJJ34726.1 [GenBank]
Protein name
tail fiber protein proximal subunit
RBP type
TF
Evidence RBPdetect
Probability 0,56
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MADIKRKFRAEDGLDAGGDKIVNVALADRTVGTDGVNVDFLVQENTVQVYDSTRGYNKGFVVLYDNRLYQAINDIVSPSGTFNLLQWRAVRTDAQWITVASGTYQLSSGDSISVNTGAGNDMVFTLPNAPVDGDTVVLADIGGRTGTVKVQINASVQSILNFRGEQVRSVLMTRPRSQLVFVFSNRLWQMYIIDYGKESITVTPATPYQAQANDFIVRRFTSAAPINITLPRNANNGDIISLVDLDRLNPLYHTIVKTFDDTTSIGEVGTHIAEGRNDSDAFFVFDAANSLWRIWEGDQKSRLRIIRADSNIRPNEEVLIFGTNNATTGTINLTLPTGILSGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAEGDTIASSVALLQFPKRSEYPPDAQWVSVTELEFNGTTSYVPVLELAYIEDTDSDTHYWVVQQNVPTVERVDAGSDATRARLGVIALATQAQANVDLENTPAKEVAITPETLANRTATEARRGIAKIATTAQVNQNSTASFVDDTIVTPKKLNERTATETRRGLAEIATQTETDAGLDDTTIITPKKLQARQGSETLSGIVKYVSTTSATPAETRGAAGTNVYNKTVNNLTISPKALDQYKATYAQQGAVILAIDSEVIAGQSQSGYSHAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQAETNAGTDYTRAVTPKTLNDRRATEGLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRISTPLKIKTHFDSSDRTSVNSDSGLIEEGTLWNHYTLDISKANETQRGTLRVATQAESNAGTLDDVLITPKKLLGTKSTETSEGVIKVATQTETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQNEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQNLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNAGTATRLIFEKGPQTGTNPAQSMSIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGSLNANGVATFGSSVTANGEFISKSSNAFRAISGNYGFFIRNDAVNTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNTSGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKSVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1291 AA
molecular weight: 139506,40550 Da
isoelectric point:5,33607
aromaticity:0,07359
hydropathy:-0,31696

Domains

Domains [InterPro]
DC_1986
ATT
15–141
DC_1986 DC_1209 IPR048391
IPR048390
ATT
981–1094
IPR048390
DC_1209
STR
1000–1277
DC_1209
XJJ34726.1
1 1291
Architecture
ATT
STR
ATT
STR
ATT
STR
ATT 15-141 | STR 343-980 | ATT 981-1094 | STR 1095-1140 | ATT 1141-1239 | STR 1240-1277 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_VIPECOMC06
[NCBI] 		3350135 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XJJ34726.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ416618 [NCBI]
CDS location
range 113887 -> 117762
strand -
CDS
ATGGCCGACATCAAACGTAAGTTCAGAGCCGAAGACGGTCTGGACGCCGGTGGCGACAAGATTGTTAACGTAGCATTAGCCGACCGTACAGTAGGTACTGATGGCGTAAACGTTGACTTCCTGGTACAAGAAAACACCGTTCAAGTATATGATTCTACGCGTGGATATAACAAAGGATTTGTTGTTCTTTATGACAACCGTTTATATCAAGCAATAAATGATATCGTGTCTCCTTCCGGGACATTTAACCTTTTACAATGGCGTGCAGTTCGTACAGATGCACAATGGATAACTGTCGCTTCTGGGACTTATCAACTTTCTTCAGGTGATTCGATTTCGGTTAACACCGGTGCCGGCAATGATATGGTTTTCACATTGCCAAATGCGCCGGTTGATGGTGATACTGTTGTTTTGGCTGATATTGGTGGAAGAACCGGGACAGTTAAAGTACAGATTAACGCGTCTGTGCAGAGTATTTTAAACTTTAGAGGCGAACAAGTTCGTTCAGTTTTAATGACGCGACCACGTTCACAACTAGTGTTTGTGTTTAGTAATCGTTTGTGGCAGATGTATATCATTGATTACGGTAAAGAATCAATCACTGTTACACCTGCGACACCATATCAAGCACAAGCAAATGATTTTATAGTTCGTCGTTTTACTAGTGCAGCACCAATCAACATTACACTTCCACGTAATGCTAACAATGGTGATATAATCAGCCTAGTCGATTTAGATAGATTAAACCCACTGTATCATACAATTGTTAAAACATTTGATGATACAACGTCTATTGGTGAAGTAGGGACTCATATTGCCGAAGGCAGAAATGACTCTGACGCGTTTTTTGTTTTTGATGCTGCAAATAGTTTATGGCGTATATGGGAAGGCGACCAGAAATCGCGTCTTCGTATTATCCGTGCAGATTCAAATATTCGTCCAAACGAAGAAGTTCTTATTTTTGGCACAAATAACGCTACAACCGGAACTATTAATCTTACGCTGCCTACTGGAATTTTGAGTGGTGACACTGTTAAAATTTCAATGAACTACATGCGTAAAGGCCAAACAGTAAAAATTAAAGCTGCCGAAGGTGATACAATTGCTTCTTCTGTCGCATTACTTCAGTTCCCTAAACGTTCTGAATATCCACCTGATGCTCAATGGGTCTCTGTTACTGAACTAGAATTCAATGGCACTACTTCATATGTTCCTGTATTAGAATTAGCGTATATCGAAGACACTGATTCTGACACTCATTATTGGGTTGTGCAACAGAATGTCCCTACGGTAGAACGTGTTGATGCTGGATCTGATGCTACACGAGCTCGTTTAGGTGTTATTGCTCTTGCTACTCAAGCGCAAGCAAATGTTGATTTAGAGAATACTCCGGCTAAAGAAGTTGCTATTACTCCTGAAACGTTGGCAAATCGTACAGCAACTGAAGCTCGACGTGGTATCGCTAAAATTGCTACAACAGCACAAGTTAACCAGAACTCCACAGCATCATTTGTGGACGATACTATTGTTACGCCTAAAAAACTAAATGAGCGTACAGCAACTGAAACTCGTCGCGGTCTTGCTGAAATTGCTACTCAGACTGAAACCGATGCTGGTCTTGATGACACAACGATTATTACGCCTAAGAAATTACAGGCACGTCAGGGCTCTGAAACGCTGTCTGGTATAGTTAAATATGTATCGACTACTTCTGCTACTCCTGCCGAAACTCGTGGGGCCGCAGGCACTAACGTTTATAATAAAACCGTAAATAATTTAACTATTTCTCCTAAAGCCCTTGACCAATATAAAGCAACGTATGCTCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCTATTGATAGTGAAGTAATTGCTGGACAATCTCAGTCTGGATACTCTCATGCTGTAGTAACTCCTGAAACACTACATAAGAAAACTTCTACTGATGGACGTATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAGCAGAAACTAATGCTGGGACTGATTATACACGTGCAGTAACGCCTAAGACGTTAAATGATAGGAGAGCGACGGAAGGATTATCCGGCATAGCCGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTTGATACTGGAACTGATGATACTCGTATCTCGACTCCACTGAAAATTAAAACTCATTTTGATTCTTCTGACCGTACCAGTGTTAATTCTGATTCCGGACTTATTGAAGAAGGAACCTTGTGGAACCATTATACTCTTGATATTTCTAAAGCAAATGAAACACAACGTGGTACACTTCGCGTAGCGACCCAGGCAGAATCTAATGCAGGAACTTTAGATGATGTTCTTATTACTCCTAAAAAGCTTTTAGGGACTAAGTCCACTGAAACGTCTGAAGGTGTAATCAAGGTTGCAACCCAGACTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCGAACACTGCTGTATCTCCTAAGAATTTAAAATGGATTGTCCAGAACGAACCAACATGGGCTGCTACTACAGCAATTCGTGGATTCGTTAAAACTTCATCCGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACAGTCGGTTCTACACAGAACTTAGAGCTATATGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTACTTGCCATTAAAAGCAAAAGCTGCTGACACGAATTTATTGGATGGCCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGACATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACATTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGTTCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAACGCTGGAACAGCAACTCGTCTGATTTTTGAAAAAGGACCTCAAACTGGAACTAACCCAGCACAGTCAATGAGCATCCGTGTATGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGCAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGTATCAATGGTACTGTGATGCCGATAAATGTCAACGCTTCAGGTTCTTTGAACGCGAACGGCGTTGCAACATTTGGTAGTTCAGTTACTGCTAATGGTGAATTCATCAGCAAATCATCGAATGCTTTTAGAGCTATTAGTGGTAATTACGGATTCTTTATTCGTAATGATGCTGTTAATACCTATTTTATGCTTACTGCATCAGGTGATCAGACTGGTGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAACAATACATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATTGCTAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACGGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAAACATCTGATTTATATACACGTGCACCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAACGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACAACTCCAGAAGCACGTACAACCCGTTGGACACGTACATGGCAGAAAACTAAAAATTCTTGGTCGAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGTGGAAACCCTCCTCAACCTTCTGATATTGGCGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTAAGGATTGGTAATGTCCGCATTATTCCAGACCCTGTGAATAAATCTGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
bfb967366b34398ad4949358781529b99cef6a8bafe9af59c8828eabf0b289d8
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,7936
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50