Protein
- UniProt accession
- A0A6J5RNM3_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Major tropism determinant N-terminal domain-containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9043
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9491
- Protein sequence
-
MSSVIRIKRSSTVATPSSLKLGELAYSYLANNGSNGGDTLYIGVGSENPTTGNASNIVPIGGKSYVDKLNGIAAGATANLGTVTSISAAAGTPITVTASTTAAVITMVAATATTNGYMSSAYATKLDGIAVGATANLGTITGVTASGPILAVPNSITPSIINISIPAATASAAGYLTMADWSTFNSKTTNLGTVTRVQTAGSVSGLTLTGDVTESGTITLGGTITQLNQNTTGTAANVTGIVAIGNGGTGASTASGARTALGLQIGVDVQPYSIDIATKQYVDSVAQGLDTKQSVVVATITAINLTGQPQTINGVSVVTGNRVLVKNQASSYDNGIYIVASSAWTRATDMDTWSEFPGAYVFIEGGTLYANSGWVCKAGNAGTVGSSPVTWEQFSSSALVPATTTVLGGVKIGNGISVDADGVISAATGTVSGPSSSTDKGIARFNSTTGTAIQNSLVTISDTGLITAPKVGNIIPFYYANIQAFPSATTAEGALAISDADDRVYFASDDAWLPLAKLADLATAYVLPAATTTTSGGVKVGSGLAIDAITGVLSNTQTSFTNALARGAIQGSGTIAYDNQTGIISTALVGYTDTLARGAVGVAASAGLSYDAATGKFSSTITQYTDVLATTAARAALTFTAGSGAYNSTTGAISIPTNTSQLTNGANYATQDYVTSAVGNKDNTDEIIEGVANLYFTAARARNAISVTTANTGLTYNAVSGVLTNTITQYTDILATAAAKAAFTQGTGITIVPGIGAAASTISTSITQYTDTMARLAFTSGAGISIVGGAIVCTITQFTSAMATEAAEAAFIGSDKIILTPGTGTSPVVISTSLTQYTDAMARGAFTNGAGISIINGQITNLIGAYTLPIASSQTLGGIKMGDGLVIDATGTVSIEVDGGTY
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 902 AA molecular weight: 89832,11080 Da isoelectric point: 4,56289 aromaticity: 0,05987 hydropathy: 0,28747
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4175262.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796912
[NCBI]
CDS location
range 102001 -> 104709
strand +
strand +
CDS
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Genbank protein accession
CAB4185425.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797079
[NCBI]
CDS location
range 48528 -> 51236
strand +
strand +
CDS
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Genbank protein accession
CAB4193444.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797194
[NCBI]
CDS location
range 57294 -> 60002
strand -
strand -
CDS
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Genbank protein accession
CAB4216080.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797435
[NCBI]
CDS location
range 50880 -> 53588
strand +
strand +
CDS
ATGAGTTCAGTAATAAGAATAAAAAGGTCTTCGACAGTAGCAACCCCTTCGTCGTTGAAATTAGGAGAACTAGCCTACTCCTACCTTGCAAATAATGGTTCAAATGGTGGCGACACTTTATATATTGGTGTTGGCAGTGAAAATCCAACAACTGGTAATGCTTCTAATATAGTACCCATAGGTGGTAAAAGCTATGTAGATAAGTTAAATGGTATTGCAGCAGGTGCTACAGCTAATCTTGGTACTGTTACCAGTATTAGTGCTGCAGCTGGCACTCCTATTACTGTAACTGCTTCTACTACTGCTGCAGTTATAACAATGGTTGCCGCTACTGCAACTACTAATGGTTATATGAGTAGTGCCTATGCTACTAAATTAGATGGTATTGCAGTAGGCGCTACAGCTAATCTAGGTACAATAACCGGAGTTACAGCATCTGGACCCATTCTTGCGGTACCAAATAGTATTACTCCAAGTATTATTAATATTAGTATTCCTGCCGCTACTGCTTCTGCTGCAGGCTATCTAACTATGGCAGACTGGAGTACTTTTAATAGTAAAACTACTAATTTAGGTACTGTTACACGAGTTCAAACTGCGGGTAGTGTAAGTGGACTTACACTTACAGGTGATGTTACTGAAAGTGGCACAATTACTCTTGGTGGTACGATTACTCAATTAAACCAAAATACTACAGGTACTGCAGCAAATGTTACAGGAATTGTAGCTATTGGCAATGGTGGTACTGGAGCATCGACAGCTTCAGGAGCTAGAACTGCTTTAGGTTTACAGATTGGTGTTGATGTACAGCCCTACAGTATAGATATAGCAACTAAGCAGTATGTTGACTCAGTTGCTCAAGGTCTTGATACTAAACAATCTGTTGTAGTCGCAACTATAACAGCTATTAATTTAACTGGACAGCCACAAACAATTAACGGCGTTTCAGTAGTTACTGGAAATCGTGTTCTAGTTAAAAATCAAGCCAGCTCCTATGACAACGGTATTTATATAGTAGCTTCTAGTGCTTGGACACGCGCTACTGATATGGATACCTGGAGTGAGTTTCCTGGTGCATATGTGTTTATTGAGGGCGGTACATTATACGCTAATTCTGGTTGGGTATGTAAAGCGGGCAATGCTGGGACAGTAGGTAGTAGCCCTGTAACTTGGGAACAGTTCAGTTCTAGTGCTTTAGTTCCTGCTACAACTACTGTTCTTGGTGGAGTTAAAATTGGTAATGGTATAAGTGTTGATGCAGATGGTGTTATTAGTGCAGCTACAGGTACTGTAAGTGGCCCAAGTAGCTCAACCGATAAAGGAATAGCTAGGTTTAATTCTACTACTGGTACAGCAATACAGAATAGTTTGGTAACTATATCAGATACGGGTCTTATTACTGCACCAAAAGTTGGTAATATTATACCTTTCTATTATGCTAATATACAGGCTTTTCCAAGTGCTACAACAGCTGAAGGTGCGCTTGCAATCAGTGATGCAGATGATCGTGTTTATTTTGCTTCCGACGATGCCTGGCTACCCTTAGCTAAACTTGCAGATCTCGCTACAGCATATGTGTTACCAGCAGCAACTACAACCACCTCTGGTGGTGTTAAAGTTGGTAGCGGATTAGCTATAGATGCTATTACTGGCGTTCTAAGTAATACTCAAACAAGTTTTACTAATGCTTTAGCTCGTGGAGCTATCCAAGGATCTGGTACTATAGCTTATGATAATCAAACTGGTATTATAAGTACTGCATTAGTAGGATATACAGATACTTTAGCACGTGGTGCTGTTGGTGTAGCTGCTAGTGCAGGTTTAAGTTATGATGCTGCCACTGGTAAATTTAGTTCTACTATTACTCAGTATACAGATGTTTTAGCTACTACAGCTGCAAGAGCCGCATTAACTTTTACAGCGGGTTCTGGTGCATACAATAGTACTACTGGTGCTATATCAATACCTACAAATACTAGTCAACTTACTAATGGTGCAAACTATGCCACACAAGACTATGTTACTTCAGCAGTAGGAAATAAAGATAATACAGATGAGATAATAGAAGGTGTAGCTAATTTATACTTTACAGCAGCAAGAGCTAGAAATGCTATAAGTGTTACGACTGCTAATACTGGTTTAACCTATAATGCAGTATCAGGTGTATTAACTAATACAATTACACAGTATACAGATATCTTAGCAACTGCTGCAGCTAAAGCAGCATTTACTCAAGGTACGGGTATAACGATAGTTCCTGGAATAGGGGCCGCTGCTTCCACAATTAGTACATCTATAACACAGTATACTGATACAATGGCAAGGCTTGCATTTACAAGTGGTGCTGGAATTTCTATTGTTGGTGGTGCTATAGTCTGTACTATAACACAGTTTACTAGTGCTATGGCAACAGAAGCAGCCGAAGCTGCTTTTATAGGTAGTGATAAGATAATTTTAACACCAGGTACTGGAACTTCTCCTGTAGTAATTTCTACCTCTTTAACTCAGTATACTGATGCAATGGCAAGAGGTGCCTTTACAAATGGTGCTGGAATTAGTATTATTAATGGTCAGATTACTAATCTGATAGGGGCTTATACTTTACCTATTGCCTCTAGTCAAACGTTAGGCGGTATTAAGATGGGCGACGGTTTAGTAATAGATGCTACAGGAACTGTAAGTATTGAAGTTGACGGCGGAACATATTAA
Genbank protein accession
CAB5230730.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR798422
[NCBI]
CDS location
range 53396 -> 56104
strand +
strand +
CDS
ATGAGTTCAGTAATAAGAATAAAAAGGTCTTCGACAGTAGCAACCCCTTCGTCGTTGAAATTAGGAGAACTAGCCTACTCCTACCTTGCAAATAATGGTTCAAATGGTGGCGACACTTTATATATTGGTGTTGGCAGTGAAAATCCAACAACTGGTAATGCTTCTAATATAGTACCCATAGGTGGTAAAAGCTATGTAGATAAGTTAAATGGTATTGCAGCAGGTGCTACAGCTAATCTTGGTACTGTTACCAGTATTAGTGCTGCAGCTGGCACTCCTATTACTGTAACTGCTTCTACTACTGCTGCAGTTATAACAATGGTTGCCGCTACTGCAACTACTAATGGTTATATGAGTAGTGCCTATGCTACTAAATTAGATGGTATTGCAGTAGGCGCTACAGCTAATCTAGGTACAATAACCGGAGTTACAGCATCTGGACCCATTCTTGCGGTACCAAATAGTATTACTCCAAGTATTATTAATATTAGTATTCCTGCCGCTACTGCTTCTGCTGCAGGCTATCTAACTATGGCAGACTGGAGTACTTTTAATAGTAAAACTACTAATTTAGGTACTGTTACACGAGTTCAAACTGCGGGTAGTGTAAGTGGACTTACACTTACAGGTGATGTTACTGAAAGTGGCACAATTACTCTTGGTGGTACGATTACTCAATTAAACCAAAATACTACAGGTACTGCAGCAAATGTTACAGGAATTGTAGCTATTGGCAATGGTGGTACTGGAGCATCGACAGCTTCAGGAGCTAGAACTGCTTTAGGTTTACAGATTGGTGTTGATGTACAGCCCTACAGTATAGATATAGCAACTAAGCAGTATGTTGACTCAGTTGCTCAAGGTCTTGATACTAAACAATCTGTTGTAGTCGCAACTATAACAGCTATTAATTTAACTGGACAGCCACAAACAATTAACGGCGTTTCAGTAGTTACTGGAAATCGTGTTCTAGTTAAAAATCAAGCCAGCTCCTATGACAACGGTATTTATATAGTAGCTTCTAGTGCTTGGACACGCGCTACTGATATGGATACCTGGAGTGAGTTTCCTGGTGCATATGTGTTTATTGAGGGCGGTACATTATACGCTAATTCTGGTTGGGTATGTAAAGCGGGCAATGCTGGGACAGTAGGTAGTAGCCCTGTAACTTGGGAACAGTTCAGTTCTAGTGCTTTAGTTCCTGCTACAACTACTGTTCTTGGTGGAGTTAAAATTGGTAATGGTATAAGTGTTGATGCAGATGGTGTTATTAGTGCAGCTACAGGTACTGTAAGTGGCCCAAGTAGCTCAACCGATAAAGGAATAGCTAGGTTTAATTCTACTACTGGTACAGCAATACAGAATAGTTTGGTAACTATATCAGATACGGGTCTTATTACTGCACCAAAAGTTGGTAATATTATACCTTTCTATTATGCTAATATACAGGCTTTTCCAAGTGCTACAACAGCTGAAGGTGCGCTTGCAATCAGTGATGCAGATGATCGTGTTTATTTTGCTTCCGACGATGCCTGGCTACCCTTAGCTAAACTTGCAGATCTCGCTACAGCATATGTGTTACCAGCAGCAACTACAACCACCTCTGGTGGTGTTAAAGTTGGTAGCGGATTAGCTATAGATGCTATTACTGGCGTTCTAAGTAATACTCAAACAAGTTTTACTAATGCTTTAGCTCGTGGAGCTATCCAAGGATCTGGTACTATAGCTTATGATAATCAAACTGGTATTATAAGTACTGCATTAGTAGGATATACAGATACTTTAGCACGTGGTGCTGTTGGTGTAGCTGCTAGTGCAGGTTTAAGTTATGATGCTGCCACTGGTAAATTTAGTTCTACTATTACTCAGTATACAGATGTTTTAGCTACTACAGCTGCAAGAGCCGCATTAACTTTTACAGCGGGTTCTGGTGCATACAATAGTACTACTGGTGCTATATCAATACCTACAAATACTAGTCAACTTACTAATGGTGCAAACTATGCCACACAAGACTATGTTACTTCAGCAGTAGGAAATAAAGATAATACAGATGAGATAATAGAAGGTGTAGCTAATTTATACTTTACAGCAGCAAGAGCTAGAAATGCTATAAGTGTTACGACTGCTAATACTGGTTTAACCTATAATGCAGTATCAGGTGTATTAACTAATACAATTACACAGTATACAGATATCTTAGCAACTGCTGCAGCTAAAGCAGCATTTACTCAAGGTACGGGTATAACGATAGTTCCTGGAATAGGGGCCGCTGCTTCCACAATTAGTACATCTATAACACAGTATACTGATACAATGGCAAGGCTTGCATTTACAAGTGGTGCTGGAATTTCTATTGTTGGTGGTGCTATAGTCTGTACTATAACACAGTTTACTAGTGCTATGGCAACAGAAGCAGCCGAAGCTGCTTTTATAGGTAGTGATAAGATAATTTTAACACCAGGTACTGGAACTTCTCCTGTAGTAATTTCTACCTCTTTAACTCAGTATACTGATGCAATGGCAAGAGGTGCCTTTACAAATGGTGCTGGAATTAGTATTATTAATGGTCAGATTACTAATCTGATAGGGGCTTATACTTTACCTATTGCCTCTAGTCAAACGTTAGGCGGTATTAAGATGGGCGACGGTTTAGTAATAGATGCTACAGGAACTGTAAGTATTGAAGTTGACGGCGGAACATATTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.