Protein

UniProt accession
A0A6J5QX05_9CAUD [UniProt]
Protein name
Phage tail collar domain containing protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,8848

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,6757

Protein sequence
MASVLLSPVGNGQQFFTNNGIPNAGGLIYTYQAGSSTLLTTYTTVNGTIANTNPIVLDAYGRTPSEVWMQAGYSYKFIIQTASAVTLQTLDNLYPILQNAPATTPTLPAGMILLWSGSIGSIPSGYVICDGTNSTPDLRDRFVIAAGSTYAVNATGGSADAIVVSHTHTVTDPGHSHGISTNTSLIATNSNQAPFPGTSDNIQSTTKTTGISIVSAGTSGTGANLPPYYALAYIMKT
Physico‐chemical
properties
protein length:237 AA
molecular weight: 24493,07350 Da
isoelectric point:5,62936
aromaticity:0,08017
hydropathy:0,08101

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI]
2100421 Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4178751.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796978 [NCBI]
CDS location
range 1414 -> 2127
strand +
CDS
ATGGCAAGCGTACTTTTATCCCCAGTTGGCAATGGCCAGCAATTTTTTACTAATAATGGCATACCTAATGCTGGTGGATTAATTTACACCTACCAGGCCGGTTCAAGCACTTTATTGACTACTTATACAACTGTTAACGGCACTATTGCTAATACAAACCCGATTGTTTTGGATGCGTATGGTAGGACTCCTAGTGAAGTTTGGATGCAAGCTGGATATAGCTATAAATTTATTATTCAAACGGCATCAGCGGTTACATTGCAAACATTAGATAATTTATATCCAATATTACAAAATGCACCAGCAACTACACCAACTCTTCCAGCTGGCATGATTTTATTATGGTCCGGAAGTATAGGGTCAATTCCAAGTGGATATGTCATTTGTGATGGTACAAATTCAACGCCGGATTTGCGTGACCGTTTTGTTATTGCCGCCGGATCAACTTATGCGGTTAATGCAACTGGCGGTAGTGCTGATGCAATAGTTGTTAGCCACACACATACCGTTACTGACCCTGGTCATAGTCATGGTATATCAACCAATACATCTTTAATTGCTACTAATTCAAATCAAGCACCATTTCCTGGTACTAGTGACAACATTCAATCAACTACAAAAACAACAGGAATTTCTATTGTTTCTGCTGGTACAAGTGGTACAGGTGCCAACTTGCCGCCATACTATGCACTTGCATACATCATGAAAACATAA

Genbank protein accession
CAB4184144.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797052 [NCBI]
CDS location
range 17294 -> 18007
strand -
CDS
ATGGCAAGCGTACTTTTATCCCCAGTTGGCAATGGCCAGCAATTTTTTACTAATAATGGCATACCTAATGCTGGTGGATTAATTTACACCTACCAGGCCGGTTCAAGCACTTTATTGACTACTTATACAACTGTTAACGGCACTATTGCTAATACAAACCCGATTGTTTTGGATGCGTATGGTAGGACTCCTAGTGAAGTTTGGATGCAAGCTGGATATAGCTATAAATTTATTATTCAAACGGCATCAGCGGTTACATTGCAAACATTAGATAATTTATATCCAATATTACAAAATGCACCAGCAACTACACCAACTCTTCCAGCTGGCATGATTTTATTATGGTCCGGAAGTATAGGGTCAATTCCAAGTGGATATGTCATTTGTGATGGTACAAATTCAACGCCGGATTTGCGTGACCGTTTTGTTATTGCCGCCGGATCAACTTATGCGGTTAATGCAACTGGCGGTAGTGCTGATGCAATAGTTGTTAGCCACACACATACCGTTACTGACCCTGGTCATAGTCATGGTATATCAACCAATACATCTTTAATTGCTACTAATTCAAATCAAGCACCATTTCCTGGTACTAGTGACAACATTCAATCAACTACAAAAACAACAGGAATTTCTATTGTTTCTGCTGGTACAAGTGGTACAGGTGCCAACTTGCCGCCATACTATGCACTTGCATACATCATGAAAACATAA

Genbank protein accession
CAB4202808.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797318 [NCBI]
CDS location
range 19495 -> 20208
strand -
CDS
ATGGCAAGCGTACTTTTATCCCCAGTTGGCAATGGCCAGCAATTTTTTACTAATAATGGCATACCTAATGCTGGTGGATTAATTTACACCTACCAGGCCGGTTCAAGCACTTTATTGACTACTTATACAACTGTTAACGGCACTATTGCTAATACAAACCCGATTGTTTTGGATGCGTATGGTAGGACTCCTAGTGAAGTTTGGATGCAAGCTGGATATAGCTATAAATTTATTATTCAAACGGCATCAGCGGTTACATTGCAAACATTAGATAATTTATATCCAATATTACAAAATGCACCAGCAACTACACCAACTCTTCCAGCTGGCATGATTTTATTATGGTCCGGAAGTATAGGGTCAATTCCAAGTGGATATGTCATTTGTGATGGTACAAATTCAACGCCGGATTTGCGTGACCGTTTTGTTATTGCCGCCGGATCAACTTATGCGGTTAATGCAACTGGCGGTAGTGCTGATGCAATAGTTGTTAGCCACACACATACCGTTACTGACCCTGGTCATAGTCATGGTATATCAACCAATACATCTTTAATTGCTACTAATTCAAATCAAGCACCATTTCCTGGTACTAGTGACAACATTCAATCAACTACAAAAACAACAGGAATTTCTATTGTTTCTGCTGGTACAAGTGGTACAGGTGCCAACTTGCCGCCATACTATGCACTTGCATACATCATGAAAACATAA

Genbank protein accession
CAB4215646.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797424 [NCBI]
CDS location
range 29582 -> 30295
strand +
CDS
ATGGCAAGCGTACTTTTATCCCCAGTTGGCAATGGCCAGCAATTTTTTACTAATAATGGCATACCTAATGCTGGTGGATTAATTTACACCTACCAGGCCGGTTCAAGCACTTTATTGACTACTTATACAACTGTTAACGGCACTATTGCTAATACAAACCCGATTGTTTTGGATGCGTATGGTAGGACTCCTAGTGAAGTTTGGATGCAAGCTGGATATAGCTATAAATTTATTATTCAAACGGCATCAGCGGTTACATTGCAAACATTAGATAATTTATATCCAATATTACAAAATGCACCAGCAACTACACCAACTCTTCCAGCTGGCATGATTTTATTATGGTCCGGAAGTATAGGGTCAATTCCAAGTGGATATGTCATTTGTGATGGTACAAATTCAACGCCGGATTTGCGTGACCGTTTTGTTATTGCCGCCGGATCAACTTATGCGGTTAATGCAACTGGCGGTAGTGCTGATGCAATAGTTGTTAGCCACACACATACCGTTACTGACCCTGGTCATAGTCATGGTATATCAACCAATACATCTTTAATTGCTACTAATTCAAATCAAGCACCATTTCCTGGTACTAGTGACAACATTCAATCAACTACAAAAACAACAGGAATTTCTATTGTTTCTGCTGGTACAAGTGGTACAGGTGCCAACTTGCCGCCATACTATGCACTTGCATACATCATGAAAACATAA

Genbank protein accession
CAB5230011.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR798406 [NCBI]
CDS location
range 7967 -> 8680
strand -
CDS
ATGGCAAGCGTACTTTTATCCCCAGTTGGCAATGGCCAGCAATTTTTTACTAATAATGGCATACCTAATGCTGGTGGATTAATTTACACCTACCAGGCCGGTTCAAGCACTTTATTGACTACTTATACAACTGTTAACGGCACTATTGCTAATACAAACCCGATTGTTTTGGATGCGTATGGTAGGACTCCTAGTGAAGTTTGGATGCAAGCTGGATATAGCTATAAATTTATTATTCAAACGGCATCAGCGGTTACATTGCAAACATTAGATAATTTATATCCAATATTACAAAATGCACCAGCAACTACACCAACTCTTCCAGCTGGCATGATTTTATTATGGTCCGGAAGTATAGGGTCAATTCCAAGTGGATATGTCATTTGTGATGGTACAAATTCAACGCCGGATTTGCGTGACCGTTTTGTTATTGCCGCCGGATCAACTTATGCGGTTAATGCAACTGGCGGTAGTGCTGATGCAATAGTTGTTAGCCACACACATACCGTTACTGACCCTGGTCATAGTCATGGTATATCAACCAATACATCTTTAATTGCTACTAATTCAAATCAAGCACCATTTCCTGGTACTAGTGACAACATTCAATCAACTACAAAAACAACAGGAATTTCTATTGTTTCTGCTGGTACAAGTGGTACAGGTGCCAACTTGCCGCCATACTATGCACTTGCATACATCATGAAAACATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID: 170522

Method: ESMFold

Resolution: 0,8154

Evidence: 0,9043

Literature

No literature entries available.