Protein
- UniProt accession
- A0A6J5QJ58_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- K1 capsule-specific polysaccharide lyase C-terminal domain-containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,8587
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,5099
- Protein sequence
-
MSVKVSRANSLYGYPSPQSNQFLDPIVTNRAPLTSDRGIAGQVWVDQTNNLAYMFNKNSAGLAQWIQIVAGGGAGVFTSLIVTGALTQTAGTVNISADAAVAAVNIATGAAAKTLTLGSATAGSVTNVNSDLVIATAGKGLTINGGAATDTIGQATLVAGTVTIANTNIAATDRIFISRRTTGGAAVGNLTYVINVGVSFVVSSFNDASAAVITDVGSFDYLIIRQS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 227 AA molecular weight: 22877,45560 Da isoelectric point: 8,00570 aromaticity: 0,06167 hydropathy: 0,39912
Domains
Domains [InterPro]
IPR056204
151–208
151–208
1
227
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4184679.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797063
[NCBI]
CDS location
range 15350 -> 16033
strand +
strand +
CDS
ATGTCAGTTAAAGTTTCTCGTGCTAATTCTTTGTATGGTTATCCTAGTCCTCAAAGTAACCAATTTTTAGATCCTATTGTTACTAATCGTGCTCCTCTTACATCTGATAGAGGTATAGCTGGTCAAGTATGGGTTGATCAAACTAACAACCTTGCTTATATGTTTAACAAAAACAGTGCGGGCTTGGCTCAATGGATTCAGATTGTAGCTGGTGGCGGAGCTGGTGTATTTACATCATTAATAGTTACTGGTGCATTAACTCAAACTGCTGGAACTGTTAATATCTCTGCTGATGCAGCAGTTGCGGCAGTAAATATTGCTACTGGTGCAGCAGCTAAAACTTTGACTCTTGGCTCTGCTACTGCTGGTTCAGTAACAAACGTCAACAGTGATTTAGTTATTGCTACAGCTGGTAAAGGGTTAACTATAAACGGTGGAGCAGCCACTGATACAATAGGTCAAGCTACTTTAGTAGCTGGAACTGTAACAATTGCTAATACTAATATTGCAGCAACTGATAGAATATTTATTTCTCGTAGAACTACTGGTGGAGCAGCTGTAGGCAATTTAACTTATGTTATAAATGTTGGAGTTAGTTTTGTTGTAAGTTCTTTTAATGATGCAAGTGCGGCTGTTATTACAGATGTTGGAAGCTTTGATTATCTAATAATAAGACAAAGTTAG
Genbank protein accession
CAB4204227.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797335
[NCBI]
CDS location
range 31028 -> 31711
strand +
strand +
CDS
ATGTCAGTTAAAGTTTCTCGTGCTAATTCTTTGTATGGTTATCCTAGTCCTCAAAGTAACCAATTTTTAGATCCTATTGTTACTAATCGTGCTCCTCTTACATCTGATAGAGGTATAGCTGGTCAAGTATGGGTTGATCAAACTAACAACCTTGCTTATATGTTTAACAAAAACAGTGCGGGCTTGGCTCAATGGATTCAGATTGTAGCTGGTGGCGGAGCTGGTGTATTTACATCATTAATAGTTACTGGTGCATTAACTCAAACTGCTGGAACTGTTAATATCTCTGCTGATGCAGCAGTTGCGGCAGTAAATATTGCTACTGGTGCAGCAGCTAAAACTTTGACTCTTGGCTCTGCTACTGCTGGTTCAGTAACAAACGTCAACAGTGATTTAGTTATTGCTACAGCTGGTAAAGGGTTAACTATAAACGGTGGAGCAGCCACTGATACAATAGGTCAAGCTACTTTAGTAGCTGGAACTGTAACAATTGCTAATACTAATATTGCAGCAACTGATAGAATATTTATTTCTCGTAGAACTACTGGTGGAGCAGCTGTAGGCAATTTAACTTATGTTATAAATGTTGGAGTTAGTTTTGTTGTAAGTTCTTTTAATGATGCAAGTGCGGCTGTTATTACAGATGTTGGAAGCTTTGATTATCTAATAATAAGACAAAGTTAG
Genbank protein accession
CAB4215650.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797425
[NCBI]
CDS location
range 30016 -> 30699
strand -
strand -
CDS
ATGTCAGTTAAAGTTTCTCGTGCTAATTCTTTGTATGGTTATCCTAGTCCTCAAAGTAACCAATTTTTAGATCCTATTGTTACTAATCGTGCTCCTCTTACATCTGATAGAGGTATAGCTGGTCAAGTATGGGTTGATCAAACTAACAACCTTGCTTATATGTTTAACAAAAACAGTGCGGGCTTGGCTCAATGGATTCAGATTGTAGCTGGTGGCGGAGCTGGTGTATTTACATCATTAATAGTTACTGGTGCATTAACTCAAACTGCTGGAACTGTTAATATCTCTGCTGATGCAGCAGTTGCGGCAGTAAATATTGCTACTGGTGCAGCAGCTAAAACTTTGACTCTTGGCTCTGCTACTGCTGGTTCAGTAACAAACGTCAACAGTGATTTAGTTATTGCTACAGCTGGTAAAGGGTTAACTATAAACGGTGGAGCAGCCACTGATACAATAGGTCAAGCTACTTTAGTAGCTGGAACTGTAACAATTGCTAATACTAATATTGCAGCAACTGATAGAATATTTATTTCTCGTAGAACTACTGGTGGAGCAGCTGTAGGCAATTTAACTTATGTTATAAATGTTGGAGTTAGTTTTGTTGTAAGTTCTTTTAATGATGCAAGTGCGGCTGTTATTACAGATGTTGGAAGCTTTGATTATCTAATAATAAGACAAAGTTAG
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID: 170470
Method: ESMFold
Resolution: 0,7709
Evidence: 0,8034
Literature
No literature entries available.