Protein
- UniProt accession
- A0A6J5NSH4_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Major tropism determinant N-terminal domain-containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9342
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,7652
- Protein sequence
-
MAITIKHAKTDTIADWTQADLDAQIALGNFPAGTVLADIVLPSDWNNDHTISGTVPIANGGTGQTTANAAINALLPSQASQSGKVLSTNGTDTSWIAAGGTGTVTSVTGTAPVSVATGTTTPVISMTAATSSVDGYLTSTDWNTFNGKGNGTVTSITAGTGLSGGTITSSGTIAIDSTVVTLTGTQTLTNKTLTSPKVNEILDTNGNEILGLSPTASATDYLTVKNGIGVGVPLHFYADGSSTNIGMHIQPKGSGLVTISDGTDFNKGIRFRSSGSAASAVTLLDAVSTAGRVVTLPDATTTLVGRDTTDTLTNKSISGSTNTLSNIGNSSLTNSAITINGTSTSLGGSINVGTVTSVTGTSPVVSSGGATPAISMAAASTTTDGYLTSTDWNTFNSKGSGTVTSVSATSPVTSTGGATPTIAMPAATTSVSGYLTSTDWTTFNNKGSGTVTSVAALTLGTTGTDLSSSVANGTTTPVITLNVPTASATNRGVLSSADWTTFNNKGSGTVTAVSVVSANGLAGSSSGGATPALTLSTTVTGLLKGNGTAISAATSGTDYAPATSGTSILYGNGAGGFSNVTVGSGLSFSTGTLSSTATGTVTSVSGTGTVAGISLSGTVTSSGNLTLGGTFALPSGQVTGKMIYDTFTATASQTSFTTSQTYTSGKIQVAVNGVILLNGTDCTVTSGTAVVMATGLTVGDIVIITYPI
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 708 AA molecular weight: 69236,45420 Da isoelectric point: 4,69026 aromaticity: 0,04237 hydropathy: 0,17387
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4160616.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796715
[NCBI]
CDS location
range 1088 -> 3214
strand +
strand +
CDS
ATGGCAATAACCATTAAACATGCCAAGACGGACACCATAGCGGATTGGACACAAGCCGATTTAGATGCACAGATTGCATTAGGTAACTTTCCTGCTGGTACAGTATTAGCTGACATTGTATTACCTTCTGATTGGAATAACGATCATACAATCTCTGGTACAGTTCCTATTGCTAATGGCGGTACTGGTCAAACTACAGCTAACGCAGCTATTAATGCTTTATTACCTAGCCAAGCAAGTCAATCAGGTAAAGTATTAAGCACTAATGGTACAGATACATCATGGATAGCAGCCGGTGGTACAGGAACAGTTACTTCTGTTACAGGCACAGCTCCAGTATCAGTAGCCACAGGTACGACTACTCCAGTTATATCTATGACAGCAGCTACAAGCTCTGTAGACGGATACTTAACATCTACCGATTGGAATACGTTTAACGGTAAGGGTAATGGCACAGTCACAAGCATTACTGCTGGCACAGGTTTATCAGGTGGCACTATTACATCATCTGGCACTATTGCTATTGATAGCACAGTAGTTACGCTTACTGGCACTCAAACACTTACAAACAAAACTCTAACATCACCTAAAGTAAATGAAATATTAGATACTAATGGTAATGAAATATTAGGGCTTTCTCCTACTGCTTCTGCAACTGATTATCTCACAGTCAAAAATGGTATTGGTGTAGGTGTACCCCTTCATTTTTATGCAGATGGTTCTAGCACTAATATTGGTATGCACATCCAGCCAAAAGGATCAGGATTAGTCACAATTAGTGATGGTACAGACTTTAACAAAGGTATTCGTTTTAGAAGCTCAGGTAGTGCTGCAAGTGCTGTTACTTTACTAGATGCAGTATCTACAGCAGGTAGAGTAGTCACATTACCAGATGCTACAACAACCTTAGTAGGCAGAGACACTACTGATACGCTTACTAATAAATCTATTTCAGGTTCTACAAATACTTTAAGCAATATTGGCAACTCAAGTTTAACCAATTCTGCTATTACGATTAATGGCACAAGCACAAGTCTTGGTGGTTCAATTAATGTAGGCACAGTTACAAGCGTAACAGGTACATCTCCAGTAGTATCATCAGGTGGTGCAACACCAGCTATTAGTATGGCTGCAGCATCTACTACAACGGATGGTTATTTAACATCCACAGATTGGAATACTTTTAATAGTAAAGGTTCTGGCACAGTTACTTCTGTATCAGCTACTAGCCCTGTTACTTCTACAGGTGGTGCAACTCCTACTATTGCTATGCCAGCAGCTACTACAAGCGTATCTGGTTATCTTACAAGCACAGACTGGACAACATTTAATAATAAGGGTTCAGGAACAGTAACAAGCGTTGCAGCTTTAACACTAGGCACAACAGGCACAGATTTAAGCTCAAGCGTAGCTAATGGTACTACAACGCCGGTCATTACTTTAAATGTACCTACAGCATCAGCTACAAACAGAGGTGTATTATCATCTGCTGATTGGACTACGTTTAATAACAAAGGATCAGGTACTGTAACAGCAGTATCAGTCGTATCAGCTAACGGTTTAGCAGGCTCATCATCAGGTGGTGCAACTCCAGCATTAACATTATCAACAACAGTCACAGGATTGTTAAAAGGTAATGGAACAGCCATAAGCGCAGCTACATCTGGTACAGATTATGCTCCAGCTACATCTGGCACATCTATTTTATATGGTAACGGTGCTGGTGGCTTTAGCAATGTTACAGTAGGATCTGGACTATCATTTAGTACAGGCACTTTATCTTCAACTGCAACTGGTACAGTTACTAGCGTAAGTGGAACAGGAACAGTAGCTGGTATTAGTTTAAGTGGAACAGTGACATCATCAGGTAACTTAACTTTAGGTGGTACTTTTGCATTACCTTCAGGTCAAGTTACAGGCAAGATGATTTATGATACTTTTACAGCAACAGCATCACAAACATCATTTACAACATCACAAACTTATACTTCAGGAAAAATTCAAGTAGCAGTAAACGGTGTTATACTATTAAATGGTACAGATTGCACAGTAACAAGCGGTACAGCAGTTGTTATGGCAACAGGATTAACGGTAGGTGATATTGTTATAATTACTTATCCTATATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID: 170174
Method: ESMFold
Resolution: 0,5933
Evidence: 0,5848
Literature
No literature entries available.