Protein

UniProt accession
A0A6J5NH96_9CAUD [UniProt]
Protein name
Collagen triple helix repeat
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9222

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9175

Protein sequence
MADLTNKYIYETYPSIVGIGEQGSSGVTGTLKPLTDGVGVHLPIEVSTTEVNITAEDTQTVNLSIAGYGQVIDEDGNWVGPSAGLVGTSGTSGSSGTNGSSGSAGLNGTSGTDGTSGTDGSDGTNGINGTSGSSGTNGSSGTNGSSGTNGTSGTNGTSGIGTNGTSGTNGSSGTNGTSGTSGANGIATGRLYFFNNSESSDIAPYKVLSENPTGGGLQTITKTLAGNSTANLVQQFLTPEFAFDKIPAGIQRFHFHALKPQANDDIQIYATLQLANSAGIGYSPIYTTTENIIQWNDETTPSETTVDIILLSTLVDPTDRMIVKVYLKNNEATTRIVNWYTEDNEYSYIITSIGAASGTSGTSGSSGTNGASAPAGLVNGTGVNSLKQDNALTTTDATAAGDNSIALGTGANSALESVSIGIDANAPNQRSVAIGRNAQATGGNSIAIGNYSNAGPTGIGLACSSVEGQTNVAANAIMIVSGDSGGSNNGSATSSIVIGPGSGLRASAADVIAIGRASVASAAGAVALGADVTADKADTVSVKALDVQTPSTPSAGGIIMTDAGSTERRLNLTATGGLQVDSTPVIASAGPNSIGNIWSGTQVQYDALGTYSATTLYFID
Physico‐chemical
properties
protein length:620 AA
molecular weight: 61337,63370 Da
isoelectric point:4,20042
aromaticity:0,04677
hydropathy:-0,13726

Domains

Domains [InterPro]
Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI]
2100421 Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4134659.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796289 [NCBI]
CDS location
range 3535 -> 5397
strand -
CDS
ATGGCAGATTTAACTAATAAGTATATCTACGAAACGTACCCATCTATCGTGGGTATTGGTGAACAAGGCTCGTCAGGAGTAACAGGTACACTAAAACCACTAACAGATGGTGTAGGTGTACACTTACCTATTGAAGTAAGTACAACTGAAGTAAACATTACAGCTGAAGACACACAAACAGTTAATTTAAGTATTGCTGGTTATGGTCAAGTTATTGACGAAGATGGTAATTGGGTTGGACCTAGTGCTGGATTAGTTGGAACATCAGGAACATCAGGAAGTAGTGGAACAAATGGATCAAGTGGAAGCGCTGGATTGAATGGAACGAGCGGAACTGATGGAACTAGTGGAACTGACGGTAGTGATGGAACAAATGGAATTAATGGAACATCAGGTAGTAGTGGAACGAACGGAAGTTCAGGAACGAATGGATCTAGCGGTACTAACGGAACCTCAGGAACGAATGGAACGAGTGGAATTGGAACTAATGGTACTAGCGGAACTAATGGAAGTTCAGGAACGAATGGAACTAGCGGAACATCAGGTGCTAATGGTATTGCAACGGGTAGACTTTACTTCTTTAATAACTCTGAATCTTCAGATATTGCACCATACAAAGTTTTATCAGAAAATCCAACCGGAGGTGGTCTTCAAACAATTACTAAAACTCTTGCAGGTAATTCAACTGCAAATCTTGTACAACAATTTTTAACACCTGAATTTGCTTTTGATAAAATTCCAGCAGGTATTCAAAGATTCCATTTTCATGCATTAAAACCACAAGCTAATGATGATATTCAAATTTATGCAACACTTCAATTAGCTAATTCTGCGGGAATTGGTTATAGTCCAATTTATACTACAACAGAAAATATTATTCAATGGAATGATGAAACTACGCCTTCTGAAACAACTGTAGATATTATATTGTTATCTACATTAGTTGATCCAACTGATAGAATGATTGTTAAAGTTTATTTAAAAAACAATGAAGCAACAACTAGAATTGTAAATTGGTATACAGAAGACAATGAATATTCATATATTATTACTTCTATTGGTGCAGCTTCAGGTACGTCAGGTACTAGTGGAAGTAGTGGAACAAATGGTGCATCTGCACCCGCAGGTTTAGTTAATGGTACTGGAGTTAACTCATTAAAACAAGATAACGCTTTAACTACAACTGACGCAACTGCTGCTGGTGATAATTCAATTGCATTGGGTACAGGAGCAAATTCTGCACTAGAATCAGTTAGTATTGGAATAGACGCTAATGCTCCTAATCAAAGATCGGTTGCTATTGGTAGAAATGCACAAGCAACTGGTGGTAATAGTATTGCAATAGGTAATTATTCTAATGCTGGACCAACTGGTATTGGACTTGCATGTTCTTCAGTAGAAGGACAAACAAATGTTGCAGCAAATGCTATTATGATAGTATCGGGTGATTCAGGTGGTTCTAATAATGGTTCGGCAACAAGTTCAATTGTAATTGGTCCTGGTAGTGGTCTTAGAGCCAGTGCTGCAGACGTTATTGCTATTGGTCGTGCTTCGGTTGCTAGCGCTGCAGGTGCTGTAGCTTTAGGTGCTGACGTAACTGCAGACAAAGCAGATACAGTAAGTGTAAAAGCTTTAGATGTTCAAACTCCTTCAACACCATCAGCCGGTGGTATTATAATGACTGACGCTGGAAGTACTGAAAGAAGATTGAATCTTACAGCAACTGGTGGATTACAAGTTGATTCTACACCAGTAATTGCATCAGCTGGACCTAACTCAATTGGAAACATTTGGAGTGGTACTCAAGTACAATACGATGCATTAGGAACTTACTCAGCAACGACACTATACTTTATAGACTAA

Genbank protein accession
CAB4154774.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796619 [NCBI]
CDS location
range 25896 -> 27758
strand +
CDS
ATGGCAGATTTAACTAATAAGTATATCTACGAAACGTACCCATCTATCGTGGGTATTGGTGAACAAGGCTCGTCAGGAGTAACAGGTACACTAAAACCACTAACAGATGGTGTAGGTGTACACTTACCTATTGAAGTAAGTACAACTGAAGTAAACATTACAGCTGAAGACACACAAACAGTTAATTTAAGTATTGCTGGTTATGGTCAAGTTATTGACGAAGATGGTAATTGGGTTGGACCTAGTGCTGGATTAGTTGGAACATCAGGAACATCAGGAAGTAGTGGAACAAATGGATCAAGTGGAAGCGCTGGATTGAATGGAACGAGCGGAACTGATGGAACTAGTGGAACTGACGGTAGTGATGGAACAAATGGAATTAATGGAACATCAGGTAGTAGTGGAACGAACGGAAGTTCAGGAACGAATGGATCTAGCGGTACTAACGGAACCTCAGGAACGAATGGAACGAGTGGAATTGGAACTAATGGTACTAGCGGAACTAATGGAAGTTCAGGAACGAATGGAACTAGCGGAACATCAGGTGCTAATGGTATTGCAACGGGTAGACTTTACTTCTTTAATAACTCTGAATCTTCAGATATTGCACCATACAAAGTTTTATCAGAAAATCCAACCGGAGGTGGTCTTCAAACAATTACTAAAACTCTTGCAGGTAATTCAACTGCAAATCTTGTACAACAATTTTTAACACCTGAATTTGCTTTTGATAAAATTCCAGCAGGTATTCAAAGATTCCATTTTCATGCATTAAAACCACAAGCTAATGATGATATTCAAATTTATGCAACACTTCAATTAGCTAATTCTGCGGGAATTGGTTATAGTCCAATTTATACTACAACAGAAAATATTATTCAATGGAATGATGAAACTACGCCTTCTGAAACAACTGTAGATATTATATTGTTATCTACATTAGTTGATCCAACTGATAGAATGATTGTTAAAGTTTATTTAAAAAACAATGAAGCAACAACTAGAATTGTAAATTGGTATACAGAAGACAATGAATATTCATATATTATTACTTCTATTGGTGCAGCTTCAGGTACGTCAGGTACTAGTGGAAGTAGTGGAACAAATGGTGCATCTGCACCCGCAGGTTTAGTTAATGGTACTGGAGTTAACTCATTAAAACAAGATAACGCTTTAACTACAACTGACGCAACTGCTGCTGGTGATAATTCAATTGCATTGGGTACAGGAGCAAATTCTGCACTAGAATCAGTTAGTATTGGAATAGACGCTAATGCTCCTAATCAAAGATCGGTTGCTATTGGTAGAAATGCACAAGCAACTGGTGGTAATAGTATTGCAATAGGTAATTATTCTAATGCTGGACCAACTGGTATTGGACTTGCATGTTCTTCAGTAGAAGGACAAACAAATGTTGCAGCAAATGCTATTATGATAGTATCGGGTGATTCAGGTGGTTCTAATAATGGTTCGGCAACAAGTTCAATTGTAATTGGTCCTGGTAGTGGTCTTAGAGCCAGTGCTGCAGACGTTATTGCTATTGGTCGTGCTTCGGTTGCTAGCGCTGCAGGTGCTGTAGCTTTAGGTGCTGACGTAACTGCAGACAAAGCAGATACAGTAAGTGTAAAAGCTTTAGATGTTCAAACTCCTTCAACACCATCAGCCGGTGGTATTATAATGACTGACGCTGGAAGTACTGAAAGAAGATTGAATCTTACAGCAACTGGTGGATTACAAGTTGATTCTACACCAGTAATTGCATCAGCTGGACCTAACTCAATTGGAAACATTTGGAGTGGTACTCAAGTACAATACGATGCATTAGGAACTTACTCAGCAACGACACTATACTTTATAGACTAA

Gene Ontology

Description Category Evidence (source)
GO:0019867 outer membrane Cellular Component IEA:InterPro (UniProt)

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID: 170089

Method: ESMFold

Resolution: 0,6371

Evidence: 0,7032

Literature

No literature entries available.