Protein
- UniProt accession
- A0A6J5NH96_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Collagen triple helix repeat
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9222
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9175
- Protein sequence
-
MADLTNKYIYETYPSIVGIGEQGSSGVTGTLKPLTDGVGVHLPIEVSTTEVNITAEDTQTVNLSIAGYGQVIDEDGNWVGPSAGLVGTSGTSGSSGTNGSSGSAGLNGTSGTDGTSGTDGSDGTNGINGTSGSSGTNGSSGTNGSSGTNGTSGTNGTSGIGTNGTSGTNGSSGTNGTSGTSGANGIATGRLYFFNNSESSDIAPYKVLSENPTGGGLQTITKTLAGNSTANLVQQFLTPEFAFDKIPAGIQRFHFHALKPQANDDIQIYATLQLANSAGIGYSPIYTTTENIIQWNDETTPSETTVDIILLSTLVDPTDRMIVKVYLKNNEATTRIVNWYTEDNEYSYIITSIGAASGTSGTSGSSGTNGASAPAGLVNGTGVNSLKQDNALTTTDATAAGDNSIALGTGANSALESVSIGIDANAPNQRSVAIGRNAQATGGNSIAIGNYSNAGPTGIGLACSSVEGQTNVAANAIMIVSGDSGGSNNGSATSSIVIGPGSGLRASAADVIAIGRASVASAAGAVALGADVTADKADTVSVKALDVQTPSTPSAGGIIMTDAGSTERRLNLTATGGLQVDSTPVIASAGPNSIGNIWSGTQVQYDALGTYSATTLYFID
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 620 AA molecular weight: 61337,63370 Da isoelectric point: 4,20042 aromaticity: 0,04677 hydropathy: -0,13726
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4134659.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796289
[NCBI]
CDS location
range 3535 -> 5397
strand -
strand -
CDS
ATGGCAGATTTAACTAATAAGTATATCTACGAAACGTACCCATCTATCGTGGGTATTGGTGAACAAGGCTCGTCAGGAGTAACAGGTACACTAAAACCACTAACAGATGGTGTAGGTGTACACTTACCTATTGAAGTAAGTACAACTGAAGTAAACATTACAGCTGAAGACACACAAACAGTTAATTTAAGTATTGCTGGTTATGGTCAAGTTATTGACGAAGATGGTAATTGGGTTGGACCTAGTGCTGGATTAGTTGGAACATCAGGAACATCAGGAAGTAGTGGAACAAATGGATCAAGTGGAAGCGCTGGATTGAATGGAACGAGCGGAACTGATGGAACTAGTGGAACTGACGGTAGTGATGGAACAAATGGAATTAATGGAACATCAGGTAGTAGTGGAACGAACGGAAGTTCAGGAACGAATGGATCTAGCGGTACTAACGGAACCTCAGGAACGAATGGAACGAGTGGAATTGGAACTAATGGTACTAGCGGAACTAATGGAAGTTCAGGAACGAATGGAACTAGCGGAACATCAGGTGCTAATGGTATTGCAACGGGTAGACTTTACTTCTTTAATAACTCTGAATCTTCAGATATTGCACCATACAAAGTTTTATCAGAAAATCCAACCGGAGGTGGTCTTCAAACAATTACTAAAACTCTTGCAGGTAATTCAACTGCAAATCTTGTACAACAATTTTTAACACCTGAATTTGCTTTTGATAAAATTCCAGCAGGTATTCAAAGATTCCATTTTCATGCATTAAAACCACAAGCTAATGATGATATTCAAATTTATGCAACACTTCAATTAGCTAATTCTGCGGGAATTGGTTATAGTCCAATTTATACTACAACAGAAAATATTATTCAATGGAATGATGAAACTACGCCTTCTGAAACAACTGTAGATATTATATTGTTATCTACATTAGTTGATCCAACTGATAGAATGATTGTTAAAGTTTATTTAAAAAACAATGAAGCAACAACTAGAATTGTAAATTGGTATACAGAAGACAATGAATATTCATATATTATTACTTCTATTGGTGCAGCTTCAGGTACGTCAGGTACTAGTGGAAGTAGTGGAACAAATGGTGCATCTGCACCCGCAGGTTTAGTTAATGGTACTGGAGTTAACTCATTAAAACAAGATAACGCTTTAACTACAACTGACGCAACTGCTGCTGGTGATAATTCAATTGCATTGGGTACAGGAGCAAATTCTGCACTAGAATCAGTTAGTATTGGAATAGACGCTAATGCTCCTAATCAAAGATCGGTTGCTATTGGTAGAAATGCACAAGCAACTGGTGGTAATAGTATTGCAATAGGTAATTATTCTAATGCTGGACCAACTGGTATTGGACTTGCATGTTCTTCAGTAGAAGGACAAACAAATGTTGCAGCAAATGCTATTATGATAGTATCGGGTGATTCAGGTGGTTCTAATAATGGTTCGGCAACAAGTTCAATTGTAATTGGTCCTGGTAGTGGTCTTAGAGCCAGTGCTGCAGACGTTATTGCTATTGGTCGTGCTTCGGTTGCTAGCGCTGCAGGTGCTGTAGCTTTAGGTGCTGACGTAACTGCAGACAAAGCAGATACAGTAAGTGTAAAAGCTTTAGATGTTCAAACTCCTTCAACACCATCAGCCGGTGGTATTATAATGACTGACGCTGGAAGTACTGAAAGAAGATTGAATCTTACAGCAACTGGTGGATTACAAGTTGATTCTACACCAGTAATTGCATCAGCTGGACCTAACTCAATTGGAAACATTTGGAGTGGTACTCAAGTACAATACGATGCATTAGGAACTTACTCAGCAACGACACTATACTTTATAGACTAA
Genbank protein accession
CAB4154774.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796619
[NCBI]
CDS location
range 25896 -> 27758
strand +
strand +
CDS
ATGGCAGATTTAACTAATAAGTATATCTACGAAACGTACCCATCTATCGTGGGTATTGGTGAACAAGGCTCGTCAGGAGTAACAGGTACACTAAAACCACTAACAGATGGTGTAGGTGTACACTTACCTATTGAAGTAAGTACAACTGAAGTAAACATTACAGCTGAAGACACACAAACAGTTAATTTAAGTATTGCTGGTTATGGTCAAGTTATTGACGAAGATGGTAATTGGGTTGGACCTAGTGCTGGATTAGTTGGAACATCAGGAACATCAGGAAGTAGTGGAACAAATGGATCAAGTGGAAGCGCTGGATTGAATGGAACGAGCGGAACTGATGGAACTAGTGGAACTGACGGTAGTGATGGAACAAATGGAATTAATGGAACATCAGGTAGTAGTGGAACGAACGGAAGTTCAGGAACGAATGGATCTAGCGGTACTAACGGAACCTCAGGAACGAATGGAACGAGTGGAATTGGAACTAATGGTACTAGCGGAACTAATGGAAGTTCAGGAACGAATGGAACTAGCGGAACATCAGGTGCTAATGGTATTGCAACGGGTAGACTTTACTTCTTTAATAACTCTGAATCTTCAGATATTGCACCATACAAAGTTTTATCAGAAAATCCAACCGGAGGTGGTCTTCAAACAATTACTAAAACTCTTGCAGGTAATTCAACTGCAAATCTTGTACAACAATTTTTAACACCTGAATTTGCTTTTGATAAAATTCCAGCAGGTATTCAAAGATTCCATTTTCATGCATTAAAACCACAAGCTAATGATGATATTCAAATTTATGCAACACTTCAATTAGCTAATTCTGCGGGAATTGGTTATAGTCCAATTTATACTACAACAGAAAATATTATTCAATGGAATGATGAAACTACGCCTTCTGAAACAACTGTAGATATTATATTGTTATCTACATTAGTTGATCCAACTGATAGAATGATTGTTAAAGTTTATTTAAAAAACAATGAAGCAACAACTAGAATTGTAAATTGGTATACAGAAGACAATGAATATTCATATATTATTACTTCTATTGGTGCAGCTTCAGGTACGTCAGGTACTAGTGGAAGTAGTGGAACAAATGGTGCATCTGCACCCGCAGGTTTAGTTAATGGTACTGGAGTTAACTCATTAAAACAAGATAACGCTTTAACTACAACTGACGCAACTGCTGCTGGTGATAATTCAATTGCATTGGGTACAGGAGCAAATTCTGCACTAGAATCAGTTAGTATTGGAATAGACGCTAATGCTCCTAATCAAAGATCGGTTGCTATTGGTAGAAATGCACAAGCAACTGGTGGTAATAGTATTGCAATAGGTAATTATTCTAATGCTGGACCAACTGGTATTGGACTTGCATGTTCTTCAGTAGAAGGACAAACAAATGTTGCAGCAAATGCTATTATGATAGTATCGGGTGATTCAGGTGGTTCTAATAATGGTTCGGCAACAAGTTCAATTGTAATTGGTCCTGGTAGTGGTCTTAGAGCCAGTGCTGCAGACGTTATTGCTATTGGTCGTGCTTCGGTTGCTAGCGCTGCAGGTGCTGTAGCTTTAGGTGCTGACGTAACTGCAGACAAAGCAGATACAGTAAGTGTAAAAGCTTTAGATGTTCAAACTCCTTCAACACCATCAGCCGGTGGTATTATAATGACTGACGCTGGAAGTACTGAAAGAAGATTGAATCTTACAGCAACTGGTGGATTACAAGTTGATTCTACACCAGTAATTGCATCAGCTGGACCTAACTCAATTGGAAACATTTGGAGTGGTACTCAAGTACAATACGATGCATTAGGAACTTACTCAGCAACGACACTATACTTTATAGACTAA
Gene Ontology
Description | Category | Evidence (source) | |
---|---|---|---|
GO:0019867 | outer membrane | Cellular Component | IEA:InterPro (UniProt) |
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID: 170089
Method: ESMFold
Resolution: 0,6371
Evidence: 0,7032
Literature
No literature entries available.