Protein

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Genbank accession
CAB5212669.1 [GenBank]
Protein name
C1q domain containing protein
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,95
Protein sequence
MELNNQYVSSSYQGLLKMTDSTNGITNTLQTVQTGNGGNTPLQMSMTEINISGSLFVNNVPVGVGTSGTSGTSGTSGSNGSSGTSGSSGTSGSGFTYNGIWLSGSTYNTNDVVTFQGQSYVAISSNTNKPPAVWPLIWSVFSAAGSSGTSGTSGSSGTSGSSGTSGSSGTSGSSGSSGSSGISGSSGTSGSNGSSGTSGSHGTSGTSGSSGSSGTSGTSGSSGTSGTSGSNGSSGRSGSNGTSGTSGSSGVSPSLVGLITTGSIGLVQSITGSLITDIKGGQPNVIIDSINSSPTLNLLGLSPNINLKQNNESSGSQYPGLTFLVDSTTYNDPNNGNGIFGGYQVNDAPPNDPTNTQNTVVGLAANSYTPEASPNLVGWFGGGGNNDNGSNTAIIFPMNNPNMDVYKPTNFHYPVNITGSLNVSQGITGSLQGTSSFALTSSFATNINKTGLITTGSIGQNQTISGSLKLTNNNNVISNVLSVTGGILLSGSINNMNFWRGPTDIGQNLGIGFNTLTKNTTGSSVIAIGASALANNISGSNLVAIGATALLNNLAPNNTSIGANSMFNNTIGYNNTAIGNNTLNNNVSGSNNLAIGNSSLSQNRSNNNTGIGNETLSNLTTGQFNTAIGLQAMAGNVSGSSNITIGNESGQNISGDNNVGIGFQSIKNTGGAAYNTAIGTQALINAAGGRNIGIGSQAGLNETGSNNLYIHNNQYGSIDNDRSGSLIWGQMNNTTSLQTLQINASTDFRNNMKISGSIIPYGSGSFDIGSPTNPFRHGYFSSGSIYLDGHQVLTLNDSGSNTAIKAPNNGTLQLLNNIVFASDNTGSIGGAFTMKGAGTYNQTETTYTGSNHFIHSDGFMSWDNKIVTSPNTGSFNFFLYDSGSFTTQMTGGTYYTNVVSGSLNMIGNDSNINIVSFNTDGTSSLNIGSNNESYSPAVNLFGQYAQLIITTDHNKFGDANLFDGITIQDVTNDPNYNIGFGINSYTSEMSGIATNMFFAGGNNSNGSNTLFIAEPKKVTFYKDEFKVSGSLQSTAGFAQVRLGSSQTITSGSDQTIIFDTIDTDPSNWYNTSTHTFTPTIEGWYEVRYQLLVGTGSSTGQMNAQLNKNNGTQVLITQNEINKNDPSSVNGSCMVHMNGTTDNLKVTFYTSSNSGTQVLQGGNGTIFNIKLI
Physico‐chemical
properties
protein length:1171 AA
molecular weight: 119531,84690 Da
isoelectric point:4,77433
aromaticity:0,07173
hydropathy:-0,30145

Domains

Domains [InterPro]
DC_1819
STR
16–206
DC_1819 DC_1933 DC_1582 IPR008983
IPR050149
Unmapped
66–250
IPR050149 DC_1988 IPR001073
G3DSA:2.10.10.20
ATT
100–140
G3DSA:2.10.10.20 IPR008160 IPR008983
CAB5212669.1
1 1171
Architecture
STR
ATT
STR
STR
RBD
STR 16-99 | ATT 100-140 | STR 141-206 | STR 398-777 | RBD 1039-1171
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
CAB5212669.1
1 1171
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 318 318 0,8510
Central domain 319 762 445 0,4278
C-terminal 763 1171 408 0,6356
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-318
Central
319-762
C-terminal
763-1171

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI] 		2100421 Uroviricota > Caudoviricetes > Peduoviridae > Maltschvirus maltsch >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB5212669.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR798237 [NCBI]
CDS location
range 21543 -> 25058
strand +
CDS
ATGGAATTAAATAATCAATATGTAAGTAGTTCGTATCAAGGTCTTTTAAAAATGACCGATAGTACGAATGGTATAACTAATACTCTTCAAACTGTTCAAACAGGTAATGGTGGTAATACCCCATTACAAATGAGCATGACTGAAATTAATATATCAGGTTCATTATTTGTTAATAATGTTCCTGTAGGTGTTGGTACATCAGGTACAAGTGGTACATCAGGAACATCTGGATCAAATGGATCTTCTGGTACTTCAGGTTCAAGTGGAACAAGTGGATCAGGATTTACATATAATGGAATTTGGTTGAGTGGATCAACTTATAATACAAATGATGTTGTTACATTTCAAGGTCAATCTTATGTAGCAATATCTTCAAATACAAATAAACCTCCCGCTGTGTGGCCTTTAATTTGGTCGGTATTTAGTGCTGCTGGTTCTTCAGGAACTAGTGGTACATCAGGTAGTTCAGGTACTTCAGGATCAAGTGGAACATCAGGTTCTTCTGGAACATCGGGTTCATCAGGAAGTAGTGGTAGTTCAGGAATATCGGGTTCATCAGGTACTTCAGGTTCTAATGGTAGTTCGGGAACAAGTGGTAGTCACGGAACATCAGGTACATCAGGTTCTAGTGGTAGTTCAGGAACAAGTGGAACTTCAGGTAGTTCAGGAACTAGTGGAACATCGGGTAGTAATGGGTCTTCAGGTAGATCAGGATCTAATGGTACATCAGGAACTTCAGGAAGTAGTGGTGTTAGTCCATCATTAGTAGGATTAATCACAACAGGTTCTATTGGATTAGTTCAATCAATTACAGGTTCATTAATAACAGATATAAAGGGAGGACAACCAAATGTTATTATTGATAGTATTAATAGTTCACCAACACTTAATTTATTAGGTTTATCTCCTAATATTAATTTAAAACAAAATAATGAAAGTTCTGGTTCACAATATCCTGGTTTAACATTTCTTGTTGATAGTACAACATATAATGACCCAAATAATGGTAATGGTATATTTGGTGGGTATCAAGTTAATGACGCTCCTCCAAATGACCCAACAAATACACAAAATACAGTTGTAGGTTTAGCAGCAAACTCTTATACACCTGAAGCAAGTCCAAATTTAGTTGGTTGGTTCGGTGGTGGTGGAAATAATGATAATGGTTCTAATACAGCTATCATATTTCCAATGAATAATCCAAATATGGATGTTTATAAACCAACTAATTTTCATTATCCAGTTAATATAACAGGTTCATTAAATGTTAGTCAAGGTATAACAGGTTCATTACAAGGAACATCATCATTTGCATTAACATCATCATTTGCTACAAACATAAATAAAACAGGTTTAATTACAACAGGTTCTATTGGACAAAATCAAACAATATCTGGTTCACTTAAATTAACTAATAATAATAATGTTATTAGTAATGTATTAAGTGTAACAGGTGGTATATTACTTTCAGGTTCAATAAATAACATGAACTTTTGGAGAGGACCAACCGATATAGGACAAAACTTAGGTATTGGTTTTAATACATTAACAAAAAATACTACTGGTTCAAGTGTTATTGCTATTGGAGCATCCGCTCTTGCTAATAACATATCAGGTAGTAACCTTGTTGCTATTGGAGCAACAGCATTATTAAATAACTTAGCACCAAATAATACCTCTATTGGTGCTAATTCAATGTTTAATAATACAATAGGATATAATAATACAGCTATTGGTAATAATACGTTAAATAATAATGTTTCGGGTTCAAACAACCTTGCAATTGGTAATTCTTCTTTATCACAAAATAGATCAAATAATAATACAGGTATTGGTAATGAAACATTATCAAATTTAACAACAGGTCAATTTAATACTGCAATTGGGTTACAAGCAATGGCGGGAAATGTATCTGGTTCAAGTAATATTACAATTGGTAATGAATCTGGTCAAAATATATCAGGTGATAATAATGTTGGTATTGGTTTCCAATCAATTAAAAATACTGGTGGAGCAGCTTATAACACTGCAATTGGTACACAAGCATTAATTAATGCTGCAGGTGGTAGAAATATTGGTATAGGTAGTCAAGCAGGTTTAAATGAAACTGGTTCAAATAATTTATATATTCATAATAATCAATATGGTTCAATTGATAATGATAGAAGTGGTTCATTAATATGGGGACAAATGAATAATACGACATCATTACAAACTTTACAGATTAATGCGTCAACTGATTTTAGAAATAACATGAAAATAAGTGGTTCAATTATCCCTTATGGTAGTGGTTCATTTGATATTGGTTCACCAACAAATCCATTTAGACACGGTTATTTCTCATCAGGATCAATTTATTTGGATGGTCATCAAGTATTAACTTTAAATGATAGTGGTAGTAATACTGCAATTAAAGCACCAAATAATGGTACATTACAATTATTAAATAATATTGTTTTTGCTAGTGATAATACTGGTTCAATTGGTGGAGCATTTACAATGAAAGGTGCTGGTACATATAATCAAACAGAAACAACATATACAGGTTCAAACCACTTTATCCATTCAGATGGATTTATGAGTTGGGATAATAAGATTGTGACATCACCAAATACAGGTAGTTTTAACTTCTTCTTATATGATAGTGGTTCATTTACAACTCAAATGACTGGTGGAACATATTATACAAATGTTGTATCAGGTTCATTAAATATGATTGGTAATGATAGTAATATTAATATTGTTTCTTTTAATACAGATGGAACATCAAGTTTAAACATTGGTTCTAATAATGAATCTTATAGTCCAGCAGTTAATTTATTTGGTCAATACGCTCAATTAATAATAACGACAGATCATAATAAATTTGGTGACGCTAATTTATTTGATGGTATAACAATACAAGATGTAACTAATGACCCAAACTATAATATTGGATTTGGTATTAATAGTTATACATCTGAAATGTCAGGAATTGCAACAAATATGTTCTTTGCTGGTGGTAACAATAGTAATGGATCAAATACTTTGTTTATTGCTGAACCAAAAAAAGTAACATTTTATAAAGATGAATTTAAAGTATCAGGTTCACTTCAATCAACAGCAGGTTTTGCACAAGTAAGATTAGGAAGTAGTCAAACTATTACATCAGGATCGGATCAAACAATCATATTTGATACAATTGATACTGATCCATCAAATTGGTATAACACTAGTACACATACATTTACTCCAACAATTGAAGGATGGTATGAAGTTAGATACCAATTATTAGTTGGAACTGGATCTAGTACAGGTCAAATGAACGCACAATTAAATAAAAATAATGGTACACAAGTATTAATTACACAAAATGAAATTAATAAAAATGATCCTTCATCAGTAAATGGTTCTTGTATGGTTCATATGAATGGTACAACAGATAATTTAAAAGTAACATTCTACACTTCAAGTAATTCTGGTACGCAGGTTTTACAAGGTGGAAATGGTACAATATTCAATATAAAATTAATATAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
6602d8054149dbd4677d2e58faeec4396684587c455171a5f74e360690ee19e3
ColabFold
Source ColabFold
Method ColabFold
Resolution 0,2597
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50