Protein
- UniProt accession
- A0A6J5N2A9_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Phage tail collar domain containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9176
- Protein sequence
-
MALGVRGSNPIWTEFDLQGHLFDDTFYLFVLENNIPYMPAEVYHDPDLNLPWTNPIQFLGNGTLPTDIYFETDVVYRLEFRQGPTQADPLIYEINNYVAGTGGSTPVDTVAFASSNQITNPQFALISFSSPLTISATDPDPIEIGPGWFLELAGTGTATITQVPLTSTNTNPSNAPYALQLTLTGWDTDGVFLRQRFQQNGMLWADKIVSSTLTARVQGVAISVTASLIDSNGTTLAQVLNVPSINGSFNEFTGYGELPATSNPDTPPAAYIDYKLALPSNVDIYLSSIQLVVQELPIEPSFEQDSIDRQIDHTYHTAYPIVPVGTIIDFHGFTIPSHYLLTDGTAYSRTAYNQLFQALTKVETVTLTSTVNTFTVVSSTDYWIGMAVEGTGIPASTTISGIAGTTITISNAATITGSSAVRFFSAGAGNGSTTFNVPNLIDYVVAQSAGSLFTSGTNGVGAKGGAATHTLTIAEMPGHTHPGSTTPMGAGAAVNGAGGNSSLSLLGVATAVSIATQGDGNPHSIVQQTVLMKKLIRYE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 539 AA molecular weight: 57125,08750 Da isoelectric point: 4,41908 aromaticity: 0,09276 hydropathy: 0,05826
Domains
Domains [InterPro]
IPR037053
321–372
321–372
1
539
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4151430.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796557
[NCBI]
CDS location
range 13751 -> 15370
strand +
strand +
CDS
ATGGCACTAGGTGTGAGAGGAAGCAACCCAATTTGGACGGAATTTGATCTCCAAGGCCATTTATTTGATGACACGTTTTATTTATTCGTGCTTGAAAATAATATTCCTTATATGCCAGCCGAGGTTTATCACGATCCTGACTTAAATCTTCCATGGACCAACCCTATCCAATTTTTAGGAAACGGTACATTACCAACAGATATTTATTTTGAAACTGATGTGGTTTATAGGCTTGAGTTTAGGCAGGGTCCAACGCAGGCAGATCCCCTAATTTATGAAATTAATAATTACGTTGCAGGCACGGGCGGATCAACCCCTGTTGATACAGTAGCTTTTGCCTCTAGTAACCAGATAACCAACCCGCAATTTGCGCTTATTAGTTTTTCCTCCCCCTTAACTATAAGCGCAACAGATCCCGATCCAATTGAGATTGGGCCGGGTTGGTTCCTTGAGCTTGCAGGTACAGGAACGGCAACTATTACCCAAGTACCGCTTACCAGCACCAACACAAACCCATCAAATGCTCCCTACGCTCTTCAATTAACCTTAACAGGATGGGATACGGACGGGGTATTTTTGCGTCAAAGATTCCAACAAAATGGCATGTTATGGGCTGATAAAATTGTCTCCTCTACTCTTACCGCTCGCGTGCAAGGCGTTGCCATAAGTGTTACTGCCAGTCTTATTGACTCAAACGGTACGACACTTGCTCAAGTATTAAATGTTCCTAGTATTAACGGATCATTCAATGAATTCACAGGCTATGGCGAGTTACCAGCAACCTCAAATCCGGATACACCTCCTGCGGCTTACATTGATTATAAATTAGCGCTACCTAGTAATGTTGATATTTATTTATCAAGTATCCAGTTAGTGGTGCAAGAGCTGCCCATAGAGCCTAGTTTTGAGCAAGACTCAATAGATAGACAAATTGATCACACCTATCATACAGCCTATCCAATTGTACCGGTCGGCACTATTATTGATTTTCATGGATTTACAATACCGTCCCATTATTTATTAACCGATGGTACAGCTTATAGCCGGACCGCATATAATCAGCTTTTCCAGGCATTAACAAAGGTGGAGACGGTTACACTGACAAGTACGGTTAATACTTTTACGGTTGTTTCAAGTACTGATTATTGGATTGGTATGGCTGTCGAGGGCACTGGGATTCCTGCATCAACTACGATATCCGGTATAGCAGGGACTACGATTACTATCTCCAATGCGGCAACTATAACCGGATCGTCCGCTGTTAGGTTTTTTTCAGCTGGTGCGGGAAATGGATCTACCACCTTCAACGTTCCCAATTTAATTGATTACGTAGTGGCCCAAAGCGCAGGCTCTTTATTTACATCTGGTACTAACGGGGTGGGGGCTAAAGGCGGTGCGGCCACACATACCCTTACTATAGCGGAAATGCCAGGCCATACCCACCCTGGAAGCACCACTCCTATGGGCGCAGGTGCTGCTGTTAATGGAGCAGGCGGTAATTCCTCTTTATCCTTATTAGGTGTAGCAACTGCTGTTTCAATAGCTACACAAGGGGATGGAAATCCACACAGTATTGTCCAGCAAACAGTGCTTATGAAAAAATTAATTAGATATGAATAA
Genbank protein accession
CAB4157172.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796656
[NCBI]
CDS location
range 3948 -> 5567
strand -
strand -
CDS
ATGGCACTAGGTGTGAGAGGAAGCAACCCAATTTGGACGGAATTTGATCTCCAAGGCCATTTATTTGATGACACGTTTTATTTATTCGTGCTTGAAAATAATATTCCTTATATGCCAGCCGAGGTTTATCACGATCCTGACTTAAATCTTCCATGGACCAACCCTATCCAATTTTTAGGAAACGGTACATTACCAACAGATATTTATTTTGAAACTGATGTGGTTTATAGGCTTGAGTTTAGGCAGGGTCCAACGCAGGCAGATCCCCTAATTTATGAAATTAATAATTACGTTGCAGGCACGGGCGGATCAACCCCTGTTGATACAGTAGCTTTTGCCTCTAGTAACCAGATAACCAACCCGCAATTTGCGCTTATTAGTTTTTCCTCCCCCTTAACTATAAGCGCAACAGATCCCGATCCAATTGAGATTGGGCCGGGTTGGTTCCTTGAGCTTGCAGGTACAGGAACGGCAACTATTACCCAAGTACCGCTTACCAGCACCAACACAAACCCATCAAATGCTCCCTACGCTCTTCAATTAACCTTAACAGGATGGGATACGGACGGGGTATTTTTGCGTCAAAGATTCCAACAAAATGGCATGTTATGGGCTGATAAAATTGTCTCCTCTACTCTTACCGCTCGCGTGCAAGGCGTTGCCATAAGTGTTACTGCCAGTCTTATTGACTCAAACGGTACGACACTTGCTCAAGTATTAAATGTTCCTAGTATTAACGGATCATTCAATGAATTCACAGGCTATGGCGAGTTACCAGCAACCTCAAATCCGGATACACCTCCTGCGGCTTACATTGATTATAAATTAGCGCTACCTAGTAATGTTGATATTTATTTATCAAGTATCCAGTTAGTGGTGCAAGAGCTGCCCATAGAGCCTAGTTTTGAGCAAGACTCAATAGATAGACAAATTGATCACACCTATCATACAGCCTATCCAATTGTACCGGTCGGCACTATTATTGATTTTCATGGATTTACAATACCGTCCCATTATTTATTAACCGATGGTACAGCTTATAGCCGGACCGCATATAATCAGCTTTTCCAGGCATTAACAAAGGTGGAGACGGTTACACTGACAAGTACGGTTAATACTTTTACGGTTGTTTCAAGTACTGATTATTGGATTGGTATGGCTGTCGAGGGCACTGGGATTCCTGCATCAACTACGATATCCGGTATAGCAGGGACTACGATTACTATCTCCAATGCGGCAACTATAACCGGATCGTCCGCTGTTAGGTTTTTTTCAGCTGGTGCGGGAAATGGATCTACCACCTTCAACGTTCCCAATTTAATTGATTACGTAGTGGCCCAAAGCGCAGGCTCTTTATTTACATCTGGTACTAACGGGGTGGGGGCTAAAGGCGGTGCGGCCACACATACCCTTACTATAGCGGAAATGCCAGGCCATACCCACCCTGGAAGCACCACTCCTATGGGCGCAGGTGCTGCTGTTAATGGAGCAGGCGGTAATTCCTCTTTATCCTTATTAGGTGTAGCAACTGCTGTTTCAATAGCTACACAAGGGGATGGAAATCCACACAGTATTGTCCAGCAAACAGTGCTTATGAAAAAATTAATTAGATATGAATAA
Genbank protein accession
CAB5225547.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR798345
[NCBI]
CDS location
range 25235 -> 26854
strand +
strand +
CDS
ATGGCACTAGGTGTGAGAGGAAGCAACCCAATTTGGACGGAATTTGATCTCCAAGGCCATTTATTTGATGACACGTTTTATTTATTCGTGCTTGAAAATAATATTCCTTATATGCCAGCCGAGGTTTATCACGATCCTGACTTAAATCTTCCATGGACCAACCCTATCCAATTTTTAGGAAACGGTACATTACCAACAGATATTTATTTTGAAACTGATGTGGTTTATAGGCTTGAGTTTAGGCAGGGTCCAACGCAGGCAGATCCCCTAATTTATGAAATTAATAATTACGTTGCAGGCACGGGCGGATCAACCCCTGTTGATACAGTAGCTTTTGCCTCTAGTAACCAGATAACCAACCCGCAATTTGCGCTTATTAGTTTTTCCTCCCCCTTAACTATAAGCGCAACAGATCCCGATCCAATTGAGATTGGGCCGGGTTGGTTCCTTGAGCTTGCAGGTACAGGAACGGCAACTATTACCCAAGTACCGCTTACCAGCACCAACACAAACCCATCAAATGCTCCCTACGCTCTTCAATTAACCTTAACAGGATGGGATACGGACGGGGTATTTTTGCGTCAAAGATTCCAACAAAATGGCATGTTATGGGCTGATAAAATTGTCTCCTCTACTCTTACCGCTCGCGTGCAAGGCGTTGCCATAAGTGTTACTGCCAGTCTTATTGACTCAAACGGTACGACACTTGCTCAAGTATTAAATGTTCCTAGTATTAACGGATCATTCAATGAATTCACAGGCTATGGCGAGTTACCAGCAACCTCAAATCCGGATACACCTCCTGCGGCTTACATTGATTATAAATTAGCGCTACCTAGTAATGTTGATATTTATTTATCAAGTATCCAGTTAGTGGTGCAAGAGCTGCCCATAGAGCCTAGTTTTGAGCAAGACTCAATAGATAGACAAATTGATCACACCTATCATACAGCCTATCCAATTGTACCGGTCGGCACTATTATTGATTTTCATGGATTTACAATACCGTCCCATTATTTATTAACCGATGGTACAGCTTATAGCCGGACCGCATATAATCAGCTTTTCCAGGCATTAACAAAGGTGGAGACGGTTACACTGACAAGTACGGTTAATACTTTTACGGTTGTTTCAAGTACTGATTATTGGATTGGTATGGCTGTCGAGGGCACTGGGATTCCTGCATCAACTACGATATCCGGTATAGCAGGGACTACGATTACTATCTCCAATGCGGCAACTATAACCGGATCGTCCGCTGTTAGGTTTTTTTCAGCTGGTGCGGGAAATGGATCTACCACCTTCAACGTTCCCAATTTAATTGATTACGTAGTGGCCCAAAGCGCAGGCTCTTTATTTACATCTGGTACTAACGGGGTGGGGGCTAAAGGCGGTGCGGCCACACATACCCTTACTATAGCGGAAATGCCAGGCCATACCCACCCTGGAAGCACCACTCCTATGGGCGCAGGTGCTGCTGTTAATGGAGCAGGCGGTAATTCCTCTTTATCCTTATTAGGTGTAGCAACTGCTGTTTCAATAGCTACACAAGGGGATGGAAATCCACACAGTATTGTCCAGCAAACAGTGCTTATGAAAAAATTAATTAGATATGAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID: 169982
Method: ESMFold
Resolution: 0,7840
Evidence: 0,8480
Literature
No literature entries available.