Protein
- UniProt accession
- A0A6J5N211_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Collagen triple helix repeat
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9246
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9008
- Protein sequence
-
MTITVTATYTTILINNEPTEVLVSTNPTFYVGAQGETGYTGSQGTTGFIGSFGNTGFTGSQGIQGETGFTGSQGIQGEIGFTGSQGEQGEQGTQGELGYTGSQGEQGYTGSQGTQGDKGDTGYVGSQGDIGYVGSQGDKGDAGYGFNIFVVYPSVSALEEDTSPAGIQVGDFALIDTGDVDDADNSLLFVWGGTAYTYVNDLSGAIGITGPQGDPGNIGYVGSQGVQGDKGDAGDLGYTGSIGYAGSQGIQGEQGIQGISGYTGSIGFVGSQGIQGVNGFTGSIGFAGSQGIQGVSGYVGSQGIQGNLGYTGSRGYAGSRGDTGLGWDYATLSGISYNYGLNVGDNFTFNTIADSAFATGNYVKIYQASTPTTNFYEGIITKTGTNAFSLLIERKGSGTGTALSGVMILFGRQGYTGSAGTNGDAGATGDVGYVGSQGDQGVPGDAGTPGDIGYTGSAGDTGYTGSAGDLGYTGSAGDIGYVGSQGDQGVPGDAGDIGYTGSTGDIGYTGSAGDLGYTGSAGSYNQDLNTSNNVIFATVTATTITSETGNLTVKASNDGGAGELYLKGGSRNGSTDDSQTILKLNDYGAYSNKTVAAEGSVPAPLEFYSVNSSNNPAAKSRFRAINDADSQIQIGVSSSASDTGNQTYITSNNTLTVTASAILLNGLTYPSADGTAGQVLSTDGAGNIGWSSAGGGSTGDITFSNIQIVGTGTYSVAGSIELVPNSSLIGNGQYIIIRPTAAFDGNHIHIEKGANPYADLMLGDDLQYVKLGSTGTITVNTFDNSTGTAYTFSSAGMTFPDDTVQTTAYIGGSGGTPVYARDELPAGAIGVIITVSDSGSDDNAPAGNYALAYWDDDVEEWLYMANSNSVTIIV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 874 AA molecular weight: 87751,02970 Da isoelectric point: 4,05003 aromaticity: 0,09382 hydropathy: -0,21865
Domains
Domains [InterPro]
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4153655.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796596
[NCBI]
CDS location
range 9804 -> 12428
strand -
strand -
CDS
ATGACAATTACCGTAACCGCAACATATACAACAATCTTAATAAACAACGAACCAACAGAAGTATTGGTCAGCACAAATCCTACATTCTATGTAGGTGCACAAGGTGAAACTGGCTACACAGGTAGTCAGGGTACTACTGGATTTATTGGTTCTTTTGGTAATACTGGATTTACCGGTAGCCAAGGCATCCAAGGTGAAACTGGATTTACTGGATCACAAGGCATCCAAGGCGAAATTGGATTTACCGGTAGTCAAGGTGAGCAAGGCGAACAAGGCACTCAAGGTGAGTTAGGTTATACTGGTAGCCAGGGTGAACAAGGTTATACTGGCAGCCAAGGCACCCAAGGAGATAAAGGTGACACTGGCTATGTAGGTAGTCAAGGTGATATCGGCTATGTTGGTAGTCAAGGTGATAAAGGCGATGCTGGATATGGATTCAACATATTTGTTGTTTATCCAAGCGTATCTGCACTTGAAGAAGATACAAGTCCTGCAGGTATTCAAGTAGGTGATTTTGCACTTATTGATACAGGTGATGTTGATGATGCCGACAATAGTTTATTATTCGTATGGGGCGGCACAGCCTATACCTATGTTAATGATCTTAGTGGAGCAATAGGTATTACAGGTCCCCAAGGCGATCCTGGTAATATTGGTTATGTAGGTAGTCAAGGTGTCCAAGGCGATAAGGGTGATGCTGGAGATTTAGGTTATACTGGTAGTATCGGTTATGCTGGATCACAAGGCATCCAAGGCGAACAAGGCATCCAAGGCATTAGTGGATACACTGGATCAATTGGGTTTGTTGGATCACAAGGCATCCAAGGTGTTAATGGATTTACCGGGTCAATTGGTTTTGCTGGATCACAAGGCATCCAAGGTGTTAGTGGTTATGTAGGTTCACAAGGCATCCAGGGCAATCTAGGTTATACCGGATCAAGAGGTTATGCAGGTAGTCGTGGAGACACTGGTTTAGGTTGGGATTATGCTACTTTATCTGGAATAAGTTACAACTACGGATTAAACGTAGGAGATAATTTTACATTTAATACAATAGCAGATTCTGCTTTTGCAACAGGAAATTATGTTAAAATTTATCAAGCATCAACTCCAACTACAAATTTCTATGAAGGTATAATCACAAAAACCGGAACTAATGCCTTTAGTTTGTTAATTGAACGTAAGGGTTCAGGTACAGGAACTGCTCTAAGTGGCGTTATGATCTTATTTGGTCGCCAAGGCTATACAGGTAGTGCAGGTACTAATGGTGACGCAGGTGCTACTGGTGATGTTGGCTATGTAGGATCACAAGGTGATCAAGGTGTTCCAGGTGATGCAGGTACCCCAGGTGATATAGGTTATACTGGTAGTGCAGGCGATACAGGTTATACAGGTAGTGCCGGTGATTTAGGTTATACAGGTAGTGCCGGTGATATTGGCTATGTAGGATCACAAGGTGATCAAGGCGTTCCAGGTGACGCAGGTGACATTGGTTATACCGGTAGCACAGGTGACATTGGTTACACAGGCAGTGCTGGTGATTTAGGTTACACAGGCAGTGCGGGATCATATAATCAAGATTTGAATACCTCAAATAATGTAATATTTGCCACCGTAACTGCAACAACTATTACTTCAGAAACTGGTAATTTAACAGTTAAGGCCTCAAATGATGGCGGTGCAGGTGAGTTATATCTAAAAGGTGGATCAAGAAATGGTTCTACTGATGATAGCCAAACTATTCTTAAATTAAATGACTATGGTGCCTATAGCAATAAAACTGTCGCCGCAGAGGGATCTGTGCCAGCACCTTTAGAATTTTATAGTGTTAATAGTTCAAATAATCCAGCAGCAAAATCTAGATTCCGCGCAATTAATGATGCTGATAGTCAAATTCAAATCGGAGTAAGTAGTTCTGCTAGTGATACCGGTAATCAAACCTATATCACTTCTAACAACACATTGACAGTCACTGCCAGTGCTATCTTACTAAATGGATTAACATATCCTAGTGCTGATGGAACTGCTGGTCAAGTATTGTCTACAGACGGTGCAGGTAATATTGGATGGTCATCAGCAGGTGGCGGGTCAACTGGTGATATTACATTTAGTAATATTCAAATTGTCGGAACTGGCACATATAGTGTAGCCGGTTCGATTGAACTTGTTCCTAATAGTAGTTTAATCGGTAATGGACAATACATTATTATTCGTCCAACCGCAGCATTTGATGGCAATCATATACACATCGAAAAAGGTGCTAATCCGTATGCTGATCTAATGTTAGGTGACGATCTTCAGTATGTTAAATTGGGCTCAACTGGCACAATTACTGTTAATACTTTTGATAACAGCACAGGCACAGCCTATACATTCAGCAGTGCAGGTATGACATTCCCAGATGATACAGTCCAAACAACTGCCTATATTGGCGGTAGTGGTGGAACTCCTGTATATGCTCGCGATGAATTACCTGCAGGTGCTATTGGCGTGATAATCACAGTCAGTGATAGTGGTAGTGATGATAATGCTCCAGCAGGTAACTATGCTCTTGCCTATTGGGATGATGATGTAGAAGAATGGCTATATATGGCCAACAGTAATTCAGTAACAATAATAGTCTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.