Protein
- UniProt accession
- A0A6J5MQY7_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Collagen triple helix repeat
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9355
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,8560
- Protein sequence
-
MPVKTTLQVRRDTGANWNTANPILAAGEIGFETDTGNFKIGNGTTKWNGAAGDGVNKLPYANSTGPTGATGATGPTGATGATGPTGATGATGAAGADGKGFDGVTSSTSIAVGTGSRAFTVASTGAYIIGTRVRVVNTGTPANYVEGVISALTVNTSITVNVDTIGGSGTFTAWTFTVAGNVGATGAAGATGAQGTAGATGATGATGATGPAGTNGTNGTNGTNGTNGVGYDGITSTTSLSISTGSKTITLNKLGALAIGTRIRAASTATPANYVEGVITGIATLAVTFLVDQINGSGTLTSWNVSVAGERGLSNAPATGYTRVPYSDLGVVVFSTSPTGPNQNFVSGLTSPGWTDPSPFRIQTGVLASGSWASGEQAVVFPTAFASGIVPIVTITPIASNLNATTTVTLKAAPTNTGFTAVARTQTGTTYTNAAPTSYWIAVQATSTSGAS
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 452 AA molecular weight: 44040,90920 Da isoelectric point: 9,12326 aromaticity: 0,06416 hydropathy: 0,07942
Domains
Domains [InterPro]
IPR041352
8–45
8–45
1
452
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4137909.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796338
[NCBI]
CDS location
range 74547 -> 75905
strand -
strand -
CDS
ATGCCCGTAAAAACCACACTTCAAGTACGTAGAGATACTGGTGCTAACTGGAATACCGCTAACCCTATTTTGGCGGCAGGTGAGATTGGCTTTGAAACCGATACTGGTAACTTTAAAATTGGTAATGGCACCACTAAATGGAATGGTGCTGCTGGAGACGGTGTAAACAAACTTCCTTACGCAAACTCTACTGGGCCTACTGGAGCCACAGGAGCCACAGGCCCTACTGGGGCTACTGGTGCTACAGGCCCTACTGGGGCTACTGGTGCCACAGGAGCAGCAGGTGCTGACGGTAAAGGATTTGATGGAGTAACTTCATCTACTTCTATTGCTGTTGGAACTGGCTCTAGAGCATTTACTGTTGCTTCTACTGGAGCATACATAATTGGTACACGAGTTCGTGTAGTTAACACTGGTACTCCAGCAAACTATGTTGAGGGTGTAATTAGTGCTCTAACAGTTAACACTTCAATCACAGTGAACGTAGACACTATTGGTGGGTCTGGAACTTTCACTGCTTGGACTTTCACTGTCGCAGGTAACGTTGGTGCTACTGGAGCCGCAGGTGCTACAGGGGCTCAAGGTACCGCAGGTGCTACAGGTGCGACTGGTGCCACAGGTGCTACAGGTCCAGCAGGAACTAATGGAACCAATGGAACAAACGGTACTAATGGTACTAATGGTGTTGGTTACGACGGAATCACCTCGACCACCTCACTTTCAATTAGCACAGGCTCTAAAACTATCACACTAAACAAACTTGGTGCTCTTGCTATAGGTACTAGAATTCGTGCTGCAAGCACTGCTACCCCAGCAAATTATGTTGAAGGCGTTATCACAGGAATCGCTACACTAGCGGTTACTTTCTTAGTAGACCAGATTAATGGTTCTGGAACTTTAACTTCTTGGAATGTTTCTGTTGCGGGTGAAAGAGGTCTTTCAAATGCCCCAGCAACTGGGTATACCAGAGTGCCTTATTCAGACTTAGGTGTAGTTGTTTTTTCAACATCGCCAACTGGGCCAAACCAGAATTTTGTCTCTGGGCTTACAAGTCCTGGTTGGACTGACCCTAGCCCGTTCAGAATACAGACAGGCGTTCTTGCTTCTGGTTCTTGGGCAAGCGGTGAACAGGCTGTAGTATTTCCTACTGCTTTTGCTTCAGGTATCGTGCCGATAGTCACAATAACTCCTATTGCTTCTAACCTAAACGCTACAACTACAGTGACTTTAAAGGCTGCACCTACAAACACAGGGTTTACTGCTGTCGCTAGAACGCAGACAGGCACTACCTATACTAATGCTGCACCTACCTCATACTGGATTGCCGTTCAAGCCACTAGTACTTCTGGTGCTTCTTAA
Genbank protein accession
CAB4148167.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796481
[NCBI]
CDS location
range 71584 -> 72942
strand -
strand -
CDS
ATGCCCGTAAAAACCACACTTCAAGTACGTAGAGATACTGGTGCTAACTGGAATACCGCTAACCCTATTTTGGCGGCAGGTGAGATTGGCTTTGAAACCGATACTGGTAACTTTAAAATTGGTAATGGCACCACTAAATGGAATGGTGCTGCTGGAGACGGTGTAAACAAACTTCCTTACGCAAACTCTACTGGGCCTACTGGAGCCACAGGAGCCACAGGCCCTACTGGGGCTACTGGTGCTACAGGCCCTACTGGGGCTACTGGTGCCACAGGAGCAGCAGGTGCTGACGGTAAAGGATTTGATGGAGTAACTTCATCTACTTCTATTGCTGTTGGAACTGGCTCTAGAGCATTTACTGTTGCTTCTACTGGAGCATACATAATTGGTACACGAGTTCGTGTAGTTAACACTGGTACTCCAGCAAACTATGTTGAGGGTGTAATTAGTGCTCTAACAGTTAACACTTCAATCACAGTGAACGTAGACACTATTGGTGGGTCTGGAACTTTCACTGCTTGGACTTTCACTGTCGCAGGTAACGTTGGTGCTACTGGAGCCGCAGGTGCTACAGGGGCTCAAGGTACCGCAGGTGCTACAGGTGCGACTGGTGCCACAGGTGCTACAGGTCCAGCAGGAACTAATGGAACCAATGGAACAAACGGTACTAATGGTACTAATGGTGTTGGTTACGACGGAATCACCTCGACCACCTCACTTTCAATTAGCACAGGCTCTAAAACTATCACACTAAACAAACTTGGTGCTCTTGCTATAGGTACTAGAATTCGTGCTGCAAGCACTGCTACCCCAGCAAATTATGTTGAAGGCGTTATCACAGGAATCGCTACACTAGCGGTTACTTTCTTAGTAGACCAGATTAATGGTTCTGGAACTTTAACTTCTTGGAATGTTTCTGTTGCGGGTGAAAGAGGTCTTTCAAATGCCCCAGCAACTGGGTATACCAGAGTGCCTTATTCAGACTTAGGTGTAGTTGTTTTTTCAACATCGCCAACTGGGCCAAACCAGAATTTTGTCTCTGGGCTTACAAGTCCTGGTTGGACTGACCCTAGCCCGTTCAGAATACAGACAGGCGTTCTTGCTTCTGGTTCTTGGGCAAGCGGTGAACAGGCTGTAGTATTTCCTACTGCTTTTGCTTCAGGTATCGTGCCGATAGTCACAATAACTCCTATTGCTTCTAACCTAAACGCTACAACTACAGTGACTTTAAAGGCTGCACCTACAAACACAGGGTTTACTGCTGTCGCTAGAACGCAGACAGGCACTACCTATACTAATGCTGCACCTACCTCATACTGGATTGCCGTTCAAGCCACTAGTACTTCTGGTGCTTCTTAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID: 169917
Method: ESMFold
Resolution: 0,7473
Evidence: 0,8147
Literature
No literature entries available.