Protein

UniProt accession
A0A6J5MDK9_9CAUD [UniProt]
Protein name
Major tropism determinant N-terminal domain-containing protein
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,8925

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9342

Protein sequence
MSNILRIKRRVASGAPGAPSSLKNAELAFNEADNTLYYGFGDDGNGNANNIPAIGGIGAFVSLSTSQTLTGNKTFSGTVVVPTPTANAHATTKLYVDQQVSNISNIVSNVATSFTVSGDSGSNQTITSGTDTLTISGGTGLSSVAGATDTITLNLDNTTVTAGSYGGAGTVGTFTVDAQGRLTAAGNTAISVTASQISDKGTSLVTGLTGTANEIAVSNSGVGAVTLSLPANVTIPNNLTVTGDLIVQGNTTTLNTATLVVEDKNIVLSNVASPSDVSADGAGITILGATNKTLNWVDATDAWTSSEHLDLAAGKVIKIGTSEVLSNTTLASSVVNSSLTSVGNVTSGTWSAGTIAISYGGTGATSASGARTNLGLAIGTDVQAYDPELAAIAGLTSAADKLPYFTGANTADLATFTTFGRSLVDDADASAARITIGVGTIATQNSNNVTITGGSISNLTTFDGITFDGGTF
Physico‐chemical
properties
protein length:472 AA
molecular weight: 46840,86760 Da
isoelectric point:4,27608
aromaticity:0,04661
hydropathy:0,15148

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage uncultured Caudovirales phage
[NCBI]
2100421 Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4143140.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796418 [NCBI]
CDS location
range 61661 -> 63079
strand +
CDS
ATGTCTAATATTTTAAGGATTAAAAGAAGAGTTGCTAGTGGCGCACCAGGAGCACCAAGCTCTTTAAAAAACGCAGAGTTAGCATTTAACGAAGCCGACAACACCCTTTACTATGGTTTTGGCGATGATGGTAATGGTAATGCAAATAACATTCCAGCTATCGGTGGTATTGGTGCATTCGTATCACTTAGTACTTCTCAAACACTAACTGGAAATAAAACTTTTTCTGGAACCGTTGTCGTCCCAACGCCAACGGCAAACGCTCATGCTACAACAAAACTTTATGTTGATCAACAGGTGTCCAACATCAGCAACATTGTTTCAAACGTTGCTACATCATTTACGGTCTCTGGCGATTCTGGATCAAACCAAACAATTACTTCAGGCACTGATACACTAACAATTTCTGGTGGCACTGGATTAAGTTCTGTTGCAGGCGCAACTGATACAATTACCTTAAATCTTGACAACACAACAGTTACAGCCGGTTCATACGGTGGAGCTGGAACTGTTGGCACATTCACAGTTGATGCACAAGGCCGTTTAACAGCTGCAGGTAATACTGCAATCTCAGTAACTGCATCGCAGATCAGCGATAAGGGAACAAGCCTTGTCACTGGCTTAACGGGTACAGCAAACGAAATAGCAGTGTCAAACTCTGGAGTAGGCGCTGTTACATTGAGTCTTCCAGCCAACGTAACAATTCCTAATAATCTTACAGTAACTGGTGACTTAATTGTTCAAGGAAATACGACAACATTAAATACAGCAACTCTTGTTGTTGAAGATAAAAACATTGTTCTTTCCAATGTCGCTTCACCATCTGATGTTTCTGCTGATGGTGCTGGTATTACGATTCTTGGTGCAACTAACAAAACACTTAACTGGGTTGACGCAACAGATGCCTGGACATCTTCTGAGCACTTAGATTTAGCTGCTGGAAAAGTTATAAAAATAGGAACATCTGAAGTATTATCAAATACTACTTTAGCTTCAAGTGTTGTTAACTCAAGCTTAACCTCAGTGGGCAATGTTACATCAGGAACCTGGAGTGCAGGGACAATAGCTATCAGTTATGGTGGTACTGGTGCAACAAGTGCGTCTGGTGCTAGAACCAATTTAGGTTTGGCTATAGGAACTGATGTTCAAGCCTATGATCCAGAGCTCGCAGCAATAGCTGGTCTTACATCAGCAGCTGACAAACTACCATATTTCACGGGAGCAAATACTGCAGATTTAGCTACCTTTACTACATTTGGTAGAAGTCTGGTAGACGACGCAGATGCTTCAGCAGCAAGAATAACTATCGGTGTTGGAACTATTGCAACACAAAATTCAAATAACGTTACAATTACAGGTGGATCTATTTCTAACTTGACGACATTCGATGGTATCACATTTGATGGTGGAACCTTCTAA

Genbank protein accession
CAB4162641.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796737 [NCBI]
CDS location
range 61663 -> 63081
strand +
CDS
ATGTCTAATATTTTAAGGATTAAAAGAAGAGTTGCTAGTGGCGCACCAGGAGCACCAAGCTCTTTAAAAAACGCAGAGTTAGCATTTAACGAAGCCGACAACACCCTTTACTATGGTTTTGGCGATGATGGTAATGGTAATGCAAATAACATTCCAGCTATCGGTGGTATTGGTGCATTCGTATCACTTAGTACTTCTCAAACACTAACTGGAAATAAAACTTTTTCTGGAACCGTTGTCGTCCCAACGCCAACGGCAAACGCTCATGCTACAACAAAACTTTATGTTGATCAACAGGTGTCCAACATCAGCAACATTGTTTCAAACGTTGCTACATCATTTACGGTCTCTGGCGATTCTGGATCAAACCAAACAATTACTTCAGGCACTGATACACTAACAATTTCTGGTGGCACTGGATTAAGTTCTGTTGCAGGCGCAACTGATACAATTACCTTAAATCTTGACAACACAACAGTTACAGCCGGTTCATACGGTGGAGCTGGAACTGTTGGCACATTCACAGTTGATGCACAAGGCCGTTTAACAGCTGCAGGTAATACTGCAATCTCAGTAACTGCATCGCAGATCAGCGATAAGGGAACAAGCCTTGTCACTGGCTTAACGGGTACAGCAAACGAAATAGCAGTGTCAAACTCTGGAGTAGGCGCTGTTACATTGAGTCTTCCAGCCAACGTAACAATTCCTAATAATCTTACAGTAACTGGTGACTTAATTGTTCAAGGAAATACGACAACATTAAATACAGCAACTCTTGTTGTTGAAGATAAAAACATTGTTCTTTCCAATGTCGCTTCACCATCTGATGTTTCTGCTGATGGTGCTGGTATTACGATTCTTGGTGCAACTAACAAAACACTTAACTGGGTTGACGCAACAGATGCCTGGACATCTTCTGAGCACTTAGATTTAGCTGCTGGAAAAGTTATAAAAATAGGAACATCTGAAGTATTATCAAATACTACTTTAGCTTCAAGTGTTGTTAACTCAAGCTTAACCTCAGTGGGCAATGTTACATCAGGAACCTGGAGTGCAGGGACAATAGCTATCAGTTATGGTGGTACTGGTGCAACAAGTGCGTCTGGTGCTAGAACCAATTTAGGTTTGGCTATAGGAACTGATGTTCAAGCCTATGATCCAGAGCTCGCAGCAATAGCTGGTCTTACATCAGCAGCTGACAAACTACCATATTTCACGGGAGCAAATACTGCAGATTTAGCTACCTTTACTACATTTGGTAGAAGTCTGGTAGACGACGCAGATGCTTCAGCAGCAAGAATAACTATCGGTGTTGGAACTATTGCAACACAAAATTCAAATAACGTTACAATTACAGGTGGATCTATTTCTAACTTGACGACATTCGATGGTATCACATTTGATGGTGGAACCTTCTAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

PDB ID: 169848

Method: ESMFold

Resolution: 0,7288

Evidence: 0,7548

Literature

No literature entries available.