Protein
- UniProt accession
- A0A6J5LHD3_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Phage tail collar domain containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,8980
- Protein sequence
-
MPINPDLLIAAAMLQDSLVDKDGTPMSAGIITCYQDNSRTTLKNWYYQSSNFADASGKYTFSPLPNPLTLSAAGTICDINGVDTIPFFYPYSEIDQTQAQPYYITIWNHDRTNQITRPNFPYNPEENNPDEEGSVNNYIINNVLWRNIGTVDLTNILQLTVAPSQHDGFRYPDIQFLKNVTGGQDTVTFTKFPLTSAPILKGDITPEYYINHTCSNSPTGETQKCYQFPISLHVNTLNGVQFTATIQAQNAGGISPGQNTINLFIFQDTGSGTSPPSPILIGSITLNSAWTKYEFTTVFPTTAGLNPSAGQDDALYLQVQMPLDINCSINFTKPSIYLTNESPTNSFETYDEVDAIINSPRTGDIRISINSFNPYGWVAMNNGSIGNGASSATARANADTFQLYNLFWNAFNQYSTGTSSSGSNAVCPMFLGSTSVGYGPAISTSAITDFNANKAIVLTESLGRVIQGTVPVSSLLPSESQPITASNSGGNLLITGTIPNFQTFTGESVQFSNTGGALPTGLASTGIYYAIPQSANTFLLATTYLNALAGTVIAFGGAGSGTNTASFIPLGSVIGEYAHAQLLNELFNHTHDPLTPGTNFWESVVSASPGFLITAGGSSNAINSSTTGNVTGEGTQQPFNVTQPSVFLNMFVKL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 654 AA molecular weight: 69969,82190 Da isoelectric point: 4,42056 aromaticity: 0,10398 hydropathy: -0,11820
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4127011.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796198
[NCBI]
CDS location
range 15802 -> 17766
strand +
strand +
CDS
ATGCCTATAAACCCAGATTTGTTAATTGCTGCAGCAATGCTCCAAGATAGCCTGGTAGACAAGGACGGCACCCCTATGTCTGCAGGTATCATCACATGTTATCAAGATAACAGCAGAACTACGCTTAAAAATTGGTACTATCAGTCATCAAATTTTGCAGATGCTAGCGGTAAATATACATTTTCTCCATTACCAAACCCACTGACTTTAAGTGCTGCGGGTACGATATGTGATATAAATGGTGTTGATACTATTCCATTCTTTTATCCTTATAGTGAAATCGATCAAACTCAAGCGCAACCTTATTACATTACTATCTGGAATCATGATAGAACCAACCAAATCACTAGACCAAACTTTCCTTATAATCCAGAAGAAAATAATCCTGATGAAGAAGGTTCTGTAAATAATTACATCATAAATAATGTATTATGGAGAAATATTGGGACTGTTGATTTAACAAATATTCTTCAACTTACAGTAGCCCCTAGTCAGCATGATGGTTTTAGATATCCTGATATACAATTCTTAAAAAATGTAACAGGAGGTCAAGATACAGTAACATTTACCAAATTCCCTCTGACCTCAGCGCCGATTCTTAAAGGCGACATTACACCAGAATATTATATCAATCATACATGCAGCAATAGTCCTACCGGTGAAACACAAAAATGTTATCAATTCCCTATATCATTACACGTTAATACGCTTAATGGTGTGCAATTTACAGCAACTATACAGGCACAAAATGCAGGTGGTATAAGTCCCGGTCAAAACACTATTAATTTATTTATATTCCAAGATACAGGAAGTGGAACAAGCCCTCCGTCACCGATATTAATTGGCTCGATTACTTTAAATAGTGCGTGGACTAAATATGAATTTACTACAGTTTTCCCGACTACAGCCGGATTAAATCCAAGTGCTGGGCAAGATGATGCGCTTTATTTGCAAGTACAAATGCCATTGGACATTAACTGCTCTATTAATTTTACAAAACCATCCATTTACCTGACGAATGAATCACCTACAAATAGTTTTGAAACATATGATGAAGTTGATGCGATTATAAATAGTCCAAGAACAGGTGATATACGAATCAGCATTAATTCATTTAATCCATACGGTTGGGTTGCAATGAATAATGGTTCTATAGGAAATGGTGCTTCATCGGCAACAGCACGGGCAAATGCAGATACATTTCAATTGTATAATTTATTTTGGAATGCTTTTAATCAATATTCTACGGGAACATCATCAAGTGGTTCTAATGCTGTGTGCCCGATGTTTTTAGGTTCTACATCAGTTGGATATGGGCCTGCAATATCAACTTCGGCTATTACTGATTTTAATGCGAATAAAGCGATTGTATTGACAGAAAGCTTAGGTCGCGTTATCCAAGGGACAGTGCCTGTCTCTTCATTATTGCCTAGTGAAAGTCAGCCTATCACGGCATCTAATAGTGGCGGTAACTTATTAATTACAGGAACAATACCTAATTTCCAAACATTTACTGGTGAATCAGTGCAATTTAGTAATACGGGTGGCGCTTTACCTACAGGTCTTGCCTCTACGGGGATTTATTATGCTATTCCGCAATCAGCCAACACATTTTTATTGGCCACTACTTATTTGAATGCCTTGGCTGGAACTGTTATAGCTTTTGGAGGCGCTGGTTCCGGAACAAATACGGCTAGCTTTATTCCTTTAGGAAGTGTTATTGGCGAATATGCGCATGCTCAATTATTAAATGAATTATTTAATCATACACATGATCCGTTGACACCAGGAACTAACTTTTGGGAAAGTGTAGTTTCAGCTTCCCCAGGATTTTTAATTACGGCGGGAGGAAGTAGTAATGCTATTAACTCTAGTACAACAGGTAATGTAACGGGCGAAGGCACACAACAACCATTTAATGTTACTCAGCCTTCAGTATTTTTAAATATGTTTGTGAAATTATAG
Genbank protein accession
CAB4132566.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796260
[NCBI]
CDS location
range 18939 -> 20903
strand -
strand -
CDS
ATGCCTATAAACCCAGATTTGTTAATTGCTGCAGCAATGCTCCAAGATAGCCTGGTAGACAAGGACGGCACCCCTATGTCTGCAGGTATCATCACATGTTATCAAGATAACAGCAGAACTACGCTTAAAAATTGGTACTATCAGTCATCAAATTTTGCAGATGCTAGCGGTAAATATACATTTTCTCCATTACCAAACCCACTGACTTTAAGTGCTGCGGGTACGATATGTGATATAAATGGTGTTGATACTATTCCATTCTTTTATCCTTATAGTGAAATCGATCAAACTCAAGCGCAACCTTATTACATTACTATCTGGAATCATGATAGAACCAACCAAATCACTAGACCAAACTTTCCTTATAATCCAGAAGAAAATAATCCTGATGAAGAAGGTTCTGTAAATAATTACATCATAAATAATGTATTATGGAGAAATATTGGGACTGTTGATTTAACAAATATTCTTCAACTTACAGTAGCCCCTAGTCAGCATGATGGTTTTAGATATCCTGATATACAATTCTTAAAAAATGTAACAGGAGGTCAAGATACAGTAACATTTACCAAATTCCCTCTGACCTCAGCGCCGATTCTTAAAGGCGACATTACACCAGAATATTATATCAATCATACATGCAGCAATAGTCCTACCGGTGAAACACAAAAATGTTATCAATTCCCTATATCATTACACGTTAATACGCTTAATGGTGTGCAATTTACAGCAACTATACAGGCACAAAATGCAGGTGGTATAAGTCCCGGTCAAAACACTATTAATTTATTTATATTCCAAGATACAGGAAGTGGAACAAGCCCTCCGTCACCGATATTAATTGGCTCGATTACTTTAAATAGTGCGTGGACTAAATATGAATTTACTACAGTTTTCCCGACTACAGCCGGATTAAATCCAAGTGCTGGGCAAGATGATGCGCTTTATTTGCAAGTACAAATGCCATTGGACATTAACTGCTCTATTAATTTTACAAAACCATCCATTTACCTGACGAATGAATCACCTACAAATAGTTTTGAAACATATGATGAAGTTGATGCGATTATAAATAGTCCAAGAACAGGTGATATACGAATCAGCATTAATTCATTTAATCCATACGGTTGGGTTGCAATGAATAATGGTTCTATAGGAAATGGTGCTTCATCGGCAACAGCACGGGCAAATGCAGATACATTTCAATTGTATAATTTATTTTGGAATGCTTTTAATCAATATTCTACGGGAACATCATCAAGTGGTTCTAATGCTGTGTGCCCGATGTTTTTAGGTTCTACATCAGTTGGATATGGGCCTGCAATATCAACTTCGGCTATTACTGATTTTAATGCGAATAAAGCGATTGTATTGACAGAAAGCTTAGGTCGCGTTATCCAAGGGACAGTGCCTGTCTCTTCATTATTGCCTAGTGAAAGTCAGCCTATCACGGCATCTAATAGTGGCGGTAACTTATTAATTACAGGAACAATACCTAATTTCCAAACATTTACTGGTGAATCAGTGCAATTTAGTAATACGGGTGGCGCTTTACCTACAGGTCTTGCCTCTACGGGGATTTATTATGCTATTCCGCAATCAGCCAACACATTTTTATTGGCCACTACTTATTTGAATGCCTTGGCTGGAACTGTTATAGCTTTTGGAGGCGCTGGTTCCGGAACAAATACGGCTAGCTTTATTCCTTTAGGAAGTGTTATTGGCGAATATGCGCATGCTCAATTATTAAATGAATTATTTAATCATACACATGATCCGTTGACACCAGGAACTAACTTTTGGGAAAGTGTAGTTTCAGCTTCCCCAGGATTTTTAATTACGGCGGGAGGAAGTAGTAATGCTATTAACTCTAGTACAACAGGTAATGTAACGGGCGAAGGCACACAACAACCATTTAATGTTACTCAGCCTTCAGTATTTTTAAATATGTTTGTGAAATTATAG
Genbank protein accession
CAB4202399.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR797327
[NCBI]
CDS location
range 6492 -> 8456
strand +
strand +
CDS
ATGCCTATAAACCCAGATTTGTTAATTGCTGCAGCAATGCTCCAAGATAGCCTGGTAGACAAGGACGGCACCCCTATGTCTGCAGGTATCATCACATGTTATCAAGATAACAGCAGAACTACGCTTAAAAATTGGTACTATCAGTCATCAAATTTTGCAGATGCTAGCGGTAAATATACATTTTCTCCATTACCAAACCCACTGACTTTAAGTGCTGCGGGTACGATATGTGATATAAATGGTGTTGATACTATTCCATTCTTTTATCCTTATAGTGAAATCGATCAAACTCAAGCGCAACCTTATTACATTACTATCTGGAATCATGATAGAACCAACCAAATCACTAGACCAAACTTTCCTTATAATCCAGAAGAAAATAATCCTGATGAAGAAGGTTCTGTAAATAATTACATCATAAATAATGTATTATGGAGAAATATTGGGACTGTTGATTTAACAAATATTCTTCAACTTACAGTAGCCCCTAGTCAGCATGATGGTTTTAGATATCCTGATATACAATTCTTAAAAAATGTAACAGGAGGTCAAGATACAGTAACATTTACCAAATTCCCTCTGACCTCAGCGCCGATTCTTAAAGGCGACATTACACCAGAATATTATATCAATCATACATGCAGCAATAGTCCTACCGGTGAAACACAAAAATGTTATCAATTCCCTATATCATTACACGTTAATACGCTTAATGGTGTGCAATTTACAGCAACTATACAGGCACAAAATGCAGGTGGTATAAGTCCCGGTCAAAACACTATTAATTTATTTATATTCCAAGATACAGGAAGTGGAACAAGCCCTCCGTCACCGATATTAATTGGCTCGATTACTTTAAATAGTGCGTGGACTAAATATGAATTTACTACAGTTTTCCCGACTACAGCCGGATTAAATCCAAGTGCTGGGCAAGATGATGCGCTTTATTTGCAAGTACAAATGCCATTGGACATTAACTGCTCTATTAATTTTACAAAACCATCCATTTACCTGACGAATGAATCACCTACAAATAGTTTTGAAACATATGATGAAGTTGATGCGATTATAAATAGTCCAAGAACAGGTGATATACGAATCAGCATTAATTCATTTAATCCATACGGTTGGGTTGCAATGAATAATGGTTCTATAGGAAATGGTGCTTCATCGGCAACAGCACGGGCAAATGCAGATACATTTCAATTGTATAATTTATTTTGGAATGCTTTTAATCAATATTCTACGGGAACATCATCAAGTGGTTCTAATGCTGTGTGCCCGATGTTTTTAGGTTCTACATCAGTTGGATATGGGCCTGCAATATCAACTTCGGCTATTACTGATTTTAATGCGAATAAAGCGATTGTATTGACAGAAAGCTTAGGTCGCGTTATCCAAGGGACAGTGCCTGTCTCTTCATTATTGCCTAGTGAAAGTCAGCCTATCACGGCATCTAATAGTGGCGGTAACTTATTAATTACAGGAACAATACCTAATTTCCAAACATTTACTGGTGAATCAGTGCAATTTAGTAATACGGGTGGCGCTTTACCTACAGGTCTTGCCTCTACGGGGATTTATTATGCTATTCCGCAATCAGCCAACACATTTTTATTGGCCACTACTTATTTGAATGCCTTGGCTGGAACTGTTATAGCTTTTGGAGGCGCTGGTTCCGGAACAAATACGGCTAGCTTTATTCCTTTAGGAAGTGTTATTGGCGAATATGCGCATGCTCAATTATTAAATGAATTATTTAATCATACACATGATCCGTTGACACCAGGAACTAACTTTTGGGAAAGTGTAGTTTCAGCTTCCCCAGGATTTTTAATTACGGCGGGAGGAAGTAGTAATGCTATTAACTCTAGTACAACAGGTAATGTAACGGGCGAAGGCACACAACAACCATTTAATGTTACTCAGCCTTCAGTATTTTTAAATATGTTTGTGAAATTATAG
Genbank protein accession
CAB5207255.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR798228
[NCBI]
CDS location
range 23548 -> 25512
strand +
strand +
CDS
ATGCCTATAAACCCAGATTTGTTAATTGCTGCAGCAATGCTCCAAGATAGCCTGGTAGACAAGGACGGCACCCCTATGTCTGCAGGTATCATCACATGTTATCAAGATAACAGCAGAACTACGCTTAAAAATTGGTACTATCAGTCATCAAATTTTGCAGATGCTAGCGGTAAATATACATTTTCTCCATTACCAAACCCACTGACTTTAAGTGCTGCGGGTACGATATGTGATATAAATGGTGTTGATACTATTCCATTCTTTTATCCTTATAGTGAAATCGATCAAACTCAAGCGCAACCTTATTACATTACTATCTGGAATCATGATAGAACCAACCAAATCACTAGACCAAACTTTCCTTATAATCCAGAAGAAAATAATCCTGATGAAGAAGGTTCTGTAAATAATTACATCATAAATAATGTATTATGGAGAAATATTGGGACTGTTGATTTAACAAATATTCTTCAACTTACAGTAGCCCCTAGTCAGCATGATGGTTTTAGATATCCTGATATACAATTCTTAAAAAATGTAACAGGAGGTCAAGATACAGTAACATTTACCAAATTCCCTCTGACCTCAGCGCCGATTCTTAAAGGCGACATTACACCAGAATATTATATCAATCATACATGCAGCAATAGTCCTACCGGTGAAACACAAAAATGTTATCAATTCCCTATATCATTACACGTTAATACGCTTAATGGTGTGCAATTTACAGCAACTATACAGGCACAAAATGCAGGTGGTATAAGTCCCGGTCAAAACACTATTAATTTATTTATATTCCAAGATACAGGAAGTGGAACAAGCCCTCCGTCACCGATATTAATTGGCTCGATTACTTTAAATAGTGCGTGGACTAAATATGAATTTACTACAGTTTTCCCGACTACAGCCGGATTAAATCCAAGTGCTGGGCAAGATGATGCGCTTTATTTGCAAGTACAAATGCCATTGGACATTAACTGCTCTATTAATTTTACAAAACCATCCATTTACCTGACGAATGAATCACCTACAAATAGTTTTGAAACATATGATGAAGTTGATGCGATTATAAATAGTCCAAGAACAGGTGATATACGAATCAGCATTAATTCATTTAATCCATACGGTTGGGTTGCAATGAATAATGGTTCTATAGGAAATGGTGCTTCATCGGCAACAGCACGGGCAAATGCAGATACATTTCAATTGTATAATTTATTTTGGAATGCTTTTAATCAATATTCTACGGGAACATCATCAAGTGGTTCTAATGCTGTGTGCCCGATGTTTTTAGGTTCTACATCAGTTGGATATGGGCCTGCAATATCAACTTCGGCTATTACTGATTTTAATGCGAATAAAGCGATTGTATTGACAGAAAGCTTAGGTCGCGTTATCCAAGGGACAGTGCCTGTCTCTTCATTATTGCCTAGTGAAAGTCAGCCTATCACGGCATCTAATAGTGGCGGTAACTTATTAATTACAGGAACAATACCTAATTTCCAAACATTTACTGGTGAATCAGTGCAATTTAGTAATACGGGTGGCGCTTTACCTACAGGTCTTGCCTCTACGGGGATTTATTATGCTATTCCGCAATCAGCCAACACATTTTTATTGGCCACTACTTATTTGAATGCCTTGGCTGGAACTGTTATAGCTTTTGGAGGCGCTGGTTCCGGAACAAATACGGCTAGCTTTATTCCTTTAGGAAGTGTTATTGGCGAATATGCGCATGCTCAATTATTAAATGAATTATTTAATCATACACATGATCCGTTGACACCAGGAACTAACTTTTGGGAAAGTGTAGTTTCAGCTTCCCCAGGATTTTTAATTACGGCGGGAGGAAGTAGTAATGCTATTAACTCTAGTACAACAGGTAATGTAACGGGCGAAGGCACACAACAACCATTTAATGTTACTCAGCCTTCAGTATTTTTAAATATGTTTGTGAAATTATAG
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID: 169608
Method: ESMFold
Resolution: 0,6404
Evidence: 0,6778
Literature
No literature entries available.