Protein
- UniProt accession
- A0A6J5KW69_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Major tropism determinant N-terminal domain-containing protein
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9170
- Protein sequence
-
MSIQKLRSGRVPTATASTYIGEGGTIFWNSTTGEFRLSDGVTPGGSRVGFPVASLTEIGGIKLGPGVTLNGQDQLVVDPTGLDFAFGDFYAFTNPGASDGACLSSVNANQDINIVSNGTGNVNVIGEFNVHATDGVLETALSAPPIFKVTGDGQVTMLVPKADQAGGALEIVGNDTGLYLPPDQTGVILHITGNSGLSSRSYFDANANYTLLAGRRYNGTQLNPTKVLNGEVIFRIAGQAATQATTEPAIFQAFGPARIEWVATQDQQPNKQGGEISIYATANDTAASASVKVATFNATTGLTATKFNGPLTGNVTGKADTAGNADTVTNGVYTNGSYANPAWITSLAKSKVGLGSVENTALSTSTFYLGTTQITYNRASAAQTLAGVSVSGNAGTVTNGVYTTDTGTVTNTMLAGSIANNKLANSTIQVNGVTLTLGDTAKTITAAAGTLTGTELNSTVVTSSLTALGGMSTIKAGTISAAFNVPKNTPIATQTFTVSGLTTSHKIIITSNTAMPDSTYFIPAAWVSATNTVSIQIAHTGGGAFTTTFDISYFAWV
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 557 AA molecular weight: 56902,58840 Da isoelectric point: 5,15435 aromaticity: 0,07361 hydropathy: 0,05404
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4125296.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796187
[NCBI]
CDS location
range 62443 -> 64116
strand -
strand -
CDS
ATGTCAATTCAAAAGTTAAGATCAGGCCGTGTTCCAACAGCCACTGCATCGACTTATATCGGTGAAGGGGGCACTATATTTTGGAATTCAACCACCGGTGAGTTTAGACTAAGCGACGGTGTTACTCCGGGCGGTAGTCGTGTTGGATTTCCCGTAGCATCACTTACTGAGATTGGTGGTATCAAGTTAGGACCAGGCGTCACACTTAACGGACAAGATCAACTAGTTGTTGATCCAACCGGGCTCGACTTTGCCTTTGGTGATTTCTACGCATTTACAAATCCCGGAGCAAGCGACGGTGCTTGCCTAAGTTCGGTTAATGCCAACCAAGATATTAATATTGTATCTAACGGTACTGGTAATGTAAATGTTATTGGTGAGTTTAATGTCCACGCTACAGATGGGGTTTTAGAAACTGCCCTGTCTGCTCCTCCTATATTTAAGGTAACTGGTGACGGGCAAGTTACTATGCTTGTGCCTAAAGCTGACCAAGCTGGCGGAGCATTAGAGATTGTAGGTAACGATACTGGCTTATATTTGCCGCCGGATCAAACAGGTGTTATTCTACACATTACTGGCAACAGCGGTCTATCATCAAGAAGTTACTTTGATGCCAATGCTAACTACACCTTACTAGCAGGCCGCAGATACAACGGCACACAACTCAATCCAACAAAAGTTCTAAACGGTGAAGTTATTTTCCGCATCGCCGGACAGGCCGCTACACAGGCTACAACAGAGCCTGCTATATTTCAAGCATTTGGACCAGCACGTATTGAATGGGTAGCAACACAGGATCAACAGCCTAACAAGCAAGGTGGCGAGATCAGCATCTATGCCACAGCAAATGACACAGCCGCTAGTGCCTCAGTTAAGGTAGCAACATTCAATGCTACTACTGGCCTAACAGCTACTAAGTTTAACGGCCCATTAACTGGTAATGTCACTGGTAAAGCTGATACAGCAGGCAATGCTGACACAGTGACTAATGGTGTTTACACTAACGGCAGTTATGCTAACCCAGCGTGGATTACTTCGTTAGCAAAGTCTAAAGTAGGTTTAGGTAGCGTAGAAAACACAGCCTTATCAACAAGTACATTCTATCTAGGCACTACACAGATAACCTATAACCGAGCAAGTGCCGCACAGACTCTAGCAGGAGTAAGTGTAAGTGGTAACGCTGGAACTGTAACTAACGGTGTTTATACTACTGACACAGGTACTGTAACTAACACTATGCTTGCTGGCAGTATTGCCAACAACAAGTTGGCCAATAGCACAATACAAGTCAACGGTGTGACCTTAACTCTAGGTGATACTGCTAAGACTATTACAGCGGCCGCTGGAACACTGACTGGCACAGAATTAAACTCTACAGTAGTCACAAGTAGTCTAACAGCACTAGGTGGTATGAGTACTATTAAAGCTGGAACAATATCAGCCGCATTTAATGTTCCTAAAAATACACCGATCGCTACTCAAACCTTTACAGTCTCTGGACTAACTACTAGCCATAAAATCATTATTACATCTAATACAGCAATGCCCGATTCTACCTATTTTATCCCGGCAGCGTGGGTTAGTGCTACTAATACTGTTAGTATTCAAATTGCACATACCGGTGGAGGAGCATTTACTACTACATTTGACATCAGCTACTTTGCTTGGGTATAA
Genbank protein accession
CAB5208567.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR798231
[NCBI]
CDS location
range 38974 -> 40647
strand +
strand +
CDS
ATGTCAATTCAAAAGTTAAGATCAGGCCGTGTTCCAACAGCCACTGCATCGACTTATATCGGTGAAGGGGGCACTATATTTTGGAATTCAACCACCGGTGAGTTTAGACTAAGCGACGGTGTTACTCCGGGCGGTAGTCGTGTTGGATTTCCCGTAGCATCACTTACTGAGATTGGTGGTATCAAGTTAGGACCAGGCGTCACACTTAACGGACAAGATCAACTAGTTGTTGATCCAACCGGGCTCGACTTTGCCTTTGGTGATTTCTACGCATTTACAAATCCCGGAGCAAGCGACGGTGCTTGCCTAAGTTCGGTTAATGCCAACCAAGATATTAATATTGTATCTAACGGTACTGGTAATGTAAATGTTATTGGTGAGTTTAATGTCCACGCTACAGATGGGGTTTTAGAAACTGCCCTGTCTGCTCCTCCTATATTTAAGGTAACTGGTGACGGGCAAGTTACTATGCTTGTGCCTAAAGCTGACCAAGCTGGCGGAGCATTAGAGATTGTAGGTAACGATACTGGCTTATATTTGCCGCCGGATCAAACAGGTGTTATTCTACACATTACTGGCAACAGCGGTCTATCATCAAGAAGTTACTTTGATGCCAATGCTAACTACACCTTACTAGCAGGCCGCAGATACAACGGCACACAACTCAATCCAACAAAAGTTCTAAACGGTGAAGTTATTTTCCGCATCGCCGGACAGGCCGCTACACAGGCTACAACAGAGCCTGCTATATTTCAAGCATTTGGACCAGCACGTATTGAATGGGTAGCAACACAGGATCAACAGCCTAACAAGCAAGGTGGCGAGATCAGCATCTATGCCACAGCAAATGACACAGCCGCTAGTGCCTCAGTTAAGGTAGCAACATTCAATGCTACTACTGGCCTAACAGCTACTAAGTTTAACGGCCCATTAACTGGTAATGTCACTGGTAAAGCTGATACAGCAGGCAATGCTGACACAGTGACTAATGGTGTTTACACTAACGGCAGTTATGCTAACCCAGCGTGGATTACTTCGTTAGCAAAGTCTAAAGTAGGTTTAGGTAGCGTAGAAAACACAGCCTTATCAACAAGTACATTCTATCTAGGCACTACACAGATAACCTATAACCGAGCAAGTGCCGCACAGACTCTAGCAGGAGTAAGTGTAAGTGGTAACGCTGGAACTGTAACTAACGGTGTTTATACTACTGACACAGGTACTGTAACTAACACTATGCTTGCTGGCAGTATTGCCAACAACAAGTTGGCCAATAGCACAATACAAGTCAACGGTGTGACCTTAACTCTAGGTGATACTGCTAAGACTATTACAGCGGCCGCTGGAACACTGACTGGCACAGAATTAAACTCTACAGTAGTCACAAGTAGTCTAACAGCACTAGGTGGTATGAGTACTATTAAAGCTGGAACAATATCAGCCGCATTTAATGTTCCTAAAAATACACCGATCGCTACTCAAACCTTTACAGTCTCTGGACTAACTACTAGCCATAAAATCATTATTACATCTAATACAGCAATGCCCGATTCTACCTATTTTATCCCGGCAGCGTGGGTTAGTGCTACTAATACTGTTAGTATTCAAATTGCACATACCGGTGGAGGAGCATTTACTACTACATTTGACATCAGCTACTTTGCTTGGGTATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
PDB ID: 169420
Method: ESMFold
Resolution: 0,6056
Evidence: 0,5877
Literature
No literature entries available.