Protein
View in Explore- Genbank accession
- XHB27214.1 [GenBank]
- Protein name
- tail fiber protein
- RBP type
-
TFTF
- Protein sequence
-
MAKKVTLPKGQTGATGTTLGQAGNILDLSDIDDIFGDTPKAKKGSPVTEFFNGIKQGLFDSVKPQQALKAFMRSAAPDGFSRMFGVYEDTMSTIRDVKDSVERTSASDLLFLTREAQDLAVKLKDKVPASVFDRLNNRLESQIENYKYAEDSNRNYKEIRRRMEAERDEDELKSAIDQVTLVQRDLAIKAEQGEVKRFAIGQAERGIRDKVSADRFDWMAKAMGQTVDNLSKLASYNEQVNYSIQKKGLEIQFRSMLHLRKIAQQTEATMELLNNGFAALVRNTGIPDHKKSSMKDLVGFNAAQRVSNSFVDNAIQTLPNFLGNFGSAVTNNATRFANENIRNFADAARAGSMFGADAWENRYNIAGQFAGSYLGDWTRNSVIPVLGRMVRPGVERFSNNYLGGRHNQASYLLDNFPAWTQEYMNNYQNTYGARGILRDIMAPFVPQFTLQDRLKTGSYQTIGQDSGFNQLTQRTIVEAIPGYLSRLLQETRMIRTGRDDITREVFDLSTGSFMSVEDSAANTERRLVSRSTVRGVSGALTDVLEAFDPNKELSIDARKALTERLIRDANMNKRFDPEAYARAGGYDRSKVSGEAIKELTEYIKRQYNIGADGRMASTNENFARRQEISTLFLDVRNFSRDPIKEIERLTNAGKTDQLREMGIIITEQGIDRINYPRIWELMSSEVKYGGWGNDNPFDRYSNTPPSDDGGPGQLSPLGDQNNPHFIGPMYQSQTERKMRQAQEQVIRASKLAQEQANKGYDYAQQKVSLATDYVRDNVPNQFSELRRNINIPASMNFGDLRDQLYGQAGDMYSRAVNYSNQFNGYSDIVNQSIADLYTKANTFTPVIKGMDFLNGNLIDINTGKIVEKISDITGEIKNQAGITVVTAQEVATGLYNQRGDLLTKATDIASQLRDKAAQIAGDARERLTQGLDNVSDMAKDWYLPGREEAVILGRDLLAGEYIDTATNQIITNLKDAKGTIINRAGDVVVTAQELAKGLIRSDGFNLRRNVADASNWIQRNVLGGGSTTQKIFNAMGTVANKAKDFTLGLGRDILSNRDAYLPGMLKPVLQKVKLKAGEYYTAGGNLLKSFDEINGPVLDRDGNIVVDEEQIPELINSDGSKHTAAKSKGLFRTGLGNLARGYANMSMRYWKWLGKKSVDTAKGMAGLGYKLLGSPFKKRFSAFTGKVETQIDKKALDTTTDQLLAGIWEELRNQKPDANKPRRGSWQDLTSRVSDTLNGKNNGDVETTESKGLFGKLGDTLKNIFGKKKGDEEDEGLLEDLGLGGKKGGKWAAARQILGRGALAIGGGALSTAAAYASFGGTGASTNDKLAGAAIVTSNPIMWALKDFLIKPVLGWRGSQKYKDDLISYRMMQYGATTTDQMNKVTELEQLVSSVATRGGDASFDVRALNARDIIKIFGYGTDDGPAIMRLANWIDFRFKPIFEAWLKGLSKINRSDVDISEVDSKVPNELKGQLIRSVSFPYEGNTPYLVLNNPFGEEDLSIDVASIQKKEKELLAKYSSTEKTSVTPKATSSSFKESATNVINDTITTIKSKSTDITNWFRDSAIGKAVKAVSPVESIRKMVTTVVDTIIPKANASDSLTSLQALRVHAYGMQGLDLAAVNGLLSIESLVNDKMRVANGKATYTGDIEELIKWTGQAFGMVTTSDGPDRVKVVDWLYRRFLPVFKAFIVTARSVSTSITLSQIETLTATQRLQIANAIMGATDDEGVSIWKAPSIFNIVGDMDSVEDLAKISLDEIKKEAETEVAEAPGKSKSAQIAGKNDAASGRSFASRIIDNVKSTFNSATTKVTNWMENTSARVSQVIGRAQEGITDTYYTAKYKLGAGGELTPTGQTYGQLATGNGGVWENIPMPQSNKSRDAAQATFKAVSEMTGVPVELLNIFCGIESSFNYNAKAPTSSAAGWFQFIKSTWKGMLAKYGAKFGIPADDENGSLRFDPRINALMGAMFLRDNYEYLENALGRAPTDVDLYLAHFMGPAGARKFLTRDQNSIGAEIFPDQARANRSIFFKTDGSARTLGEIYQVMENKVAKFRTGGGKNANSQSLGKPKSTEELMNDAATAKQKDMATDKELIGGAADTSMTDSSNNKIGLGKIMSGMASPLRTNAPSMMLPGAPSSAADVSSGQQPVVDTGAATQATVRASQIEEQRKVVTSQDKAMLDIASEQLSVLKQFHADMLNYIKNKAANPSAQTGQEQANTIAPSQRPGRVVDNRPLPIRLR
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 2237 AA molecular weight: 245478,79430 Da isoelectric point: 8,86610 aromaticity: 0,07599 hydropathy: -0,45758
Domains
Domains [InterPro]
DC_0124
STR
1–899
STR
1–899
Coil
Unmapped
149–173
Unmapped
149–173
IPR023346
STR
1883–2015
STR
1883–2015
IPR008258
ENZ
1885–1978
ENZ
1885–1978
1
2237
Architecture
STR 1-2218 |
Legend:
ATT
STR
RBD
CBM
LEC
ENZ
CHP
LNK
TAS
TTP
UNK
Unmapped
Taxonomy
| Name | Taxonomy ID | Lineage | |
|---|---|---|---|
| Phage |
Pseudomonas phage phi9_PA9 [NCBI] |
3289869 | Viruses > unclassified bacterial viruses > |
| Host |
Pseudomonas aeruginosa PAO1 [NCBI] |
208964 | Bacteria > Proteobacteria > Gammaproteobacteria > Pseudomonadales > Pseudomonadaceae > Pseudomonas |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XHB27214.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ093904.1
[NCBI]
CDS location
range 63423 -> 70136
strand +
strand +
CDS
ATGGCCAAGAAGGTAACATTGCCCAAAGGTCAAACTGGTGCAACCGGTACAACATTAGGGCAAGCTGGTAATATTCTTGACTTAAGTGATATCGATGATATTTTTGGTGATACACCGAAAGCTAAAAAGGGATCACCTGTCACTGAATTTTTTAATGGTATTAAACAAGGACTCTTTGACTCTGTTAAACCACAACAAGCTTTAAAAGCATTCATGCGGTCAGCGGCACCAGATGGCTTTTCACGTATGTTCGGTGTATATGAAGATACGATGTCAACTATCCGGGATGTCAAAGATTCTGTAGAACGTACGAGTGCTAGTGATTTACTCTTTTTAACAAGAGAAGCACAAGATTTAGCAGTTAAGTTAAAAGATAAAGTCCCAGCTTCTGTTTTTGACAGACTTAATAATCGATTAGAAAGTCAAATCGAAAACTATAAGTACGCTGAAGATTCAAATAGAAATTATAAAGAAATCCGCCGTCGCATGGAAGCTGAACGTGACGAGGATGAACTTAAATCTGCTATAGATCAAGTAACTCTTGTTCAACGGGATTTAGCTATAAAAGCTGAACAAGGTGAAGTTAAACGATTCGCTATTGGACAAGCTGAACGTGGAATACGTGATAAGGTATCAGCTGATAGATTTGACTGGATGGCTAAGGCCATGGGTCAAACAGTTGATAATTTATCTAAATTAGCTAGTTATAATGAACAAGTTAATTACAGTATTCAAAAGAAAGGATTAGAAATCCAGTTTCGCTCTATGCTGCATCTTCGGAAAATTGCACAGCAAACCGAAGCTACCATGGAATTATTAAATAATGGTTTTGCAGCACTTGTTAGAAACACAGGGATTCCAGATCATAAAAAGTCATCAATGAAGGATCTTGTTGGCTTTAATGCAGCTCAACGGGTATCGAATAGTTTTGTTGACAACGCTATTCAAACATTACCAAATTTCTTAGGTAATTTTGGATCAGCCGTAACTAATAATGCTACTCGCTTTGCAAATGAAAATATCCGTAACTTTGCTGATGCAGCTCGTGCTGGAAGCATGTTTGGCGCAGATGCATGGGAGAATAGATACAATATAGCCGGTCAATTCGCTGGCTCTTATCTTGGTGATTGGACAAGGAATTCAGTTATACCTGTATTAGGTAGAATGGTTCGTCCTGGTGTGGAACGTTTTTCAAATAACTATCTAGGCGGTCGACATAATCAAGCATCTTATTTACTTGATAACTTCCCTGCCTGGACACAAGAATACATGAATAACTACCAAAACACTTATGGTGCTCGTGGTATTCTTCGTGACATTATGGCTCCATTTGTTCCACAGTTCACATTACAAGATCGATTAAAGACTGGCTCCTATCAAACAATTGGTCAGGACAGTGGCTTTAATCAACTAACACAACGTACTATAGTTGAAGCTATTCCTGGATATCTATCTAGGTTACTACAAGAAACAAGAATGATCCGGACTGGTCGTGATGATATTACACGTGAAGTGTTTGATCTCTCAACTGGTTCATTCATGTCTGTAGAGGATTCAGCTGCAAACACAGAACGTCGTCTAGTTAGTCGTTCTACTGTACGAGGTGTGAGCGGTGCTCTTACCGATGTTCTTGAAGCATTTGACCCAAATAAAGAACTATCAATAGATGCTAGGAAAGCGCTAACTGAACGTTTAATTCGTGATGCCAATATGAATAAACGTTTTGACCCCGAAGCATATGCTCGTGCTGGTGGGTATGATCGTTCTAAAGTGTCCGGTGAGGCGATTAAAGAATTAACCGAATATATTAAACGGCAATACAACATTGGTGCTGATGGTAGGATGGCGAGCACTAATGAAAACTTTGCTAGGCGTCAAGAAATATCTACATTATTCTTAGACGTTAGAAACTTCTCACGTGATCCTATTAAAGAAATTGAGCGTTTAACCAATGCTGGTAAAACTGATCAATTACGTGAAATGGGTATTATCATAACTGAGCAGGGCATTGATCGTATTAATTATCCACGTATTTGGGAACTGATGAGTTCAGAAGTAAAATACGGAGGATGGGGTAATGATAATCCATTTGATCGTTATAGTAATACACCACCTTCTGATGATGGTGGTCCAGGGCAACTCTCCCCACTAGGCGATCAGAATAACCCGCACTTTATTGGCCCAATGTATCAGTCACAAACTGAACGAAAAATGCGGCAAGCTCAAGAGCAAGTTATTCGTGCTTCTAAGCTGGCCCAAGAACAAGCTAATAAAGGGTATGATTATGCGCAGCAAAAAGTATCACTAGCTACGGATTATGTAAGGGATAATGTACCTAATCAATTTAGTGAATTACGCAGGAATATAAACATACCAGCGTCAATGAACTTTGGTGATTTAAGAGATCAACTGTACGGTCAAGCCGGCGATATGTATAGTCGGGCTGTTAACTATAGTAATCAGTTCAATGGATATTCTGATATAGTCAATCAGTCAATAGCTGATCTATATACCAAAGCTAATACTTTTACTCCAGTTATCAAAGGAATGGATTTTTTAAATGGAAATTTAATTGATATTAATACTGGTAAGATAGTAGAGAAAATATCTGATATCACTGGTGAAATTAAAAACCAAGCTGGTATAACTGTAGTAACCGCTCAAGAAGTAGCTACTGGTCTTTATAATCAACGTGGTGATTTATTAACCAAGGCAACTGATATTGCTAGTCAATTACGTGATAAAGCGGCACAGATCGCTGGTGATGCTAGAGAACGGTTAACTCAAGGTTTAGATAATGTTTCTGATATGGCTAAAGATTGGTATTTACCTGGTCGTGAAGAAGCCGTTATTCTTGGACGTGATCTACTAGCCGGTGAGTATATCGATACAGCAACTAATCAAATTATAACCAATTTGAAAGATGCTAAGGGTACTATTATTAATAGGGCTGGTGATGTAGTCGTAACCGCTCAAGAACTGGCTAAAGGTTTAATACGATCAGATGGTTTCAATCTACGAAGGAATGTAGCAGATGCATCTAACTGGATACAACGAAATGTACTAGGTGGTGGATCAACTACTCAGAAAATCTTTAATGCAATGGGTACAGTTGCTAATAAAGCAAAAGACTTTACTCTTGGATTAGGTAGGGATATTCTAAGTAATCGAGATGCATATTTACCTGGTATGTTAAAACCAGTATTACAGAAAGTTAAACTAAAAGCAGGTGAGTACTACACAGCTGGTGGCAACCTATTAAAATCATTCGATGAAATTAATGGACCAGTTTTAGATAGGGATGGTAACATCGTTGTTGATGAGGAACAAATACCTGAACTTATTAACTCTGATGGATCTAAGCATACTGCTGCTAAGAGTAAGGGTTTATTCCGAACTGGCTTAGGTAATCTGGCCCGTGGTTATGCTAATATGTCAATGCGTTATTGGAAGTGGCTGGGTAAGAAATCTGTAGATACTGCTAAAGGAATGGCGGGTTTAGGATATAAATTACTTGGATCACCTTTCAAGAAACGTTTCAGTGCATTTACTGGTAAAGTAGAAACACAGATAGATAAGAAAGCTCTAGATACCACTACTGATCAATTATTAGCAGGTATATGGGAAGAACTACGTAATCAGAAACCAGATGCTAATAAACCTCGCCGTGGTTCCTGGCAAGATCTAACATCACGTGTTAGTGATACTTTAAATGGTAAAAATAACGGTGATGTAGAAACCACTGAATCAAAAGGTCTTTTTGGTAAACTTGGTGATACCTTAAAGAATATCTTTGGTAAGAAGAAAGGCGATGAGGAAGATGAAGGATTATTGGAAGACCTAGGTCTTGGTGGTAAGAAAGGTGGGAAATGGGCTGCTGCTCGCCAAATACTTGGCAGAGGTGCTTTAGCTATTGGTGGTGGAGCATTATCAACAGCTGCTGCATATGCTAGTTTTGGTGGCACTGGTGCATCAACAAATGATAAACTAGCTGGTGCAGCTATTGTAACTAGTAACCCGATTATGTGGGCACTTAAAGATTTCTTAATAAAACCTGTATTAGGTTGGAGAGGAAGTCAGAAATACAAAGATGACTTAATCAGTTATCGAATGATGCAGTATGGTGCCACAACAACTGATCAGATGAACAAGGTTACTGAATTAGAACAACTTGTATCTAGCGTAGCTACACGTGGTGGAGATGCATCCTTTGATGTAAGGGCTCTTAATGCACGTGACATTATTAAGATATTTGGATATGGTACCGATGATGGCCCAGCTATCATGCGTTTAGCCAATTGGATTGACTTCAGGTTTAAACCGATCTTTGAGGCATGGCTTAAAGGCCTATCCAAAATTAATCGTAGTGATGTAGACATCAGTGAGGTTGATAGTAAAGTACCTAATGAACTAAAAGGACAACTCATTAGATCAGTATCATTCCCATACGAAGGTAATACACCTTATCTAGTTCTTAATAACCCATTTGGTGAAGAGGACTTATCAATTGATGTGGCTTCTATTCAGAAGAAAGAAAAGGAATTATTAGCTAAGTATAGTTCCACAGAGAAAACATCTGTCACACCTAAAGCAACTTCCAGTAGTTTTAAGGAAAGTGCTACTAATGTAATAAATGATACTATTACTACGATTAAGTCTAAGTCAACTGATATTACTAATTGGTTTAGGGATTCAGCTATTGGGAAAGCAGTTAAAGCTGTTAGTCCAGTTGAGTCTATACGTAAAATGGTAACTACAGTAGTAGACACAATTATTCCTAAAGCAAATGCAAGTGATTCATTAACATCACTGCAAGCACTACGTGTACATGCTTATGGGATGCAAGGTTTAGACTTAGCTGCTGTAAATGGATTATTATCAATTGAAAGTCTTGTTAATGATAAAATGCGAGTAGCTAATGGTAAAGCTACTTATACAGGTGACATAGAGGAATTAATTAAGTGGACTGGCCAAGCATTTGGTATGGTTACAACTAGCGA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Genome Context
Genome Context
Tertiary structure
PDB ID
036a6bfca56ab7430cf425902a19ef921f453c1aae87c1acc9004fd0c74b6b00
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50
pLDDT < 50