Protein
- UniProt accession
- A0A6J5KP70_9CAUD [UniProt]
- Protein name
- Collagen triple helix repeat
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9346
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,9470
- Protein sequence
-
MSNTIIQIKRSANQNTPNTLAWGELAYSFVANTLYIGDQANVPVPVGATSAMANLAYGAANSAANTVRVSQNGISTLSAQQLNFVNTSTILITVTPGSGAAAGNANISFDITSPTQGTTGTQGIQGVQGTRGIQGFDGVKGESGGESYEYLFNQDYSLITDPGTGHLSFDAYPILQATYLQINYNDANGQNVYNMLQAIDDSTSGVKGTFKVYNRANTLEYGFYVITGNHFHNGEPFFQVPVDGLDATVDNFSADADLIITFVRTGDIGDTGAQGTQGDVGIQGAQGTLGVQGSSGYVGADGMQGATGSGAQGTQGLAGIQGLFGVQGAFGTQGAQGIQGQIGIQGLGGIQGSFGVQGSLGNQGTTGAQGVVGSQGLSGTQGSLGTQGSIGLQGTIGAQGLAGIQGSLGTQGTIGSQGTIGSQGTIGAQGLNGTQGAFGTQGTLGSQGTIGAQGLVGTQGTLGTKGDTGSFGGASFDYTFLTNTANTDPASGNTKFNNTTLISSTELYIDYNDRFGANVFNYLQTIDDSTSTIKGSFKVANTANVNEFAYFSITGLHWHDTSGSPTSSYFAVPIAGLSSTLVSATFTNLTNVVVTFVRTGDKGDQGIQGLNGTQGAIGTQGSFGTQGTIGSQGTVGAQGTSGSQGTIGAQGTIGSQGSQGTQGTLGRQGTTGSQGLNGTQGTIGTQGTVGAGTQGTIGSQGTIGSQGTIGSQGLAGIQGTLGSQGTVGAGTQGTIGSQGTIGAGTQGSTGSGTQGSTGSQGSTGSGTQGAIGSQGSTGSGTQGSTGSGTQGAIGSQGTTGAGTQGSTGSGTQGSTGSGTQGAIGSQGTTGAGTQGSTGSGTQGSTGTQGSTGSGTQGSTGTQGTVGSQGLAGTQGLLGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLVGTQGTIGSQGLNGTQGSLGTQGTIGSQGLAGTQGSLGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLVGTQGSLGTQGTVGSQGTIGSQGLAGTQGTIGSQGLVGTQGTIGSQGLNGTQGTIGSQGTLGTQGTQGTIGAQGLSGIQGSLGTQGAQGVKGNDGTSVNIKGSVATANAANFTAADPSPALGDGFIATDTGHLWVYTSTGPIVGFSDVGTIVGPQGTTGTTGSQGTIGTQGTIGAQGLAGTQGTFGSQGTLGAQGTIGSQGIIGSQGTVGSQGLAGTQGTGGSQGLAGTQGALGTQGSLGTQGTTGSQGLAGTQGTIGTQGTIGSQGLAGTQGTIGTQGLAGTQGTIGTQGTIGSQGLAGTQGTIGTQGTVGSQGL
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1336 AA molecular weight: 127089,12230 Da isoelectric point: 4,32621 aromaticity: 0,04341 hydropathy: -0,18174
Domains
Domains [InterPro]
IPR008160
600–651
600–651
1
1336
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Name | Taxonomy ID | Lineage | |
---|---|---|---|
Phage |
uncultured Caudovirales phage [NCBI] |
2100421 | Uroviricota > Caudoviricetes > environmental samples > |
Host | No host information |
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAB4124088.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
LR796178
[NCBI]
CDS location
range 2 -> 4009
strand -
strand -
CDS
ATGTCAAATACTATTATTCAGATTAAAAGATCGGCAAATCAGAATACACCTAATACACTAGCATGGGGCGAATTAGCATATTCGTTCGTAGCAAATACTCTCTATATCGGCGATCAAGCTAATGTTCCTGTGCCAGTTGGCGCAACTTCAGCGATGGCAAATCTAGCCTATGGCGCTGCAAATTCAGCTGCAAATACTGTTAGAGTTTCACAAAATGGAATATCAACATTATCTGCGCAACAATTAAACTTCGTAAATACTAGCACAATACTAATTACTGTAACTCCTGGATCTGGCGCTGCCGCAGGAAATGCTAATATTTCGTTTGATATTACATCGCCAACCCAAGGAACAACTGGAACTCAGGGCATTCAGGGCGTTCAAGGAACTCGCGGCATTCAAGGATTTGATGGCGTTAAGGGCGAGTCCGGTGGCGAATCTTATGAGTATTTGTTTAATCAGGATTATTCTCTAATAACTGATCCTGGAACAGGACATTTAAGTTTTGACGCATATCCTATTCTTCAAGCAACATATCTACAAATTAATTATAATGATGCGAATGGACAAAATGTCTACAATATGTTGCAGGCGATTGATGACTCTACATCAGGAGTTAAAGGAACATTTAAAGTCTATAATAGAGCGAATACTCTAGAGTATGGTTTTTATGTTATTACAGGAAATCATTTTCATAATGGTGAACCATTCTTCCAGGTTCCAGTTGATGGCTTAGATGCAACAGTTGATAACTTTTCAGCAGATGCAGATCTAATTATCACATTCGTTAGAACTGGCGATATTGGCGACACGGGTGCTCAAGGAACACAGGGCGATGTAGGTATTCAAGGCGCGCAAGGAACTTTAGGCGTTCAAGGAAGTTCTGGTTATGTTGGCGCTGACGGTATGCAAGGTGCAACTGGATCTGGTGCCCAAGGAACGCAAGGTCTTGCTGGAATTCAAGGTTTGTTTGGCGTTCAAGGAGCATTCGGTACACAGGGCGCTCAAGGTATTCAAGGTCAAATTGGTATTCAAGGTCTTGGCGGAATTCAAGGTTCGTTTGGTGTTCAAGGTTCTTTAGGTAATCAGGGAACTACTGGTGCCCAAGGTGTAGTTGGATCACAGGGTCTGTCTGGCACGCAAGGTTCACTCGGTACTCAAGGGTCTATAGGTCTACAGGGAACTATTGGTGCACAAGGATTAGCTGGTATTCAAGGATCATTAGGCACTCAAGGAACCATAGGATCACAGGGCACGATTGGATCACAGGGAACTATTGGGGCACAAGGTCTTAATGGCACTCAAGGTGCATTTGGCACTCAAGGAACTCTGGGTTCACAAGGAACTATTGGCGCACAAGGATTAGTTGGAACTCAAGGAACACTGGGAACTAAAGGTGATACCGGAAGTTTTGGCGGCGCAAGTTTCGACTATACGTTCTTAACTAATACAGCAAATACTGATCCAGCTTCAGGTAATACTAAGTTTAATAATACAACTCTTATAAGTTCAACTGAGTTGTATATCGACTATAATGATAGATTCGGTGCTAATGTATTTAACTACCTACAGACAATTGATGATTCTACGTCAACAATTAAAGGTTCATTTAAAGTTGCAAATACTGCTAATGTTAATGAATTCGCATATTTCAGTATAACTGGACTACATTGGCACGATACTAGTGGCTCACCAACTAGCTCATATTTTGCTGTCCCTATCGCAGGATTATCTTCCACTTTAGTATCTGCCACTTTCACTAACTTAACTAATGTGGTGGTGACTTTCGTTAGAACTGGTGATAAGGGCGACCAAGGTATTCAAGGTCTTAATGGAACACAGGGCGCAATAGGAACGCAAGGTTCTTTTGGGACGCAAGGAACGATTGGTTCACAAGGAACCGTTGGTGCACAAGGAACATCAGGTAGTCAAGGAACTATTGGCGCACAAGGAACGATTGGATCGCAAGGTTCGCAAGGAACTCAAGGAACACTAGGCAGACAGGGTACAACTGGATCCCAAGGTCTTAATGGAACTCAAGGAACCATTGGAACTCAAGGAACTGTTGGTGCTGGAACTCAAGGAACCATTGGGTCTCAAGGAACCATTGGGTCTCAAGGAACCATTGGGTCACAAGGTCTAGCAGGAATCCAAGGAACTCTAGGCTCACAGGGTACAGTTGGCGCAGGAACCCAAGGAACGATAGGTTCGCAAGGAACGATCGGTGCTGGAACGCAAGGATCTACTGGATCTGGAACACAGGGGTCTACTGGATCTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACTCAAGGTGCGATAGGTTCACAAGGATCTACTGGATCTGGAACACAGGGGTCTACTGGATCTGGAACTCAAGGTGCGATAGGTTCACAAGGAACAACTGGTGCTGGAACTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACTCAAGGTGCGATAGGTTCACAAGGAACAACTGGTGCTGGAACTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACACAGGGGTCTACTGGAACTCAAGGATCTACTGGATCTGGAACACAGGGGTCTACTGGAACTCAAGGAACTGTTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAGGGATTATTAGGTACTCAAGGAACCATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACCATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGGTCACAAGGTCTAGTTGGAACTCAAGGAACAATTGGGTCACAAGGTCTTAATGGAACTCAGGGATCATTAGGTACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAGGGATCATTAGGTACTCAAGGAACGATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACCATTGGGTCGCAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACCATTGGGTCGCAAGGTCTAGTTGGAACTCAGGGATCATTAGGCACTCAAGGAACTGTTGGGTCACAGGGAACTATAGGGTCACAAGGATTAGCTGGAACCCAAGGAACAATTGGGTCACAAGGTCTAGTTGGAACTCAAGGAACAATTGGGTCACAAGGTCTTAATGGAACTCAGGGAACTATTGGATCCCAAGGAACATTAGGAACCCAAGGTACTCAGGGAACTATCGGTGCACAAGGTCTTAGTGGAATTCAAGGATCATTAGGAACTCAGGGTGCGCAGGGTGTTAAAGGAAATGATGGTACTTCTGTAAATATTAAAGGGAGTGTTGCTACTGCTAATGCTGCCAATTTTACTGCAGCAGATCCATCGCCAGCCTTAGGCGATGGCTTTATTGCTACTGATACTGGACATCTTTGGGTATACACTTCAACTGGACCAATTGTAGGGTTTTCTGACGTAGGAACTATTGTTGGTCCACAAGGAACGACCGGCACTACTGGTTCCCAAGGAACTATTGGTACGCAGGGAACAATTGGGGCACAAGGTCTAGCAGGAACTCAAGGAACATTCGGTTCACAGGGCACTCTTGGGGCACAAGGAACTATTGGGTCGCAGGGAATTATTGGTTCACAAGGAACTGTTGGTTCACAAGGTCTAGCTGGCACCCAAGGAACTGGTGGTTCGCAAGGTTTAGCTGGAACTCAAGGTGCATTAGGTACTCAGGGATCATTAGGCACTCAAGGAACGACAGGATCACAAGGATTAGCTGGAACACAAGGAACGATTGGGACACAAGGAACCATAGGATCACAAGGATTAGCTGGAACACAAGGAACGATTGGGACACAAGGATTAGCTGGAACACAAGGAACGATTGGGACACAAGGAACCATAGGATCACAAGGTCTAGCTGGAACTCAAGGAACGATTGGAACTCAAGGAACAGTTGGGTCACAAGGATTA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.