Protein

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Genbank accession
CAL1327499.1 [GenBank]
Protein name
Tail fiber
RBP type
TF
Evidence GenBank
Probability 1,00
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,77
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,92
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKTAGARPAASVLAEGELAINLKDRTLFTKDDTGNIIDLSISAGGNISGNITQTGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHKNKAPIFTDLSSTTSTSEYHPLIKQRYKDGTFSVGTLVNEGSFKIQYINESGDSKYWTFNRNGSFIVDNGNIEVRAGNISASGNINSATGMVSAPQINTKTIVFDTKAFGQYDSQSLVQYVYPGTGETNGINYLRKFRAKSGGTIYHELASAQTGKSDELSWWTGNTAVNKQMGLRNDGSLVLRRSLAIGTITTDENINNYGSTGAMGECYIVIGDASTGLSYKKTGVYDLVASGLSVASITPDSFRSTRKAIFGRSEDQGGTWILPGQNAALLSVHTEVDQNNNGDGQTHIGYNSNGKFYHYFRGRGRMAIGMAEGLIVEPGILDIKTGSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNSDGTNASLIFKAASGIDGTKQILWEGGTRAGQNKSYVTAKAWGNSFNSSGDRNRETVFEVSDGQGYYFYAQRVAPAPGSTTGVVQFRVAGALLTSGGITSSGSIVTESSLVANNGLSVNGQAKFGGTADALRIWNAEYGAIFRRSEASLHIIPTPKDAGESGGISNLRPLSISLNNGMVQMRHSVTLGDDGRGGNMITVDNDNKLVVVTTHSRISPNYRMQLGQSAYIDAECTDAVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNIDRTDTSTYVPILKQRYVQGNSCYSLGTLINGGNFRVHYHEGGDGGSTGAIIKDLGWEFNKNGDFYSPGKLGAGNIRIGTDGNITGGSGNFANLNTTLNRKVNSGFITYGSTEGWYKFATVTMPQSAATATFTLTGGSGFNDGLNTQCSINEIVLRTGNNNPPGLNAVLYNRSINGFRNIAYINTHGDTYDIYINVGPYANQMTCSWNASDQVTVEVVGINGTTQSPVEELPSGYATGQVANVLNNLVDRGKVKRYEADSEIAINNQTGIRIRSNGDKTGSIATMLRNDGGSFYILFTDKNATDGAATVNGDWNSKRPFAINLTTGEVLMNNGIAVRSAALFYNSINVKDNGSINFDKSGANPRNMRIFHAGDASRGNRIEIADETNYIAYFEKTPGGANRFVVNNATVAGVNQMNSFGININNALGGNSIAFGDNDTGIKQSGDGILDIITNAARRMRFQTGDTYSDMNINAPNVYIRSDIRLKSNFRPIKNALEKVEQLDGLIYDKAEYIGGEPVQTEAGIIAQTLQDVLPEAVREVEDIKGNKILTVSSQSQIALLVEAVKTLSARVKELESKLM
Physico‐chemical
properties
protein length:1298 AA
molecular weight: 139305,10000 Da
isoelectric point:7,92254
aromaticity:0,08475
hydropathy:-0,35501

Domains

Domains [InterPro]
DC_0538
STR
1–824
DC_0538 DC_1942
DC_0387
STR
778–1132
DC_0387 IPR030392 Coil
IPR030392
CHP
1200–1297
IPR030392
CAL1327499.1
1 1298
Architecture
STR
ATT
STR 1-1120 | ATT 1121-1297 |
Legend: ATT STR RBD CBM LEC ENZ CHP LNK TAS TTP UNK Unmapped

Tail Spike Domain Segmentation

Tail Spike Domain Segmentation

This protein has been segmented into three structural domains: N-terminal, central domain, and C-terminal.

Domain Layout
N-terminal
Central
C-terminal
CAL1327499.1
1 1298
Domain Start End Length (AA) Confidence
N-terminal 1 302 302 0,1137
Central domain 303 501 200 0,5186
C-terminal 502 1298 796 0,6013
Legend: N-terminal Central domain C-terminal
3D Structure with Domain Coloring

The structure is colored according to the domain segmentation: N-terminal (blue), Central (green), C-terminal (pink).

Domain Coloring
N-terminal
1-302
Central
303-501
C-terminal
502-1298

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage vB_Eco_EL
[NCBI] 		3044327 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
CAL1327499.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
OZ034682.1 [NCBI]
CDS location
range 153437 -> 157333
strand +
CDS
ATGGCTACTTTAAAACAAATACAATTTAAAAGAAGCAAAACCGCAGGTGCACGTCCTGCTGCTTCAGTATTAGCCGAAGGTGAATTGGCTATAAACTTAAAAGATAGAACACTTTTTACTAAAGATGATACAGGAAATATCATTGATTTAAGTATTTCCGCTGGCGGTAATATCAGTGGAAATATCACTCAAACTGGTGATTATTTACAAAATGGAACATATAATCTTAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCTGGTAAATATATTGAATTCCTGCCTAAAACCGCGGGTAATGGTGCTTGGGCAAACCAACATAAAAATAAAGCTCCTATCTTTACCGATTTGAGTTCAACTACTTCTACTTCAGAATACCATCCGCTAATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGTTGGTACGTTAGTAAATGAAGGAAGTTTTAAAATTCAATATATCAATGAATCTGGTGATTCAAAATATTGGACTTTTAATCGAAACGGTAGTTTTATTGTAGATAATGGCAATATTGAAGTTCGTGCTGGTAATATTTCCGCTTCAGGCAATATTAATTCAGCTACTGGGATGGTTTCTGCTCCACAGATTAATACAAAAACCATAGTTTTTGATACAAAAGCATTCGGACAATATGATTCGCAGTCATTAGTTCAATATGTTTATCCTGGAACAGGTGAAACAAACGGAATCAATTACCTTCGCAAATTCCGTGCTAAATCTGGTGGTACAATTTATCATGAATTAGCTTCTGCGCAAACCGGAAAAAGTGATGAACTTTCTTGGTGGACTGGTAATACAGCGGTTAATAAACAAATGGGCCTTCGCAATGATGGGTCTTTAGTACTACGACGTTCACTTGCAATTGGTACAATTACAACAGATGAAAACATCAATAACTACGGTTCCACTGGAGCAATGGGCGAATGTTATATAGTTATCGGTGATGCATCAACGGGTTTATCATACAAAAAAACTGGGGTATATGACTTAGTTGCTAGTGGTCTTTCTGTAGCATCTATTACTCCTGATAGTTTCCGTAGTACGCGCAAAGCGATTTTTGGACGCTCGGAAGACCAAGGTGGTACGTGGATTCTTCCTGGTCAAAACGCAGCTCTTCTTTCAGTTCATACTGAAGTTGACCAAAACAATAATGGAGATGGTCAGACACATATTGGCTATAATAGTAATGGTAAATTTTATCATTATTTTAGAGGCAGAGGAAGAATGGCCATTGGAATGGCCGAAGGACTTATTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAAAACTGGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGATGGTACCGTCGCTTCTGTTCAAACATTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATAGTGATGGAACTAACGCTTCTCTAATTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGTACTAAACAAATACTTTGGGAAGGTGGTACTCGTGCTGGGCAGAATAAGAGCTATGTAACTGCTAAAGCTTGGGGAAATTCATTTAATTCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACGGTTTTTGAAGTATCAGATGGACAAGGATATTATTTTTATGCTCAACGTGTAGCTCCTGCACCAGGTTCAACAACTGGAGTAGTTCAATTTAGAGTTGCTGGAGCATTATTAACTTCTGGTGGCATTACATCATCCGGTTCTATTGTTACTGAATCTAGTTTAGTTGCTAATAATGGATTATCTGTAAATGGTCAAGCTAAATTTGGTGGAACAGCAGATGCATTAAGAATTTGGAATGCTGAATACGGTGCTATTTTCCGCCGTTCAGAAGCATCATTACATATTATCCCGACTCCTAAAGATGCCGGTGAAAGTGGTGGAATAAGTAATCTCCGCCCGTTAAGTATTAGTCTTAATAATGGTATGGTACAAATGCGTCATTCTGTCACGTTAGGCGATGACGGCAGAGGTGGCAATATGATTACGGTAGACAATGATAATAAACTTGTTGTTGTTACTACCCATAGTCGCATTTCTCCTAATTACCGTATGCAGCTAGGTCAGTCGGCATACATTGATGCAGAATGTACTGATGCTGTTCGCCCGGCTGGAGCAGGTTCATTTGCTTCTCAGAATAATGAAAATGTCCGTGCACCGTTCTATATGAATATTGATAGAACTGATACAAGTACTTACGTTCCTATTTTAAAACAACGCTATGTTCAAGGAAATAGCTGTTATTCTTTAGGTACTTTAATAAATGGCGGTAATTTTAGAGTTCATTATCATGAAGGGGGTGATGGCGGTTCTACTGGCGCGATTATAAAGGATTTAGGTTGGGAATTTAACAAAAATGGTGATTTTTACTCTCCTGGTAAATTAGGTGCTGGAAATATTCGTATCGGAACAGACGGTAATATTACCGGTGGTTCTGGTAACTTTGCTAACCTAAATACGACTTTAAACCGTAAAGTTAATTCTGGATTTATTACTTACGGTTCAACCGAAGGATGGTATAAGTTTGCAACAGTAACAATGCCACAGAGCGCAGCTACAGCAACATTTACATTGACTGGTGGTAGTGGGTTTAATGATGGATTAAATACTCAATGTTCTATAAATGAAATTGTTCTTCGTACCGGTAATAACAATCCTCCCGGATTAAATGCTGTATTATATAATCGTTCAATAAACGGATTTCGTAATATAGCTTATATTAATACGCACGGAGATACATACGACATTTATATAAATGTCGGTCCATATGCAAACCAAATGACTTGTTCTTGGAATGCGTCAGATCAAGTTACCGTTGAAGTCGTTGGCATTAATGGAACAACTCAATCTCCTGTAGAAGAATTACCTTCTGGTTATGCTACTGGACAAGTTGCTAATGTTCTTAATAACTTGGTTGATCGCGGTAAAGTTAAACGTTACGAAGCTGATTCTGAAATAGCTATTAATAACCAAACCGGCATTCGTATTAGAAGCAACGGCGATAAAACTGGTTCTATTGCTACAATGCTACGAAATGATGGCGGTAGTTTTTATATTCTGTTTACAGATAAAAATGCCACTGATGGCGCAGCAACTGTTAACGGCGATTGGAATAGTAAGCGTCCTTTCGCAATTAACTTAACAACCGGTGAAGTGCTAATGAATAACGGTATAGCTGTTCGCAGCGCTGCTTTATTCTATAATAGCATAAACGTCAAAGATAATGGTTCTATTAACTTTGATAAATCAGGCGCTAACCCGAGAAATATGAGAATATTTCATGCTGGCGATGCTTCTCGCGGTAACCGTATTGAAATTGCCGATGAAACTAACTATATTGCTTACTTTGAAAAAACTCCAGGTGGAGCTAACCGCTTTGTAGTAAATAATGCTACTGTGGCTGGTGTTAATCAAATGAATTCATTTGGTATTAACATCAATAACGCACTTGGTGGAAATAGTATAGCATTTGGTGATAATGACACTGGAATTAAACAATCTGGTGACGGAATTCTCGATATCATTACTAACGCCGCACGCCGAATGAGATTCCAGACGGGTGACACTTATTCTGATATGAATATTAACGCTCCAAACGTTTATATTCGTTCTGATATTCGTTTGAAATCTAATTTCAGACCTATTAAAAATGCTCTTGAAAAGGTTGAACAGCTTGATGGTTTAATCTATGACAAAGCTGAATATATAGGCGGTGAACCTGTTCAAACAGAAGCAGGTATTATAGCTCAAACACTGCAAGACGTTTTACCTGAAGCAGTTCGTGAAGTTGAAGATATTAAAGGTAATAAAATACTCACTGTTTCTTCTCAATCCCAGATTGCTCTTCTAGTTGAAGCTGTGAAAACACTTTCTGCTCGTGTAAAAGAACTTGAATCTAAACTTATGTAA

Genome Context

Genome Context

Tertiary structure

PDB ID
8e1d0e3b2fb33028efca0fafcb89db652ddc3ddb19f1fa5852811908d287673f
ESMFold
Source ESMFold
Method ESMFold
Resolution 0,5089
Oligomeric State monomer
Download PDB
Model Confidence
Very high
pLDDT > 90
High
90 > pLDDT > 70
Low
70 > pLDDT > 50
Very low
pLDDT < 50