Protein

Genbank accession
YP_010093296.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber protein distal subunit
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,66
TF
Evidence RBPdetect2
Probability 0,96
Protein sequence
MATLKQIQFKRSKVAGVNPTAAQLAEGELAINLKDRTLFTKDDLGNIISLGFAKGGDINGNVTQNGDYLQNGTYNLNGNQFVYAGKYIEFLPKTAGNGAWANQHLNKAPIFTDLSSTTSVSEYHPLIKQRYKDGTFSAGTLVNEGSFKFHYIDETRTSKYWTFNRNGNFQVDSGSLLVSNGYLVTQSNIETKAGSLIGPKVITKNINVSTKSWDTNIDTAYDLVSLPTWQYTPTETDLDTNGINYLRKFRGHVSSAIFHEVADARSGKPQNISYWTGRNAEVYQWSYTTDGRMSVANSIGIGLADVGDQGRYPLVSFGKGIAIGDNDTGIKWVRDGVIDLVANGISAGTILNNGINSTKKLMVGYSRDSGTTWDFPNNNQAMFTARTDVDGNNNGDGQTHIGYNSNSKMYHYFRGTGRMAVGMSQGLLVEPGILDISTGSNTLSLRADGTVASVQTLKLNNGLYFNGDGTNASLVFKAASGIDGTKQIMWEGGKRAGQNKSYVTAKAWGNSFNASGDRNRETVFEVADGQGYYFYAQRVAPASGSTVGPIQFRIAGALLTGGGITSSGSIVTESSLVANNGLSVNGQAKFGGTADALRIWDAEYGAIFRRSETALHIIPTNKDAGESGGISNLRPLSIALNNGMVQMRHSVTLGDDGAGGNMITVDNDNKLVVVTSHSRISPNYRMQVGQAAYIDAECTDTVRPAGAGSFASQNNENVRAPFYMNINRTDTSTYVPILKQRYVQGNSCYSLGTLINGGNFRVHYHEGGDGSSTGATIKDLGWEFTRSGDFISPKRISAGGSVYLGTDGNITGGSGNFANLNSTIESLKTDIVSSYPIGAPIPWPTDTPPEGYAIMEGQTFDAGLYPKLAAVYPSGSLPDMRGQTIKGKPSGRAVLSTEADGVKSHSHSASASNTDLGTKTTSSFDYGSKTTSSFDYGTKTSNTTGNHNHTVSGNTSSAGAHRHARSGPQIQYGVHTSIFYDGYNSAGPNGNAKITGTVSGATASSNMAKTSSDGAHTHSWSGTTSTTGNHAHTVGIGAHTHTVGIGAHTHSVAIGSHGHTITVNATGNTENTVKNVAFNYIVRLA
Physico‐chemical
properties
protein length:1085 AA
molecular weight: 115197,67450 Da
isoelectric point:8,47780
aromaticity:0,08664
hydropathy:-0,39806

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage phi25-307
[NCBI] 		2340715 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
YP_010093296.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
NC_055734 [NCBI]
CDS location
range 136311 -> 139568
strand +
CDS
ATGGCTACATTAAAACAGATACAATTTAAAAGAAGCAAAGTAGCAGGAGTTAATCCTACTGCAGCACAATTAGCCGAAGGCGAATTAGCGATAAACTTAAAAGATCGAACTCTTTTTACTAAAGATGACCTCGGTAATATTATTAGCCTAGGCTTTGCTAAGGGCGGGGATATTAACGGTAATGTAACTCAAAATGGAGATTATTTACAGAACGGTACATATAATCTCAATGGAAACCAGTTTGTTTATGCAGGAAAATATATTGAATTTTTACCTAAAACTGCAGGCAATGGTGCTTGGGCTAACCAACATTTGAATAAAGCCCCTATCTTTACAGATTTAAGTTCAACTACTTCTGTTTCAGAATACCATCCGCTGATTAAACAACGCTATAAAGATGGAACTTTTTCTGCTGGTACATTAGTAAACGAAGGTAGTTTTAAATTCCATTATATTGATGAAACCAGGACTTCAAAATACTGGACTTTTAATCGAAACGGTAATTTTCAAGTTGATTCCGGAAGTTTATTAGTATCTAATGGATATTTAGTTACTCAAAGTAATATTGAAACTAAAGCTGGTTCTTTAATTGGTCCTAAAGTTATTACCAAAAATATCAATGTGAGCACTAAATCTTGGGACACTAATATTGATACTGCATATGATTTAGTTTCATTACCTACTTGGCAGTATACTCCAACCGAAACGGATTTGGATACTAATGGTATAAACTACCTTCGTAAATTCCGCGGACATGTTTCTTCTGCTATTTTCCATGAAGTTGCTGATGCTCGTTCAGGTAAACCACAGAATATTTCGTATTGGACGGGACGTAATGCTGAAGTTTATCAATGGTCTTATACCACAGATGGGCGTATGTCTGTTGCTAATTCGATAGGTATAGGTCTTGCTGATGTTGGTGACCAAGGACGTTATCCATTGGTTTCGTTTGGTAAAGGTATTGCAATTGGTGACAATGATACTGGTATTAAATGGGTTCGTGACGGGGTTATCGATTTAGTTGCGAATGGTATTTCTGCCGGCACTATTCTTAATAACGGTATTAACAGTACTAAAAAATTGATGGTCGGTTATAGCCGCGATTCTGGTACTACTTGGGATTTCCCAAATAACAACCAAGCAATGTTTACCGCACGCACCGATGTTGATGGTAATAATAACGGCGATGGTCAGACTCATATCGGTTATAACAGTAATTCTAAAATGTATCACTATTTCCGTGGTACAGGTCGTATGGCTGTTGGTATGTCCCAAGGTCTCCTTGTTGAACCAGGAATTTTAGATATTAGCACTGGTTCAAATACATTAAGTTTGCGTGCTGACGGTACTGTTGCTTCTGTTCAAACGTTAAAGCTTAATAATGGATTATATTTTAATGGTGATGGAACTAATGCTTCTTTAGTTTTTAAAGCAGCTTCAGGTATTGATGGCACTAAGCAAATTATGTGGGAAGGTGGTAAGCGTGCTGGTCAAAATAAAAGTTATGTGACAGCTAAAGCTTGGGGTAATTCATTTAACGCATCTGGCGATCGTAATCGTGAAACAGTTTTTGAAGTAGCTGACGGACAAGGTTATTACTTTTATGCGCAGCGTGTAGCTCCCGCTTCAGGATCTACTGTCGGACCAATTCAATTTAGAATTGCTGGAGCATTATTAACCGGTGGTGGTATTACATCATCCGGCTCGATTGTTACAGAATCAAGTTTAGTTGCTAATAACGGATTATCTGTAAATGGCCAGGCTAAATTTGGCGGAACAGCTGATGCATTAAGAATTTGGGATGCCGAATATGGCGCTATTTTCCGTCGTTCAGAAACAGCATTACATATTATCCCGACCAATAAAGATGCTGGTGAATCTGGTGGAATAAGCAATCTGCGCCCATTGAGCATCGCACTTAACAACGGTATGGTTCAAATGCGTCATTCTGTCACGTTAGGTGATGATGGTGCAGGCGGTAATATGATTACTGTGGACAACGATAACAAACTTGTTGTTGTTACTAGTCATAGTCGTATTTCTCCTAATTACCGTATGCAGGTAGGACAAGCAGCTTATATTGATGCTGAATGTACTGACACCGTTCGCCCGGCTGGTGCAGGGTCTTTTGCTTCACAAAATAATGAAAACGTTCGTGCTCCGTTCTATATGAATATTAATCGCACAGATACAAGTACTTACGTTCCTATTTTAAAACAACGTTATGTTCAAGGAAATAGCTGTTATTCTTTAGGTACTTTAATAAATGGCGGTAACTTCAGAGTTCATTATCATGAAGGTGGAGACGGAAGTTCAACAGGCGCAACTATAAAAGATTTAGGCTGGGAATTTACACGTTCTGGTGATTTTATATCTCCTAAGCGCATTTCTGCTGGGGGTTCAGTTTATTTAGGCACAGACGGTAACATTACTGGTGGTTCTGGTAATTTTGCCAACTTAAATAGTACAATTGAATCACTTAAAACTGATATTGTTTCAAGTTATCCTATTGGAGCTCCGATTCCTTGGCCTACTGATACACCTCCTGAAGGTTACGCCATAATGGAAGGTCAAACATTTGATGCTGGCTTGTATCCTAAGTTAGCTGCTGTGTATCCTTCCGGCTCTCTGCCTGATATGCGTGGTCAAACTATCAAGGGTAAACCATCTGGGCGTGCTGTATTAAGTACAGAAGCAGACGGTGTTAAGTCACATAGCCATAGTGCAAGTGCATCAAACACGGATTTGGGTACTAAAACCACTTCTAGTTTTGATTACGGTAGCAAAACGACTTCAAGCTTTGATTATGGTACTAAGACCAGTAATACCACTGGCAACCATAACCATACAGTGAGTGGTAATACTAGTTCCGCTGGTGCTCACCGACACGCGCGTTCAGGCCCTCAGATTCAATACGGCGTACACACTAGCATATTCTATGATGGATACAATAGTGCTGGTCCAAATGGCAACGCTAAAATCACTGGAACCGTGAGTGGTGCTACTGCATCGTCGAATATGGCCAAAACTTCTTCAGACGGTGCCCACACCCATAGTTGGTCTGGTACTACTAGCACCACAGGTAACCATGCCCACACCGTAGGTATTGGCGCCCATACTCACACCGTAGGTATTGGCGCTCACACCCATTCGGTTGCAATTGGTTCACATGGTCATACAATAACTGTAAATGCCACAGGAAATACAGAAAACACAGTTAAAAACGTTGCTTTTAACTATATCGTTCGTTTAGCATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.