Protein

Genbank accession
XRL28086.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber proximal subunit
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9287

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9179

Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVDTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAAVVTPASLYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSIQEVGTHSIEGRTTIDGFLMYDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISIGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETKWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANADLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGKLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAVRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTGEFGGSLAANRTFTIRNTGLPTNIIFEKGPATGSNPVQSMSIRVWGNQYGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKDGNITFSINGTVMPKNVTASGMLNVNGAAAFGSSVNVTGEIISRNTNAFRAISSQYGFFIRNDSSNVYFMLTDQGDQTGGYNALRPLTINNASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSNLYTRAPTSDTVGFWSIDVNDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIVPDPVNKSVKFEWIE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140511,23900 Da
isoelectric point:5,55319
aromaticity:0,07448
hydropathy:-0,34407

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Escherichia phage HMD-9
[NCBI] 		3411022 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XRL28086.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PV287714.1 [NCBI]
CDS location
range 146755 -> 150624
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTCAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGTACGCTGGAGAGCATTACGTACTGATGCTAATTGGACAACTGTTTCATCAGGACCTTATCAATTAAAGTCAGGCGAATCAATTTCAGTTGATACTGCAGCCGGTAATGACATTACATTTACTTTACCATCTTCCCCAATTGATGGAGATACTATCGTTCTCCAAGACATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTACAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGCGAACAAGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCGCAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTAGCTGATTATAGCAGAGAAGCTGCAGTTGTAACACCGGCAAGTCTTTATCAGGCGCAATCTAACGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCCGCTGCGCCGATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCGCTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAATACAAGAAGTTGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACAACGATTGACGGTTTCTTGATGTATGATGATAATGAAAAATTATGGAGACTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGTATTATAACGACTAATTCAAACATTCGCCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGAGCGAATAACGGAACAACCCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCAACTGATATTTCTATTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGCCAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAGTATCCGCCTGAAACTAAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGCGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAGCTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAACAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTTGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATAGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCAAATGCTGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTAGCAATTACACCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCCACAGAAACTCGTAGAGGCGTTGCTGAAATTGCTACGCAGCAGGAAACTAATGCAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTAGACAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACCTTTGTATCTACCGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACCCAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAAAGCCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACTGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGATCGTAAAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGCGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAAAATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCAACCCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACATCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAGTGGATTGTGCAGAGTGAACCTACCTGGGCAGCTACTACTGCGGTAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACGTTCGTTGGTAATGATACGGTAGGTTCAACACAGCCATTAGAATCATATGAGAAAAATAGCTATGCGGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGCTGATACAAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAGCAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGGTGAATTTGGTGGTTCTTTAGCTGCTAATAGAACATTTACCATCCGTAATACCGGACTCCCGACCAATATCATTTTCGAAAAAGGTCCTGCAACCGGTTCAAACCCGGTTCAGTCAATGAGCATCCGTGTATGGGGTAACCAGTATGGCGGCGGCTCGGATACGACTCGTTCTACCGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGTAATAAAGACGGGAATATAACGTTTAGCATTAATGGTACTGTGATGCCAAAAAATGTAACTGCTTCGGGTATGTTGAATGTGAATGGCGCTGCAGCATTCGGTAGTTCAGTTAATGTAACCGGCGAAATTATTTCCAGAAATACAAACGCTTTCCGCGCTATCAGTAGCCAATACGGGTTCTTTATTCGTAATGATAGCTCTAATGTCTATTTTATGCTGACCGATCAAGGCGATCAGACTGGTGGATATAATGCATTACGTCCTTTAACCATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATTATTGCCAAAGGTGCAACTATTAACTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGCACTAAAACATCTAATTTATATACTCGTGCACCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATGTTAATGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACACTGACTCAGTTTGGTAATACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACGCCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACCCGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAGCCATCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTGTTCCTGACCCAGTGAATAAATCTGTTAAATTTGAATGGATTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.