Protein
- Genbank accession
- XQU49547.1 [GenBank]
- Protein name
- long-tail fiber proximal subunit
- RBP type
-
TF
evidence: RBPdetect
probability: 0,9263
TF
evidence: RBPdetect2
probability: 0,4720
- Protein sequence
-
MADSIKRKFRGADGFDAAGEKIVNVATADRTVLSDGVNVEFLIQENTLQQYDSTRGYTSGFAVIYDNRIWVSNRDIAKPAGNFNELYWTSVRTDAKWRVVSSGTTILKSGEFISVDTAKGNDMIFTLPNNPQDGDTIMLKDIGNKTGTVGVTINASIQDIVLRGPTNKVRSVKMTHPLSQYVFVFSNRLWNLYVSDYERVARIVTPSAVVQAQSNDFIVRRYTSPDPIRVTLPKHANTGDIINFTDLDGKNPQFHMIVSTFDDNTNIGTVGQKSVEVRTSGDGFIVYDESESIWRIWEGDLRPRMRVITDNVTLIPNEVVTVFGVNNSTQKTIDITLPTDIAIGDTVTIAMNYMRKGQKVNIRAATGDKIASSLQLLQFPKRSEYPPDATWVMNDVLTFDGTTSYVPVLQLSYIEHSGSKYWIVADNDPTVERVDSKDNETRKRLGVIALASQDQANVDHENNPEKELAITPQTLANRVATKVRRGIARLVTLTEIQALTPGPHLDDVIVTPAMLNEKTATETRRGVAETATQAEANGSTDDERIITPKKLHNRIASEILTGILKLVRTTGTLAGIGRDTKGTNVYDYDNNIDAVTPKSLFQFKSTEQAQGGVYLATQNEVIAGGPAQPGFPVVVTPETLHGKTSTDSRIGLIQIAKQAEVDTGTDYTKAVTPKTLNDRKAREDLSGIAEIATQVEFDTGTDDTRIVTPLKVKTRFNSTDRTSVVALSGLVEQGTLWDHYTLDIKEASETQRGTAALATQVQVDAGTDDKTIVTPKKLHAKKATETTEGIIQVANQAETVAGTIANKAVSPKNFKYVVQEEKTWESTIAQRGFVKLSEKALTFKGDTLNGSGRLLPGDLINEPALTDLPKEGYAVSPYEMNRALQYFLPAKAKAVDSDLLDGIDSTQFVRRDIDQVVNGKITFKKDVTLEAPLVSSSTAKFTTVNATISVDIGDTLGNSRINLNTLANGWNIETLANGSTLDFTATDKVLTLNRNGNVTVAQTLTAMNKVDANKGFSVEGGTMVINPSSTEIVIGTQSKQVTLQNKDAKTFSVVDPSGTYTILNTKNAFEITAQGFVKKAGDSMTGPLQIQAPLTVQIPEGRVAPDVKPSDDNPASWSASITSAAIYNKLPGYGVPVMEKDAEGQDTGFVDHYEYVKGPGVLTQHGIGKTAVYQIWAPRPTVQELNHNAQTFWIRNFNIVTGEWDEFGKMYTSVQRPTAGEIGAVSTSGSAFNNLTIRDWLQIKNVRIVPNETTRTVDFIWVDE
- Physico‐chemical
properties -
protein length: 1264 AA molecular weight: 138200,64580 Da isoelectric point: 5,49471 aromaticity: 0,06883 hydropathy: -0,32777
Domains
Domains [InterPro]
No domain annotations available.
Legend:
Pfam
SMART
CDD
TIGRFAM
HAMAP
SUPFAM
PRINTS
Gene3D
PANTHER
Other
Taxonomy
Coding sequence (CDS)
Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XQU49547.1
[NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ898399.1
[NCBI]
CDS location
range 43565 -> 47359
strand -
strand -
CDS
ATGGCAGATTCAATCAAACGCAAGTTTCGTGGCGCTGACGGCTTCGATGCTGCGGGTGAAAAAATAGTCAACGTTGCTACTGCTGACCGCACGGTGTTATCCGATGGCGTCAACGTTGAATTCCTTATCCAAGAAAACACATTACAACAGTATGATTCTACTCGTGGCTACACTTCCGGTTTCGCAGTAATTTACGACAACCGCATTTGGGTTTCAAATCGTGATATTGCAAAACCTGCTGGCAATTTTAATGAACTTTATTGGACTTCGGTTCGTACCGACGCAAAATGGCGTGTAGTTTCAAGCGGAACAACAATTTTAAAATCAGGTGAATTTATTTCTGTCGATACCGCAAAAGGTAATGACATGATTTTCACTTTACCAAATAATCCACAAGATGGCGATACAATTATGCTGAAGGATATCGGTAATAAAACCGGTACCGTTGGTGTAACTATCAACGCATCTATTCAAGACATTGTACTGCGTGGCCCTACGAATAAAGTTCGCTCGGTCAAAATGACTCATCCACTGTCTCAATATGTGTTTGTGTTCAGCAATAGATTGTGGAATCTTTACGTTTCTGATTACGAAAGAGTTGCTCGTATTGTAACACCAAGCGCAGTCGTTCAAGCTCAATCTAACGACTTTATAGTTCGCAGATATACTTCTCCAGACCCAATCCGTGTTACTTTGCCTAAACATGCAAACACTGGAGATATCATCAACTTTACTGACCTTGATGGAAAGAACCCTCAATTCCACATGATTGTTAGTACTTTCGATGATAACACCAATATCGGTACTGTCGGTCAAAAATCTGTAGAAGTTCGTACTTCTGGTGACGGATTCATTGTATATGATGAATCAGAGTCAATCTGGAGAATCTGGGAAGGCGACTTACGTCCGCGCATGCGTGTGATCACCGACAACGTAACTTTAATTCCAAATGAGGTTGTTACTGTTTTTGGTGTAAATAACAGCACTCAGAAAACTATTGATATAACTTTACCTACTGATATTGCTATTGGCGATACTGTCACTATTGCAATGAATTATATGCGCAAAGGACAGAAAGTAAATATCAGAGCAGCTACTGGAGATAAAATTGCTTCAAGTCTTCAATTACTGCAATTCCCTAAACGCTCAGAGTATCCGCCTGATGCCACTTGGGTAATGAATGATGTTCTTACTTTTGACGGTACTACTTCTTATGTTCCAGTATTGCAATTATCTTATATTGAACATTCTGGAAGTAAATACTGGATTGTTGCTGATAATGATCCGACCGTAGAGCGTGTTGACTCTAAAGATAATGAAACTCGTAAACGCTTAGGCGTTATTGCTTTAGCAAGTCAAGACCAAGCAAACGTTGACCACGAAAATAATCCAGAAAAAGAGTTAGCAATTACTCCTCAAACTCTGGCAAACCGTGTTGCTACTAAAGTTCGTCGCGGTATTGCTCGTTTAGTTACTTTAACTGAAATACAAGCTCTAACTCCTGGGCCGCATTTGGATGATGTTATTGTCACTCCTGCGATGCTGAATGAAAAAACAGCAACAGAAACTCGTCGTGGTGTTGCTGAAACTGCTACTCAAGCTGAAGCAAATGGTTCAACCGACGATGAACGTATCATCACTCCGAAGAAGCTGCATAACCGTATTGCTTCTGAGATTTTGACTGGTATTCTTAAATTAGTCAGAACAACTGGAACTCTTGCGGGTATTGGACGTGATACTAAAGGTACTAACGTTTATGATTATGATAACAACATTGATGCGGTAACTCCAAAATCGTTGTTCCAATTCAAGTCTACTGAGCAAGCTCAGGGCGGTGTTTATCTTGCTACTCAAAATGAAGTAATTGCCGGTGGTCCAGCTCAACCTGGTTTCCCAGTAGTTGTTACTCCAGAAACGCTTCATGGCAAAACTTCAACTGATTCAAGAATCGGTTTGATTCAAATTGCTAAACAAGCTGAAGTAGATACTGGTACAGATTACACAAAAGCAGTTACTCCTAAAACTCTGAATGACCGTAAGGCTCGTGAAGATTTAAGTGGTATTGCTGAAATTGCAACTCAAGTTGAATTTGATACCGGAACGGACGATACACGTATCGTAACTCCATTAAAGGTTAAAACTCGTTTCAATTCAACCGATAGAACATCTGTTGTTGCTCTGTCTGGATTAGTTGAGCAAGGAACCTTGTGGGACCATTATACATTAGATATCAAAGAAGCATCTGAGACTCAGCGTGGTACTGCTGCTCTGGCCACTCAAGTACAAGTTGATGCTGGTACTGATGATAAGACGATTGTTACGCCTAAGAAATTGCATGCTAAGAAAGCTACTGAAACTACCGAAGGTATTATTCAAGTTGCTAACCAAGCTGAAACGGTAGCCGGTACTATTGCTAATAAAGCAGTTTCTCCTAAGAACTTTAAGTATGTTGTCCAAGAAGAAAAAACTTGGGAATCTACTATAGCTCAGCGTGGTTTCGTTAAATTATCAGAAAAAGCACTCACCTTTAAGGGTGATACTTTAAATGGTTCTGGTCGTCTGCTTCCAGGTGATTTAATTAACGAACCCGCTTTAACAGATTTGCCTAAAGAAGGTTATGCAGTATCTCCATACGAGATGAACCGTGCTCTGCAATACTTCTTGCCGGCTAAAGCAAAAGCTGTTGATTCGGATTTACTGGATGGAATTGATTCAACTCAGTTTGTTCGCCGCGATATCGACCAAGTAGTTAATGGCAAAATTACATTCAAAAAGGATGTTACTCTAGAAGCTCCTCTGGTGTCCTCTAGTACGGCCAAATTCACTACCGTGAATGCTACTATATCTGTTGATATTGGTGACACTCTGGGTAATTCTAGAATCAATTTGAATACTCTGGCGAATGGCTGGAACATTGAAACTCTGGCGAATGGTTCAACTCTTGATTTTACTGCTACAGATAAAGTTCTGACGCTTAATCGTAATGGAAACGTAACGGTTGCTCAGACTCTGACAGCAATGAACAAAGTTGACGCTAATAAGGGCTTTTCAGTTGAAGGTGGTACAATGGTTATCAATCCTTCCTCTACTGAAATTGTCATTGGTACTCAATCTAAGCAAGTAACATTGCAGAACAAAGATGCTAAGACATTCTCAGTTGTAGACCCTTCTGGCACTTACACCATTCTGAATACCAAGAATGCTTTTGAAATAACGGCTCAAGGGTTCGTTAAGAAAGCAGGTGATTCAATGACTGGGCCACTTCAAATTCAAGCTCCATTGACTGTTCAGATTCCTGAAGGACGAGTTGCTCCTGATGTTAAACCATCAGATGATAACCCAGCTTCATGGTCTGCATCAATTACGTCAGCAGCAATTTACAACAAATTGCCTGGCTATGGTGTTCCAGTTATGGAAAAAGATGCTGAAGGACAAGACACCGGTTTCGTAGACCATTACGAATATGTTAAAGGTCCTGGTGTATTAACTCAGCATGGTATTGGTAAGACTGCGGTCTATCAAATTTGGGCGCCACGCCCAACTGTGCAAGAGTTAAACCACAATGCTCAGACTTTCTGGATTCGTAACTTCAACATCGTCACTGGCGAGTGGGACGAATTTGGTAAGATGTACACCTCAGTTCAGAGACCTACTGCAGGGGAAATTGGTGCTGTATCAACTTCTGGTTCAGCTTTCAATAACTTGACAATTCGCGATTGGTTACAGATTAAGAACGTTCGTATTGTTCCTAATGAAACTACTCGCACTGTTGACTTCATATGGGTTGATGAATAA
Gene Ontology
No Gene Ontology terms available.
Enzymatic activity
No enzymatic activity data available.
Tertiary structure
No tertiary structures available.
Literature
No literature entries available.