Protein

Genbank accession
AHY25235.1 [GenBank]
Protein name
long tail fiber distal subunit [Pectobacterium bacteriophage PM2]
RBP type
TSP
Evidence DepoScope
Probability 1,00
TSP
Evidence RBPdetect
Probability 0,80
Protein sequence
MADIKQIQFKRSNTAGARPTSEQIAEGELAINLTDRTLFTKNTLGQVIDLGFAKGGTVVGDINQTGNINSTGNIVAAEILATTRLDSNGPITSNNGRIYSNAPANVDAKVILQGLEIPSSRLRERGSIWAAPQTTTFGSVVISSYNGTNATTASNFIFNGDGDLNVPKNVLATQFKASVQIESPKTVTRQIITSGRATINEFGGNPDYGWNDLVSWPHSETNSINYVYKGRASSSGTIWHQVLDERAGVAEWALYTGVSTSAKNFSVSSIGDGKFRRNLIIGSSSGANYSSLGDNSISIGDVNTGFRRPSLGNLHVLANNSIVAGFSEPDGLNYSYRRLVVQTNNLSNQSVLPENNTAQLRIATFNDNNNFGDGWTHIGYNAGGEYNHYFRGKGEAAFAMGKGVNIATGGLKVTGDSSFVGNVTITGQITPQNYANFDIRYPSYSALSSGINQEIVSRSANAFRSVGARYGFIIRSSGDATHFLSTAIDDPYGTFSSNRPLRIDHITGIVTMEQGLSVLTNVNIGAATYRTDGNILGSNWTSGNLATHISTEDGKRVLKTGDTMSGRLFINQNEGAQLVVNNPEANGPVFIIGRKNQADSFYVGNGNSNSGDVMLHNYVFNNTLTLRQNDTLISKPLLVTGGITSTGGITLGDWTNIDNRINNSSLGVGQTWVNQSRTFNTEYTNDTNKPIMVNVSFSWETNGTIIQFLVDNVVVDTNRIRGFSMSGNFQVIVPKGSKYMITRVSQDISAVIISNWAELR
Physico‐chemical
properties
protein length:760 AA
molecular weight: 81808,66450 Da
isoelectric point:7,81255
aromaticity:0,08421
hydropathy:-0,27711

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Pectobacterium bacteriophage PM2
[NCBI] 		1429794 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
AHY25235.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
KF835987.1 [NCBI]
CDS location
range 159239 -> 161521
strand +
CDS
ATGGCCGATATAAAACAAATCCAATTTAAACGATCAAATACAGCAGGAGCAAGACCTACATCAGAGCAAATTGCTGAAGGTGAACTTGCTATAAATTTAACGGATCGTACGCTATTCACTAAAAACACATTAGGTCAAGTAATTGATTTAGGATTCGCTAAAGGCGGTACTGTAGTTGGCGATATAAACCAGACAGGTAATATTAACAGTACTGGCAATATTGTAGCAGCCGAAATCCTAGCAACAACTAGACTTGATAGTAATGGTCCCATTACATCTAATAATGGTCGAATTTATTCTAATGCACCTGCTAATGTAGATGCTAAAGTTATTTTACAAGGGTTGGAAATTCCTTCAAGTAGATTACGTGAGCGAGGATCAATTTGGGCTGCCCCACAAACAACAACATTTGGTTCTGTTGTTATTAGTTCTTATAATGGAACTAATGCAACAACGGCTTCTAATTTCATATTTAATGGTGATGGTGACCTAAATGTCCCTAAAAACGTATTGGCAACTCAATTTAAAGCATCTGTACAAATTGAGAGCCCTAAAACGGTAACAAGACAAATTATAACTAGCGGAAGAGCTACTATAAATGAATTTGGCGGGAATCCTGATTATGGGTGGAATGATCTAGTAAGTTGGCCTCATTCAGAAACTAATTCTATCAATTATGTTTACAAAGGGCGTGCTTCTTCTTCAGGAACTATTTGGCATCAAGTTTTAGATGAAAGAGCTGGAGTTGCAGAATGGGCTCTTTATACTGGTGTTTCTACATCAGCAAAAAACTTTTCTGTTTCTAGTATTGGTGATGGTAAATTTAGAAGAAATTTAATTATTGGATCTTCTTCAGGTGCTAATTATTCTTCTTTAGGTGATAATTCTATTTCTATTGGCGATGTAAATACAGGATTCAGACGTCCTTCTTTAGGTAATTTACATGTTTTAGCAAACAATTCTATAGTTGCTGGATTTTCAGAACCGGATGGTCTTAATTATTCTTATAGAAGATTGGTAGTCCAGACTAATAATTTATCTAATCAATCTGTATTACCAGAAAATAATACTGCGCAATTAAGAATTGCAACATTTAACGACAATAATAATTTTGGCGACGGGTGGACCCATATAGGTTATAATGCTGGTGGTGAATATAACCACTATTTTAGAGGTAAAGGTGAAGCAGCCTTTGCTATGGGTAAAGGTGTCAATATCGCTACAGGTGGTTTAAAAGTTACGGGTGATTCATCTTTCGTAGGCAATGTTACTATAACCGGACAAATAACTCCTCAAAATTATGCTAATTTTGACATAAGATACCCATCATATTCTGCATTATCAAGCGGTATAAACCAAGAAATAGTAAGTAGAAGTGCTAATGCCTTTAGAAGTGTTGGGGCTAGATATGGTTTTATTATTAGAAGTTCTGGAGATGCAACTCATTTCCTTTCGACCGCAATAGATGATCCTTACGGAACATTTAGTTCTAATAGACCTTTAAGAATTGATCATATCACTGGCATTGTTACGATGGAACAAGGTCTTAGTGTCCTTACTAATGTAAATATAGGAGCCGCTACCTATAGAACAGATGGGAATATTTTAGGATCGAATTGGACATCAGGAAATCTTGCTACTCATATAAGTACTGAAGATGGTAAAAGAGTTCTTAAAACTGGCGATACCATGTCAGGAAGACTTTTTATTAACCAGAATGAAGGTGCTCAATTAGTAGTAAATAATCCAGAAGCAAACGGCCCAGTCTTTATTATAGGAAGGAAAAACCAGGCTGATAGTTTCTATGTTGGTAACGGTAATTCTAATTCAGGCGATGTTATGCTACACAATTATGTTTTTAATAACACGCTGACATTAAGACAAAACGATACGTTAATTAGTAAACCTTTATTAGTTACTGGTGGAATTACATCTACCGGCGGAATTACACTAGGTGATTGGACTAATATTGATAACAGAATTAATAATTCATCTTTAGGCGTAGGACAAACTTGGGTTAATCAAAGTAGAACTTTTAACACAGAATATACTAATGATACTAATAAACCTATTATGGTTAATGTTTCTTTCTCTTGGGAAACTAATGGCACTATTATCCAATTTTTAGTAGATAACGTTGTTGTTGATACTAATAGAATTAGAGGTTTTAGTATGTCAGGTAATTTCCAAGTTATAGTTCCTAAAGGTTCTAAATACATGATTACTAGGGTTTCTCAAGATATTTCGGCTGTTATTATATCAAATTGGGCCGAATTAAGATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.