Protein

Genbank accession
XOD32557.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber proximal subunit
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9289

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9321

Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRAVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSVRWRALRTDANWTTVSSGPYQLKSGESISVNTAAGNDITFTLPTSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQIGLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPASLYQAQSNDFIMRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEDGTHSIEGRTSIDGFLMYDDNEKLWRLFDGDSKARLRVITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISIGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNNYTIARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITSETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQDTTFSFADDNIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGKNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTSLKIKTRFNRTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVAGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTLVRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQSLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLMAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATQLIFEKGPQSGTNPAQTMTVKVWGNQFSGESDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTASGEIISRSANAFRAINGNYGFIVRNDGSVTNFMLTASGDQTGGFNGLRPLTIINASGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDFYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQVPGYFEMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNAIMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140103,58960 Da
isoelectric point:5,25843
aromaticity:0,07292
hydropathy:-0,31559

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage sb4
[NCBI] 		3387549 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOD32557.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ666542.1 [NCBI]
CDS location
range 151630 -> 155499
strand +
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTTAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTGCCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACCTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATACGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCCGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCGGGAGCTTTTAATAGCGTACGTTGGAGAGCATTACGTACTGATGCAAATTGGACAACCGTTTCATCAGGGCCTTATCAATTAAAGTCAGGTGAATCAATTTCAGTTAACACTGCAGCAGGAAATGATATCACATTTACTTTGCCAACTTCTCCAATTGATGGAGATACTATCGTTCTTCAAGATATTGGTGGAAAACCCGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGCGAACAAGTACGATCAGTACTAATGACCCATCCAAAATCACAGATAGGTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGCAGAGAAGCGGTAGTTGTGACGCCAGCAAGTCTCTATCAGGCACAGTCAAATGATTTTATCATGCGCAGATTTACTTCTGCTGCACCGATAAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAATTAAATCCTCTTTATCATACAATTGTTACTACATATGATGAAACTACATCAGTACAAGAAGATGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACATCGATTGATGGTTTCTTGATGTATGATGATAATGAGAAATTATGGAGATTATTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCGTTATAACAACTAATTCTAATATTCGTCCAAACGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAATGGAACAACTCAAACAATTGAACTTCAGCTTCCGACCGATATTTCCATTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGCCAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACAGTTGAAAGAGTCGATTCTTTAAATAATTATACTATAGCAAGATTAGGCGTGATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTTCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACCACTGCTCAAGTGAACCAGGACACTACATTCTCTTTTGCTGATGATAATATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACACAGCAAGAAACTAACGCAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGACAAGGTTCTGAATCATTATCTGGTATTGTAACATTTGTATCTACTGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTAAAAATGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCGCTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAGAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATCGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGCGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTAAAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACATCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGAACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTGGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTAGATAATGTTCTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTGGGTACTAAATCTACCGAAGCACAAGAAGGCGTTATTAAAGTTGCAACTCAATCTGAAACTGTAGCTGGAACATCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCAACTACTTTGGTAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTCGGTAATGATACTGTTGGTTCAACACAGTCATTAGAATTATACGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCTCCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCATTAATGGCAAAAGCTGCTGACACGAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCCCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCGCAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACTCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGATCAGTTTCGGCAAATAGTACACTAACTATTTCTAATACTGGAACAGCAACTCAATTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAATCTGGAACGAACCCAGCGCAGACGATGACTGTCAAAGTGTGGGGAAATCAATTTAGTGGGGAATCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACGTCTAGTCATTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCTGGAAATATAACATTTAATATCAACGGTACAGTAACTCCGATAAATGTTAATGCTTCAGGAACATTGAATGCAAATGGTGTAGCAACATTTGGTAATTCAGTCACGGCAAGTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGTGCTATTAACGGAAATTACGGTTTTATTGTTCGCAATGACGGGTCAGTTACGAATTTTATGCTTACTGCATCGGGCGATCAGACTGGTGGATTTAATGGATTACGTCCATTAACTATTATTAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGCTTAATCATCGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTGACTGTTAACTCAAGAATTCGTTCTCAGGGTACTAAAACATCTGATTTTTATACCCGTGCTCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGGTCCCGGGTTATTTTGAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAGGTTAAATCTCCTGGTACGTTAACTCAGTTTGGTAACACACTCGATTCGCTTTATCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACCCCAGAAGCGCGCACCACTCGCTGGACACGCACATGGCAGAAAACAAAAAACTCTTGGTCGAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGAGGTAACCCTCCTCAGCCGTCTGATATCGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTATAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.