Protein

Genbank accession
XOD32267.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber proximal subunit
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9312

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,5940

Protein sequence
MTHPKSQMIFIFNNRLWQMYVADYNREAAIVTPSTAYQAQSNDFIVRRFTSAAPINIKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSVQEVGTHSIEGRTSIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTAQTIELQLPTDISIGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPEAEWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTAGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGQSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRIATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGTLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATQSETVTGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTLVRGFVKTSSGSITFVGNDTAGSTQDLELYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAVDSNLLDGLDSLQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNTGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMTVRVWGNQFSGESDTTRSTVFEVSDETSSHFYSQRNKAGNITFNINGTVTPINVNASGTLNANGVATFGNSVTATGEIISRSANAFRAINGNYGFIIRNDGSVTNFMLTASGNQTGGFNGLRPLSINNQSGQVTIGESLIIAKGATINSGGLTVNSRICSQGVKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFEMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGAIPSDNGIIGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1118 AA
molecular weight: 121561,01280 Da
isoelectric point:5,31509
aromaticity:0,07156
hydropathy:-0,32800

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage sb3
[NCBI] 		3387548 Viruses >
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XOD32267.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ666541.1 [NCBI]
CDS location
range 152392 -> 155748
strand +
CDS
ATGACTCATCCAAAGTCACAGATGATATTCATTTTTAATAATCGTTTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAACAGAGAAGCTGCGATTGTTACTCCATCAACTGCATATCAAGCACAATCTAATGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCCGCTGCGCCGATTAATATTAAACTTCCGAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTTGATTTAGATAAATTAAATCCACTTTATCATACAATTGTCACAACATATGATGAAACAACTTCAGTACAAGAAGTTGGAACTCATTCTATTGAAGGCCGTACATCGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAAAAATTATGGAGATTGTTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGCATTATAACAACTAATTCTAATATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAACGGAACAGCCCAAACAATTGAACTTCAACTTCCAACCGATATTTCCATTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGCCAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCTGGCGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCACCTGAAGCTGAATGGGTGACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGACGGAAAATACTGGGTTGTACAACAAAACGTTCCAACCGTAGAAAGAGTTGATTCTTTAAACGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTGATTGCTTTAGCTACACAAGCGCAAGCTAATGTCGATTTAGAAAATTCTCCACAAAAAGAATTAGCAATTACTCCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTATCGCGAGAATAGCAACCACTGCTCAAGTAAATCAGAACACCACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATCACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGTAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTAATGCAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGTCAGGGTTCTGAATCATTATCAGGTATTGTAACCTTTGTATCTACTGCAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAATGGTACAAACGTTTATAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCTCTAGATCAGTATAAAGCTACTCCAACGCAACAAGGCGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGACAGAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGACCGTATAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACGCAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACCAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAAGTTGAAGCTGCTGCAGGAACATTGGATAATGTTCTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCGCAGGAAGGCGTTATTAAAGTTGCAACTCAGTCTGAAACTGTGACTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTACAGAGTGAACCTACTTGGGCAGCTACTACTTTGGTAAGAGGCTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACGTTCGTTGGTAATGATACAGCTGGTTCTACGCAGGACTTAGAACTATATGAGAAAAATAGCTATGCAGTATCACCATATGAATTAAACCGCGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGTAGATAGTAATTTATTAGATGGTTTAGATTCACTCCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCGCAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACGCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTCGGTGGATCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAATACTGGAACAGCAACTCGTCTGATTTTTGAGAAAGGACCTCAAACTGGGACGAACCCAGCTCAAACGATGACAGTCAGAGTGTGGGGAAATCAATTCAGCGGTGAATCGGACACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTAGTGATGAAACGTCTAGTCACTTTTATTCTCAGCGCAATAAAGCTGGTAATATAACATTTAATATAAACGGTACAGTAACGCCGATAAATGTGAATGCTTCAGGAACATTGAATGCGAATGGCGTCGCAACATTTGGTAATTCAGTCACTGCAACTGGTGAAATTATTTCTCGAAGCGCAAATGCTTTCCGCGCTATTAACGGAAATTATGGTTTCATTATTCGTAATGACGGGTCAGTAACGAATTTTATGCTTACTGCATCAGGCAATCAAACTGGTGGATTTAATGGATTACGTCCATTGTCCATTAATAATCAATCTGGGCAGGTCACAATTGGTGAAAGCTTGATCATTGCTAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACTGTTAACTCGAGAATTTGTTCTCAAGGTGTTAAAACATCTGATTTATATACCCGAGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATCGATATTAATGATTCAGCCACTTATAACCAGTTCCCGGGTTATTTTGAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGGCTTCCATACTTAGAACGTGGCGAAGAAGTTAAATCTCCTGGTACGTTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACTCCAGAAGCACGCACCACTCGCTGGACGCGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCTTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGATGGGGGTAACCCTCCTCAACCTTCGGATATAGGAGCGATCCCATCTGATAACGGAATAATAGGTAATCTTACTATTCGTGATTTCTTGCGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.