Protein

Genbank accession
XPN41240.1 [GenBank]
Protein name
long-tail fiber proximal subunit
RBP type
TF

evidence: RBPdetect

probability: 0,9242

TF

evidence: RBPdetect2

probability: 0,9294

Protein sequence
MAEIKRKFRAEDGLDAGGDKIINVALADRTVGTDGVNVDYLIQENTVQQYDPTRGYLKDFVIIYDNRFWAAINDIPKPAGAFNSGRWRALRTDANWITVSSGSYQLKSGEAISVNTAAGNDITFTLPSSPIDGDTIVLQDIGGKPGVNQVLIVAPVQSIVNFRGEQVRSVLMTHPKSQIVLIFSNRLWQMYVADYSREAVVVTPANTYQAQSNDFIVRRFTSAAPINVKLPRFANHGDIINFVDLDKLNPLYHTIVTTYDETTSIQEVGTHSIEGRTTIDGFLMFDDNEKLWRLFDGDSKARLRIITTNSNIRPNEEVMVFGANNGTTQTIELQLPTDISVGDTVKISMNYMRKGQTVKIKAAGEDKIASSVQLLQFPKRSEYPPETKWVTVQELVFNGETNYVPVLQLAYIEDSDGKYWVVQQNVPTVERVDSLNDSTRARLGVIALATQAQANVDLENSPQKELAITPETLANRTATETRRGIARIATTAQVNQNTTFSFADDIIITPKKLNERTATETRRGVAEIATQQETNAGTDDTTIITPKKLQARQGSESLSGIVTFVSTTGATPASSRELNGTNVYNKNTNNLVVSPKALDQYKATPTQQGAVILAVESEVIAGKSQEGWANAVVTPETLHKKTSTDGRIGLIEIATQSEVNTGTDYTRAVTPKTLNDRKATESLSGIAEIATQVEFDAGVDDTRISTPLKIKTRFNSTDRTSVVALSGLVESGTLWDHYTLNILEANETQRGTLRVATQVEAAAGKLDNVLITPKKLLGTKSTEAQEGVIKVATRSETVAGTSANTAVSPKNLKWIVQSEPTWAATTAIRGFVKTSSGSITFVGNDTVGSTQPLESYEKNSYAVSPYELNRVLANYLPLKAKAADTNLLDGLDSSQFIRRDIAQTVNGSLTLTQQTNLSAPLVSSSTATFGGSVSANSTLTISNAGTATRLIFEKGPQTGTNPAQTMNIRVWGNQFGGGSDTTRSTVFEVGDETSNHFYSQRNKAGNITFSINGTVMPINVNASGLMNVNGTATFGRSVTANGEFTSKSANAFRAINGNYGFFIRNDGGSTYFMLTASGDQTGGFNGLRPLAINNASGQVTIGERLIIAKGATINSGGLTVNSRIRSQGTKTSDLYTRAPTSDTVGFWSIDINDSATYNQFPGYFKMVEKTNEVTGLPYLERGEEVKSPGTLTQFGNTLDSLYQDWITYPTTPEARTTRWTRTWQKTKNSWSSFVQVFDGGNPPQPSDIGALPSDNATMGNLTIRDFLRIGNVRIIPDPVNKTVKFEWVE
Physico‐chemical
properties
protein length:1289 AA
molecular weight: 140211,96920 Da
isoelectric point:5,89229
aromaticity:0,07448
hydropathy:-0,33809

Domains

Domains [InterPro]

No domain annotations available.

Legend: Pfam SMART CDD TIGRFAM HAMAP SUPFAM PRINTS Gene3D PANTHER Other

Taxonomy

  Name Taxonomy ID Lineage
Phage Shigella phage SP21535
[NCBI] 		3384871 Viruses > Duplodnaviria > Heunggongvirae > Uroviricota > Caudoviricetes
Host No host information

Coding sequence (CDS)

Coding sequence (CDS)
Genbank protein accession
XPN41240.1 [NCBI]
Genbank nucleotide accession
PQ615101.1 [NCBI]
CDS location
range 157128 -> 160997
strand -
CDS
ATGGCCGAGATTAAAAGAAAGTTCAGAGCAGAAGATGGTCTGGACGCAGGTGGCGATAAAATAATCAACGTAGCTTTAGCTGATCGTACCGTAGGAACTGACGGTGTTAACGTTGATTACTTAATTCAAGAAAACACAGTTCAACAATATGATCCAACTCGTGGATATTTAAAAGATTTTGTAATCATTTATGATAACCGCTTTTGGGCTGCTATAAATGATATTCCAAAACCAGCAGGAGCTTTTAATAGCGGACGCTGGAGAGCATTACGTACTGATGCTAACTGGATTACGGTTTCATCTGGTTCATATCAATTAAAATCGGGTGAAGCAATTTCGGTTAACACTGCAGCTGGAAATGACATTACGTTTACTTTACCGTCTTCTCCAATTGATGGTGATACTATCGTTCTCCAAGATATTGGAGGAAAACCTGGAGTTAACCAAGTTTTAATTGTAGCTCCAGTGCAAAGTATTGTAAACTTTAGAGGTGAACAGGTACGTTCAGTACTAATGACTCATCCAAAATCGCAGATAGTTTTAATTTTTAGTAATCGTCTGTGGCAAATGTATGTTGCTGATTATAGTAGAGAAGCTGTAGTTGTAACACCAGCGAATACTTATCAAGCGCAATCCAACGATTTTATCGTGCGTAGATTTACTTCTGCTGCACCAATTAATGTTAAACTTCCAAGATTTGCTAATCATGGCGATATTATTAATTTCGTCGATTTAGATAAACTAAATCCGCTTTATCATACAATTGTTACTACATACGATGAAACGACTTCAATACAAGAAGTCGGAACTCATTCCATTGAAGGCCGTACAACGATTGACGGTTTCTTGATGTTTGATGATAATGAGAAATTATGGAGATTATTTGACGGGGATAGTAAAGCACGTTTACGTATCATAACAACTAATTCAAACATTCGTCCAAATGAAGAAGTTATGGTATTTGGTGCGAATAATGGAACAACCCAAACAATTGAGCTTCAGCTTCCTACTGATATCTCTGTTGGTGATACTGTTAAAATTTCCATGAATTACATGAGAAAAGGACAAACAGTTAAAATCAAAGCTGCCGGTGAAGATAAAATTGCTTCTTCAGTTCAATTGCTGCAATTCCCAAAACGTTCAGAATATCCACCTGAAACTAAATGGGTAACTGTTCAAGAATTAGTTTTTAACGGTGAAACTAATTATGTTCCAGTTTTACAACTTGCTTATATAGAAGATTCTGATGGAAAATACTGGGTTGTACAGCAAAACGTTCCAACTGTAGAAAGAGTAGATTCTTTAAATGATTCTACTAGAGCAAGATTAGGCGTAATTGCTTTAGCTACACAAGCTCAAGCTAACGTCGATTTAGAAAATTCTCCGCAAAAAGAATTAGCAATTACACCAGAAACATTAGCTAACCGTACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTATCGCAAGAATAGCAACTACTGCTCAAGTGAACCAGAACACTACATTCTCTTTTGCTGATGATATTATCATTACTCCTAAAAAGCTGAATGAAAGAACTGCTACAGAAACTCGCAGAGGTGTTGCTGAAATTGCTACGCAACAGGAAACTAATGCAGGTACTGATGATACTACAATCATCACTCCTAAAAAGCTTCAAGCTCGACAAGGTTCTGAGTCATTATCTGGTATTGTAACTTTTGTATCTACTACAGGAGCTACTCCAGCTTCTAGTCGTGAATTAAACGGTACAAATGTTTACAATAAAAACACTAATAATTTAGTTGTTTCGCCTAAAGCTTTGGATCAGTATAAAGCTACTCCAACACAACAAGGTGCAGTAATTTTAGCAGTTGAAAGTGAAGTAATTGCTGGAAAAAGTCAAGAAGGATGGGCAAATGCGGTTGTAACGCCAGAAACGTTACATAAAAAGACATCAACTGATGGAAGAATTGGTTTAATTGAAATTGCTACGCAAAGTGAAGTTAATACAGGAACTGATTATACTCGTGCAGTCACTCCTAAAACTTTAAATGATCGTAAAGCAACTGAAAGTTTAAGTGGTATAGCTGAAATTGCTACACAAGTTGAATTCGACGCAGGCGTCGACGATACTCGTATCTCTACACCATTAAAAATTAAAACTAGATTTAATAGTACTGATCGTACTTCTGTTGTTGCTCTATCTGGATTAGTTGAATCAGGAACTCTCTGGGACCATTATACCCTTAATATTCTTGAAGCAAATGAGACACAGCGTGGTACACTTCGTGTAGCTACACAGGTTGAAGCTGCTGCAGGAAAATTAGATAATGTTTTAATAACTCCTAAAAAGCTTTTAGGTACTAAATCTACTGAAGCACAGGAAGGTGTTATTAAAGTTGCGACTCGGTCTGAAACTGTGGCTGGAACGTCAGCAAATACTGCTGTATCTCCAAAAAATTTAAAATGGATTGTGCAGAGTGAACCTACCTGGGCGGCTACTACTGCGATAAGAGGTTTTGTTAAAACTTCATCTGGTTCAATTACATTCGTTGGTAATGATACGGTAGGTTCAACACAACCGTTAGAATCATATGAGAAAAATAGCTATGCGGTATCACCATATGAATTAAACCGTGTATTAGCAAATTATTTGCCGTTAAAAGCAAAAGCTGCTGATACAAATTTATTGGATGGTCTAGATTCATCTCAGTTCATTCGTAGGGATATTGCACAGACGGTTAATGGTTCACTAACCTTAACCCAACAAACGAATCTGAGTGCCCCTCTTGTATCATCTAGTACTGCTACGTTTGGTGGATCAGTTTCGGCAAATAGTACATTAACTATTTCTAACGCTGGAACAGCAACTCGTCTGATTTTTGAAAAAGGACCTCAGACTGGAACTAACCCAGCACAGACGATGAATATCAGAGTTTGGGGAAATCAGTTTGGTGGCGGTTCAGATACAACACGTTCTACTGTATTTGAAGTTGGTGATGAAACGTCTAATCACTTTTATTCTCAACGCAATAAAGCTGGGAATATAACGTTTAGCATTAACGGTACTGTAATGCCAATAAATGTTAATGCTTCCGGTTTGATGAATGTGAATGGCACTGCAACATTCGGTCGTTCAGTTACTGCTAATGGCGAATTCACCAGTAAATCAGCAAATGCCTTTAGAGCAATAAATGGTAATTATGGATTCTTTATCAGGAATGATGGCGGAAGCACATATTTTATGCTCACTGCATCGGGTGATCAGACTGGCGGATTTAATGGATTACGTCCTTTAGCTATTAATAATGCATCTGGTCAAGTAACGATTGGTGAAAGATTAATCATTGCCAAAGGTGCTACTATAAATTCAGGTGGTTTAACAGTTAACTCGAGAATTCGTTCTCAAGGTACTAAAACATCTGACCTATACACCCGTGCGCCAACATCTGATACTGTAGGATTCTGGTCAATTGACATTAATGATTCAGCTACTTATAACCAGTTCCCAGGTTATTTTAAAATGGTTGAAAAAACTAATGAAGTGACTGGACTTCCATACTTAGAACGCGGAGAAGAGGTTAAATCTCCTGGTACATTGACTCAGTTTGGTAACACACTTGATTCGCTTTACCAAGATTGGATTACTTATCCAACGACTCCAGAAGCGCGTACCACTCGCTGGACGCGTACATGGCAGAAAACCAAAAACTCCTGGTCAAGTTTTGTTCAGGTATTTGACGGAGGTAACCCTCCTCAACCATCTGATATTGGTGCTTTACCATCTGATAATGCTACAATGGGGAATCTTACTATTCGTGATTTCTTACGAATTGGTAATGTTCGCATTATTCCTGACCCAGTGAATAAAACGGTTAAATTTGAATGGGTTGAATAA

Gene Ontology

No Gene Ontology terms available.

Enzymatic activity

No enzymatic activity data available.

Tertiary structure

No tertiary structures available.

Literature

No literature entries available.